MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012924	TTG	2	6	218193	218198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751119
4502	NC_012924	T	6	6	218350	218355	0 %	100 %	0 %	0 %	253751119
4503	NC_012924	TCCACG	2	12	218550	218561	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253751119
4504	NC_012924	GTC	2	6	218564	218569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751119
4505	NC_012924	TCCT	2	8	218669	218676	0 %	50 %	0 %	50 %	253751119
4506	NC_012924	CAA	2	6	218695	218700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751119
4507	NC_012924	GTT	2	6	218729	218734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751119
4508	NC_012924	TTC	2	6	218771	218776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
4509	NC_012924	TTC	2	6	218804	218809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
4510	NC_012924	AAAGTC	2	12	218810	218821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253751119
4511	NC_012924	ATG	2	6	218823	218828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751119
4512	NC_012924	GTG	2	6	218864	218869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751119
4513	NC_012924	TGG	3	9	218932	218940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751119
4514	NC_012924	TCA	2	6	218995	219000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751119
4515	NC_012924	CGGT	2	8	219027	219034	0 %	25 %	50 %	25 %	253751119
4516	NC_012924	TCT	2	6	219066	219071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
4517	NC_012924	TAA	2	6	219097	219102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751119
4518	NC_012924	ACC	2	6	219147	219152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751119
4519	NC_012924	TTC	2	6	219161	219166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
4520	NC_012924	GTA	2	6	219224	219229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751119
4521	NC_012924	CCA	2	6	219264	219269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751119
4522	NC_012924	CAGT	2	8	219282	219289	25 %	25 %	25 %	25 %	253751119
4523	NC_012924	TTC	2	6	219434	219439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
4524	NC_012924	AAT	2	6	219581	219586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751119
4525	NC_012924	AAC	2	6	219650	219655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751119
4526	NC_012924	CT	4	8	219681	219688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_012924	CTT	2	6	219702	219707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_012924	AGG	2	6	219722	219727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_012924	CCT	2	6	219745	219750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_012924	TGGT	2	8	219842	219849	0 %	50 %	50 %	0 %	253751120
4531	NC_012924	CAG	2	6	219879	219884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751120
4532	NC_012924	TGA	2	6	219888	219893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751120
4533	NC_012924	TCCAA	2	10	219974	219983	40 %	20 %	0 %	40 %	253751120
4534	NC_012924	AGC	2	6	220213	220218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751120
4535	NC_012924	CAA	2	6	220227	220232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751120
4536	NC_012924	CTT	2	6	220254	220259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751120
4537	NC_012924	TCT	2	6	220268	220273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751120
4538	NC_012924	T	7	7	220273	220279	0 %	100 %	0 %	0 %	253751120
4539	NC_012924	ACA	2	6	220325	220330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751120
4540	NC_012924	CAA	2	6	220335	220340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751120
4541	NC_012924	ACC	2	6	220399	220404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751120
4542	NC_012924	GCT	2	6	220418	220423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751120
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4544	NC_012924	AGC	2	6	220474	220479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751120
4545	NC_012924	TTG	2	6	220551	220556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751120
4546	NC_012924	ACC	2	6	220669	220674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751120
4547	NC_012924	CAAT	2	8	220683	220690	50 %	25 %	0 %	25 %	253751120
4548	NC_012924	GAT	2	6	220867	220872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751120
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4552	NC_012924	AGG	2	6	220973	220978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751120
4553	NC_012924	TGC	2	6	221059	221064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751120
4554	NC_012924	GAG	2	6	221100	221105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751120
4555	NC_012924	AAG	2	6	221189	221194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751120
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4557	NC_012924	CTT	2	6	221484	221489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751120
4558	NC_012924	AGA	2	6	221532	221537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751120
4559	NC_012924	GAT	2	6	221554	221559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751120
4560	NC_012924	CTG	2	6	221598	221603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751120
4561	NC_012924	T	6	6	221632	221637	0 %	100 %	0 %	0 %	253751120
4562	NC_012924	GT	3	6	221674	221679	0 %	50 %	50 %	0 %	253751120
4563	NC_012924	CTT	2	6	221730	221735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751120
4564	NC_012924	AT	3	6	221750	221755	50 %	50 %	0 %	0 %	253751120
4565	NC_012924	T	6	6	221795	221800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_012924	TC	3	6	221806	221811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_012924	T	6	6	221823	221828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_012924	A	6	6	221878	221883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_012924	T	8	8	221906	221913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_012924	ATG	2	6	221982	221987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751121
4571	NC_012924	A	6	6	221988	221993	100 %	0 %	0 %	0 %	253751121
4572	NC_012924	A	6	6	222022	222027	100 %	0 %	0 %	0 %	253751121
4573	NC_012924	CAG	2	6	222072	222077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751121
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4575	NC_012924	TGT	2	6	222272	222277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751121
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4577	NC_012924	GAT	2	6	222567	222572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751121
4578	NC_012924	CAA	2	6	222615	222620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751121
4579	NC_012924	AGCA	2	8	222636	222643	50 %	0 %	25 %	25 %	253751121
4580	NC_012924	GA	3	6	222699	222704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_012924	T	6	6	222719	222724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_012924	ATAG	2	8	222733	222740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_012924	AAG	2	6	222741	222746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_012924	AAAGA	2	10	222879	222888	80 %	0 %	20 %	0 %	253751122
4585	NC_012924	CGG	2	6	222895	222900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751122
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4587	NC_012924	CG	3	6	222955	222960	0 %	0 %	50 %	50 %	253751122
4588	NC_012924	TTGA	2	8	223032	223039	25 %	50 %	25 %	0 %	253751122
4589	NC_012924	ATT	2	6	223079	223084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751123
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4594	NC_012924	ACT	2	6	223257	223262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751123
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4596	NC_012924	CTTT	2	8	223318	223325	0 %	75 %	0 %	25 %	253751123
4597	NC_012924	GCG	2	6	223425	223430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751123
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4603	NC_012924	TC	3	6	223583	223588	0 %	50 %	0 %	50 %	253751123
4604	NC_012924	GTT	2	6	223671	223676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012924	TGA	2	6	223681	223686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_012924	AT	3	6	223759	223764	50 %	50 %	0 %	0 %	253751124
4607	NC_012924	AAT	2	6	223766	223771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751124
4608	NC_012924	ATT	2	6	223775	223780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751124
4609	NC_012924	A	6	6	223809	223814	100 %	0 %	0 %	0 %	253751124
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4611	NC_012924	TGG	2	6	223872	223877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751124
4612	NC_012924	CGA	2	6	223903	223908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751124
4613	NC_012924	GACA	2	8	223912	223919	50 %	0 %	25 %	25 %	253751124
4614	NC_012924	GCT	2	6	223958	223963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751124
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4618	NC_012924	CAG	2	6	224108	224113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751124
4619	NC_012924	CTCC	2	8	224161	224168	0 %	25 %	0 %	75 %	253751124
4620	NC_012924	ATG	2	6	224178	224183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751124
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4622	NC_012924	TCCT	2	8	224343	224350	0 %	50 %	0 %	50 %	253751124
4623	NC_012924	GTG	2	6	224438	224443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751124
4624	NC_012924	GAA	2	6	224453	224458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751124
4625	NC_012924	AGA	2	6	224476	224481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751124
4626	NC_012924	TCCG	2	8	224526	224533	0 %	25 %	25 %	50 %	253751124
4627	NC_012924	TGG	2	6	224536	224541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751124
4628	NC_012924	ATC	2	6	224613	224618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751124
4629	NC_012924	GGT	2	6	224759	224764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751124
4630	NC_012924	CAT	2	6	224770	224775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751124
4631	NC_012924	AGC	2	6	224956	224961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751124
4632	NC_012924	TC	3	6	224972	224977	0 %	50 %	0 %	50 %	253751124
4633	NC_012924	AGG	2	6	225015	225020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751124
4634	NC_012924	TGGCTA	2	12	225030	225041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253751124
4635	NC_012924	ACC	2	6	225083	225088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751124
4636	NC_012924	CCG	2	6	225229	225234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253751124
4637	NC_012924	ATT	2	6	225251	225256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751124
4638	NC_012924	GTC	2	6	225339	225344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751124
4639	NC_012924	CAA	2	6	225448	225453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751124
4640	NC_012924	TGC	2	6	225526	225531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751124
4641	NC_012924	GTG	2	6	225596	225601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751124
4642	NC_012924	GAA	2	6	225625	225630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751124
4643	NC_012924	TGAGTT	2	12	225772	225783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	253751124
4644	NC_012924	AGC	2	6	225804	225809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751124
4645	NC_012924	CA	3	6	225827	225832	50 %	0 %	0 %	50 %	253751124
4646	NC_012924	ATG	2	6	225902	225907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751124
4647	NC_012924	CGC	2	6	226016	226021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253751124
4648	NC_012924	TGA	2	6	226149	226154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751125
4649	NC_012924	TC	3	6	226193	226198	0 %	50 %	0 %	50 %	253751125
4650	NC_012924	TGA	2	6	226206	226211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751125
4651	NC_012924	ATC	2	6	226253	226258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751125
4652	NC_012924	TTG	2	6	226292	226297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751125
4653	NC_012924	GAG	2	6	226324	226329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751125
4654	NC_012924	AGGGC	2	10	226407	226416	20 %	0 %	60 %	20 %	253751125
4655	NC_012924	AGCAG	2	10	226440	226449	40 %	0 %	40 %	20 %	253751125
4656	NC_012924	GAT	2	6	226498	226503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751125
4657	NC_012924	GTG	2	6	226532	226537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751125
4658	NC_012924	CTA	2	6	226659	226664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751125
4659	NC_012924	GA	3	6	226668	226673	50 %	0 %	50 %	0 %	253751125
4660	NC_012924	GAA	2	6	226693	226698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751125
4661	NC_012924	AGA	2	6	226722	226727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751125
4662	NC_012924	TGG	2	6	226751	226756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751125
4663	NC_012924	A	6	6	226766	226771	100 %	0 %	0 %	0 %	253751125
4664	NC_012924	T	6	6	226789	226794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_012924	C	6	6	226824	226829	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4666	NC_012924	TCC	2	6	226833	226838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4667	NC_012924	T	6	6	226863	226868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4668	NC_012924	T	9	9	226934	226942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4669	NC_012924	TAG	2	6	226955	226960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4670	NC_012924	TTA	2	6	226993	226998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751126
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4672	NC_012924	TTG	2	6	227041	227046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751126
4673	NC_012924	GATG	2	8	227144	227151	25 %	25 %	50 %	0 %	253751126
4674	NC_012924	TGA	2	6	227153	227158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751126
4675	NC_012924	A	6	6	227214	227219	100 %	0 %	0 %	0 %	253751126
4676	NC_012924	ATCAA	2	10	227263	227272	60 %	20 %	0 %	20 %	253751126
4677	NC_012924	GTG	2	6	227314	227319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4678	NC_012924	ACT	2	6	227325	227330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4679	NC_012924	T	7	7	227334	227340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4680	NC_012924	ACTT	2	8	227349	227356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4681	NC_012924	ATT	2	6	227362	227367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4682	NC_012924	TCG	2	6	227450	227455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4683	NC_012924	TAA	2	6	227459	227464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4684	NC_012924	TAA	2	6	227528	227533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4685	NC_012924	ATTT	2	8	227643	227650	25 %	75 %	0 %	0 %	253751127
4686	NC_012924	A	6	6	227722	227727	100 %	0 %	0 %	0 %	253751127
4687	NC_012924	GCA	3	9	227742	227750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751127
4688	NC_012924	TA	3	6	227779	227784	50 %	50 %	0 %	0 %	253751127
4689	NC_012924	AGA	2	6	227936	227941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751127
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4692	NC_012924	AGA	2	6	228041	228046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751127
4693	NC_012924	GAC	2	6	228077	228082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751127
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4696	NC_012924	GTC	2	6	228227	228232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751127
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4706	NC_012924	GTG	2	6	228745	228750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751127
4707	NC_012924	CTT	2	6	228780	228785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751127
4708	NC_012924	CCTTG	2	10	228830	228839	0 %	40 %	20 %	40 %	253751127
4709	NC_012924	TTG	2	6	228849	228854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751127
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4712	NC_012924	GAC	2	6	229017	229022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751127
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4714	NC_012924	A	7	7	229081	229087	100 %	0 %	0 %	0 %	253751127
4715	NC_012924	AAG	2	6	229120	229125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4716	NC_012924	GAAA	2	8	229136	229143	75 %	0 %	25 %	0 %	253751128
4717	NC_012924	GTT	2	6	229159	229164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751128
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4721	NC_012924	ATG	2	6	229303	229308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751128
4722	NC_012924	CTA	2	6	229340	229345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751128
4723	NC_012924	CAG	2	6	229377	229382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751128
4724	NC_012924	TGG	2	6	229484	229489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751128
4725	NC_012924	CCG	2	6	229534	229539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253751128
4726	NC_012924	ATT	2	6	229555	229560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751128
4727	NC_012924	GAA	2	6	229562	229567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751128
4728	NC_012924	GGCA	2	8	229600	229607	25 %	0 %	50 %	25 %	253751128
4729	NC_012924	TGAT	2	8	229618	229625	25 %	50 %	25 %	0 %	253751128
4730	NC_012924	GACC	2	8	229673	229680	25 %	0 %	25 %	50 %	253751128
4731	NC_012924	AAG	2	6	229699	229704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751128
4732	NC_012924	TC	3	6	229793	229798	0 %	50 %	0 %	50 %	253751128
4733	NC_012924	ACCAA	2	10	229839	229848	60 %	0 %	0 %	40 %	253751128
4734	NC_012924	AAG	2	6	229855	229860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751128
4735	NC_012924	TGA	2	6	229949	229954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751128
4736	NC_012924	GGT	2	6	229971	229976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751128
4737	NC_012924	CAG	2	6	229996	230001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751128
4738	NC_012924	GA	3	6	230018	230023	50 %	0 %	50 %	0 %	253751128
4739	NC_012924	GAA	2	6	230031	230036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751128
4740	NC_012924	TAAA	2	8	230066	230073	75 %	25 %	0 %	0 %	253751128
4741	NC_012924	GAT	2	6	230142	230147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_012924	ATA	2	6	230154	230159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4743	NC_012924	TA	3	6	230163	230168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4744	NC_012924	TTTA	2	8	230174	230181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_012924	AGA	2	6	230238	230243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751129
4746	NC_012924	AT	3	6	230341	230346	50 %	50 %	0 %	0 %	253751129
4747	NC_012924	T	7	7	230387	230393	0 %	100 %	0 %	0 %	253751129
4748	NC_012924	TGG	2	6	230443	230448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751129
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4986	NC_012924	T	6	6	242153	242158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4987	NC_012924	CTG	2	6	242165	242170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4989	NC_012924	T	6	6	242286	242291	0 %	100 %	0 %	0 %	253751139
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4996	NC_012924	ATG	2	6	242620	242625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751139
4997	NC_012924	TGG	2	6	242638	242643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751139
4998	NC_012924	CAC	2	6	242764	242769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751139
4999	NC_012924	AGG	2	6	242854	242859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751139
5000	NC_012924	ATG	2	6	242863	242868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751139

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