MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 57249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012726	TAA	2	6	153305	153310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618656
3502	NC_012726	AGT	2	6	153357	153362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618656
3503	NC_012726	TTGC	2	8	153405	153412	0 %	50 %	25 %	25 %	238618656
3504	NC_012726	CAT	2	6	153454	153459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618656
3505	NC_012726	TAA	2	6	153476	153481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618656
3506	NC_012726	ATA	2	6	153484	153489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618656
3507	NC_012726	CTT	2	6	153586	153591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618656
3508	NC_012726	AAT	2	6	153618	153623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618656
3509	NC_012726	TAA	2	6	153647	153652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618656
3510	NC_012726	GAA	2	6	153659	153664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618656
3511	NC_012726	CAA	2	6	153674	153679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618656
3512	NC_012726	CTT	2	6	153690	153695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618656
3513	NC_012726	CTT	2	6	153781	153786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618656
3514	NC_012726	CTT	2	6	153915	153920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_012726	GAA	3	9	153923	153931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_012726	TAC	2	6	154008	154013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_012726	AT	3	6	154051	154056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012726	TAT	2	6	154142	154147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_012726	CTT	2	6	154187	154192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_012726	TAG	2	6	154261	154266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_012726	GAGTC	2	10	154282	154291	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3522	NC_012726	TTG	2	6	154421	154426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618657
3523	NC_012726	GTA	2	6	154475	154480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618657
3524	NC_012726	AAG	2	6	154484	154489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618657
3525	NC_012726	AGT	2	6	154494	154499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618657
3526	NC_012726	ACT	2	6	154519	154524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618657
3527	NC_012726	AGA	2	6	154584	154589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618657
3528	NC_012726	CTC	2	6	154634	154639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618657
3529	NC_012726	GGA	3	9	154651	154659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618657
3530	NC_012726	GGT	2	6	154672	154677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618657
3531	NC_012726	GAA	2	6	154679	154684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618657
3532	NC_012726	GAA	2	6	154691	154696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618657
3533	NC_012726	GAA	2	6	154703	154708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618657
3534	NC_012726	GAA	2	6	154729	154734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618657
3535	NC_012726	A	6	6	154761	154766	100 %	0 %	0 %	0 %	238618658
3536	NC_012726	TA	3	6	154815	154820	50 %	50 %	0 %	0 %	238618658
3537	NC_012726	TTA	2	6	154865	154870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618658
3538	NC_012726	TG	3	6	154882	154887	0 %	50 %	50 %	0 %	238618658
3539	NC_012726	TAA	2	6	154892	154897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618658
3540	NC_012726	AT	3	6	154945	154950	50 %	50 %	0 %	0 %	238618658
3541	NC_012726	GTA	2	6	154968	154973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618658
3542	NC_012726	TC	3	6	155001	155006	0 %	50 %	0 %	50 %	238618658
3543	NC_012726	T	7	7	155034	155040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_012726	TTG	2	6	155053	155058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618659
3545	NC_012726	ATC	2	6	155105	155110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618659
3546	NC_012726	AGA	2	6	155174	155179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618659
3547	NC_012726	TCC	2	6	155201	155206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618659
3548	NC_012726	ATAG	2	8	155274	155281	50 %	25 %	25 %	0 %	238618659
3549	NC_012726	TG	3	6	155322	155327	0 %	50 %	50 %	0 %	238618659
3550	NC_012726	TAA	2	6	155377	155382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618659
3551	NC_012726	AGT	2	6	155556	155561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618659
3552	NC_012726	AT	3	6	155586	155591	50 %	50 %	0 %	0 %	238618659
3553	NC_012726	ACT	2	6	155668	155673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618659
3554	NC_012726	GAT	2	6	155727	155732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618659
3555	NC_012726	ACTG	2	8	155789	155796	25 %	25 %	25 %	25 %	238618659
3556	NC_012726	AG	3	6	155841	155846	50 %	0 %	50 %	0 %	238618659
3557	NC_012726	ATA	2	6	155856	155861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618659
3558	NC_012726	TGA	2	6	156071	156076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618659
3559	NC_012726	TTTA	3	12	156100	156111	25 %	75 %	0 %	0 %	238618659
3560	NC_012726	TAT	2	6	156129	156134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618659
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3562	NC_012726	TA	3	6	156192	156197	50 %	50 %	0 %	0 %	238618659
3563	NC_012726	GAA	2	6	156213	156218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618659
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3565	NC_012726	GAA	2	6	156251	156256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618659
3566	NC_012726	TGA	2	6	156260	156265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618659
3567	NC_012726	TAT	2	6	156275	156280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618659
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3569	NC_012726	A	6	6	156317	156322	100 %	0 %	0 %	0 %	238618659
3570	NC_012726	TTA	2	6	156385	156390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618659
3571	NC_012726	ATT	2	6	156395	156400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618659
3572	NC_012726	ATG	2	6	156478	156483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618659
3573	NC_012726	ATTGG	2	10	156484	156493	20 %	40 %	40 %	0 %	238618659
3574	NC_012726	TAG	2	6	156556	156561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618659
3575	NC_012726	TA	3	6	156591	156596	50 %	50 %	0 %	0 %	238618659
3576	NC_012726	TAA	3	9	156692	156700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_012726	AAT	2	6	156721	156726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_012726	ACT	2	6	156743	156748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_012726	TAA	2	6	156807	156812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_012726	ATG	2	6	156816	156821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_012726	T	6	6	156838	156843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_012726	AAT	2	6	156902	156907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_012726	TTA	2	6	156923	156928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_012726	ATC	2	6	156949	156954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_012726	ATCT	2	8	156958	156965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_012726	ATA	2	6	156984	156989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_012726	TAT	4	12	157003	157014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_012726	AT	3	6	157080	157085	50 %	50 %	0 %	0 %	238618660
3589	NC_012726	T	6	6	157106	157111	0 %	100 %	0 %	0 %	238618660
3590	NC_012726	TTAG	2	8	157217	157224	25 %	50 %	25 %	0 %	238618660
3591	NC_012726	GAA	2	6	157232	157237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618660
3592	NC_012726	TAG	2	6	157342	157347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618660
3593	NC_012726	TTTA	2	8	157348	157355	25 %	75 %	0 %	0 %	238618660
3594	NC_012726	AGG	2	6	157371	157376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618660
3595	NC_012726	CTT	2	6	157410	157415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618660
3596	NC_012726	CGC	2	6	157441	157446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238618660
3597	NC_012726	CGG	2	6	157456	157461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238618660
3598	NC_012726	GTT	2	6	157496	157501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618660
3599	NC_012726	AAG	2	6	157574	157579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618660
3600	NC_012726	TA	3	6	157619	157624	50 %	50 %	0 %	0 %	238618660
3601	NC_012726	AAT	2	6	157625	157630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618660
3602	NC_012726	AT	3	6	157636	157641	50 %	50 %	0 %	0 %	238618660
3603	NC_012726	CTC	2	6	157642	157647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618660
3604	NC_012726	GA	3	6	157671	157676	50 %	0 %	50 %	0 %	238618660
3605	NC_012726	ACG	2	6	157776	157781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618660
3606	NC_012726	AAAAT	2	10	157848	157857	80 %	20 %	0 %	0 %	238618660
3607	NC_012726	AGA	2	6	157861	157866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618660
3608	NC_012726	TAC	2	6	157997	158002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618661
3609	NC_012726	AT	3	6	158007	158012	50 %	50 %	0 %	0 %	238618661
3610	NC_012726	GA	3	6	158041	158046	50 %	0 %	50 %	0 %	238618661
3611	NC_012726	TTC	2	6	158138	158143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618661
3612	NC_012726	ATT	2	6	158177	158182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618661
3613	NC_012726	ATA	2	6	158299	158304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618661
3614	NC_012726	ATT	2	6	158366	158371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618661
3615	NC_012726	AAAG	2	8	158409	158416	75 %	0 %	25 %	0 %	238618661
3616	NC_012726	TGGC	2	8	158518	158525	0 %	25 %	50 %	25 %	238618661
3617	NC_012726	ATG	2	6	158530	158535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618661
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3619	NC_012726	GAG	2	6	158591	158596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618661
3620	NC_012726	GGAT	2	8	158668	158675	25 %	25 %	50 %	0 %	238618661
3621	NC_012726	TTA	2	6	158677	158682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618661
3622	NC_012726	TAA	2	6	158875	158880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618661
3623	NC_012726	TGG	2	6	158897	158902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618661
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3997	NC_012726	AAT	2	6	175253	175258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618681
3998	NC_012726	ATA	2	6	175261	175266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618681
3999	NC_012726	ACG	2	6	175299	175304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618681
4000	NC_012726	CAA	2	6	175312	175317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618681

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