MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27003	NC_012924	TAT	2	6	1314925	1314930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752092
27004	NC_012924	ATG	2	6	1314967	1314972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752092
27005	NC_012924	ACT	2	6	1314999	1315004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752092
27006	NC_012924	TGA	2	6	1315251	1315256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752092
27007	NC_012924	A	6	6	1315262	1315267	100 %	0 %	0 %	0 %	253752092
27008	NC_012924	GGTT	2	8	1315305	1315312	0 %	50 %	50 %	0 %	253752092
27009	NC_012924	AACTGA	2	12	1315335	1315346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253752092
27010	NC_012924	TAT	2	6	1315347	1315352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752092
27011	NC_012924	TGAAA	2	10	1315368	1315377	60 %	20 %	20 %	0 %	253752092
27012	NC_012924	CAA	2	6	1315457	1315462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752092
27013	NC_012924	CTGTCG	2	12	1315541	1315552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752092
27014	NC_012924	A	6	6	1315570	1315575	100 %	0 %	0 %	0 %	253752092
27015	NC_012924	CTG	2	6	1315640	1315645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752092
27016	NC_012924	CGCT	2	8	1315662	1315669	0 %	25 %	25 %	50 %	253752092
27017	NC_012924	ACC	2	6	1315706	1315711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752092
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27019	NC_012924	GTTAC	2	10	1315859	1315868	20 %	40 %	20 %	20 %	253752092
27020	NC_012924	A	6	6	1315928	1315933	100 %	0 %	0 %	0 %	253752092
27021	NC_012924	CCT	2	6	1315937	1315942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27022	NC_012924	AGG	2	6	1315953	1315958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27023	NC_012924	ACCGTA	2	12	1315989	1316000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253752093
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27028	NC_012924	CATT	2	8	1316417	1316424	25 %	50 %	0 %	25 %	253752093
27029	NC_012924	TCA	2	6	1316425	1316430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752093
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27046	NC_012924	TTTA	2	8	1317113	1317120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27047	NC_012924	CCAT	2	8	1317184	1317191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27050	NC_012924	CAA	2	6	1317329	1317334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27051	NC_012924	A	7	7	1317369	1317375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27052	NC_012924	AGG	2	6	1317416	1317421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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27054	NC_012924	TTTC	2	8	1317542	1317549	0 %	75 %	0 %	25 %	253752094
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27068	NC_012924	TATG	2	8	1318186	1318193	25 %	50 %	25 %	0 %	253752094
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27119	NC_012924	TTA	2	6	1320354	1320359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752097
27120	NC_012924	GAC	2	6	1320386	1320391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752097
27121	NC_012924	TCAA	2	8	1320510	1320517	50 %	25 %	0 %	25 %	253752097
27122	NC_012924	GAC	2	6	1320682	1320687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752097
27123	NC_012924	TCT	2	6	1320732	1320737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752097
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27130	NC_012924	TCT	2	6	1321131	1321136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752097
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27148	NC_012924	TAT	2	6	1322536	1322541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27149	NC_012924	ATGG	2	8	1322545	1322552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27150	NC_012924	AG	3	6	1322571	1322576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27151	NC_012924	CAGT	2	8	1322596	1322603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27152	NC_012924	ATA	2	6	1322624	1322629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752098
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27220	NC_012924	CTGAGC	2	12	1326642	1326653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253752099
27221	NC_012924	TCTG	2	8	1326679	1326686	0 %	50 %	25 %	25 %	253752099
27222	NC_012924	CTGA	2	8	1326692	1326699	25 %	25 %	25 %	25 %	253752099
27223	NC_012924	GTT	2	6	1326713	1326718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752099
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27225	NC_012924	TCT	2	6	1326748	1326753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752099
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27231	NC_012924	CAT	2	6	1327362	1327367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752099
27232	NC_012924	A	6	6	1327384	1327389	100 %	0 %	0 %	0 %	253752099
27233	NC_012924	GAA	2	6	1327399	1327404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752099
27234	NC_012924	GCAAA	2	10	1327676	1327685	60 %	0 %	20 %	20 %	253752100
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27236	NC_012924	ATT	2	6	1327760	1327765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752100
27237	NC_012924	CCT	2	6	1327798	1327803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752100
27238	NC_012924	CTG	2	6	1327831	1327836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752100
27239	NC_012924	CAT	2	6	1327903	1327908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752100
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27243	NC_012924	CAT	2	6	1328089	1328094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752100
27244	NC_012924	GTA	2	6	1328123	1328128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752100
27245	NC_012924	CTT	2	6	1328173	1328178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27247	NC_012924	TTA	2	6	1328207	1328212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27248	NC_012924	GCC	2	6	1328271	1328276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752101
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27259	NC_012924	TTTA	2	8	1328679	1328686	25 %	75 %	0 %	0 %	253752102
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27265	NC_012924	A	7	7	1329211	1329217	100 %	0 %	0 %	0 %	253752103
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27322	NC_012924	TATT	2	8	1332022	1332029	25 %	75 %	0 %	0 %	253752104
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27341	NC_012924	TACCT	2	10	1332841	1332850	20 %	40 %	0 %	40 %	253752104
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27343	NC_012924	CAT	2	6	1333096	1333101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752104
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27345	NC_012924	AGTA	2	8	1333188	1333195	50 %	25 %	25 %	0 %	253752104
27346	NC_012924	TCT	2	6	1333217	1333222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752104
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27348	NC_012924	AATT	2	8	1333342	1333349	50 %	50 %	0 %	0 %	253752104
27349	NC_012924	GAA	2	6	1333380	1333385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752104
27350	NC_012924	TCAA	2	8	1333391	1333398	50 %	25 %	0 %	25 %	253752104
27351	NC_012924	C	6	6	1333415	1333420	0 %	0 %	0 %	100 %	253752104
27352	NC_012924	T	6	6	1333450	1333455	0 %	100 %	0 %	0 %	253752104
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27471	NC_012924	AAG	2	6	1340579	1340584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752111
27472	NC_012924	CCA	2	6	1340587	1340592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752111
27473	NC_012924	ACC	2	6	1340633	1340638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752111
27474	NC_012924	GTAAG	2	10	1340782	1340791	40 %	20 %	40 %	0 %	253752111
27475	NC_012924	A	6	6	1340797	1340802	100 %	0 %	0 %	0 %	253752111
27476	NC_012924	ACC	2	6	1340822	1340827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752111
27477	NC_012924	CAT	2	6	1340861	1340866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752111
27478	NC_012924	ATA	2	6	1340957	1340962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752111
27479	NC_012924	CCAA	2	8	1341055	1341062	50 %	0 %	0 %	50 %	253752111
27480	NC_012924	ACT	2	6	1341089	1341094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752111
27481	NC_012924	CGT	2	6	1341097	1341102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752111
27482	NC_012924	TCC	2	6	1341115	1341120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752112
27483	NC_012924	CCGCT	2	10	1341155	1341164	0 %	20 %	20 %	60 %	253752112
27484	NC_012924	CAC	2	6	1341174	1341179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752112
27485	NC_012924	AAAG	2	8	1341205	1341212	75 %	0 %	25 %	0 %	253752112
27486	NC_012924	AGC	2	6	1341216	1341221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752112
27487	NC_012924	CTG	2	6	1341279	1341284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752112
27488	NC_012924	CCTG	2	8	1341413	1341420	0 %	25 %	25 %	50 %	253752112
27489	NC_012924	AAC	2	6	1341588	1341593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752112
27490	NC_012924	CGCATC	2	12	1341594	1341605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253752112
27491	NC_012924	TC	3	6	1341625	1341630	0 %	50 %	0 %	50 %	253752112
27492	NC_012924	TCTG	2	8	1341758	1341765	0 %	50 %	25 %	25 %	253752113
27493	NC_012924	AAT	2	6	1341807	1341812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752113
27494	NC_012924	CCAT	2	8	1341824	1341831	25 %	25 %	0 %	50 %	253752113
27495	NC_012924	ACC	2	6	1341865	1341870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752113
27496	NC_012924	TGG	2	6	1341900	1341905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752113
27497	NC_012924	CCA	2	6	1342014	1342019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752113
27498	NC_012924	TTC	2	6	1342081	1342086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752113
27499	NC_012924	TCC	2	6	1342100	1342105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752113
27500	NC_012924	CAG	2	6	1342162	1342167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752113

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