MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 43489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012926	TTGG	2	8	216886	216893	0 %	50 %	50 %	0 %	253754840
4502	NC_012926	CTTC	2	8	216894	216901	0 %	50 %	0 %	50 %	253754840
4503	NC_012926	TCT	2	6	216951	216956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754840
4504	NC_012926	GACA	2	8	217015	217022	50 %	0 %	25 %	25 %	253754840
4505	NC_012926	T	6	6	217057	217062	0 %	100 %	0 %	0 %	253754840
4506	NC_012926	TGG	2	6	217082	217087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754840
4507	NC_012926	AG	3	6	217104	217109	50 %	0 %	50 %	0 %	253754840
4508	NC_012926	T	6	6	217125	217130	0 %	100 %	0 %	0 %	253754840
4509	NC_012926	T	7	7	217140	217146	0 %	100 %	0 %	0 %	253754840
4510	NC_012926	ATC	2	6	217150	217155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754840
4511	NC_012926	TCT	2	6	217184	217189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754840
4512	NC_012926	GCTT	2	8	217324	217331	0 %	50 %	25 %	25 %	253754840
4513	NC_012926	CAT	2	6	217462	217467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754840
4514	NC_012926	AGA	2	6	217577	217582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_012926	GGA	2	6	217681	217686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754841
4516	NC_012926	ATT	2	6	217841	217846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754841
4517	NC_012926	AGA	2	6	217908	217913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754841
4518	NC_012926	GTC	2	6	217951	217956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754841
4519	NC_012926	GAT	2	6	218043	218048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754841
4520	NC_012926	ATGAC	2	10	218078	218087	40 %	20 %	20 %	20 %	253754841
4521	NC_012926	CGG	2	6	218115	218120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253754841
4522	NC_012926	ATG	2	6	218255	218260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754841
4523	NC_012926	AAG	2	6	218405	218410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754841
4524	NC_012926	GAA	2	6	218569	218574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754841
4525	NC_012926	GAGT	2	8	218610	218617	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_012926	TAG	2	6	218618	218623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_012926	TTG	2	6	218628	218633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_012926	T	6	6	218653	218658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_012926	GTT	2	6	218684	218689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_012926	TTGAT	2	10	218693	218702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_012926	ATCTGC	2	12	218716	218727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_012926	TAA	2	6	218766	218771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_012926	ATTG	2	8	218795	218802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012926	TG	3	6	218801	218806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012926	TTTA	2	8	218841	218848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_012926	ATTTA	2	10	218877	218886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012926	AAT	2	6	218909	218914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_012926	CATC	2	8	218981	218988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_012926	AAG	2	6	219001	219006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754842
4540	NC_012926	GAT	2	6	219051	219056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754842
4541	NC_012926	AAG	3	9	219125	219133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754842
4542	NC_012926	ATG	2	6	219136	219141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754842
4543	NC_012926	AAAT	2	8	219218	219225	75 %	25 %	0 %	0 %	253754842
4544	NC_012926	GAC	3	9	219267	219275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754842
4545	NC_012926	AAC	2	6	219366	219371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754842
4546	NC_012926	GTT	2	6	219397	219402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754842
4547	NC_012926	TCA	2	6	219418	219423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754842
4548	NC_012926	AGC	2	6	219458	219463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754842
4549	NC_012926	ACA	2	6	219544	219549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754842
4550	NC_012926	ATG	2	6	219563	219568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754842
4551	NC_012926	AGC	2	6	219588	219593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754842
4552	NC_012926	CTT	2	6	219629	219634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754842
4553	NC_012926	AGCTC	2	10	219706	219715	20 %	20 %	20 %	40 %	253754842
4554	NC_012926	GGC	2	6	219729	219734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253754842
4555	NC_012926	CAT	2	6	219774	219779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754842
4556	NC_012926	GTA	2	6	219959	219964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_012926	GAAT	2	8	219973	219980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_012926	AGA	2	6	220132	220137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_012926	AAC	2	6	220138	220143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_012926	C	6	6	220149	220154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4561	NC_012926	AT	3	6	220189	220194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_012926	AAAATT	2	12	220273	220284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_012926	TTTA	2	8	220319	220326	25 %	75 %	0 %	0 %	253754843
4564	NC_012926	T	7	7	220364	220370	0 %	100 %	0 %	0 %	253754843
4565	NC_012926	TGT	2	6	220379	220384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754843
4566	NC_012926	TGA	2	6	220397	220402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754843
4567	NC_012926	GTC	2	6	220422	220427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754843
4568	NC_012926	TTG	2	6	220462	220467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754843
4569	NC_012926	T	6	6	220619	220624	0 %	100 %	0 %	0 %	253754843
4570	NC_012926	TCCACG	2	12	220819	220830	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253754843
4571	NC_012926	GTC	2	6	220833	220838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754843
4572	NC_012926	TCCT	2	8	220938	220945	0 %	50 %	0 %	50 %	253754843
4573	NC_012926	CAA	2	6	220964	220969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754843
4574	NC_012926	GTT	2	6	220998	221003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754843
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4576	NC_012926	TTC	2	6	221073	221078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754843
4577	NC_012926	AAAGTC	2	12	221079	221090	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253754843
4578	NC_012926	ATG	2	6	221092	221097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754843
4579	NC_012926	GTG	2	6	221133	221138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754843
4580	NC_012926	TGG	3	9	221201	221209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754843
4581	NC_012926	TCA	2	6	221264	221269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754843
4582	NC_012926	CGGT	2	8	221296	221303	0 %	25 %	50 %	25 %	253754843
4583	NC_012926	TCT	2	6	221335	221340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754843
4584	NC_012926	TAA	2	6	221366	221371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754843
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4586	NC_012926	TTC	2	6	221430	221435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754843
4587	NC_012926	GTA	2	6	221493	221498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754843
4588	NC_012926	CCA	2	6	221533	221538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754843
4589	NC_012926	CAGT	2	8	221551	221558	25 %	25 %	25 %	25 %	253754843
4590	NC_012926	TTC	2	6	221703	221708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754843
4591	NC_012926	AAT	2	6	221850	221855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754843
4592	NC_012926	AAC	2	6	221919	221924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754843
4593	NC_012926	CT	4	8	221950	221957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_012926	CTT	2	6	221971	221976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_012926	AGG	2	6	221991	221996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_012926	CCT	2	6	222014	222019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_012926	TGGT	2	8	222111	222118	0 %	50 %	50 %	0 %	253754844
4598	NC_012926	CAG	2	6	222148	222153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754844
4599	NC_012926	TGA	2	6	222157	222162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754844
4600	NC_012926	TCCAA	2	10	222243	222252	40 %	20 %	0 %	40 %	253754844
4601	NC_012926	AGC	2	6	222482	222487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754844
4602	NC_012926	CAA	2	6	222496	222501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754844
4603	NC_012926	CTT	2	6	222523	222528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754844
4604	NC_012926	TCT	2	6	222537	222542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754844
4605	NC_012926	T	7	7	222542	222548	0 %	100 %	0 %	0 %	253754844
4606	NC_012926	ACA	2	6	222594	222599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754844
4607	NC_012926	CAA	2	6	222604	222609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754844
4608	NC_012926	ACC	2	6	222668	222673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754844
4609	NC_012926	GCT	2	6	222687	222692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754844
4610	NC_012926	AG	3	6	222710	222715	50 %	0 %	50 %	0 %	253754844
4611	NC_012926	AGC	2	6	222743	222748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754844
4612	NC_012926	TTG	2	6	222820	222825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754844
4613	NC_012926	ACC	2	6	222938	222943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754844
4614	NC_012926	CAAT	2	8	222952	222959	50 %	25 %	0 %	25 %	253754844
4615	NC_012926	GAT	2	6	223136	223141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754844
4616	NC_012926	GAA	2	6	223147	223152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754844
4617	NC_012926	AAC	2	6	223193	223198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754844
4618	NC_012926	AGA	2	6	223207	223212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754844
4619	NC_012926	AGG	2	6	223242	223247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754844
4620	NC_012926	TGC	2	6	223328	223333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754844
4621	NC_012926	GAG	2	6	223369	223374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754844
4622	NC_012926	AAG	2	6	223458	223463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754844
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4624	NC_012926	CTT	2	6	223753	223758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754844
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4742	NC_012926	ATCAA	2	10	229529	229538	60 %	20 %	0 %	20 %	253754850
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4746	NC_012926	ACTT	2	8	229615	229622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4747	NC_012926	ATT	2	6	229628	229633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4995	NC_012926	ACC	2	6	241866	241871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754861
4996	NC_012926	CA	3	6	241965	241970	50 %	0 %	0 %	50 %	253754861
4997	NC_012926	T	6	6	241981	241986	0 %	100 %	0 %	0 %	253754861
4998	NC_012926	GCA	2	6	241993	241998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754861
4999	NC_012926	GCG	2	6	242130	242135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253754861
5000	NC_012926	CCA	2	6	242150	242155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754861

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