MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012632	TA	3	6	271014	271019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_012632	GATT	2	8	271037	271044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_012632	TA	3	6	271194	271199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_012632	AT	3	6	271250	271255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_012632	GAT	2	6	271262	271267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_012632	TTC	2	6	271287	271292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_012632	TGG	2	6	271300	271305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_012632	GCA	2	6	271424	271429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_012632	TGAC	2	8	271431	271438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_012632	TTCGA	2	10	271442	271451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6011	NC_012632	GCT	2	6	271538	271543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_012632	TCTA	2	8	271611	271618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_012632	AGA	2	6	271756	271761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_012632	AG	3	6	272067	272072	50 %	0 %	50 %	0 %	229583878
6015	NC_012632	TGG	2	6	272122	272127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583878
6016	NC_012632	TAA	2	6	272128	272133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583878
6017	NC_012632	TTC	2	6	272145	272150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583878
6018	NC_012632	ACA	2	6	272210	272215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583878
6019	NC_012632	GA	3	6	272300	272305	50 %	0 %	50 %	0 %	229583878
6020	NC_012632	T	6	6	272377	272382	0 %	100 %	0 %	0 %	229583878
6021	NC_012632	TAA	2	6	272388	272393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583878
6022	NC_012632	GAT	2	6	272437	272442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_012632	GGT	2	6	272550	272555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012632	ATGA	2	8	272582	272589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_012632	TGAAA	2	10	272602	272611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_012632	CAA	2	6	272675	272680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_012632	ATTA	2	8	272682	272689	50 %	50 %	0 %	0 %	229583879
6028	NC_012632	CTTTT	2	10	272700	272709	0 %	80 %	0 %	20 %	229583879
6029	NC_012632	CTA	2	6	272728	272733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583879
6030	NC_012632	GGA	2	6	272766	272771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583879
6031	NC_012632	CTTA	2	8	272822	272829	25 %	50 %	0 %	25 %	229583879
6032	NC_012632	ATC	2	6	272879	272884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583879
6033	NC_012632	TTC	2	6	272889	272894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583879
6034	NC_012632	TA	3	6	273032	273037	50 %	50 %	0 %	0 %	229583879
6035	NC_012632	AGG	2	6	273087	273092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583879
6036	NC_012632	TTA	2	6	273114	273119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583879
6037	NC_012632	TCA	4	12	273180	273191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583879
6038	NC_012632	TCTCA	2	10	273200	273209	20 %	40 %	0 %	40 %	229583879
6039	NC_012632	TCA	3	9	273207	273215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583879
6040	NC_012632	TAC	2	6	273218	273223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583879
6041	NC_012632	GTA	2	6	273261	273266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583879
6042	NC_012632	CT	3	6	273292	273297	0 %	50 %	0 %	50 %	229583879
6043	NC_012632	CTA	2	6	273307	273312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583879
6044	NC_012632	TTCATG	2	12	273383	273394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229583879
6045	NC_012632	ACT	2	6	273486	273491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583879
6046	NC_012632	ATT	2	6	273510	273515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583879
6047	NC_012632	TGAA	2	8	273552	273559	50 %	25 %	25 %	0 %	229583879
6048	NC_012632	ATA	2	6	273609	273614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_012632	TA	3	6	273613	273618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_012632	T	6	6	273624	273629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_012632	AG	3	6	273644	273649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_012632	ACT	2	6	273656	273661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583880
6053	NC_012632	ATA	2	6	273676	273681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583880
6054	NC_012632	AAG	2	6	273686	273691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583880
6055	NC_012632	CTAATG	2	12	273744	273755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229583880
6056	NC_012632	TTC	2	6	273826	273831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583880
6057	NC_012632	AGA	2	6	273883	273888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583880
6058	NC_012632	ATT	2	6	273935	273940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583880
6059	NC_012632	GAA	2	6	274023	274028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583880
6060	NC_012632	TATT	2	8	274043	274050	25 %	75 %	0 %	0 %	229583880
6061	NC_012632	AGC	2	6	274139	274144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583880
6062	NC_012632	ATA	2	6	274146	274151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583880
6063	NC_012632	TA	3	6	274150	274155	50 %	50 %	0 %	0 %	229583880
6064	NC_012632	AAAAG	2	10	274176	274185	80 %	0 %	20 %	0 %	229583880
6065	NC_012632	GA	3	6	274232	274237	50 %	0 %	50 %	0 %	229583880
6066	NC_012632	TGAAA	2	10	274250	274259	60 %	20 %	20 %	0 %	229583880
6067	NC_012632	ATG	2	6	274372	274377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583880
6068	NC_012632	GAA	2	6	274422	274427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583880
6069	NC_012632	TAG	2	6	274538	274543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583880
6070	NC_012632	A	6	6	274561	274566	100 %	0 %	0 %	0 %	229583880
6071	NC_012632	A	6	6	274592	274597	100 %	0 %	0 %	0 %	229583880
6072	NC_012632	T	7	7	274612	274618	0 %	100 %	0 %	0 %	229583881
6073	NC_012632	TGA	2	6	274622	274627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583881
6074	NC_012632	ATG	2	6	274634	274639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583881
6075	NC_012632	CAG	2	6	274786	274791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583881
6076	NC_012632	TTA	2	6	274792	274797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583881
6077	NC_012632	GGA	2	6	274806	274811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583881
6078	NC_012632	ATC	2	6	274865	274870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583881
6079	NC_012632	TC	3	6	274901	274906	0 %	50 %	0 %	50 %	229583881
6080	NC_012632	TA	3	6	274936	274941	50 %	50 %	0 %	0 %	229583881
6081	NC_012632	GGA	2	6	274949	274954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583881
6082	NC_012632	TTA	2	6	275010	275015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583881
6083	NC_012632	ACTA	2	8	275030	275037	50 %	25 %	0 %	25 %	229583881
6084	NC_012632	CCT	2	6	275052	275057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583881
6085	NC_012632	TCC	2	6	275105	275110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583881
6086	NC_012632	ATT	2	6	275111	275116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583881
6087	NC_012632	AAC	2	6	275129	275134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583881
6088	NC_012632	ACT	2	6	275199	275204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583881
6089	NC_012632	TACA	2	8	275233	275240	50 %	25 %	0 %	25 %	229583881
6090	NC_012632	CCT	2	6	275274	275279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583881
6091	NC_012632	ATA	2	6	275285	275290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583881
6092	NC_012632	TTA	2	6	275403	275408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583881
6093	NC_012632	TAA	2	6	275474	275479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583881
6094	NC_012632	ATTT	2	8	275483	275490	25 %	75 %	0 %	0 %	229583881
6095	NC_012632	TAA	2	6	275532	275537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_012632	AAAT	2	8	275551	275558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_012632	GAA	2	6	275567	275572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583882
6098	NC_012632	T	6	6	275573	275578	0 %	100 %	0 %	0 %	229583882
6099	NC_012632	CCT	2	6	275608	275613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583882
6100	NC_012632	CACT	2	8	275614	275621	25 %	25 %	0 %	50 %	229583882
6101	NC_012632	GGTAT	2	10	275640	275649	20 %	40 %	40 %	0 %	229583882
6102	NC_012632	CAA	2	6	275730	275735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583882
6103	NC_012632	TGT	2	6	275789	275794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583882
6104	NC_012632	ATCT	2	8	275836	275843	25 %	50 %	0 %	25 %	229583882
6105	NC_012632	TCT	2	6	275872	275877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583882
6106	NC_012632	TA	3	6	275879	275884	50 %	50 %	0 %	0 %	229583882
6107	NC_012632	TAT	2	6	275890	275895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583882
6108	NC_012632	CTT	2	6	275941	275946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583882
6109	NC_012632	TTC	2	6	275963	275968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583882
6110	NC_012632	CCT	2	6	276019	276024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583882
6111	NC_012632	GCT	3	9	276036	276044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583882
6112	NC_012632	TTA	2	6	276046	276051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583882
6113	NC_012632	AGCC	2	8	276103	276110	25 %	0 %	25 %	50 %	229583882
6114	NC_012632	AATA	2	8	276149	276156	75 %	25 %	0 %	0 %	229583882
6115	NC_012632	TCA	2	6	276168	276173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583882
6116	NC_012632	CTC	2	6	276371	276376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583882
6117	NC_012632	ATA	2	6	276506	276511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_012632	ATA	2	6	276526	276531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_012632	TTA	2	6	276557	276562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_012632	TA	3	6	276566	276571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_012632	TAT	2	6	276598	276603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583883
6122	NC_012632	TTG	2	6	276682	276687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583883
6123	NC_012632	TAA	2	6	276710	276715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583883
6124	NC_012632	ATT	2	6	276917	276922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583883
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6126	NC_012632	TAA	2	6	276973	276978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583883
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6251	NC_012632	ATT	2	6	283061	283066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583889
6252	NC_012632	TCT	2	6	283096	283101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583889
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6255	NC_012632	TCC	2	6	283224	283229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583889
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6259	NC_012632	CTTT	2	8	283444	283451	0 %	75 %	0 %	25 %	229583889
6260	NC_012632	CAT	4	12	283472	283483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583889
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6263	NC_012632	CAT	2	6	283573	283578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583889
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6271	NC_012632	ATC	2	6	284079	284084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583890
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6276	NC_012632	TAA	2	6	284261	284266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6277	NC_012632	TA	3	6	284355	284360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6279	NC_012632	TTA	2	6	284444	284449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6280	NC_012632	AAAG	2	8	284469	284476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6281	NC_012632	GGTT	2	8	284501	284508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6282	NC_012632	TTC	2	6	284520	284525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6283	NC_012632	TGA	2	6	284614	284619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583891
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6288	NC_012632	ATTT	2	8	284845	284852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6289	NC_012632	ATC	2	6	284919	284924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6292	NC_012632	TCC	2	6	285028	285033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6293	NC_012632	TAG	2	6	285117	285122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6294	NC_012632	TTC	2	6	285128	285133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6295	NC_012632	ACA	2	6	285143	285148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6296	NC_012632	CAT	2	6	285180	285185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6298	NC_012632	TCC	2	6	285364	285369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6300	NC_012632	TCA	2	6	285407	285412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6321	NC_012632	TCT	2	6	286528	286533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6322	NC_012632	ATA	2	6	286540	286545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6324	NC_012632	CT	3	6	286575	286580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6352	NC_012632	TCT	2	6	287739	287744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6353	NC_012632	CTT	2	6	287764	287769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6354	NC_012632	CTT	2	6	287821	287826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6366	NC_012632	TC	3	6	288430	288435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6367	NC_012632	TC	4	8	288437	288444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6368	NC_012632	CTTT	2	8	288449	288456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6369	NC_012632	TTC	2	6	288512	288517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6370	NC_012632	CCTAG	2	10	288526	288535	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6371	NC_012632	GTT	2	6	288575	288580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6375	NC_012632	A	6	6	288717	288722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6376	NC_012632	T	7	7	288739	288745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6377	NC_012632	T	6	6	288764	288769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6378	NC_012632	A	6	6	288775	288780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6379	NC_012632	TGT	2	6	288835	288840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6381	NC_012632	T	6	6	288959	288964	0 %	100 %	0 %	0 %	229583894
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6497	NC_012632	T	6	6	294233	294238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_012632	AGTA	2	8	294250	294257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_012632	TAA	2	6	294295	294300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583901
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