MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012632	AAGG	2	8	21084	21091	50 %	0 %	50 %	0 %	229583595
502	NC_012632	ATC	2	6	21110	21115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583595
503	NC_012632	TGGCT	2	10	21173	21182	0 %	40 %	40 %	20 %	229583595
504	NC_012632	AGG	2	6	21184	21189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583595
505	NC_012632	ATT	2	6	21209	21214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583595
506	NC_012632	AGGG	2	8	21215	21222	25 %	0 %	75 %	0 %	229583595
507	NC_012632	GAAA	2	8	21276	21283	75 %	0 %	25 %	0 %	229583595
508	NC_012632	TGA	2	6	21308	21313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583595
509	NC_012632	ATT	2	6	21345	21350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583595
510	NC_012632	GGT	2	6	21405	21410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583595
511	NC_012632	TTGA	2	8	21453	21460	25 %	50 %	25 %	0 %	229583596
512	NC_012632	GA	3	6	21515	21520	50 %	0 %	50 %	0 %	229583596
513	NC_012632	T	6	6	21655	21660	0 %	100 %	0 %	0 %	229583596
514	NC_012632	TGAGT	2	10	21704	21713	20 %	40 %	40 %	0 %	229583596
515	NC_012632	TAA	2	6	21751	21756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583596
516	NC_012632	ATGT	2	8	21830	21837	25 %	50 %	25 %	0 %	229583596
517	NC_012632	AG	3	6	21931	21936	50 %	0 %	50 %	0 %	229583596
518	NC_012632	TTC	2	6	21946	21951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583596
519	NC_012632	TCT	2	6	21983	21988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583596
520	NC_012632	GT	3	6	22105	22110	0 %	50 %	50 %	0 %	229583597
521	NC_012632	ATT	2	6	22149	22154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583597
522	NC_012632	TCA	2	6	22202	22207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583597
523	NC_012632	ATA	2	6	22209	22214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583597
524	NC_012632	ATG	2	6	22227	22232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583597
525	NC_012632	ATG	2	6	22278	22283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583597
526	NC_012632	AAC	2	6	22343	22348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583597
527	NC_012632	ATT	2	6	22452	22457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583597
528	NC_012632	TCT	2	6	22493	22498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583597
529	NC_012632	TAA	2	6	22509	22514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583597
530	NC_012632	T	6	6	22597	22602	0 %	100 %	0 %	0 %	229583597
531	NC_012632	AAC	2	6	22713	22718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583597
532	NC_012632	AGT	2	6	22801	22806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583598
533	NC_012632	TCT	2	6	22841	22846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583598
534	NC_012632	AGT	2	6	22866	22871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583598
535	NC_012632	TA	3	6	22875	22880	50 %	50 %	0 %	0 %	229583598
536	NC_012632	ATT	2	6	22925	22930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583598
537	NC_012632	T	6	6	22942	22947	0 %	100 %	0 %	0 %	229583598
538	NC_012632	CCA	2	6	22956	22961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583598
539	NC_012632	TAT	2	6	22983	22988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583598
540	NC_012632	CT	3	6	22990	22995	0 %	50 %	0 %	50 %	229583598
541	NC_012632	CTT	2	6	23013	23018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583598
542	NC_012632	AAT	2	6	23038	23043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583598
543	NC_012632	TC	3	6	23061	23066	0 %	50 %	0 %	50 %	229583598
544	NC_012632	TA	3	6	23110	23115	50 %	50 %	0 %	0 %	229583598
545	NC_012632	CTT	2	6	23121	23126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583598
546	NC_012632	ATCT	2	8	23131	23138	25 %	50 %	0 %	25 %	229583598
547	NC_012632	CTT	2	6	23145	23150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583598
548	NC_012632	CTA	2	6	23169	23174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583598
549	NC_012632	TCAT	2	8	23189	23196	25 %	50 %	0 %	25 %	229583598
550	NC_012632	TGG	2	6	23215	23220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583598
551	NC_012632	TAT	2	6	23257	23262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583598
552	NC_012632	ATT	2	6	23285	23290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583598
553	NC_012632	TAC	2	6	23359	23364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583598
554	NC_012632	TC	3	6	23380	23385	0 %	50 %	0 %	50 %	229583598
555	NC_012632	AAG	2	6	23390	23395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583598
556	NC_012632	AGT	2	6	23423	23428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583598
557	NC_012632	CCT	2	6	23517	23522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583599
558	NC_012632	TAA	2	6	23543	23548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583599
559	NC_012632	AAT	2	6	23616	23621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583599
560	NC_012632	A	6	6	23748	23753	100 %	0 %	0 %	0 %	229583599
561	NC_012632	ATG	2	6	23846	23851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583599
562	NC_012632	TAGA	2	8	23918	23925	50 %	25 %	25 %	0 %	229583599
563	NC_012632	ACT	2	6	23935	23940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583599
564	NC_012632	AAG	2	6	24069	24074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583599
565	NC_012632	AAGAG	2	10	24151	24160	60 %	0 %	40 %	0 %	229583599
566	NC_012632	CT	3	6	24327	24332	0 %	50 %	0 %	50 %	229583599
567	NC_012632	TAG	2	6	24443	24448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583599
568	NC_012632	AGA	2	6	24490	24495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583599
569	NC_012632	AT	3	6	24519	24524	50 %	50 %	0 %	0 %	229583599
570	NC_012632	GAT	2	6	24560	24565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012632	TGA	2	6	24589	24594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012632	GAT	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012632	TAGA	2	8	24633	24640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012632	ATA	2	6	24661	24666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_012632	AT	3	6	24669	24674	50 %	50 %	0 %	0 %	229583600
576	NC_012632	AGA	2	6	24744	24749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583600
577	NC_012632	AT	3	6	24832	24837	50 %	50 %	0 %	0 %	229583600
578	NC_012632	GAT	2	6	24856	24861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583600
579	NC_012632	AT	3	6	24860	24865	50 %	50 %	0 %	0 %	229583600
580	NC_012632	TCCA	2	8	24877	24884	25 %	25 %	0 %	50 %	229583600
581	NC_012632	AC	3	6	24920	24925	50 %	0 %	0 %	50 %	229583600
582	NC_012632	ATA	2	6	24965	24970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583600
583	NC_012632	ATT	2	6	24998	25003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583600
584	NC_012632	GAT	2	6	25066	25071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583600
585	NC_012632	ATT	2	6	25081	25086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583600
586	NC_012632	TAC	2	6	25165	25170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583600
587	NC_012632	TA	3	6	25219	25224	50 %	50 %	0 %	0 %	229583600
588	NC_012632	ATT	2	6	25307	25312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583601
589	NC_012632	TGT	2	6	25335	25340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583601
590	NC_012632	AAT	2	6	25407	25412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583601
591	NC_012632	CTT	2	6	25519	25524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583601
592	NC_012632	GTT	2	6	25557	25562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583601
593	NC_012632	ACT	2	6	25585	25590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583601
594	NC_012632	CTGA	2	8	25834	25841	25 %	25 %	25 %	25 %	229583601
595	NC_012632	AAGG	2	8	25860	25867	50 %	0 %	50 %	0 %	229583601
596	NC_012632	GTT	2	6	25873	25878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583601
597	NC_012632	ATA	2	6	25882	25887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583601
598	NC_012632	GTG	2	6	25943	25948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583601
599	NC_012632	TCA	2	6	25957	25962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583601
600	NC_012632	GAT	2	6	26077	26082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583601
601	NC_012632	TGG	2	6	26112	26117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583601
602	NC_012632	GA	3	6	26140	26145	50 %	0 %	50 %	0 %	229583601
603	NC_012632	GAG	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583601
604	NC_012632	GTT	2	6	26170	26175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583601
605	NC_012632	AAT	2	6	26214	26219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583601
606	NC_012632	TAT	2	6	26272	26277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583601
607	NC_012632	CA	3	6	26324	26329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_012632	AT	3	6	26330	26335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012632	AGT	2	6	26360	26365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583602
610	NC_012632	CTT	2	6	26406	26411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583602
611	NC_012632	AAG	2	6	26442	26447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583602
612	NC_012632	AGC	2	6	26470	26475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583602
613	NC_012632	A	6	6	26552	26557	100 %	0 %	0 %	0 %	229583602
614	NC_012632	GAAGA	2	10	26561	26570	60 %	0 %	40 %	0 %	229583602
615	NC_012632	TA	3	6	26574	26579	50 %	50 %	0 %	0 %	229583602
616	NC_012632	GAA	2	6	26589	26594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583602
617	NC_012632	ATTT	2	8	26618	26625	25 %	75 %	0 %	0 %	229583602
618	NC_012632	ATG	2	6	26678	26683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583602
619	NC_012632	TAT	2	6	26696	26701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583602
620	NC_012632	AAGA	2	8	26752	26759	75 %	0 %	25 %	0 %	229583602
621	NC_012632	TGA	2	6	26905	26910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583602
622	NC_012632	TATTT	2	10	26917	26926	20 %	80 %	0 %	0 %	229583602
623	NC_012632	AAC	2	6	26988	26993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583602
624	NC_012632	TAG	2	6	27045	27050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012632	TAA	2	6	27067	27072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012632	TAG	2	6	27086	27091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012632	TAATAC	2	12	27112	27123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
628	NC_012632	AAAAT	2	10	27149	27158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012632	TAC	2	6	27178	27183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583603
630	NC_012632	CTA	2	6	27187	27192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583603
631	NC_012632	TAT	2	6	27229	27234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583603
632	NC_012632	ATT	2	6	27258	27263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583603
633	NC_012632	CTCC	2	8	27283	27290	0 %	25 %	0 %	75 %	229583603
634	NC_012632	TGCT	2	8	27352	27359	0 %	50 %	25 %	25 %	229583603
635	NC_012632	TAT	2	6	27476	27481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583603
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646	NC_012632	TA	3	6	27887	27892	50 %	50 %	0 %	0 %	229583603
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651	NC_012632	ATA	2	6	28190	28195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583603
652	NC_012632	ATAA	2	8	28219	28226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_012632	TA	3	6	28234	28239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_012632	AGTTA	2	10	28360	28369	40 %	40 %	20 %	0 %	229583604
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742	NC_012632	CTTTTC	2	12	32719	32730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_012632	GTTT	2	8	33454	33461	0 %	75 %	25 %	0 %	229583609
760	NC_012632	AAG	2	6	33528	33533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583609
761	NC_012632	CCT	2	6	33539	33544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583609
762	NC_012632	CTTCT	2	10	33574	33583	0 %	60 %	0 %	40 %	229583609
763	NC_012632	TAA	2	6	33616	33621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583609
764	NC_012632	ATA	2	6	33663	33668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583609
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773	NC_012632	AT	3	6	34187	34192	50 %	50 %	0 %	0 %	229583610
774	NC_012632	TAA	2	6	34210	34215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_012632	TAC	2	6	34246	34251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_012632	GGT	2	6	34261	34266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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782	NC_012632	A	6	6	34541	34546	100 %	0 %	0 %	0 %	229583611
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786	NC_012632	TAT	2	6	34687	34692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583611
787	NC_012632	GAAA	2	8	34703	34710	75 %	0 %	25 %	0 %	229583611
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794	NC_012632	ATA	2	6	34943	34948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583611
795	NC_012632	AGG	2	6	34955	34960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583611
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803	NC_012632	T	6	6	35278	35283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
804	NC_012632	TTA	2	6	35337	35342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583612
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833	NC_012632	T	6	6	36955	36960	0 %	100 %	0 %	0 %	229583615
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844	NC_012632	ACA	2	6	37604	37609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583616
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854	NC_012632	TATTTA	2	12	38248	38259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
855	NC_012632	A	6	6	38286	38291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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859	NC_012632	AAT	2	6	38383	38388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583618
860	NC_012632	ATTAG	2	10	38395	38404	40 %	40 %	20 %	0 %	229583618
861	NC_012632	CTTTT	2	10	38422	38431	0 %	80 %	0 %	20 %	229583618
862	NC_012632	CCA	2	6	38445	38450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583618
863	NC_012632	AT	4	8	38489	38496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
864	NC_012632	ATTT	2	8	38503	38510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
865	NC_012632	AAAT	2	8	38514	38521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
866	NC_012632	AT	3	6	38523	38528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
867	NC_012632	AAAT	2	8	38579	38586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
868	NC_012632	AT	3	6	38585	38590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
869	NC_012632	GAT	2	6	38611	38616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
870	NC_012632	CTG	2	6	38652	38657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
871	NC_012632	ATT	2	6	38683	38688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
872	NC_012632	TTC	2	6	38709	38714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
873	NC_012632	GGT	2	6	38724	38729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
874	NC_012632	TAA	2	6	38775	38780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
875	NC_012632	TAA	2	6	38869	38874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
876	NC_012632	ATT	2	6	38982	38987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
877	NC_012632	AATA	2	8	38989	38996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
878	NC_012632	TGGTG	2	10	39029	39038	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
879	NC_012632	GATT	2	8	39044	39051	25 %	50 %	25 %	0 %	229583619
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882	NC_012632	TAG	2	6	39093	39098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583619
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885	NC_012632	CTT	2	6	39208	39213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583619
886	NC_012632	TTTTA	2	10	39214	39223	20 %	80 %	0 %	0 %	229583619
887	NC_012632	AAAT	2	8	39233	39240	75 %	25 %	0 %	0 %	229583619
888	NC_012632	AGA	2	6	39250	39255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583619
889	NC_012632	ATTAT	2	10	39391	39400	40 %	60 %	0 %	0 %	229583619
890	NC_012632	ACTC	2	8	39416	39423	25 %	25 %	0 %	50 %	229583619
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