MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 43489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012926	GGAT	2	8	169919	169926	25 %	25 %	50 %	0 %	253754806
3502	NC_012926	AGACT	2	10	169948	169957	40 %	20 %	20 %	20 %	253754806
3503	NC_012926	CT	3	6	169981	169986	0 %	50 %	0 %	50 %	253754806
3504	NC_012926	TAG	2	6	170023	170028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754806
3505	NC_012926	TGAC	2	8	170039	170046	25 %	25 %	25 %	25 %	253754806
3506	NC_012926	CTG	2	6	170114	170119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754807
3507	NC_012926	ACT	2	6	170131	170136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754807
3508	NC_012926	ATA	2	6	170257	170262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754807
3509	NC_012926	TCT	3	9	170437	170445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754807
3510	NC_012926	TTC	2	6	170469	170474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754807
3511	NC_012926	GAG	2	6	170483	170488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754807
3512	NC_012926	TAT	2	6	170591	170596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754807
3513	NC_012926	TTC	2	6	170610	170615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754807
3514	NC_012926	TCC	2	6	170749	170754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754807
3515	NC_012926	T	6	6	170775	170780	0 %	100 %	0 %	0 %	253754807
3516	NC_012926	AGA	2	6	170787	170792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754807
3517	NC_012926	A	6	6	170851	170856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012926	A	7	7	170858	170864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_012926	TAG	2	6	170906	170911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_012926	TAC	2	6	170914	170919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_012926	TAGA	2	8	171064	171071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_012926	TCA	2	6	171129	171134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_012926	CAA	2	6	171143	171148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_012926	CCAG	2	8	171190	171197	25 %	0 %	25 %	50 %	253754808
3525	NC_012926	CTT	2	6	171280	171285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754808
3526	NC_012926	GATT	2	8	171303	171310	25 %	50 %	25 %	0 %	253754808
3527	NC_012926	GAG	2	6	171391	171396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754808
3528	NC_012926	TCAG	2	8	171407	171414	25 %	25 %	25 %	25 %	253754808
3529	NC_012926	CTTG	2	8	171429	171436	0 %	50 %	25 %	25 %	253754808
3530	NC_012926	CGC	2	6	171591	171596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253754808
3531	NC_012926	AGC	2	6	171622	171627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754808
3532	NC_012926	TGA	2	6	171669	171674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754808
3533	NC_012926	CGT	2	6	171699	171704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754808
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3535	NC_012926	GGT	2	6	171853	171858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754808
3536	NC_012926	CATC	2	8	171915	171922	25 %	25 %	0 %	50 %	253754808
3537	NC_012926	CGGA	2	8	171926	171933	25 %	0 %	50 %	25 %	253754808
3538	NC_012926	CAC	2	6	171934	171939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754808
3539	NC_012926	CGGT	2	8	172013	172020	0 %	25 %	50 %	25 %	253754808
3540	NC_012926	TCC	2	6	172043	172048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754808
3541	NC_012926	GAAA	2	8	172074	172081	75 %	0 %	25 %	0 %	253754808
3542	NC_012926	ATG	2	6	172085	172090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754808
3543	NC_012926	TGCC	2	8	172146	172153	0 %	25 %	25 %	50 %	253754808
3544	NC_012926	GTT	2	6	172174	172179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754808
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3546	NC_012926	T	7	7	172235	172241	0 %	100 %	0 %	0 %	253754808
3547	NC_012926	TCT	2	6	172254	172259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754808
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3550	NC_012926	CAT	2	6	172288	172293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754808
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3552	NC_012926	ATA	2	6	172313	172318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754808
3553	NC_012926	TCA	2	6	172359	172364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_012926	AGT	2	6	172369	172374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_012926	TGTA	2	8	172483	172490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_012926	AAC	2	6	172536	172541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_012926	GAAA	2	8	172556	172563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_012926	GTAG	2	8	172564	172571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_012926	AG	3	6	172591	172596	50 %	0 %	50 %	0 %	253754809
3560	NC_012926	T	6	6	172614	172619	0 %	100 %	0 %	0 %	253754809
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3563	NC_012926	AACA	2	8	172745	172752	75 %	0 %	0 %	25 %	253754809
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3582	NC_012926	CAAG	2	8	173940	173947	50 %	0 %	25 %	25 %	253754809
3583	NC_012926	TAGA	2	8	173970	173977	50 %	25 %	25 %	0 %	253754809
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3599	NC_012926	TGG	2	6	174777	174782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_012926	T	6	6	174792	174797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_012926	AGT	2	6	174804	174809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3603	NC_012926	AGG	2	6	174897	174902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3605	NC_012926	AGC	2	6	175005	175010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754811
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3609	NC_012926	ATACA	2	10	175067	175076	60 %	20 %	0 %	20 %	253754811
3610	NC_012926	AAAG	2	8	175118	175125	75 %	0 %	25 %	0 %	253754811
3611	NC_012926	ATCT	2	8	175154	175161	25 %	50 %	0 %	25 %	253754811
3612	NC_012926	AAG	2	6	175167	175172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754811
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3624	NC_012926	GA	3	6	175538	175543	50 %	0 %	50 %	0 %	253754811
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3750	NC_012926	ATG	2	6	181440	181445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754816
3751	NC_012926	CCT	2	6	181457	181462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754816
3752	NC_012926	AAC	2	6	181471	181476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754816
3753	NC_012926	CCG	2	6	181487	181492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253754816
3754	NC_012926	TCA	2	6	181505	181510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754816
3755	NC_012926	TCTGG	2	10	181536	181545	0 %	40 %	40 %	20 %	253754816
3756	NC_012926	GATG	2	8	181697	181704	25 %	25 %	50 %	0 %	253754816
3757	NC_012926	CATG	2	8	181736	181743	25 %	25 %	25 %	25 %	253754816
3758	NC_012926	CTT	2	6	181852	181857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754816
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3762	NC_012926	TAT	2	6	182021	182026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754816
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3769	NC_012926	ATC	2	6	182244	182249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754816
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3772	NC_012926	GGA	2	6	182282	182287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754816
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3774	NC_012926	GTC	2	6	182515	182520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754817
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3780	NC_012926	TATAA	2	10	182921	182930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3781	NC_012926	GGA	3	9	182958	182966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3861	NC_012926	TGATT	2	10	186911	186920	20 %	60 %	20 %	0 %	253754820
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3998	NC_012926	ATT	2	6	193369	193374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_012926	AAAT	2	8	193416	193423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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