MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 57249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012726	TGGCT	2	10	21176	21185	0 %	40 %	40 %	20 %	238618501
502	NC_012726	AGG	2	6	21187	21192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618501
503	NC_012726	ATT	2	6	21212	21217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618501
504	NC_012726	AGGG	2	8	21218	21225	25 %	0 %	75 %	0 %	238618501
505	NC_012726	GAAA	2	8	21279	21286	75 %	0 %	25 %	0 %	238618501
506	NC_012726	TGA	2	6	21311	21316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618501
507	NC_012726	ATT	2	6	21348	21353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618501
508	NC_012726	GGT	2	6	21408	21413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618501
509	NC_012726	TTGA	2	8	21456	21463	25 %	50 %	25 %	0 %	238618502
510	NC_012726	GA	3	6	21518	21523	50 %	0 %	50 %	0 %	238618502
511	NC_012726	T	6	6	21658	21663	0 %	100 %	0 %	0 %	238618502
512	NC_012726	TGAGT	2	10	21707	21716	20 %	40 %	40 %	0 %	238618502
513	NC_012726	TAA	2	6	21754	21759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618502
514	NC_012726	ATGT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	238618502
515	NC_012726	AG	3	6	21934	21939	50 %	0 %	50 %	0 %	238618502
516	NC_012726	TTC	2	6	21949	21954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618502
517	NC_012726	TCT	2	6	21986	21991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618502
518	NC_012726	GT	3	6	22108	22113	0 %	50 %	50 %	0 %	238618503
519	NC_012726	ATT	2	6	22152	22157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618503
520	NC_012726	TCA	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618503
521	NC_012726	ATA	2	6	22212	22217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618503
522	NC_012726	ATG	2	6	22230	22235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618503
523	NC_012726	ATG	2	6	22281	22286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618503
524	NC_012726	AAC	2	6	22346	22351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618503
525	NC_012726	ATT	2	6	22455	22460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618503
526	NC_012726	TCT	2	6	22496	22501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618503
527	NC_012726	TAA	2	6	22512	22517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618503
528	NC_012726	T	6	6	22600	22605	0 %	100 %	0 %	0 %	238618503
529	NC_012726	AAC	2	6	22716	22721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618503
530	NC_012726	AGT	2	6	22804	22809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618504
531	NC_012726	TCT	2	6	22844	22849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618504
532	NC_012726	AGT	2	6	22869	22874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618504
533	NC_012726	TA	3	6	22878	22883	50 %	50 %	0 %	0 %	238618504
534	NC_012726	ATT	2	6	22928	22933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618504
535	NC_012726	T	6	6	22945	22950	0 %	100 %	0 %	0 %	238618504
536	NC_012726	CCA	2	6	22959	22964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238618504
537	NC_012726	TAT	2	6	22986	22991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618504
538	NC_012726	CT	3	6	22993	22998	0 %	50 %	0 %	50 %	238618504
539	NC_012726	CTT	2	6	23016	23021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618504
540	NC_012726	AAT	2	6	23041	23046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618504
541	NC_012726	TC	3	6	23064	23069	0 %	50 %	0 %	50 %	238618504
542	NC_012726	TA	3	6	23113	23118	50 %	50 %	0 %	0 %	238618504
543	NC_012726	CTT	2	6	23124	23129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618504
544	NC_012726	ATCT	2	8	23134	23141	25 %	50 %	0 %	25 %	238618504
545	NC_012726	CTT	2	6	23148	23153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618504
546	NC_012726	CTA	2	6	23172	23177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618504
547	NC_012726	TCAT	2	8	23192	23199	25 %	50 %	0 %	25 %	238618504
548	NC_012726	TGG	2	6	23218	23223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618504
549	NC_012726	TAT	2	6	23260	23265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618504
550	NC_012726	ATT	2	6	23288	23293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618504
551	NC_012726	TAC	2	6	23362	23367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618504
552	NC_012726	TC	3	6	23383	23388	0 %	50 %	0 %	50 %	238618504
553	NC_012726	AAG	2	6	23393	23398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618504
554	NC_012726	AGT	2	6	23426	23431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618504
555	NC_012726	CCT	2	6	23520	23525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618505
556	NC_012726	TAA	2	6	23546	23551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618505
557	NC_012726	AAT	2	6	23619	23624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618505
558	NC_012726	A	6	6	23751	23756	100 %	0 %	0 %	0 %	238618505
559	NC_012726	ATG	2	6	23849	23854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618505
560	NC_012726	TAGA	2	8	23921	23928	50 %	25 %	25 %	0 %	238618505
561	NC_012726	ACT	2	6	23938	23943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618505
562	NC_012726	AAG	2	6	24072	24077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618505
563	NC_012726	AAGAG	2	10	24154	24163	60 %	0 %	40 %	0 %	238618505
564	NC_012726	CT	3	6	24330	24335	0 %	50 %	0 %	50 %	238618505
565	NC_012726	TAG	2	6	24446	24451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618505
566	NC_012726	AGA	2	6	24493	24498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618505
567	NC_012726	AT	3	6	24522	24527	50 %	50 %	0 %	0 %	238618505
568	NC_012726	GAT	2	6	24563	24568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012726	TGA	2	6	24592	24597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012726	GAT	2	6	24616	24621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012726	TAGA	2	8	24636	24643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012726	ATA	2	6	24664	24669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012726	AT	3	6	24672	24677	50 %	50 %	0 %	0 %	238618506
574	NC_012726	AGA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618506
575	NC_012726	AT	3	6	24835	24840	50 %	50 %	0 %	0 %	238618506
576	NC_012726	GAT	2	6	24859	24864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618506
577	NC_012726	AT	3	6	24863	24868	50 %	50 %	0 %	0 %	238618506
578	NC_012726	TCCA	2	8	24880	24887	25 %	25 %	0 %	50 %	238618506
579	NC_012726	AC	3	6	24923	24928	50 %	0 %	0 %	50 %	238618506
580	NC_012726	ATA	2	6	24968	24973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618506
581	NC_012726	ATT	2	6	25001	25006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618506
582	NC_012726	GAT	2	6	25069	25074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618506
583	NC_012726	ATT	2	6	25084	25089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618506
584	NC_012726	TAC	2	6	25168	25173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618506
585	NC_012726	TA	3	6	25222	25227	50 %	50 %	0 %	0 %	238618506
586	NC_012726	CTATG	2	10	25262	25271	20 %	40 %	20 %	20 %	238618507
587	NC_012726	ATT	2	6	25310	25315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618507
588	NC_012726	TGT	2	6	25338	25343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618507
589	NC_012726	AAT	2	6	25410	25415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618507
590	NC_012726	CTT	2	6	25522	25527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618507
591	NC_012726	GTT	2	6	25560	25565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618507
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593	NC_012726	ACT	2	6	25588	25593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618507
594	NC_012726	CTGA	2	8	25837	25844	25 %	25 %	25 %	25 %	238618507
595	NC_012726	AAGG	2	8	25863	25870	50 %	0 %	50 %	0 %	238618507
596	NC_012726	GTT	2	6	25876	25881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618507
597	NC_012726	ATA	2	6	25885	25890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618507
598	NC_012726	GTG	2	6	25946	25951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618507
599	NC_012726	TCA	2	6	25960	25965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618507
600	NC_012726	GTCACT	2	12	25966	25977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238618507
601	NC_012726	GAT	2	6	26080	26085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618507
602	NC_012726	TGG	2	6	26115	26120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618507
603	NC_012726	GA	3	6	26143	26148	50 %	0 %	50 %	0 %	238618507
604	NC_012726	GAG	2	6	26158	26163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618507
605	NC_012726	GTT	2	6	26173	26178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618507
606	NC_012726	AAT	2	6	26217	26222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618507
607	NC_012726	TAT	2	6	26275	26280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618507
608	NC_012726	CA	3	6	26327	26332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_012726	AT	3	6	26333	26338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012726	AGT	2	6	26363	26368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618508
611	NC_012726	CTT	2	6	26409	26414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618508
612	NC_012726	AAG	2	6	26445	26450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618508
613	NC_012726	AGC	2	6	26473	26478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618508
614	NC_012726	A	6	6	26555	26560	100 %	0 %	0 %	0 %	238618508
615	NC_012726	GAAGA	2	10	26564	26573	60 %	0 %	40 %	0 %	238618508
616	NC_012726	TA	3	6	26577	26582	50 %	50 %	0 %	0 %	238618508
617	NC_012726	GAA	2	6	26592	26597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618508
618	NC_012726	ATTT	2	8	26621	26628	25 %	75 %	0 %	0 %	238618508
619	NC_012726	ATG	2	6	26681	26686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618508
620	NC_012726	TAT	2	6	26699	26704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618508
621	NC_012726	AAGA	2	8	26755	26762	75 %	0 %	25 %	0 %	238618508
622	NC_012726	GTCA	2	8	26825	26832	25 %	25 %	25 %	25 %	238618508
623	NC_012726	TGA	2	6	26908	26913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618508
624	NC_012726	TATTT	2	10	26920	26929	20 %	80 %	0 %	0 %	238618508
625	NC_012726	AAC	2	6	26991	26996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618508
626	NC_012726	TAA	2	6	27070	27075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012726	TAG	2	6	27089	27094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012726	AAAAT	2	10	27152	27161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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630	NC_012726	CTA	2	6	27190	27195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618509
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861	NC_012726	AAT	2	6	38389	38394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618524
862	NC_012726	ATTAG	2	10	38401	38410	40 %	40 %	20 %	0 %	238618524
863	NC_012726	CTTTT	2	10	38428	38437	0 %	80 %	0 %	20 %	238618524
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869	NC_012726	AAAT	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
870	NC_012726	AT	3	6	38591	38596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
871	NC_012726	GAT	2	6	38617	38622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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877	NC_012726	TAA	2	6	38875	38880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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889	NC_012726	AAAT	2	8	39239	39246	75 %	25 %	0 %	0 %	238618525
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