MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 93965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012587	CTT	2	6	117892	117897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820696
3002	NC_012587	GAAG	2	8	117907	117914	50 %	0 %	50 %	0 %	227820696
3003	NC_012587	GCT	2	6	117998	118003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3004	NC_012587	TCG	2	6	118068	118073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3005	NC_012587	GAA	2	6	118081	118086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820696
3006	NC_012587	CGAC	2	8	118164	118171	25 %	0 %	25 %	50 %	227820696
3007	NC_012587	TCT	2	6	118174	118179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820696
3008	NC_012587	GCC	2	6	118205	118210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820696
3009	NC_012587	CGA	2	6	118212	118217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3010	NC_012587	CGA	2	6	118351	118356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3011	NC_012587	GAC	2	6	118358	118363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3012	NC_012587	TCG	2	6	118371	118376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3013	NC_012587	TGACG	2	10	118381	118390	20 %	20 %	40 %	20 %	227820696
3014	NC_012587	GGC	2	6	118406	118411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820696
3015	NC_012587	GCCG	2	8	118477	118484	0 %	0 %	50 %	50 %	227820696
3016	NC_012587	GTCG	2	8	118543	118550	0 %	25 %	50 %	25 %	227820696
3017	NC_012587	CGG	2	6	118552	118557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820696
3018	NC_012587	GCA	2	6	118606	118611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3019	NC_012587	TGA	2	6	118620	118625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820696
3020	NC_012587	GAAGCC	2	12	118675	118686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820696
3021	NC_012587	CTT	2	6	118702	118707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820696
3022	NC_012587	GCCG	2	8	118738	118745	0 %	0 %	50 %	50 %	227820696
3023	NC_012587	ATCG	2	8	118756	118763	25 %	25 %	25 %	25 %	227820696
3024	NC_012587	GGC	2	6	118835	118840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_012587	GCC	2	6	118845	118850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_012587	CG	4	8	118936	118943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_012587	GAC	2	6	119031	119036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_012587	GCA	2	6	119055	119060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_012587	GAG	2	6	119088	119093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012587	GCCG	2	8	119236	119243	0 %	0 %	50 %	50 %	227820697
3031	NC_012587	TCG	2	6	119253	119258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3032	NC_012587	CGG	2	6	119296	119301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820697
3033	NC_012587	TTC	2	6	119306	119311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820697
3034	NC_012587	ACGCTG	2	12	119321	119332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3035	NC_012587	GCA	2	6	119338	119343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3036	NC_012587	GTC	2	6	119351	119356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3037	NC_012587	CGGCG	2	10	119365	119374	0 %	0 %	60 %	40 %	227820697
3038	NC_012587	CCG	2	6	119394	119399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820697
3039	NC_012587	TC	3	6	119407	119412	0 %	50 %	0 %	50 %	227820697
3040	NC_012587	TCA	2	6	119421	119426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820697
3041	NC_012587	CGG	2	6	119436	119441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820697
3042	NC_012587	GGC	2	6	119494	119499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820697
3043	NC_012587	CGG	2	6	119512	119517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820697
3044	NC_012587	TCT	2	6	119539	119544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820697
3045	NC_012587	GCC	2	6	119563	119568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820697
3046	NC_012587	CGA	2	6	119607	119612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3047	NC_012587	CCA	2	6	119634	119639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820697
3048	NC_012587	GTC	2	6	119729	119734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3049	NC_012587	CGA	2	6	119812	119817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3050	NC_012587	GCC	2	6	119825	119830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820697
3051	NC_012587	GTT	2	6	119860	119865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820697
3052	NC_012587	CGC	2	6	119902	119907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820697
3053	NC_012587	CGG	2	6	119995	120000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820697
3054	NC_012587	GAT	2	6	120052	120057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820697
3055	NC_012587	GTG	2	6	120065	120070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820697
3056	NC_012587	CCG	2	6	120141	120146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820697
3057	NC_012587	AGC	2	6	120175	120180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820697
3058	NC_012587	CCGC	2	8	120206	120213	0 %	0 %	25 %	75 %	227820698
3059	NC_012587	GAT	2	6	120324	120329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820698
3060	NC_012587	GATG	2	8	120408	120415	25 %	25 %	50 %	0 %	227820698
3061	NC_012587	CG	3	6	120416	120421	0 %	0 %	50 %	50 %	227820698
3062	NC_012587	ACA	2	6	120482	120487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227820698
3063	NC_012587	CAT	2	6	120519	120524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820698
3064	NC_012587	TGA	2	6	120599	120604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820698
3065	NC_012587	GGC	2	6	120643	120648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820698
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3067	NC_012587	GTC	2	6	120697	120702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820698
3068	NC_012587	GCC	2	6	120743	120748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820698
3069	NC_012587	CGC	2	6	120778	120783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820698
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3071	NC_012587	CGC	2	6	120957	120962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820698
3072	NC_012587	GACG	2	8	120980	120987	25 %	0 %	50 %	25 %	227820699
3073	NC_012587	GCG	2	6	121002	121007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820699
3074	NC_012587	GCCG	2	8	121011	121018	0 %	0 %	50 %	50 %	227820699
3075	NC_012587	TCG	2	6	121024	121029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820699
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3081	NC_012587	CTG	2	6	121356	121361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820699
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3086	NC_012587	CGCC	2	8	121526	121533	0 %	0 %	25 %	75 %	227820699
3087	NC_012587	CGT	2	6	121535	121540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820699
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3090	NC_012587	ATG	2	6	121620	121625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012587	CAC	2	6	121643	121648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_012587	CGGC	2	8	121675	121682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_012587	CGC	2	6	121688	121693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_012587	CG	3	6	121695	121700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_012587	GAC	2	6	121759	121764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820700
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3099	NC_012587	GCC	2	6	121860	121865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820700
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3102	NC_012587	CGC	2	6	121911	121916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820700
3103	NC_012587	CCGG	2	8	121921	121928	0 %	0 %	50 %	50 %	227820700
3104	NC_012587	TGA	2	6	121946	121951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820700
3105	NC_012587	CCGG	2	8	122035	122042	0 %	0 %	50 %	50 %	227820700
3106	NC_012587	ACC	2	6	122047	122052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820700
3107	NC_012587	GCG	2	6	122063	122068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820700
3108	NC_012587	GAC	2	6	122148	122153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820700
3109	NC_012587	CGG	2	6	122218	122223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820700
3110	NC_012587	GAC	2	6	122256	122261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820700
3111	NC_012587	CAC	2	6	122316	122321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820700
3112	NC_012587	ATC	2	6	122332	122337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820700
3113	NC_012587	TCG	2	6	122354	122359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820700
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3116	NC_012587	GC	3	6	122424	122429	0 %	0 %	50 %	50 %	227820700
3117	NC_012587	CGTC	2	8	122531	122538	0 %	25 %	25 %	50 %	227820700
3118	NC_012587	GAG	3	9	122569	122577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820700
3119	NC_012587	GC	3	6	122579	122584	0 %	0 %	50 %	50 %	227820700
3120	NC_012587	CGA	2	6	122883	122888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820701
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3122	NC_012587	CGG	2	6	122969	122974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820701
3123	NC_012587	CGC	2	6	122985	122990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820701
3124	NC_012587	CGA	2	6	122993	122998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820701
3125	NC_012587	TGG	2	6	123032	123037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820701
3126	NC_012587	CGG	2	6	123039	123044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820701
3127	NC_012587	CGGC	2	8	123050	123057	0 %	0 %	50 %	50 %	227820701
3128	NC_012587	GAT	2	6	123099	123104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820701
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3133	NC_012587	CGG	2	6	123249	123254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820701
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3142	NC_012587	CGG	2	6	123634	123639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820702
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3152	NC_012587	CCGGC	2	10	124024	124033	0 %	0 %	40 %	60 %	227820702
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3172	NC_012587	CCCG	2	8	124771	124778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3240	NC_012587	ACG	2	6	127922	127927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820704
3241	NC_012587	GAG	2	6	127936	127941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820704
3242	NC_012587	TCG	2	6	127968	127973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820704
3243	NC_012587	ACC	2	6	127976	127981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820704
3244	NC_012587	CGA	2	6	128004	128009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820704
3245	NC_012587	CG	3	6	128088	128093	0 %	0 %	50 %	50 %	227820704
3246	NC_012587	GTTGAC	2	12	128107	128118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227820704
3247	NC_012587	CAT	2	6	128179	128184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820704
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3250	NC_012587	CGG	2	6	128373	128378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820704
3251	NC_012587	CGG	2	6	128386	128391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820704
3252	NC_012587	CGC	2	6	128413	128418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820704
3253	NC_012587	CTG	2	6	128431	128436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820704
3254	NC_012587	TGCT	2	8	128439	128446	0 %	50 %	25 %	25 %	227820704
3255	NC_012587	TC	4	8	128457	128464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_012587	AACG	2	8	128476	128483	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3257	NC_012587	GAA	2	6	128498	128503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_012587	TCCC	2	8	128507	128514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3259	NC_012587	TCC	2	6	128521	128526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3260	NC_012587	TGC	2	6	128537	128542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_012587	TA	3	6	128576	128581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_012587	AAT	2	6	128599	128604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_012587	GAC	2	6	128605	128610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_012587	GCAG	3	12	128632	128643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3265	NC_012587	TC	3	6	128673	128678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3266	NC_012587	GAT	2	6	128734	128739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_012587	GC	3	6	128769	128774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3268	NC_012587	AGGA	2	8	128779	128786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_012587	TTG	2	6	128810	128815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_012587	GA	3	6	128826	128831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_012587	GGA	2	6	128833	128838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_012587	CGG	2	6	128942	128947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820705
3273	NC_012587	CTG	2	6	128971	128976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820705
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3489	NC_012587	AAG	2	6	137029	137034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_012587	GGA	2	6	137089	137094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_012587	TTC	2	6	137155	137160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3492	NC_012587	CAT	2	6	137228	137233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_012587	GC	3	6	137341	137346	0 %	0 %	50 %	50 %	227820712
3494	NC_012587	CAA	2	6	137352	137357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227820712
3495	NC_012587	ACTG	2	8	137358	137365	25 %	25 %	25 %	25 %	227820712
3496	NC_012587	GGA	2	6	137410	137415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820712
3497	NC_012587	CGG	2	6	137439	137444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820712
3498	NC_012587	GAC	3	9	137477	137485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820712
3499	NC_012587	AGG	2	6	137525	137530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820712
3500	NC_012587	AGCGCC	2	12	137591	137602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	227820712

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