MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 plasmid pYN01

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012624	AT	3	6	403	408	50 %	50 %	0 %	0 %	228288720
2	NC_012624	CA	4	8	615	622	50 %	0 %	0 %	50 %	228288720
3	NC_012624	AT	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	228288723
4	NC_012624	AT	3	6	2219	2224	50 %	50 %	0 %	0 %	228288724
5	NC_012624	AG	3	6	3407	3412	50 %	0 %	50 %	0 %	228288725
6	NC_012624	AG	3	6	3730	3735	50 %	0 %	50 %	0 %	228288726
7	NC_012624	TA	3	6	4176	4181	50 %	50 %	0 %	0 %	228288726
8	NC_012624	AG	3	6	4816	4821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012624	AT	3	6	4904	4909	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
10	NC_012624	TA	3	6	5026	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
11	NC_012624	TA	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
12	NC_012624	TA	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	228288728
13	NC_012624	TC	3	6	6623	6628	0 %	50 %	0 %	50 %	228288729
14	NC_012624	CT	3	6	6649	6654	0 %	50 %	0 %	50 %	228288729
15	NC_012624	TC	3	6	7068	7073	0 %	50 %	0 %	50 %	228288730
16	NC_012624	TC	3	6	7295	7300	0 %	50 %	0 %	50 %	228288731
17	NC_012624	GA	3	6	7326	7331	50 %	0 %	50 %	0 %	228288731
18	NC_012624	AT	3	6	7753	7758	50 %	50 %	0 %	0 %	228288733
19	NC_012624	CT	3	6	8667	8672	0 %	50 %	0 %	50 %	228288736
20	NC_012624	AG	3	6	8973	8978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012624	TC	3	6	9149	9154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012624	TA	3	6	9242	9247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012624	AC	3	6	9464	9469	50 %	0 %	0 %	50 %	228288737
24	NC_012624	CA	3	6	9689	9694	50 %	0 %	0 %	50 %	228288737
25	NC_012624	GT	3	6	9831	9836	0 %	50 %	50 %	0 %	228288737
26	NC_012624	AG	3	6	9997	10002	50 %	0 %	50 %	0 %	228288738
27	NC_012624	TC	3	6	10955	10960	0 %	50 %	0 %	50 %	228288738
28	NC_012624	AT	3	6	11203	11208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012624	AG	3	6	11295	11300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012624	TA	3	6	11993	11998	50 %	50 %	0 %	0 %	228288740
31	NC_012624	AG	3	6	12226	12231	50 %	0 %	50 %	0 %	228288740
32	NC_012624	TA	3	6	12239	12244	50 %	50 %	0 %	0 %	228288740
33	NC_012624	CT	3	6	12789	12794	0 %	50 %	0 %	50 %	228288741
34	NC_012624	CT	3	6	13120	13125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012624	TC	3	6	13613	13618	0 %	50 %	0 %	50 %	228288742
36	NC_012624	TA	3	6	13655	13660	50 %	50 %	0 %	0 %	228288742
37	NC_012624	TC	3	6	13678	13683	0 %	50 %	0 %	50 %	228288742
38	NC_012624	AG	3	6	13792	13797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012624	AG	3	6	13826	13831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012624	TC	3	6	14075	14080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012624	GA	3	6	14102	14107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012624	TA	3	6	14114	14119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012624	AT	3	6	14221	14226	50 %	50 %	0 %	0 %	228288744
44	NC_012624	AT	3	6	14584	14589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012624	TA	3	6	15088	15093	50 %	50 %	0 %	0 %	228288745
46	NC_012624	TA	4	8	15315	15322	50 %	50 %	0 %	0 %	228288745
47	NC_012624	TA	4	8	15506	15513	50 %	50 %	0 %	0 %	228288745
48	NC_012624	CT	3	6	15600	15605	0 %	50 %	0 %	50 %	228288745
49	NC_012624	TA	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	228288746
50	NC_012624	AT	3	6	16736	16741	50 %	50 %	0 %	0 %	228288746
51	NC_012624	TC	3	6	16822	16827	0 %	50 %	0 %	50 %	228288746
52	NC_012624	AG	4	8	17049	17056	50 %	0 %	50 %	0 %	228288746
53	NC_012624	TC	3	6	17208	17213	0 %	50 %	0 %	50 %	228288746
54	NC_012624	AT	3	6	17825	17830	50 %	50 %	0 %	0 %	228288746
55	NC_012624	TC	3	6	18533	18538	0 %	50 %	0 %	50 %	228288747
56	NC_012624	TA	3	6	18732	18737	50 %	50 %	0 %	0 %	228288747
57	NC_012624	CT	3	6	19844	19849	0 %	50 %	0 %	50 %	228288747
58	NC_012624	CT	4	8	19958	19965	0 %	50 %	0 %	50 %	228288747
59	NC_012624	TA	3	6	20601	20606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012624	AG	3	6	20898	20903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012624	TA	3	6	22367	22372	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
62	NC_012624	TA	3	6	22755	22760	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
63	NC_012624	TA	3	6	22905	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
64	NC_012624	CT	3	6	22933	22938	0 %	50 %	0 %	50 %	228288748
65	NC_012624	TC	3	6	22958	22963	0 %	50 %	0 %	50 %	228288748
66	NC_012624	TA	4	8	22968	22975	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
67	NC_012624	GT	3	6	23260	23265	0 %	50 %	50 %	0 %	228288748
68	NC_012624	AT	3	6	23776	23781	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
69	NC_012624	AT	3	6	24825	24830	50 %	50 %	0 %	0 %	228288748
70	NC_012624	TC	3	6	25712	25717	0 %	50 %	0 %	50 %	228288750
71	NC_012624	AT	3	6	26610	26615	50 %	50 %	0 %	0 %	228288752
72	NC_012624	TC	4	8	27308	27315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012624	AG	3	6	27817	27822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012624	TC	4	8	28069	28076	0 %	50 %	0 %	50 %	228288754
75	NC_012624	AT	4	8	28155	28162	50 %	50 %	0 %	0 %	228288754
76	NC_012624	AT	3	6	28598	28603	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
77	NC_012624	AT	3	6	29152	29157	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
78	NC_012624	TA	3	6	29685	29690	50 %	50 %	0 %	0 %	228288755
79	NC_012624	CA	3	6	31392	31397	50 %	0 %	0 %	50 %	228288757
80	NC_012624	TA	4	8	31512	31519	50 %	50 %	0 %	0 %	228288757
81	NC_012624	TA	3	6	32921	32926	50 %	50 %	0 %	0 %	228288758
82	NC_012624	TC	3	6	33706	33711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012624	TA	3	6	34596	34601	50 %	50 %	0 %	0 %	228288759
84	NC_012624	AT	3	6	35400	35405	50 %	50 %	0 %	0 %	228288760
85	NC_012624	AT	3	6	35762	35767	50 %	50 %	0 %	0 %	228288761
86	NC_012624	TA	3	6	36056	36061	50 %	50 %	0 %	0 %	228288763
87	NC_012624	TC	3	6	36518	36523	0 %	50 %	0 %	50 %	228288763
88	NC_012624	TA	3	6	36737	36742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012624	CA	3	6	36784	36789	50 %	0 %	0 %	50 %	228288764
90	NC_012624	AG	3	6	36865	36870	50 %	0 %	50 %	0 %	228288764
91	NC_012624	GA	3	6	37268	37273	50 %	0 %	50 %	0 %	228288765
92	NC_012624	TA	3	6	38121	38126	50 %	50 %	0 %	0 %	228288766
93	NC_012624	AC	3	6	39191	39196	50 %	0 %	0 %	50 %	228288766
94	NC_012624	TC	3	6	39306	39311	0 %	50 %	0 %	50 %	228288767
95	NC_012624	TC	3	6	39537	39542	0 %	50 %	0 %	50 %	228288768
96	NC_012624	AT	3	6	39651	39656	50 %	50 %	0 %	0 %	228288768
97	NC_012624	AT	4	8	39690	39697	50 %	50 %	0 %	0 %	228288768
98	NC_012624	AT	3	6	39832	39837	50 %	50 %	0 %	0 %	228288768
99	NC_012624	TC	3	6	39988	39993	0 %	50 %	0 %	50 %	228288768
100	NC_012624	AT	3	6	40489	40494	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
101	NC_012624	TG	4	8	40798	40805	0 %	50 %	50 %	0 %	228288769
102	NC_012624	GA	3	6	40872	40877	50 %	0 %	50 %	0 %	228288769
103	NC_012624	TG	3	6	40952	40957	0 %	50 %	50 %	0 %	228288769
104	NC_012624	TA	4	8	41252	41259	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
105	NC_012624	AT	3	6	41264	41269	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
106	NC_012624	AT	3	6	41927	41932	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769
107	NC_012624	AT	3	6	42207	42212	50 %	50 %	0 %	0 %	228288769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.