MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012632	ATT	2	6	225211	225216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
5002	NC_012632	ACT	2	6	225257	225262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583831
5003	NC_012632	CAG	2	6	225273	225278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583831
5004	NC_012632	TAT	2	6	225340	225345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
5005	NC_012632	GTGCT	2	10	225397	225406	0 %	40 %	40 %	20 %	229583831
5006	NC_012632	ATT	2	6	225446	225451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
5007	NC_012632	TAT	2	6	225496	225501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
5008	NC_012632	GCA	2	6	225551	225556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583832
5009	NC_012632	TTG	2	6	225624	225629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583832
5010	NC_012632	ACC	2	6	225667	225672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583832
5011	NC_012632	TA	3	6	225730	225735	50 %	50 %	0 %	0 %	229583832
5012	NC_012632	CCT	2	6	225750	225755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583832
5013	NC_012632	CTT	2	6	225802	225807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583832
5014	NC_012632	ATT	2	6	225815	225820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583832
5015	NC_012632	AGC	2	6	225823	225828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583832
5016	NC_012632	AGC	2	6	225937	225942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583832
5017	NC_012632	TCA	2	6	225980	225985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
5018	NC_012632	CATT	2	8	226092	226099	25 %	50 %	0 %	25 %	229583832
5019	NC_012632	ACT	2	6	226268	226273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
5020	NC_012632	ACT	2	6	226289	226294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
5021	NC_012632	TTA	2	6	226311	226316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583832
5022	NC_012632	TG	3	6	226381	226386	0 %	50 %	50 %	0 %	229583832
5023	NC_012632	GCT	2	6	226394	226399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583832
5024	NC_012632	TA	3	6	226507	226512	50 %	50 %	0 %	0 %	229583832
5025	NC_012632	CTA	2	6	226656	226661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
5026	NC_012632	AAG	2	6	226757	226762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012632	ATT	2	6	226768	226773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_012632	AATA	2	8	226774	226781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012632	GAA	2	6	226794	226799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012632	TTACAT	2	12	226801	226812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5031	NC_012632	TATTT	2	10	226837	226846	20 %	80 %	0 %	0 %	229583833
5032	NC_012632	CTA	2	6	226904	226909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583833
5033	NC_012632	TTC	2	6	226924	226929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583833
5034	NC_012632	TATG	2	8	226949	226956	25 %	50 %	25 %	0 %	229583833
5035	NC_012632	TGT	2	6	227029	227034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583833
5036	NC_012632	AT	3	6	227057	227062	50 %	50 %	0 %	0 %	229583833
5037	NC_012632	AATT	2	8	227124	227131	50 %	50 %	0 %	0 %	229583833
5038	NC_012632	TCC	2	6	227156	227161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583833
5039	NC_012632	AGA	2	6	227170	227175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583833
5040	NC_012632	TAT	2	6	227259	227264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583833
5041	NC_012632	AAT	2	6	227444	227449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583833
5042	NC_012632	CT	3	6	227454	227459	0 %	50 %	0 %	50 %	229583833
5043	NC_012632	GAAA	2	8	227491	227498	75 %	0 %	25 %	0 %	229583833
5044	NC_012632	TAT	2	6	227504	227509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583833
5045	NC_012632	TAAT	2	8	227536	227543	50 %	50 %	0 %	0 %	229583833
5046	NC_012632	CT	4	8	227552	227559	0 %	50 %	0 %	50 %	229583833
5047	NC_012632	TTAAT	2	10	227561	227570	40 %	60 %	0 %	0 %	229583833
5048	NC_012632	TCC	2	6	227583	227588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583833
5049	NC_012632	GGT	2	6	227605	227610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583833
5050	NC_012632	TAA	2	6	227641	227646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583833
5051	NC_012632	ATT	2	6	227655	227660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583833
5052	NC_012632	TAC	2	6	227691	227696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583833
5053	NC_012632	TGT	2	6	227706	227711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583833
5054	NC_012632	AAT	2	6	227753	227758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583833
5055	NC_012632	TAAG	2	8	227873	227880	50 %	25 %	25 %	0 %	229583833
5056	NC_012632	CCT	2	6	227891	227896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583833
5057	NC_012632	TAAT	2	8	228077	228084	50 %	50 %	0 %	0 %	229583833
5058	NC_012632	GTC	2	6	228093	228098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583833
5059	NC_012632	TCT	2	6	228111	228116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583833
5060	NC_012632	TTA	2	6	228158	228163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012632	TA	3	6	228208	228213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_012632	ACT	2	6	228305	228310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583834
5063	NC_012632	AAT	2	6	228314	228319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583834
5064	NC_012632	GAT	2	6	228401	228406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583834
5065	NC_012632	AGA	2	6	228457	228462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583834
5066	NC_012632	TAG	2	6	228781	228786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583834
5067	NC_012632	TA	3	6	228812	228817	50 %	50 %	0 %	0 %	229583834
5068	NC_012632	TAG	2	6	228822	228827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583834
5069	NC_012632	AAGTA	2	10	228931	228940	60 %	20 %	20 %	0 %	229583834
5070	NC_012632	CGATT	2	10	228958	228967	20 %	40 %	20 %	20 %	229583834
5071	NC_012632	AAC	2	6	229007	229012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583834
5072	NC_012632	TAG	2	6	229020	229025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583834
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5075	NC_012632	AG	3	6	229441	229446	50 %	0 %	50 %	0 %	229583834
5076	NC_012632	TAC	2	6	229465	229470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583834
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5078	NC_012632	GAAG	2	8	229627	229634	50 %	0 %	50 %	0 %	229583834
5079	NC_012632	TTG	2	6	229676	229681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583834
5080	NC_012632	TTAG	2	8	229772	229779	25 %	50 %	25 %	0 %	229583834
5081	NC_012632	AGG	2	6	229804	229809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583834
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5083	NC_012632	AGAT	2	8	229896	229903	50 %	25 %	25 %	0 %	229583834
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5087	NC_012632	TAT	2	6	230071	230076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_012632	AT	3	6	230193	230198	50 %	50 %	0 %	0 %	229583835
5089	NC_012632	TAA	2	6	230205	230210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583835
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5091	NC_012632	TGT	2	6	230323	230328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583835
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5093	NC_012632	TAA	2	6	230364	230369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583835
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5095	NC_012632	A	6	6	230393	230398	100 %	0 %	0 %	0 %	229583835
5096	NC_012632	ATT	2	6	230433	230438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583835
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5099	NC_012632	A	6	6	230545	230550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_012632	TAT	2	6	230557	230562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583836
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5105	NC_012632	TA	3	6	230721	230726	50 %	50 %	0 %	0 %	229583836
5106	NC_012632	ATT	2	6	230764	230769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583836
5107	NC_012632	GCTT	2	8	230825	230832	0 %	50 %	25 %	25 %	229583836
5108	NC_012632	TA	3	6	230858	230863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012632	TTG	2	6	230942	230947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_012632	ATTT	2	8	230958	230965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_012632	GGT	2	6	231024	231029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583837
5112	NC_012632	TGC	2	6	231071	231076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583837
5113	NC_012632	GATA	2	8	231095	231102	50 %	25 %	25 %	0 %	229583837
5114	NC_012632	TAG	2	6	231122	231127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583837
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5116	NC_012632	TA	3	6	231135	231140	50 %	50 %	0 %	0 %	229583837
5117	NC_012632	TTA	2	6	231150	231155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583837
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5119	NC_012632	AGT	2	6	231218	231223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583837
5120	NC_012632	A	6	6	231248	231253	100 %	0 %	0 %	0 %	229583837
5121	NC_012632	A	7	7	231264	231270	100 %	0 %	0 %	0 %	229583837
5122	NC_012632	TGA	2	6	231307	231312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583837
5123	NC_012632	CCA	2	6	231324	231329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583837
5124	NC_012632	TGTT	2	8	231341	231348	0 %	75 %	25 %	0 %	229583837
5125	NC_012632	TTA	2	6	231368	231373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583837
5126	NC_012632	TGAA	2	8	231382	231389	50 %	25 %	25 %	0 %	229583837
5127	NC_012632	A	6	6	231388	231393	100 %	0 %	0 %	0 %	229583837
5128	NC_012632	GATTA	2	10	231394	231403	40 %	40 %	20 %	0 %	229583837
5129	NC_012632	GAAT	2	8	231488	231495	50 %	25 %	25 %	0 %	229583837
5130	NC_012632	TAA	2	6	231547	231552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583837
5131	NC_012632	TAA	2	6	231584	231589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583837
5132	NC_012632	AAGA	2	8	231630	231637	75 %	0 %	25 %	0 %	229583837
5133	NC_012632	AAGT	2	8	231719	231726	50 %	25 %	25 %	0 %	229583837
5134	NC_012632	GAAA	2	8	231805	231812	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_012632	TA	3	6	231817	231822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_012632	ATA	2	6	231931	231936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583838
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5139	NC_012632	CTT	2	6	232032	232037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583838
5140	NC_012632	AAT	2	6	232072	232077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
5141	NC_012632	AT	3	6	232283	232288	50 %	50 %	0 %	0 %	229583839
5142	NC_012632	TTC	2	6	232289	232294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583839
5143	NC_012632	AGAT	2	8	232402	232409	50 %	25 %	25 %	0 %	229583839
5144	NC_012632	GCT	2	6	232427	232432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583839
5145	NC_012632	GTA	2	6	232451	232456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583839
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5147	NC_012632	TAG	2	6	232485	232490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583839
5148	NC_012632	AGTC	2	8	232497	232504	25 %	25 %	25 %	25 %	229583839
5149	NC_012632	GAT	2	6	232510	232515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583839
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5152	NC_012632	GTAATC	2	12	232670	232681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229583839
5153	NC_012632	TCAC	2	8	232704	232711	25 %	25 %	0 %	50 %	229583839
5154	NC_012632	TAC	2	6	232753	232758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583839
5155	NC_012632	GAT	2	6	232859	232864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583839
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5157	NC_012632	ATA	2	6	232922	232927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
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5159	NC_012632	TAA	2	6	233013	233018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
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5162	NC_012632	TGG	2	6	233071	233076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583839
5163	NC_012632	AAT	2	6	233092	233097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
5164	NC_012632	TAA	2	6	233133	233138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
5165	NC_012632	ACA	2	6	233174	233179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583839
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5169	NC_012632	AT	3	6	233544	233549	50 %	50 %	0 %	0 %	229583839
5170	NC_012632	T	6	6	233589	233594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5171	NC_012632	CTA	2	6	233614	233619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5172	NC_012632	GTA	2	6	233620	233625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5181	NC_012632	GAG	2	6	233992	233997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583840
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5190	NC_012632	T	6	6	234392	234397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5191	NC_012632	GAAGAG	2	12	234420	234431	50 %	0 %	50 %	0 %	229583841
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5210	NC_012632	ACAT	2	8	235341	235348	50 %	25 %	0 %	25 %	229583842
5211	NC_012632	ATT	2	6	235349	235354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5212	NC_012632	TAA	2	6	235362	235367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5213	NC_012632	TTC	2	6	235436	235441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5214	NC_012632	TTA	2	6	235506	235511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5216	NC_012632	TGA	2	6	235547	235552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5217	NC_012632	TGA	2	6	235562	235567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5218	NC_012632	AGG	2	6	235675	235680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5219	NC_012632	AATT	2	8	235810	235817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_012632	CAT	2	6	235842	235847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583843
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5222	NC_012632	CTC	2	6	235897	235902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583843
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5228	NC_012632	TA	3	6	236258	236263	50 %	50 %	0 %	0 %	229583843
5229	NC_012632	TA	3	6	236314	236319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_012632	A	6	6	236327	236332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_012632	CTT	2	6	236477	236482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583844
5232	NC_012632	CTA	2	6	236489	236494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583844
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5234	NC_012632	AATC	2	8	236561	236568	50 %	25 %	0 %	25 %	229583844
5235	NC_012632	TCA	2	6	236629	236634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583844
5236	NC_012632	AGT	2	6	236701	236706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583844
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5238	NC_012632	ATCT	2	8	236717	236724	25 %	50 %	0 %	25 %	229583844
5239	NC_012632	AT	3	6	236733	236738	50 %	50 %	0 %	0 %	229583844
5240	NC_012632	CTT	2	6	236763	236768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583844
5241	NC_012632	CCA	2	6	236844	236849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583844
5242	NC_012632	CTT	2	6	236903	236908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583844
5243	NC_012632	TAG	2	6	236963	236968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583844
5244	NC_012632	TCA	2	6	236983	236988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583844
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5246	NC_012632	CTTT	2	8	237182	237189	0 %	75 %	0 %	25 %	229583844
5247	NC_012632	TA	3	6	237197	237202	50 %	50 %	0 %	0 %	229583844
5248	NC_012632	TCA	2	6	237307	237312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583844
5249	NC_012632	AT	3	6	237374	237379	50 %	50 %	0 %	0 %	229583844
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5372	NC_012632	AAAG	2	8	242883	242890	75 %	0 %	25 %	0 %	229583850
5373	NC_012632	TGA	2	6	242904	242909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583850
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5385	NC_012632	ATT	2	6	243576	243581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5389	NC_012632	ATT	2	6	243739	243744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_012632	AT	3	6	243826	243831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_012632	TAA	2	6	243838	243843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_012632	TTA	2	6	243870	243875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_012632	ATA	2	6	243918	243923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5453	NC_012632	CTAA	2	8	247102	247109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5497	NC_012632	AGA	2	6	249523	249528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583858
5498	NC_012632	AGA	2	6	249586	249591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583858
5499	NC_012632	GAG	2	6	249607	249612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583858
5500	NC_012632	ATTTA	2	10	249658	249667	40 %	60 %	0 %	0 %	229583858

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