MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 3023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012587	CCGCG	2	10	1351	1360	0 %	0 %	40 %	60 %	227820588
2	NC_012587	GCCGA	2	10	5200	5209	20 %	0 %	40 %	40 %	227820593
3	NC_012587	GAAGA	2	10	5413	5422	60 %	0 %	40 %	0 %	227820593
4	NC_012587	GCAGC	2	10	5933	5942	20 %	0 %	40 %	40 %	227820594
5	NC_012587	GTTCC	2	10	6167	6176	0 %	40 %	20 %	40 %	227820594
6	NC_012587	AGGCA	2	10	7307	7316	40 %	0 %	40 %	20 %	227820595
7	NC_012587	GTTCC	2	10	7719	7728	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012587	CTTGC	2	10	7932	7941	0 %	40 %	20 %	40 %	227820596
9	NC_012587	CTTCC	2	10	8311	8320	0 %	40 %	0 %	60 %	227820597
10	NC_012587	AGACA	2	10	10307	10316	60 %	0 %	20 %	20 %	227820599
11	NC_012587	TCGCC	2	10	10500	10509	0 %	20 %	20 %	60 %	227820599
12	NC_012587	CGAGG	2	10	10644	10653	20 %	0 %	60 %	20 %	227820599
13	NC_012587	GTGCC	2	10	11097	11106	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012587	CGGCA	2	10	11636	11645	20 %	0 %	40 %	40 %	227820600
15	NC_012587	GCGCC	2	10	12109	12118	0 %	0 %	40 %	60 %	227820600
16	NC_012587	GCGCA	2	10	12357	12366	20 %	0 %	40 %	40 %	227820600
17	NC_012587	GAGCC	2	10	13764	13773	20 %	0 %	40 %	40 %	227820602
18	NC_012587	GAAGT	2	10	14777	14786	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012587	CCGAA	2	10	16240	16249	40 %	0 %	20 %	40 %	227820604
20	NC_012587	GATCG	2	10	16879	16888	20 %	20 %	40 %	20 %	227820605
21	NC_012587	GGTCG	2	10	16921	16930	0 %	20 %	60 %	20 %	227820605
22	NC_012587	GCCGC	2	10	18660	18669	0 %	0 %	40 %	60 %	227820607
23	NC_012587	TCCAT	2	10	19535	19544	20 %	40 %	0 %	40 %	227820608
24	NC_012587	CGCGG	2	10	21651	21660	0 %	0 %	60 %	40 %	227820612
25	NC_012587	TGCCA	2	10	24120	24129	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012587	CTTTC	2	10	27090	27099	0 %	60 %	0 %	40 %	227820616
27	NC_012587	TAAAA	2	10	27500	27509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012587	AGCCG	2	10	28185	28194	20 %	0 %	40 %	40 %	227820617
29	NC_012587	GCCGT	2	10	29825	29834	0 %	20 %	40 %	40 %	227820617
30	NC_012587	GACCG	2	10	31159	31168	20 %	0 %	40 %	40 %	227820618
31	NC_012587	CGGAT	2	10	31226	31235	20 %	20 %	40 %	20 %	227820618
32	NC_012587	TCGAT	2	10	31247	31256	20 %	40 %	20 %	20 %	227820618
33	NC_012587	GCGCC	2	10	31308	31317	0 %	0 %	40 %	60 %	227820618
34	NC_012587	TCGAT	2	10	31508	31517	20 %	40 %	20 %	20 %	227820618
35	NC_012587	TTGCA	2	10	32950	32959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012587	CCGAC	2	10	33076	33085	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_012587	GCGCC	2	10	33356	33365	0 %	0 %	40 %	60 %	227820619
38	NC_012587	ACGGG	2	10	33899	33908	20 %	0 %	60 %	20 %	227820619
39	NC_012587	GCACC	2	10	34361	34370	20 %	0 %	20 %	60 %	227820619
40	NC_012587	CGGGC	2	10	35132	35141	0 %	0 %	60 %	40 %	227820619
41	NC_012587	ACCGG	2	10	36197	36206	20 %	0 %	40 %	40 %	227820620
42	NC_012587	ATCCG	2	10	38828	38837	20 %	20 %	20 %	40 %	227820622
43	NC_012587	GCCGT	2	10	39365	39374	0 %	20 %	40 %	40 %	227820623
44	NC_012587	GCTGA	2	10	39768	39777	20 %	20 %	40 %	20 %	227820623
45	NC_012587	CGAAG	2	10	39975	39984	40 %	0 %	40 %	20 %	227820624
46	NC_012587	GGAGC	2	10	41629	41638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012587	TCCGA	2	10	42171	42180	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012587	CGGGG	2	10	43852	43861	0 %	0 %	80 %	20 %	227820628
49	NC_012587	CGGCC	2	10	45140	45149	0 %	0 %	40 %	60 %	227820629
50	NC_012587	GCGCG	2	10	45200	45209	0 %	0 %	60 %	40 %	227820629
51	NC_012587	CGGCT	2	10	45255	45264	0 %	20 %	40 %	40 %	227820629
52	NC_012587	TGTCC	2	10	45970	45979	0 %	40 %	20 %	40 %	227820630
53	NC_012587	CGCGT	2	10	47273	47282	0 %	20 %	40 %	40 %	227820631
54	NC_012587	CGTTC	2	10	49456	49465	0 %	40 %	20 %	40 %	227820633
55	NC_012587	GCCGC	2	10	52026	52035	0 %	0 %	40 %	60 %	227820635
56	NC_012587	CCGCG	2	10	52256	52265	0 %	0 %	40 %	60 %	227820636
57	NC_012587	TCGAG	2	10	54682	54691	20 %	20 %	40 %	20 %	227820639
58	NC_012587	GCGAG	2	10	56867	56876	20 %	0 %	60 %	20 %	227820640
59	NC_012587	TTGCC	2	10	57062	57071	0 %	40 %	20 %	40 %	227820640
60	NC_012587	CGCGG	2	10	57978	57987	0 %	0 %	60 %	40 %	227820641
61	NC_012587	CGCGT	2	10	58985	58994	0 %	20 %	40 %	40 %	227820642
62	NC_012587	GAAGA	2	10	61074	61083	60 %	0 %	40 %	0 %	227820644
63	NC_012587	CGCGG	2	10	62651	62660	0 %	0 %	60 %	40 %	227820646
64	NC_012587	GGCGC	2	10	62896	62905	0 %	0 %	60 %	40 %	227820646
65	NC_012587	CGCGG	2	10	64192	64201	0 %	0 %	60 %	40 %	227820648
66	NC_012587	GATCG	2	10	65029	65038	20 %	20 %	40 %	20 %	227820648
67	NC_012587	GGCCC	2	10	65176	65185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_012587	AGGTC	2	10	65777	65786	20 %	20 %	40 %	20 %	227820649
69	NC_012587	AGCGC	2	10	69186	69195	20 %	0 %	40 %	40 %	227820650
70	NC_012587	CGCGG	2	10	72788	72797	0 %	0 %	60 %	40 %	227820653
71	NC_012587	GACGG	2	10	75242	75251	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012587	ATCGC	2	10	76626	76635	20 %	20 %	20 %	40 %	227820657
73	NC_012587	TTCGA	2	10	81107	81116	20 %	40 %	20 %	20 %	227820661
74	NC_012587	CATGG	2	10	81241	81250	20 %	20 %	40 %	20 %	227820661
75	NC_012587	AGGGC	2	10	81297	81306	20 %	0 %	60 %	20 %	227820661
76	NC_012587	GGAAG	2	10	83043	83052	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012587	ACCAC	2	10	83203	83212	40 %	0 %	0 %	60 %	227820664
78	NC_012587	CGATG	2	10	83396	83405	20 %	20 %	40 %	20 %	227820664
79	NC_012587	CCGGC	2	10	83631	83640	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_012587	GCCGA	2	10	86638	86647	20 %	0 %	40 %	40 %	227820668
81	NC_012587	GGGTC	2	10	87166	87175	0 %	20 %	60 %	20 %	227820669
82	NC_012587	GGGGA	2	10	89596	89605	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012587	CCGGG	2	10	91859	91868	0 %	0 %	60 %	40 %	227820673
84	NC_012587	GGCTG	2	10	92433	92442	0 %	20 %	60 %	20 %	227820673
85	NC_012587	AGCGA	2	10	94526	94535	40 %	0 %	40 %	20 %	227820675
86	NC_012587	CCGAT	2	10	96022	96031	20 %	20 %	20 %	40 %	227820676
87	NC_012587	GCAGT	2	10	97561	97570	20 %	20 %	40 %	20 %	227820677
88	NC_012587	CGGCC	2	10	98523	98532	0 %	0 %	40 %	60 %	227820678
89	NC_012587	ACGGC	2	10	98729	98738	20 %	0 %	40 %	40 %	227820678
90	NC_012587	CGCGC	2	10	100427	100436	0 %	0 %	40 %	60 %	227820679
91	NC_012587	CGAAG	2	10	101201	101210	40 %	0 %	40 %	20 %	227820680
92	NC_012587	GTCGG	2	10	101667	101676	0 %	20 %	60 %	20 %	227820681
93	NC_012587	CTTCG	2	10	102465	102474	0 %	40 %	20 %	40 %	227820682
94	NC_012587	GCTCG	2	10	103523	103532	0 %	20 %	40 %	40 %	227820683
95	NC_012587	GGGGA	2	10	103947	103956	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012587	CCGGG	2	10	104410	104419	0 %	0 %	60 %	40 %	227820684
97	NC_012587	TCGTC	2	10	104728	104737	0 %	40 %	20 %	40 %	227820684
98	NC_012587	GCGAT	2	10	106161	106170	20 %	20 %	40 %	20 %	227820684
99	NC_012587	GGTGC	2	10	108450	108459	0 %	20 %	60 %	20 %	227820686
100	NC_012587	TGCCG	2	10	108488	108497	0 %	20 %	40 %	40 %	227820686
101	NC_012587	AGGCG	2	10	108635	108644	20 %	0 %	60 %	20 %	227820686
102	NC_012587	CCATG	2	10	109510	109519	20 %	20 %	20 %	40 %	227820687
103	NC_012587	TTGCG	2	10	110690	110699	0 %	40 %	40 %	20 %	227820688
104	NC_012587	CCGGC	2	10	111722	111731	0 %	0 %	40 %	60 %	227820689
105	NC_012587	CGGCG	2	10	112466	112475	0 %	0 %	60 %	40 %	227820690
106	NC_012587	ACGAA	2	10	112942	112951	60 %	0 %	20 %	20 %	227820690
107	NC_012587	TCAGC	2	10	113429	113438	20 %	20 %	20 %	40 %	227820690
108	NC_012587	TGACG	2	10	118381	118390	20 %	20 %	40 %	20 %	227820696
109	NC_012587	CGGCG	2	10	119365	119374	0 %	0 %	60 %	40 %	227820697
110	NC_012587	CCGGC	2	10	124024	124033	0 %	0 %	40 %	60 %	227820702
111	NC_012587	CTGCC	2	10	124567	124576	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_012587	GGCAG	2	10	124738	124747	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012587	GCCGC	2	10	130371	130380	0 %	0 %	40 %	60 %	227820706
114	NC_012587	GGCGA	2	10	131023	131032	20 %	0 %	60 %	20 %	227820706
115	NC_012587	TTCAG	2	10	131927	131936	20 %	40 %	20 %	20 %	227820706
116	NC_012587	CGGGC	2	10	132927	132936	0 %	0 %	60 %	40 %	227820707
117	NC_012587	GAGAA	2	10	134095	134104	60 %	0 %	40 %	0 %	227820708
118	NC_012587	TAGAA	2	10	135864	135873	60 %	20 %	20 %	0 %	227820711
119	NC_012587	CTCTG	2	10	136136	136145	0 %	40 %	20 %	40 %	227820711
120	NC_012587	CGGGC	2	10	140361	140370	0 %	0 %	60 %	40 %	227820716
121	NC_012587	TCTGG	2	10	141201	141210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012587	GCATT	2	10	148118	148127	20 %	40 %	20 %	20 %	227820720
123	NC_012587	GCCGC	2	10	150693	150702	0 %	0 %	40 %	60 %	227820722
124	NC_012587	CGCGA	2	10	157118	157127	20 %	0 %	40 %	40 %	227820724
125	NC_012587	GATAC	2	10	157589	157598	40 %	20 %	20 %	20 %	227820724
126	NC_012587	GGAGT	2	10	158132	158141	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012587	CGGAG	2	10	159819	159828	20 %	0 %	60 %	20 %	227820726
128	NC_012587	ATTGC	2	10	162191	162200	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012587	TCATG	2	10	162223	162232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012587	GGCCG	2	10	163011	163020	0 %	0 %	60 %	40 %	227820728
131	NC_012587	GCTTC	2	10	164267	164276	0 %	40 %	20 %	40 %	227820729
132	NC_012587	GCACG	2	10	164314	164323	20 %	0 %	40 %	40 %	227820729
133	NC_012587	GAAGA	2	10	164336	164345	60 %	0 %	40 %	0 %	227820729
134	NC_012587	CGACG	2	10	165242	165251	20 %	0 %	40 %	40 %	227820730
135	NC_012587	TGGCG	2	10	167056	167065	0 %	20 %	60 %	20 %	227820731
136	NC_012587	CTCGC	2	10	171997	172006	0 %	20 %	20 %	60 %	227820736
137	NC_012587	TGCCG	2	10	172125	172134	0 %	20 %	40 %	40 %	227820736
138	NC_012587	GGCGC	2	10	175226	175235	0 %	0 %	60 %	40 %	227820740
139	NC_012587	GGCCG	2	10	176305	176314	0 %	0 %	60 %	40 %	227820741
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141	NC_012587	CGGCT	2	10	180666	180675	0 %	20 %	40 %	40 %	227820745
142	NC_012587	TTCGG	2	10	180935	180944	0 %	40 %	40 %	20 %	227820746
143	NC_012587	CTGCG	2	10	181155	181164	0 %	20 %	40 %	40 %	227820746
144	NC_012587	CGGCG	2	10	181445	181454	0 %	0 %	60 %	40 %	227820746
145	NC_012587	CGAGG	2	10	181616	181625	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012587	GCATT	2	10	183119	183128	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012587	TCCTC	2	10	185941	185950	0 %	40 %	0 %	60 %	227820750
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151	NC_012587	TCGAC	2	10	187060	187069	20 %	20 %	20 %	40 %	227820751
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155	NC_012587	GGCTG	2	10	189670	189679	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
156	NC_012587	GCGCC	2	10	191235	191244	0 %	0 %	40 %	60 %	227820753
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192	NC_012587	ATCGG	2	10	225192	225201	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_012587	CCTTC	2	10	225883	225892	0 %	40 %	0 %	60 %	227820784
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243	NC_012587	CATCG	2	10	282730	282739	20 %	20 %	20 %	40 %	227820823
244	NC_012587	CCGAG	2	10	285108	285117	20 %	0 %	40 %	40 %	227820824
245	NC_012587	CCGCT	2	10	285139	285148	0 %	20 %	20 %	60 %	227820824
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248	NC_012587	GTTCG	2	10	287374	287383	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
249	NC_012587	ATGAG	2	10	289587	289596	40 %	20 %	40 %	0 %	227820828
250	NC_012587	CCGGA	2	10	291753	291762	20 %	0 %	40 %	40 %	227820831
251	NC_012587	CAGGA	2	10	292738	292747	40 %	0 %	40 %	20 %	227820831
252	NC_012587	TTCGA	2	10	293109	293118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_012587	TCCGG	2	10	293359	293368	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
254	NC_012587	CGACC	2	10	295782	295791	20 %	0 %	20 %	60 %	227820834
255	NC_012587	CTCGT	2	10	296024	296033	0 %	40 %	20 %	40 %	227820835
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257	NC_012587	CGTCA	2	10	298386	298395	20 %	20 %	20 %	40 %	227820836
258	NC_012587	GACGC	2	10	301148	301157	20 %	0 %	40 %	40 %	227820840
259	NC_012587	GCTTC	2	10	302067	302076	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
260	NC_012587	TTCGG	2	10	303690	303699	0 %	40 %	40 %	20 %	227820842
261	NC_012587	ACATC	2	10	304026	304035	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_012587	CGCGC	2	10	306280	306289	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
263	NC_012587	AGCGC	2	10	307067	307076	20 %	0 %	40 %	40 %	227820846
264	NC_012587	ATCAG	2	10	308072	308081	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
265	NC_012587	CGATT	2	10	308227	308236	20 %	40 %	20 %	20 %	227820847
266	NC_012587	GCCGG	2	10	308501	308510	0 %	0 %	60 %	40 %	227820847
267	NC_012587	TGCGA	2	10	309787	309796	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_012587	TTTCG	2	10	310091	310100	0 %	60 %	20 %	20 %	227820849
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