MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42003	NC_012924	A	6	6	2072745	2072750	100 %	0 %	0 %	0 %	253752801
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42119	NC_012924	TTG	2	6	2077974	2077979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752807
42120	NC_012924	CCTA	2	8	2078026	2078033	25 %	25 %	0 %	50 %	253752807
42121	NC_012924	T	6	6	2078059	2078064	0 %	100 %	0 %	0 %	253752807
42122	NC_012924	CTG	2	6	2078112	2078117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752808
42123	NC_012924	ACC	2	6	2078143	2078148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752808
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42125	NC_012924	GTA	2	6	2078189	2078194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752808
42126	NC_012924	CTT	2	6	2078205	2078210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752808
42127	NC_012924	TAG	3	9	2078214	2078222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752808
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42129	NC_012924	T	6	6	2078300	2078305	0 %	100 %	0 %	0 %	253752808
42130	NC_012924	CAA	2	6	2078352	2078357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752808
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42132	NC_012924	ACT	2	6	2078458	2078463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752808
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42134	NC_012924	GTA	2	6	2078504	2078509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752808
42135	NC_012924	ATA	2	6	2078564	2078569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752808
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42137	NC_012924	TTTACG	2	12	2078620	2078631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	253752808
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42142	NC_012924	AAAATC	2	12	2078800	2078811	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	253752808
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42145	NC_012924	CT	4	8	2078941	2078948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42146	NC_012924	TCA	2	6	2078954	2078959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42147	NC_012924	CGA	2	6	2079065	2079070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752809
42148	NC_012924	CT	3	6	2079076	2079081	0 %	50 %	0 %	50 %	253752809
42149	NC_012924	CAA	2	6	2079223	2079228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752809
42150	NC_012924	CAT	2	6	2079255	2079260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752809
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42154	NC_012924	ACA	2	6	2079435	2079440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752809
42155	NC_012924	GA	3	6	2079554	2079559	50 %	0 %	50 %	0 %	253752809
42156	NC_012924	GAT	2	6	2079705	2079710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752809
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42172	NC_012924	TA	3	6	2080439	2080444	50 %	50 %	0 %	0 %	253752810
42173	NC_012924	ATT	2	6	2080458	2080463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752810
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42188	NC_012924	A	6	6	2081075	2081080	100 %	0 %	0 %	0 %	253752810
42189	NC_012924	TCT	2	6	2081116	2081121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752810
42190	NC_012924	CTGA	2	8	2081126	2081133	25 %	25 %	25 %	25 %	253752810
42191	NC_012924	T	6	6	2081153	2081158	0 %	100 %	0 %	0 %	253752810
42192	NC_012924	A	6	6	2081224	2081229	100 %	0 %	0 %	0 %	253752810
42193	NC_012924	TCT	2	6	2081367	2081372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752810
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42195	NC_012924	CTCA	2	8	2081454	2081461	25 %	25 %	0 %	50 %	253752810
42196	NC_012924	ATA	2	6	2081598	2081603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42206	NC_012924	GAAA	2	8	2081974	2081981	75 %	0 %	25 %	0 %	253752811
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42211	NC_012924	CAAGC	2	10	2082309	2082318	40 %	0 %	20 %	40 %	253752812
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42220	NC_012924	CTTT	2	8	2082802	2082809	0 %	75 %	0 %	25 %	253752812
42221	NC_012924	GAAT	2	8	2082817	2082824	50 %	25 %	25 %	0 %	253752812
42222	NC_012924	TGA	2	6	2082892	2082897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752812
42223	NC_012924	AAG	2	6	2082898	2082903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752812
42224	NC_012924	GAT	2	6	2082933	2082938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752812
42225	NC_012924	TGAG	2	8	2082943	2082950	25 %	25 %	50 %	0 %	253752812
42226	NC_012924	ATA	2	6	2082955	2082960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752812
42227	NC_012924	TCAAA	2	10	2082965	2082974	60 %	20 %	0 %	20 %	253752812
42228	NC_012924	TTA	2	6	2083009	2083014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752812
42229	NC_012924	A	6	6	2083135	2083140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42230	NC_012924	A	6	6	2083195	2083200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42231	NC_012924	GAA	2	6	2083203	2083208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42232	NC_012924	TTA	2	6	2083228	2083233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42233	NC_012924	T	7	7	2083272	2083278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42234	NC_012924	A	7	7	2083294	2083300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42235	NC_012924	GAA	2	6	2083305	2083310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42236	NC_012924	TTC	2	6	2083331	2083336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42237	NC_012924	TTGTTT	2	12	2083364	2083375	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	253752813
42238	NC_012924	ACTGA	2	10	2083377	2083386	40 %	20 %	20 %	20 %	253752813
42239	NC_012924	CTTT	2	8	2083430	2083437	0 %	75 %	0 %	25 %	253752813
42240	NC_012924	CCA	2	6	2083529	2083534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752813
42241	NC_012924	TTG	2	6	2083607	2083612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752813
42242	NC_012924	TCA	2	6	2083736	2083741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752813
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42245	NC_012924	CAT	2	6	2083872	2083877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752813
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42250	NC_012924	TCA	2	6	2084279	2084284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752813
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42262	NC_012924	TTC	2	6	2084858	2084863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42263	NC_012924	ATT	2	6	2084942	2084947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42264	NC_012924	ATC	2	6	2084957	2084962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42265	NC_012924	GTTT	2	8	2085014	2085021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42266	NC_012924	T	6	6	2085019	2085024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42267	NC_012924	CGT	2	6	2085029	2085034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42268	NC_012924	A	7	7	2085045	2085051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42269	NC_012924	GCA	2	6	2085140	2085145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752814
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42282	NC_012924	TTAT	2	8	2086250	2086257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42283	NC_012924	TTGT	2	8	2086295	2086302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42284	NC_012924	ACCA	2	8	2086307	2086314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42285	NC_012924	CT	3	6	2086319	2086324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42286	NC_012924	TAC	2	6	2086339	2086344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42289	NC_012924	TAT	2	6	2086361	2086366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42290	NC_012924	A	6	6	2086373	2086378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42291	NC_012924	ATA	2	6	2086427	2086432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42316	NC_012924	TCGCT	2	10	2087426	2087435	0 %	40 %	20 %	40 %	253752816
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42323	NC_012924	TGA	2	6	2087731	2087736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752816
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42341	NC_012924	CTT	2	6	2088652	2088657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752816
42342	NC_012924	TGA	2	6	2088691	2088696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752816
42343	NC_012924	TGT	2	6	2088747	2088752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752816
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42346	NC_012924	CCAA	2	8	2088797	2088804	50 %	0 %	0 %	50 %	253752816
42347	NC_012924	ACTTGG	2	12	2088807	2088818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253752816
42348	NC_012924	CAT	2	6	2088865	2088870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752816
42349	NC_012924	GCCA	2	8	2088875	2088882	25 %	0 %	25 %	50 %	253752816
42350	NC_012924	ATC	2	6	2088917	2088922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752816
42351	NC_012924	CGA	2	6	2088955	2088960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752816
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42353	NC_012924	ATA	2	6	2089024	2089029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752816
42354	NC_012924	CT	3	6	2089056	2089061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42355	NC_012924	CAA	2	6	2089253	2089258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42356	NC_012924	TTG	2	6	2089273	2089278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42357	NC_012924	T	6	6	2089287	2089292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42358	NC_012924	CTTTT	2	10	2089318	2089327	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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42420	NC_012924	TTTG	2	8	2092167	2092174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42421	NC_012924	T	6	6	2092183	2092188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42422	NC_012924	T	6	6	2092191	2092196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42423	NC_012924	TAAAA	2	10	2092226	2092235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42424	NC_012924	CTG	2	6	2092305	2092310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42452	NC_012924	T	6	6	2093375	2093380	0 %	100 %	0 %	0 %	253752819
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42458	NC_012924	AAGA	2	8	2093639	2093646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42459	NC_012924	A	6	6	2093696	2093701	100 %	0 %	0 %	0 %	253752820
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