MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012924	T	6	6	47639	47644	0 %	100 %	0 %	0 %	253750959
1002	NC_012924	ACA	2	6	47656	47661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750959
1003	NC_012924	CAC	2	6	47666	47671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253750959
1004	NC_012924	TGT	2	6	47691	47696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750959
1005	NC_012924	GTA	2	6	47752	47757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750959
1006	NC_012924	GCTT	2	8	47874	47881	0 %	50 %	25 %	25 %	253750960
1007	NC_012924	CCTA	2	8	47960	47967	25 %	25 %	0 %	50 %	253750960
1008	NC_012924	TAT	2	6	47973	47978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750960
1009	NC_012924	GAAGT	2	10	48055	48064	40 %	20 %	40 %	0 %	253750960
1010	NC_012924	TGA	2	6	48132	48137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750960
1011	NC_012924	TAT	2	6	48153	48158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750960
1012	NC_012924	GAA	2	6	48169	48174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750960
1013	NC_012924	TTATC	2	10	48186	48195	20 %	60 %	0 %	20 %	253750960
1014	NC_012924	GCTA	2	8	48228	48235	25 %	25 %	25 %	25 %	253750960
1015	NC_012924	TC	3	6	48247	48252	0 %	50 %	0 %	50 %	253750960
1016	NC_012924	TTG	2	6	48265	48270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750960
1017	NC_012924	ATT	2	6	48278	48283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750960
1018	NC_012924	TAATC	2	10	48294	48303	40 %	40 %	0 %	20 %	253750960
1019	NC_012924	GGA	2	6	48370	48375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750960
1020	NC_012924	ATG	2	6	48429	48434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750961
1021	NC_012924	TAT	2	6	48445	48450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750961
1022	NC_012924	TC	3	6	48503	48508	0 %	50 %	0 %	50 %	253750961
1023	NC_012924	TTG	3	9	48522	48530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750961
1024	NC_012924	TCAAT	2	10	48553	48562	40 %	40 %	0 %	20 %	253750961
1025	NC_012924	CAG	2	6	48604	48609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750961
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1027	NC_012924	GAT	2	6	48711	48716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750961
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1029	NC_012924	TAT	2	6	48783	48788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750961
1030	NC_012924	TTATT	2	10	48806	48815	20 %	80 %	0 %	0 %	253750961
1031	NC_012924	CAG	2	6	48816	48821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750961
1032	NC_012924	AAGA	2	8	48831	48838	75 %	0 %	25 %	0 %	253750961
1033	NC_012924	ATCA	2	8	48862	48869	50 %	25 %	0 %	25 %	253750962
1034	NC_012924	TTG	2	6	48944	48949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750962
1035	NC_012924	A	6	6	48960	48965	100 %	0 %	0 %	0 %	253750962
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1037	NC_012924	A	6	6	49162	49167	100 %	0 %	0 %	0 %	253750962
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1039	NC_012924	ATTG	2	8	49356	49363	25 %	50 %	25 %	0 %	253750962
1040	NC_012924	GT	3	6	49646	49651	0 %	50 %	50 %	0 %	253750962
1041	NC_012924	ATTG	2	8	49665	49672	25 %	50 %	25 %	0 %	253750962
1042	NC_012924	GAAA	2	8	49701	49708	75 %	0 %	25 %	0 %	253750962
1043	NC_012924	TTTA	2	8	49815	49822	25 %	75 %	0 %	0 %	253750963
1044	NC_012924	TTG	2	6	49894	49899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750963
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1046	NC_012924	CAG	2	6	49924	49929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750963
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1053	NC_012924	GAT	3	9	50318	50326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750963
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1055	NC_012924	GCGA	2	8	50385	50392	25 %	0 %	50 %	25 %	253750963
1056	NC_012924	GCTT	2	8	50405	50412	0 %	50 %	25 %	25 %	253750963
1057	NC_012924	ATT	2	6	50436	50441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750963
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1060	NC_012924	TCG	2	6	50514	50519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750964
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1063	NC_012924	GTA	2	6	50748	50753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750964
1064	NC_012924	CAA	2	6	50771	50776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750964
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1069	NC_012924	TGA	2	6	50910	50915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750964
1070	NC_012924	ATTT	2	8	50939	50946	25 %	75 %	0 %	0 %	253750964
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1077	NC_012924	TAG	2	6	51235	51240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750964
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1079	NC_012924	TGA	2	6	51303	51308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750964
1080	NC_012924	ATG	2	6	51341	51346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750964
1081	NC_012924	TGAT	2	8	51351	51358	25 %	50 %	25 %	0 %	253750964
1082	NC_012924	TGC	2	6	51373	51378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750964
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1084	NC_012924	GTTG	2	8	51469	51476	0 %	50 %	50 %	0 %	253750964
1085	NC_012924	CTA	2	6	51480	51485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750964
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1087	NC_012924	TGA	2	6	51624	51629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750964
1088	NC_012924	CAA	2	6	51668	51673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750964
1089	NC_012924	GATT	2	8	51708	51715	25 %	50 %	25 %	0 %	253750964
1090	NC_012924	CT	3	6	51738	51743	0 %	50 %	0 %	50 %	253750964
1091	NC_012924	TAG	2	6	51843	51848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750964
1092	NC_012924	AAC	2	6	51915	51920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750964
1093	NC_012924	ATTT	2	8	51959	51966	25 %	75 %	0 %	0 %	253750964
1094	NC_012924	TCA	2	6	52141	52146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750964
1095	NC_012924	CAG	2	6	52148	52153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750964
1096	NC_012924	GA	3	6	52160	52165	50 %	0 %	50 %	0 %	253750964
1097	NC_012924	ATC	2	6	52167	52172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750964
1098	NC_012924	GACC	2	8	52230	52237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_012924	AGTCTA	2	12	52238	52249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1100	NC_012924	TAA	3	9	52258	52266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012924	TGA	2	6	52277	52282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012924	ATAG	2	8	52298	52305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012924	GAGAA	2	10	52306	52315	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012924	AAAC	2	8	52318	52325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_012924	GGA	2	6	52345	52350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012924	AG	3	6	52357	52362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012924	GAA	2	6	52384	52389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012924	AT	3	6	52401	52406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012924	GAA	2	6	52440	52445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012924	GAG	2	6	52480	52485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012924	GAAT	2	8	52538	52545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012924	TA	3	6	52716	52721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012924	TGA	2	6	52929	52934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750965
1114	NC_012924	ACC	2	6	52981	52986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253750965
1115	NC_012924	TGG	2	6	53066	53071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750965
1116	NC_012924	GAG	2	6	53143	53148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750965
1117	NC_012924	CAT	2	6	53184	53189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750965
1118	NC_012924	GCC	2	6	53232	53237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253750965
1119	NC_012924	CGG	2	6	53363	53368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253750965
1120	NC_012924	GCT	2	6	53398	53403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750965
1121	NC_012924	TCG	2	6	53415	53420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750965
1122	NC_012924	AGA	2	6	53573	53578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750965
1123	NC_012924	GAG	2	6	53650	53655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750965
1124	NC_012924	GGA	2	6	53667	53672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750965
1125	NC_012924	CAG	2	6	53695	53700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750965
1126	NC_012924	GCGGAC	2	12	53712	53723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253750965
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1128	NC_012924	AGC	2	6	53804	53809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750966
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1259	NC_012924	GGA	2	6	61238	61243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750974
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1262	NC_012924	TATT	2	8	61371	61378	25 %	75 %	0 %	0 %	253750974
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