MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_012924	TAG	2	6	194783	194788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751103
4003	NC_012924	TGG	2	6	194845	194850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751103
4004	NC_012924	ATG	2	6	194852	194857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751103
4005	NC_012924	AAC	2	6	194901	194906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751103
4006	NC_012924	ATTC	2	8	194956	194963	25 %	50 %	0 %	25 %	253751103
4007	NC_012924	GGA	2	6	194982	194987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751103
4008	NC_012924	CAG	2	6	195008	195013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751103
4009	NC_012924	TTC	2	6	195016	195021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751103
4010	NC_012924	CAG	2	6	195107	195112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751103
4011	NC_012924	GCT	2	6	195126	195131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751103
4012	NC_012924	GAA	2	6	195188	195193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751103
4013	NC_012924	ATT	2	6	195260	195265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751103
4014	NC_012924	TGAT	2	8	195338	195345	25 %	50 %	25 %	0 %	253751103
4015	NC_012924	TGA	2	6	195384	195389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751103
4016	NC_012924	TGA	2	6	195398	195403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751103
4017	NC_012924	AAAATC	2	12	195421	195432	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	253751104
4018	NC_012924	GTT	2	6	195437	195442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751104
4019	NC_012924	TGA	2	6	195452	195457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751104
4020	NC_012924	TTGATT	2	12	195491	195502	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	253751104
4021	NC_012924	T	6	6	195526	195531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_012924	AAACG	2	10	195632	195641	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_012924	GTTG	2	8	195670	195677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012924	T	7	7	195681	195687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_012924	TGC	2	6	195739	195744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751105
4026	NC_012924	AT	3	6	195762	195767	50 %	50 %	0 %	0 %	253751105
4027	NC_012924	ATT	2	6	195793	195798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751105
4028	NC_012924	ATTG	2	8	195819	195826	25 %	50 %	25 %	0 %	253751105
4029	NC_012924	CAA	2	6	195828	195833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751105
4030	NC_012924	ATT	2	6	195835	195840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751105
4031	NC_012924	TAA	2	6	195868	195873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751105
4032	NC_012924	TAA	2	6	195882	195887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751105
4033	NC_012924	T	8	8	195891	195898	0 %	100 %	0 %	0 %	253751105
4034	NC_012924	A	6	6	195938	195943	100 %	0 %	0 %	0 %	253751105
4035	NC_012924	T	6	6	195960	195965	0 %	100 %	0 %	0 %	253751105
4036	NC_012924	AAT	2	6	195967	195972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751105
4037	NC_012924	ACA	2	6	196004	196009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751105
4038	NC_012924	TCT	2	6	196022	196027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751105
4039	NC_012924	ATT	2	6	196087	196092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751105
4040	NC_012924	AAG	2	6	196149	196154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751105
4041	NC_012924	ACT	2	6	196169	196174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751105
4042	NC_012924	TC	3	6	196185	196190	0 %	50 %	0 %	50 %	253751105
4043	NC_012924	TTTTG	2	10	196203	196212	0 %	80 %	20 %	0 %	253751105
4044	NC_012924	A	6	6	196231	196236	100 %	0 %	0 %	0 %	253751105
4045	NC_012924	GAACA	2	10	196238	196247	60 %	0 %	20 %	20 %	253751105
4046	NC_012924	AATA	2	8	196264	196271	75 %	25 %	0 %	0 %	253751105
4047	NC_012924	AAAT	2	8	196388	196395	75 %	25 %	0 %	0 %	253751105
4048	NC_012924	ATT	2	6	196405	196410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751105
4049	NC_012924	ATA	2	6	196415	196420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751105
4050	NC_012924	ATT	2	6	196520	196525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751105
4051	NC_012924	ATTT	2	8	196528	196535	25 %	75 %	0 %	0 %	253751105
4052	NC_012924	TAA	2	6	196668	196673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751105
4053	NC_012924	GTC	2	6	196674	196679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751105
4054	NC_012924	TAC	2	6	196680	196685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751105
4055	NC_012924	T	8	8	196732	196739	0 %	100 %	0 %	0 %	253751105
4056	NC_012924	T	6	6	196818	196823	0 %	100 %	0 %	0 %	253751105
4057	NC_012924	TAAA	2	8	196830	196837	75 %	25 %	0 %	0 %	253751105
4058	NC_012924	AT	3	6	196845	196850	50 %	50 %	0 %	0 %	253751105
4059	NC_012924	TCT	2	6	196874	196879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751105
4060	NC_012924	T	7	7	196879	196885	0 %	100 %	0 %	0 %	253751105
4061	NC_012924	T	6	6	196941	196946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012924	A	6	6	196949	196954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012924	AAAT	3	12	196974	196985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012924	T	6	6	196990	196995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012924	TAAA	2	8	197008	197015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012924	AAAAT	2	10	197056	197065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_012924	GGA	2	6	197070	197075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012924	AATG	2	8	197082	197089	50 %	25 %	25 %	0 %	253751106
4069	NC_012924	ATG	2	6	197179	197184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751106
4070	NC_012924	TTC	2	6	197212	197217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751106
4071	NC_012924	AGT	2	6	197262	197267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751106
4072	NC_012924	TTG	2	6	197290	197295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751106
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4074	NC_012924	TC	4	8	197336	197343	0 %	50 %	0 %	50 %	253751106
4075	NC_012924	ATC	2	6	197421	197426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751106
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4077	NC_012924	CAA	2	6	197453	197458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751106
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4080	NC_012924	AAC	2	6	197676	197681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751106
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4082	NC_012924	TTG	2	6	197813	197818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751106
4083	NC_012924	TGG	2	6	197856	197861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751106
4084	NC_012924	GCC	2	6	197926	197931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253751106
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4088	NC_012924	TTAATA	2	12	198095	198106	50 %	50 %	0 %	0 %	253751106
4089	NC_012924	TAT	2	6	198144	198149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751106
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4094	NC_012924	G	6	6	198271	198276	0 %	0 %	100 %	0 %	253751106
4095	NC_012924	GGC	2	6	198289	198294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751106
4096	NC_012924	ATT	2	6	198319	198324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751106
4097	NC_012924	TCAT	2	8	198337	198344	25 %	50 %	0 %	25 %	253751106
4098	NC_012924	TATT	2	8	198345	198352	25 %	75 %	0 %	0 %	253751106
4099	NC_012924	ATA	2	6	198374	198379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751106
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4101	NC_012924	TTTTGA	2	12	198499	198510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	253751107
4102	NC_012924	AAT	2	6	198572	198577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751107
4103	NC_012924	TGAAA	2	10	198592	198601	60 %	20 %	20 %	0 %	253751107
4104	NC_012924	ACTG	2	8	198734	198741	25 %	25 %	25 %	25 %	253751107
4105	NC_012924	GAG	2	6	198789	198794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751107
4106	NC_012924	T	6	6	198872	198877	0 %	100 %	0 %	0 %	253751107
4107	NC_012924	AGA	2	6	198949	198954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751107
4108	NC_012924	CAA	2	6	198974	198979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751107
4109	NC_012924	GAA	2	6	198998	199003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751107
4110	NC_012924	CAT	2	6	199025	199030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751107
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4112	NC_012924	ACTA	2	8	199174	199181	50 %	25 %	0 %	25 %	253751107
4113	NC_012924	TG	3	6	199218	199223	0 %	50 %	50 %	0 %	253751107
4114	NC_012924	AAGGA	2	10	199244	199253	60 %	0 %	40 %	0 %	253751107
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4122	NC_012924	ATTT	2	8	199617	199624	25 %	75 %	0 %	0 %	253751107
4123	NC_012924	AT	3	6	199702	199707	50 %	50 %	0 %	0 %	253751107
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4125	NC_012924	A	6	6	199748	199753	100 %	0 %	0 %	0 %	253751107
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4242	NC_012924	T	6	6	204953	204958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4244	NC_012924	AAGTT	2	10	205013	205022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4247	NC_012924	T	6	6	205107	205112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_012924	TGA	2	6	205199	205204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751110
4252	NC_012924	TGG	2	6	205207	205212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751110
4253	NC_012924	TTTGG	2	10	205260	205269	0 %	60 %	40 %	0 %	253751110
4254	NC_012924	TTA	2	6	205276	205281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751110
4255	NC_012924	AT	3	6	205313	205318	50 %	50 %	0 %	0 %	253751110
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4277	NC_012924	TTGA	2	8	206430	206437	25 %	50 %	25 %	0 %	253751111
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4280	NC_012924	A	7	7	206602	206608	100 %	0 %	0 %	0 %	253751111
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4282	NC_012924	A	6	6	206665	206670	100 %	0 %	0 %	0 %	253751111
4283	NC_012924	ATT	2	6	206684	206689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_012924	AT	3	6	206713	206718	50 %	50 %	0 %	0 %	253751112
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4322	NC_012924	GA	3	6	208702	208707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4327	NC_012924	A	6	6	208919	208924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4335	NC_012924	ATA	2	6	209618	209623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4336	NC_012924	TGA	2	6	209644	209649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4347	NC_012924	GACA	2	8	210141	210148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4375	NC_012924	ATGA	2	8	211596	211603	50 %	25 %	25 %	0 %	253751114
4376	NC_012924	CTGG	2	8	211887	211894	0 %	25 %	50 %	25 %	253751114
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4380	NC_012924	CCAA	2	8	212078	212085	50 %	0 %	0 %	50 %	253751114
4381	NC_012924	GAT	2	6	212112	212117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751114
4382	NC_012924	ATC	2	6	212136	212141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751114
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4384	NC_012924	TGG	2	6	212189	212194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751114
4385	NC_012924	ATTC	2	8	212213	212220	25 %	50 %	0 %	25 %	253751114
4386	NC_012924	AGG	2	6	212254	212259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751114
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4400	NC_012924	T	6	6	213101	213106	0 %	100 %	0 %	0 %	253751114
4401	NC_012924	GACCA	2	10	213156	213165	40 %	0 %	20 %	40 %	253751114
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4461	NC_012924	T	6	6	216330	216335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4462	NC_012924	GTT	2	6	216361	216366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4483	NC_012924	ATG	2	6	217294	217299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751118
4484	NC_012924	AGC	2	6	217319	217324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751118
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4490	NC_012924	GAAT	2	8	217704	217711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_012924	AGA	2	6	217863	217868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4492	NC_012924	AAC	2	6	217869	217874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4493	NC_012924	C	6	6	217880	217885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4494	NC_012924	AT	3	6	217920	217925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_012924	AAAATT	2	12	218004	218015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_012924	TTTA	2	8	218050	218057	25 %	75 %	0 %	0 %	253751119
4497	NC_012924	T	7	7	218095	218101	0 %	100 %	0 %	0 %	253751119
4498	NC_012924	TGT	2	6	218110	218115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751119
4499	NC_012924	TGA	2	6	218128	218133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751119
4500	NC_012924	GTC	2	6	218153	218158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751119

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