MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012924	AAAGA	2	10	242889	242898	80 %	0 %	20 %	0 %	253751139
5002	NC_012924	GAGC	2	8	242913	242920	25 %	0 %	50 %	25 %	253751139
5003	NC_012924	GGA	2	6	242987	242992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751139
5004	NC_012924	TGAT	2	8	243016	243023	25 %	50 %	25 %	0 %	253751139
5005	NC_012924	TGG	2	6	243044	243049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751139
5006	NC_012924	ATC	2	6	243108	243113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751139
5007	NC_012924	TGG	2	6	243356	243361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751139
5008	NC_012924	GAG	2	6	243451	243456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751139
5009	NC_012924	AG	3	6	243455	243460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012924	GAT	2	6	243463	243468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751140
5011	NC_012924	ATGG	2	8	243491	243498	25 %	25 %	50 %	0 %	253751140
5012	NC_012924	AG	3	6	243530	243535	50 %	0 %	50 %	0 %	253751140
5013	NC_012924	TAC	2	6	243615	243620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751140
5014	NC_012924	TCG	2	6	243703	243708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751140
5015	NC_012924	T	6	6	243745	243750	0 %	100 %	0 %	0 %	253751140
5016	NC_012924	ATGT	2	8	243768	243775	25 %	50 %	25 %	0 %	253751140
5017	NC_012924	TGT	2	6	243780	243785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751140
5018	NC_012924	TGG	2	6	244014	244019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751140
5019	NC_012924	GACA	2	8	244201	244208	50 %	0 %	25 %	25 %	253751140
5020	NC_012924	GAA	2	6	244274	244279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751140
5021	NC_012924	TA	3	6	244293	244298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_012924	A	6	6	244300	244305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_012924	ACC	2	6	244413	244418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751141
5024	NC_012924	AG	3	6	244459	244464	50 %	0 %	50 %	0 %	253751141
5025	NC_012924	CAG	2	6	244505	244510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751141
5026	NC_012924	GATA	2	8	244528	244535	50 %	25 %	25 %	0 %	253751141
5027	NC_012924	TCCAT	2	10	244699	244708	20 %	40 %	0 %	40 %	253751141
5028	NC_012924	GTT	2	6	244755	244760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751141
5029	NC_012924	GAG	3	9	244820	244828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751141
5030	NC_012924	TCAA	2	8	245016	245023	50 %	25 %	0 %	25 %	253751141
5031	NC_012924	GAA	2	6	245042	245047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751141
5032	NC_012924	CAT	2	6	245072	245077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751141
5033	NC_012924	AT	3	6	245109	245114	50 %	50 %	0 %	0 %	253751141
5034	NC_012924	TTC	2	6	245115	245120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751141
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5037	NC_012924	AGC	2	6	245169	245174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751142
5038	NC_012924	A	6	6	245403	245408	100 %	0 %	0 %	0 %	253751142
5039	NC_012924	AAG	2	6	245413	245418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751142
5040	NC_012924	TGA	2	6	245515	245520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
5041	NC_012924	AG	3	6	245594	245599	50 %	0 %	50 %	0 %	253751142
5042	NC_012924	TCT	2	6	245668	245673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751142
5043	NC_012924	TAG	2	6	245700	245705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
5044	NC_012924	GAT	2	6	245715	245720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
5045	NC_012924	AT	3	6	245719	245724	50 %	50 %	0 %	0 %	253751142
5046	NC_012924	GTA	2	6	245725	245730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
5047	NC_012924	GAA	2	6	245769	245774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751142
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5049	NC_012924	AGAA	2	8	245836	245843	75 %	0 %	25 %	0 %	253751142
5050	NC_012924	TCA	2	6	245864	245869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751142
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5053	NC_012924	ATC	2	6	246052	246057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751143
5054	NC_012924	GAGAA	2	10	246116	246125	60 %	0 %	40 %	0 %	253751143
5055	NC_012924	CTT	2	6	246181	246186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751143
5056	NC_012924	GGT	2	6	246259	246264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751143
5057	NC_012924	TGGT	2	8	246333	246340	0 %	50 %	50 %	0 %	253751143
5058	NC_012924	A	7	7	246347	246353	100 %	0 %	0 %	0 %	253751143
5059	NC_012924	TGG	2	6	246365	246370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751143
5060	NC_012924	ATA	2	6	246437	246442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751143
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5062	NC_012924	CAT	2	6	246504	246509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751143
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5064	NC_012924	TGG	3	9	246687	246695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751143
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5069	NC_012924	TTA	2	6	246978	246983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751144
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5071	NC_012924	GAG	2	6	247002	247007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751144
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5076	NC_012924	CAT	2	6	247269	247274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751144
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5079	NC_012924	TGT	3	9	247399	247407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751144
5080	NC_012924	CAGG	2	8	247432	247439	25 %	0 %	50 %	25 %	253751144
5081	NC_012924	GTTC	2	8	247469	247476	0 %	50 %	25 %	25 %	253751144
5082	NC_012924	TTC	2	6	247542	247547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_012924	A	6	6	247650	247655	100 %	0 %	0 %	0 %	253751145
5084	NC_012924	TCAA	2	8	247774	247781	50 %	25 %	0 %	25 %	253751145
5085	NC_012924	TGA	2	6	247823	247828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751145
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5088	NC_012924	GAA	2	6	247905	247910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751145
5089	NC_012924	ACT	2	6	247915	247920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751145
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5093	NC_012924	GA	3	6	248129	248134	50 %	0 %	50 %	0 %	253751145
5094	NC_012924	GGC	2	6	248156	248161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751145
5095	NC_012924	GACT	2	8	248230	248237	25 %	25 %	25 %	25 %	253751145
5096	NC_012924	TCA	2	6	248431	248436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751145
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5098	NC_012924	CAAT	2	8	248495	248502	50 %	25 %	0 %	25 %	253751145
5099	NC_012924	GCAG	2	8	248504	248511	25 %	0 %	50 %	25 %	253751145
5100	NC_012924	AAC	2	6	248518	248523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751145
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5102	NC_012924	ATCA	2	8	248607	248614	50 %	25 %	0 %	25 %	253751145
5103	NC_012924	GGA	2	6	248640	248645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751145
5104	NC_012924	ACTCT	2	10	248659	248668	20 %	40 %	0 %	40 %	253751145
5105	NC_012924	TTG	2	6	248709	248714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751145
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5107	NC_012924	CAGC	2	8	248737	248744	25 %	0 %	25 %	50 %	253751145
5108	NC_012924	TTGG	2	8	248805	248812	0 %	50 %	50 %	0 %	253751145
5109	NC_012924	TGGCA	2	10	248915	248924	20 %	20 %	40 %	20 %	253751145
5110	NC_012924	ACA	2	6	248997	249002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751145
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5114	NC_012924	AAT	2	6	249207	249212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751145
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5117	NC_012924	AATT	2	8	249322	249329	50 %	50 %	0 %	0 %	253751145
5118	NC_012924	GTG	2	6	249352	249357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751145
5119	NC_012924	CTCAG	2	10	249420	249429	20 %	20 %	20 %	40 %	253751145
5120	NC_012924	CAA	2	6	249435	249440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751145
5121	NC_012924	GTC	2	6	249447	249452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751145
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5123	NC_012924	GAT	2	6	249516	249521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751145
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5233	NC_012924	T	6	6	254409	254414	0 %	100 %	0 %	0 %	253751151
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5237	NC_012924	A	8	8	254567	254574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5248	NC_012924	TTG	2	6	255246	255251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751152
5249	NC_012924	TGG	2	6	255259	255264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751152
5250	NC_012924	CTT	2	6	255323	255328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751152
5251	NC_012924	TGG	2	6	255368	255373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751152
5252	NC_012924	TCG	2	6	255467	255472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5255	NC_012924	TCTGC	2	10	255512	255521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5364	NC_012924	A	6	6	260508	260513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_012924	CAAA	2	8	260616	260623	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5368	NC_012924	AGA	2	6	260838	260843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_012924	GA	3	6	260868	260873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5371	NC_012924	CAA	2	6	260968	260973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5374	NC_012924	A	6	6	261111	261116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5488	NC_012924	A	6	6	266486	266491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_012924	AAATA	2	10	266510	266519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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