MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012924	GTG	2	6	23990	23995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750940
502	NC_012924	TGG	2	6	24024	24029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750940
503	NC_012924	CGG	2	6	24065	24070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253750940
504	NC_012924	ATG	2	6	24164	24169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750940
505	NC_012924	TGA	2	6	24210	24215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750940
506	NC_012924	TGT	2	6	24234	24239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750940
507	NC_012924	CAAA	2	8	24388	24395	75 %	0 %	0 %	25 %	253750940
508	NC_012924	TTTAT	2	10	24440	24449	20 %	80 %	0 %	0 %	253750941
509	NC_012924	GGTC	2	8	24486	24493	0 %	25 %	50 %	25 %	253750941
510	NC_012924	ATT	2	6	24496	24501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750941
511	NC_012924	T	6	6	24537	24542	0 %	100 %	0 %	0 %	253750941
512	NC_012924	ATT	2	6	24571	24576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750941
513	NC_012924	CTA	2	6	24636	24641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750941
514	NC_012924	TCT	2	6	24675	24680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750941
515	NC_012924	TAG	2	6	24726	24731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750941
516	NC_012924	TTA	2	6	24750	24755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750941
517	NC_012924	TAA	2	6	24814	24819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750941
518	NC_012924	ATT	2	6	24871	24876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750941
519	NC_012924	AACA	2	8	24895	24902	75 %	0 %	0 %	25 %	253750941
520	NC_012924	TAA	2	6	24916	24921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012924	T	7	7	24943	24949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012924	GA	3	6	24958	24963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012924	GAG	2	6	24977	24982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012924	GAA	2	6	24997	25002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750942
525	NC_012924	A	7	7	25001	25007	100 %	0 %	0 %	0 %	253750942
526	NC_012924	TCTA	2	8	25039	25046	25 %	50 %	0 %	25 %	253750942
527	NC_012924	ATG	2	6	25077	25082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750942
528	NC_012924	CAA	2	6	25098	25103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750942
529	NC_012924	A	6	6	25102	25107	100 %	0 %	0 %	0 %	253750942
530	NC_012924	CAA	2	6	25133	25138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750942
531	NC_012924	CAA	3	9	25148	25156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750942
532	NC_012924	AGA	2	6	25213	25218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750942
533	NC_012924	GGC	2	6	25252	25257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253750942
534	NC_012924	ATCA	2	8	25378	25385	50 %	25 %	0 %	25 %	253750942
535	NC_012924	AATGC	2	10	25406	25415	40 %	20 %	20 %	20 %	253750942
536	NC_012924	ATT	2	6	25421	25426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750942
537	NC_012924	TAA	2	6	25432	25437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750942
538	NC_012924	AAC	2	6	25449	25454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750942
539	NC_012924	TTG	2	6	25476	25481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750942
540	NC_012924	ACT	2	6	25511	25516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750942
541	NC_012924	GCT	2	6	25586	25591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750942
542	NC_012924	CTG	2	6	25620	25625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750942
543	NC_012924	TTG	2	6	25643	25648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750942
544	NC_012924	AGA	2	6	25666	25671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750942
545	NC_012924	AGC	2	6	25672	25677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750942
546	NC_012924	CAA	2	6	25736	25741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750942
547	NC_012924	TAG	2	6	25776	25781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750942
548	NC_012924	CAT	2	6	25866	25871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750942
549	NC_012924	GCA	2	6	25892	25897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750942
550	NC_012924	AAT	2	6	25898	25903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750942
551	NC_012924	GGT	2	6	26078	26083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750942
552	NC_012924	TAT	2	6	26084	26089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750942
553	NC_012924	GTT	2	6	26102	26107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750942
554	NC_012924	CAA	2	6	26124	26129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750942
555	NC_012924	GTT	2	6	26138	26143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750942
556	NC_012924	GTC	2	6	26160	26165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750942
557	NC_012924	GTG	2	6	26184	26189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750942
558	NC_012924	CAA	2	6	26202	26207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750942
559	NC_012924	TAC	2	6	26228	26233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750942
560	NC_012924	TTTG	2	8	26290	26297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012924	AT	3	6	26337	26342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012924	AGG	2	6	26343	26348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012924	A	7	7	26420	26426	100 %	0 %	0 %	0 %	253750943
564	NC_012924	TTC	2	6	26523	26528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750943
565	NC_012924	CTG	2	6	26601	26606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750943
566	NC_012924	GTA	2	6	26618	26623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750943
567	NC_012924	TTA	2	6	26629	26634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750943
568	NC_012924	TGG	2	6	26691	26696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750943
569	NC_012924	TTG	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750943
570	NC_012924	TGC	2	6	26749	26754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750943
571	NC_012924	TTC	2	6	26768	26773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750943
572	NC_012924	ATTG	2	8	26806	26813	25 %	50 %	25 %	0 %	253750943
573	NC_012924	ATT	2	6	26817	26822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750943
574	NC_012924	CGT	2	6	26828	26833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750943
575	NC_012924	TGT	3	9	26854	26862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750943
576	NC_012924	TGG	2	6	26875	26880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750943
577	NC_012924	TAT	2	6	26929	26934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750943
578	NC_012924	TGA	2	6	26976	26981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750943
579	NC_012924	ATT	2	6	26984	26989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750943
580	NC_012924	TTGA	2	8	27017	27024	25 %	50 %	25 %	0 %	253750943
581	NC_012924	TGAT	2	8	27030	27037	25 %	50 %	25 %	0 %	253750943
582	NC_012924	GTT	2	6	27173	27178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750943
583	NC_012924	AGA	2	6	27199	27204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750943
584	NC_012924	ATT	2	6	27244	27249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750943
585	NC_012924	ATT	2	6	27260	27265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750943
586	NC_012924	TTTG	2	8	27295	27302	0 %	75 %	25 %	0 %	253750943
587	NC_012924	CTT	2	6	27345	27350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012924	T	6	6	27349	27354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012924	ATTT	2	8	27357	27364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012924	TAT	2	6	27373	27378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012924	TAA	2	6	27429	27434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750944
592	NC_012924	GAT	2	6	27459	27464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750944
593	NC_012924	AGC	2	6	27558	27563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750944
594	NC_012924	GCT	2	6	27568	27573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750944
595	NC_012924	TTA	2	6	27591	27596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750944
596	NC_012924	CT	3	6	27691	27696	0 %	50 %	0 %	50 %	253750944
597	NC_012924	TTC	2	6	27761	27766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750944
598	NC_012924	TGCC	2	8	27767	27774	0 %	25 %	25 %	50 %	253750944
599	NC_012924	TGG	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750944
600	NC_012924	ACG	2	6	27838	27843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750944
601	NC_012924	ATT	2	6	27886	27891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750944
602	NC_012924	CAT	2	6	28170	28175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750944
603	NC_012924	GCGG	2	8	28284	28291	0 %	0 %	75 %	25 %	253750944
604	NC_012924	CAT	2	6	28314	28319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750944
605	NC_012924	CTT	2	6	28419	28424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750944
606	NC_012924	GAAA	2	8	28439	28446	75 %	0 %	25 %	0 %	253750944
607	NC_012924	GCA	2	6	28513	28518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750944
608	NC_012924	AGA	2	6	28566	28571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750944
609	NC_012924	TA	3	6	28605	28610	50 %	50 %	0 %	0 %	253750945
610	NC_012924	ATG	3	9	28758	28766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750945
611	NC_012924	TCA	2	6	28789	28794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750945
612	NC_012924	CTTGGC	2	12	28855	28866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750945
613	NC_012924	CT	3	6	28902	28907	0 %	50 %	0 %	50 %	253750945
614	NC_012924	T	6	6	28912	28917	0 %	100 %	0 %	0 %	253750945
615	NC_012924	CAA	2	6	29105	29110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750945
616	NC_012924	TGA	2	6	29179	29184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750945
617	NC_012924	T	6	6	29231	29236	0 %	100 %	0 %	0 %	253750945
618	NC_012924	GAT	2	6	29294	29299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750945
619	NC_012924	TCT	2	6	29303	29308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750945
620	NC_012924	TGGG	2	8	29378	29385	0 %	25 %	75 %	0 %	253750946
621	NC_012924	TCAA	2	8	29417	29424	50 %	25 %	0 %	25 %	253750946
622	NC_012924	TGA	2	6	29466	29471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750946
623	NC_012924	ACG	2	6	29524	29529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750946
624	NC_012924	GAT	2	6	29545	29550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750946
625	NC_012924	TCG	2	6	29568	29573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750946
626	NC_012924	GAA	2	6	29574	29579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750946
627	NC_012924	GGC	2	6	29667	29672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253750946
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629	NC_012924	CTA	2	6	29735	29740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750946
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656	NC_012924	TGT	2	6	30646	30651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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753	NC_012924	CAAC	2	8	36139	36146	50 %	0 %	0 %	50 %	253750950
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