MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 93965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012587	GCG	2	6	137604	137609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820712
3502	NC_012587	GGC	2	6	137613	137618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820712
3503	NC_012587	GC	3	6	137617	137622	0 %	0 %	50 %	50 %	227820712
3504	NC_012587	TGA	2	6	137637	137642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820712
3505	NC_012587	CG	3	6	137646	137651	0 %	0 %	50 %	50 %	227820712
3506	NC_012587	TCCT	2	8	137732	137739	0 %	50 %	0 %	50 %	227820712
3507	NC_012587	GC	5	10	137914	137923	0 %	0 %	50 %	50 %	227820712
3508	NC_012587	GCAA	2	8	137930	137937	50 %	0 %	25 %	25 %	227820712
3509	NC_012587	T	6	6	137988	137993	0 %	100 %	0 %	0 %	227820712
3510	NC_012587	TGC	2	6	138180	138185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820712
3511	NC_012587	GGT	2	6	138192	138197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820712
3512	NC_012587	GCAC	2	8	138213	138220	25 %	0 %	25 %	50 %	227820712
3513	NC_012587	CCA	2	6	138269	138274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820712
3514	NC_012587	GC	3	6	138291	138296	0 %	0 %	50 %	50 %	227820712
3515	NC_012587	TCGA	2	8	138324	138331	25 %	25 %	25 %	25 %	227820712
3516	NC_012587	CGG	2	6	138405	138410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820712
3517	NC_012587	CGG	2	6	138430	138435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820712
3518	NC_012587	AGC	2	6	138449	138454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820712
3519	NC_012587	GC	3	6	138478	138483	0 %	0 %	50 %	50 %	227820712
3520	NC_012587	GTCG	2	8	138589	138596	0 %	25 %	50 %	25 %	227820713
3521	NC_012587	CGC	2	6	138601	138606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820713
3522	NC_012587	TCCG	2	8	138628	138635	0 %	25 %	25 %	50 %	227820713
3523	NC_012587	GC	3	6	138723	138728	0 %	0 %	50 %	50 %	227820713
3524	NC_012587	GGT	2	6	138766	138771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820713
3525	NC_012587	GGT	2	6	138808	138813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820713
3526	NC_012587	ACC	2	6	138954	138959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820713
3527	NC_012587	TTTC	2	8	138970	138977	0 %	75 %	0 %	25 %	227820713
3528	NC_012587	GCTG	2	8	139087	139094	0 %	25 %	50 %	25 %	227820713
3529	NC_012587	GA	3	6	139154	139159	50 %	0 %	50 %	0 %	227820713
3530	NC_012587	GCC	2	6	139193	139198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820713
3531	NC_012587	AGCG	2	8	139231	139238	25 %	0 %	50 %	25 %	227820713
3532	NC_012587	G	7	7	139277	139283	0 %	0 %	100 %	0 %	227820713
3533	NC_012587	GCG	2	6	139317	139322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820713
3534	NC_012587	CGA	3	9	139360	139368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820713
3535	NC_012587	G	6	6	139369	139374	0 %	0 %	100 %	0 %	227820713
3536	NC_012587	GAA	2	6	139376	139381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820713
3537	NC_012587	CTT	2	6	139387	139392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820713
3538	NC_012587	CTAC	2	8	139480	139487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_012587	CAG	2	6	139509	139514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_012587	TCAA	2	8	139528	139535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_012587	CTC	2	6	139570	139575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820714
3542	NC_012587	CCGG	2	8	139653	139660	0 %	0 %	50 %	50 %	227820714
3543	NC_012587	CT	3	6	139673	139678	0 %	50 %	0 %	50 %	227820714
3544	NC_012587	GC	3	6	139716	139721	0 %	0 %	50 %	50 %	227820714
3545	NC_012587	AAAG	2	8	139771	139778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_012587	CATC	2	8	139888	139895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_012587	GC	3	6	139961	139966	0 %	0 %	50 %	50 %	227820715
3548	NC_012587	GCCT	2	8	139986	139993	0 %	25 %	25 %	50 %	227820715
3549	NC_012587	GCAC	2	8	140147	140154	25 %	0 %	25 %	50 %	227820715
3550	NC_012587	TCC	2	6	140186	140191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820715
3551	NC_012587	CGA	2	6	140237	140242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_012587	CGG	2	6	140310	140315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_012587	CA	3	6	140354	140359	50 %	0 %	0 %	50 %	227820716
3554	NC_012587	CGGGC	2	10	140361	140370	0 %	0 %	60 %	40 %	227820716
3555	NC_012587	AAG	2	6	140375	140380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820716
3556	NC_012587	TGC	2	6	140421	140426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820716
3557	NC_012587	CAC	2	6	140448	140453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820716
3558	NC_012587	CGG	2	6	140503	140508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820716
3559	NC_012587	AAC	2	6	140513	140518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227820716
3560	NC_012587	CGC	2	6	140548	140553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820716
3561	NC_012587	CAT	2	6	140638	140643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820716
3562	NC_012587	GCG	2	6	140803	140808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820716
3563	NC_012587	GGC	2	6	140809	140814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820716
3564	NC_012587	CT	3	6	140907	140912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_012587	CTA	2	6	140927	140932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_012587	TA	3	6	140936	140941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_012587	TGGG	2	8	140945	140952	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_012587	G	6	6	140950	140955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_012587	TCT	2	6	140992	140997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_012587	GCT	2	6	141076	141081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_012587	CAG	2	6	141116	141121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_012587	TCTGG	2	10	141201	141210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3573	NC_012587	CGA	2	6	141275	141280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_012587	TGC	2	6	141317	141322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_012587	CGA	2	6	141374	141379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_012587	TCAA	2	8	141428	141435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3577	NC_012587	CTT	2	6	141467	141472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_012587	TAC	2	6	141515	141520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_012587	AGC	2	6	141587	141592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_012587	CAT	3	9	141606	141614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_012587	AGA	2	6	141646	141651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_012587	AG	3	6	141665	141670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_012587	CTG	2	6	141680	141685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_012587	AAT	2	6	141724	141729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_012587	TCG	2	6	141766	141771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_012587	GAAT	2	8	141779	141786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_012587	GTT	2	6	141804	141809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_012587	CCA	2	6	141819	141824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_012587	AAAATC	2	12	141853	141864	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3590	NC_012587	GAC	2	6	141972	141977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_012587	GTG	2	6	142002	142007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_012587	GGC	2	6	142040	142045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_012587	CGT	2	6	142109	142114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820717
3594	NC_012587	GCC	2	6	142129	142134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820717
3595	NC_012587	CG	3	6	142178	142183	0 %	0 %	50 %	50 %	227820717
3596	NC_012587	ATTTCC	2	12	142192	142203	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227820717
3597	NC_012587	CATT	2	8	142352	142359	25 %	50 %	0 %	25 %	227820718
3598	NC_012587	GC	3	6	142361	142366	0 %	0 %	50 %	50 %	227820718
3599	NC_012587	TCA	2	6	142380	142385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820718
3600	NC_012587	T	6	6	142503	142508	0 %	100 %	0 %	0 %	227820718
3601	NC_012587	T	6	6	142535	142540	0 %	100 %	0 %	0 %	227820718
3602	NC_012587	ACG	2	6	142676	142681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820718
3603	NC_012587	GGC	2	6	142693	142698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820718
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3605	NC_012587	CCG	2	6	142773	142778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820718
3606	NC_012587	TCG	2	6	142809	142814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820718
3607	NC_012587	CAC	2	6	142861	142866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_012587	CGAG	2	8	143110	143117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_012587	T	6	6	143187	143192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_012587	TCG	2	6	143359	143364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_012587	CAA	2	6	143435	143440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_012587	TGC	2	6	143500	143505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_012587	GTT	2	6	143517	143522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_012587	CGC	2	6	143549	143554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_012587	GAT	2	6	143590	143595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_012587	TGCC	2	8	143625	143632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_012587	AAG	2	6	143668	143673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_012587	TGGG	2	8	143677	143684	0 %	25 %	75 %	0 %	227820719
3619	NC_012587	CTT	2	6	143759	143764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820719
3620	NC_012587	CGC	2	6	143831	143836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820719
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3622	NC_012587	CGG	2	6	143889	143894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820719
3623	NC_012587	CAG	2	6	143904	143909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820719
3624	NC_012587	CG	3	6	143917	143922	0 %	0 %	50 %	50 %	227820719
3625	NC_012587	ACCG	2	8	143990	143997	25 %	0 %	25 %	50 %	227820719
3626	NC_012587	GCC	2	6	144006	144011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820719
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3995	NC_012587	CGT	3	9	161983	161991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820727
3996	NC_012587	TGTCGA	2	12	162016	162027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227820727
3997	NC_012587	GCC	2	6	162041	162046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820727
3998	NC_012587	GC	3	6	162076	162081	0 %	0 %	50 %	50 %	227820727
3999	NC_012587	TCC	2	6	162116	162121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4000	NC_012587	GATGTC	2	12	162126	162137	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

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