MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 43489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012926	GTG	2	6	23988	23993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754664
502	NC_012926	TGG	2	6	24022	24027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754664
503	NC_012926	CGG	2	6	24063	24068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253754664
504	NC_012926	ATG	2	6	24162	24167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754664
505	NC_012926	TGA	2	6	24208	24213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754664
506	NC_012926	TGT	2	6	24232	24237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754664
507	NC_012926	CAAA	2	8	24386	24393	75 %	0 %	0 %	25 %	253754664
508	NC_012926	TTTAT	2	10	24438	24447	20 %	80 %	0 %	0 %	253754665
509	NC_012926	GGTC	2	8	24484	24491	0 %	25 %	50 %	25 %	253754665
510	NC_012926	ATT	2	6	24494	24499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754665
511	NC_012926	T	6	6	24535	24540	0 %	100 %	0 %	0 %	253754665
512	NC_012926	ATT	2	6	24569	24574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754665
513	NC_012926	CTA	2	6	24634	24639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754665
514	NC_012926	TCT	2	6	24673	24678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754665
515	NC_012926	TAG	2	6	24724	24729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754665
516	NC_012926	TTA	2	6	24748	24753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754665
517	NC_012926	TAA	2	6	24812	24817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754665
518	NC_012926	ATT	2	6	24869	24874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754665
519	NC_012926	AACA	2	8	24893	24900	75 %	0 %	0 %	25 %	253754665
520	NC_012926	TAA	2	6	24914	24919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012926	T	7	7	24941	24947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012926	GA	3	6	24956	24961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012926	GAG	2	6	24975	24980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012926	GAA	2	6	24995	25000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754666
525	NC_012926	A	7	7	24999	25005	100 %	0 %	0 %	0 %	253754666
526	NC_012926	TCTA	2	8	25037	25044	25 %	50 %	0 %	25 %	253754666
527	NC_012926	ATG	2	6	25075	25080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754666
528	NC_012926	CAA	2	6	25096	25101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754666
529	NC_012926	A	6	6	25100	25105	100 %	0 %	0 %	0 %	253754666
530	NC_012926	CAA	2	6	25131	25136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754666
531	NC_012926	CAA	3	9	25146	25154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754666
532	NC_012926	AGA	2	6	25211	25216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754666
533	NC_012926	GGC	2	6	25250	25255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253754666
534	NC_012926	ATCA	2	8	25376	25383	50 %	25 %	0 %	25 %	253754666
535	NC_012926	AATGC	2	10	25404	25413	40 %	20 %	20 %	20 %	253754666
536	NC_012926	ATT	2	6	25419	25424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754666
537	NC_012926	TAA	2	6	25430	25435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754666
538	NC_012926	AAC	2	6	25447	25452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754666
539	NC_012926	TTG	2	6	25474	25479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754666
540	NC_012926	ACT	2	6	25509	25514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754666
541	NC_012926	GCT	2	6	25584	25589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754666
542	NC_012926	CTG	2	6	25618	25623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754666
543	NC_012926	TTG	2	6	25641	25646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754666
544	NC_012926	AGA	2	6	25664	25669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754666
545	NC_012926	AGC	2	6	25670	25675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754666
546	NC_012926	CAA	2	6	25734	25739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754666
547	NC_012926	TAG	2	6	25774	25779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754666
548	NC_012926	CAT	2	6	25864	25869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754666
549	NC_012926	GCA	2	6	25890	25895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754666
550	NC_012926	AAT	2	6	25896	25901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754666
551	NC_012926	GGT	2	6	26076	26081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754666
552	NC_012926	TAT	2	6	26082	26087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754666
553	NC_012926	GTT	2	6	26100	26105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754666
554	NC_012926	CAA	2	6	26122	26127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754666
555	NC_012926	GTT	2	6	26136	26141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754666
556	NC_012926	GTC	2	6	26158	26163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754666
557	NC_012926	GTG	2	6	26182	26187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754666
558	NC_012926	CAA	2	6	26200	26205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754666
559	NC_012926	TAC	2	6	26226	26231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754666
560	NC_012926	TTTG	2	8	26288	26295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012926	AT	3	6	26335	26340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012926	AGG	2	6	26341	26346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012926	A	7	7	26418	26424	100 %	0 %	0 %	0 %	253754667
564	NC_012926	TTC	2	6	26521	26526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754667
565	NC_012926	CTG	2	6	26599	26604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754667
566	NC_012926	GTA	2	6	26616	26621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754667
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573	NC_012926	ATT	2	6	26815	26820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754667
574	NC_012926	CGT	2	6	26826	26831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754667
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577	NC_012926	TAT	2	6	26927	26932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754667
578	NC_012926	TGA	2	6	26974	26979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754667
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581	NC_012926	TGAT	2	8	27028	27035	25 %	50 %	25 %	0 %	253754667
582	NC_012926	GTT	2	6	27171	27176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754667
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585	NC_012926	ATT	2	6	27258	27263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754667
586	NC_012926	TTTG	2	8	27293	27300	0 %	75 %	25 %	0 %	253754667
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589	NC_012926	ATTT	2	8	27355	27362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012926	TAT	2	6	27371	27376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_012926	TTA	2	6	27589	27594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754668
596	NC_012926	CT	3	6	27689	27694	0 %	50 %	0 %	50 %	253754668
597	NC_012926	TTC	2	6	27759	27764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754668
598	NC_012926	TGCC	2	8	27765	27772	0 %	25 %	25 %	50 %	253754668
599	NC_012926	TGG	2	6	27807	27812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754668
600	NC_012926	ACG	2	6	27836	27841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754668
601	NC_012926	ATT	2	6	27884	27889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754668
602	NC_012926	CAT	2	6	28168	28173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754668
603	NC_012926	GCGG	2	8	28282	28289	0 %	0 %	75 %	25 %	253754668
604	NC_012926	CAT	2	6	28312	28317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754668
605	NC_012926	CTT	2	6	28417	28422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754668
606	NC_012926	GAAA	2	8	28437	28444	75 %	0 %	25 %	0 %	253754668
607	NC_012926	GCA	2	6	28511	28516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754668
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609	NC_012926	TA	3	6	28603	28608	50 %	50 %	0 %	0 %	253754669
610	NC_012926	ATG	3	9	28756	28764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754669
611	NC_012926	TCA	2	6	28787	28792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754669
612	NC_012926	CTTGGC	2	12	28853	28864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754669
613	NC_012926	CT	3	6	28900	28905	0 %	50 %	0 %	50 %	253754669
614	NC_012926	T	6	6	28910	28915	0 %	100 %	0 %	0 %	253754669
615	NC_012926	CAA	2	6	29103	29108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754669
616	NC_012926	TGA	2	6	29177	29182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754669
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620	NC_012926	TGGG	2	8	29376	29383	0 %	25 %	75 %	0 %	253754670
621	NC_012926	TCAA	2	8	29415	29422	50 %	25 %	0 %	25 %	253754670
622	NC_012926	TGA	2	6	29464	29469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754670
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624	NC_012926	GAT	2	6	29543	29548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754670
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629	NC_012926	CTA	2	6	29733	29738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754670
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