MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 93965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012587	GTC	2	6	39684	39689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820623
1003	NC_012587	GGC	3	9	39702	39710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820623
1004	NC_012587	CCGTCA	2	12	39722	39733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227820623
1005	NC_012587	TCT	2	6	39741	39746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820623
1006	NC_012587	CGA	2	6	39750	39755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820623
1007	NC_012587	GCTGA	2	10	39768	39777	20 %	20 %	40 %	20 %	227820623
1008	NC_012587	TA	3	6	39821	39826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012587	ATT	2	6	39834	39839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012587	GA	3	6	39876	39881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012587	GGT	2	6	39944	39949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820624
1012	NC_012587	CCG	2	6	39964	39969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820624
1013	NC_012587	CGAAG	2	10	39975	39984	40 %	0 %	40 %	20 %	227820624
1014	NC_012587	GC	3	6	39990	39995	0 %	0 %	50 %	50 %	227820624
1015	NC_012587	CGC	2	6	40003	40008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820624
1016	NC_012587	GCG	2	6	40042	40047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820624
1017	NC_012587	TCA	2	6	40066	40071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820624
1018	NC_012587	AAGG	2	8	40080	40087	50 %	0 %	50 %	0 %	227820624
1019	NC_012587	GCA	2	6	40097	40102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820624
1020	NC_012587	AGCC	2	8	40169	40176	25 %	0 %	25 %	50 %	227820624
1021	NC_012587	GAA	2	6	40182	40187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820624
1022	NC_012587	CGA	2	6	40220	40225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820624
1023	NC_012587	CGA	2	6	40237	40242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820624
1024	NC_012587	GCT	2	6	40250	40255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820624
1025	NC_012587	CGGC	2	8	40269	40276	0 %	0 %	50 %	50 %	227820624
1026	NC_012587	GGC	2	6	40290	40295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820624
1027	NC_012587	CTG	2	6	40404	40409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820624
1028	NC_012587	TGG	2	6	40474	40479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012587	CCG	2	6	40541	40546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_012587	ACCG	2	8	40565	40572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_012587	GCC	2	6	40637	40642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_012587	GCG	2	6	40738	40743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820625
1033	NC_012587	GC	4	8	40756	40763	0 %	0 %	50 %	50 %	227820625
1034	NC_012587	TCG	2	6	40808	40813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820625
1035	NC_012587	CGG	2	6	40913	40918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820625
1036	NC_012587	CAC	2	6	40962	40967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820625
1037	NC_012587	AGC	2	6	41000	41005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820625
1038	NC_012587	CGA	2	6	41043	41048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820625
1039	NC_012587	CG	4	8	41070	41077	0 %	0 %	50 %	50 %	227820625
1040	NC_012587	CAT	2	6	41148	41153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820625
1041	NC_012587	CGT	2	6	41223	41228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820625
1042	NC_012587	TGC	2	6	41241	41246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820625
1043	NC_012587	CCGC	2	8	41361	41368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1044	NC_012587	TGC	2	6	41421	41426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_012587	CGC	3	9	41468	41476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_012587	CAG	2	6	41581	41586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012587	GGAGC	2	10	41629	41638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_012587	GAAA	2	8	41666	41673	75 %	0 %	25 %	0 %	227820626
1049	NC_012587	CGC	2	6	41697	41702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820626
1050	NC_012587	GGA	2	6	41726	41731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820626
1051	NC_012587	GATC	2	8	41732	41739	25 %	25 %	25 %	25 %	227820626
1052	NC_012587	GGC	3	9	41744	41752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820626
1053	NC_012587	CAGC	2	8	41762	41769	25 %	0 %	25 %	50 %	227820626
1054	NC_012587	CGC	2	6	41837	41842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820626
1055	NC_012587	GCC	2	6	41898	41903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820626
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1057	NC_012587	CGA	2	6	42035	42040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820626
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1059	NC_012587	GC	3	6	42129	42134	0 %	0 %	50 %	50 %	227820626
1060	NC_012587	TCCGA	2	10	42171	42180	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_012587	CG	3	6	42187	42192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_012587	GC	3	6	42202	42207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_012587	GAT	2	6	42259	42264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820627
1064	NC_012587	ATC	2	6	42305	42310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820627
1065	NC_012587	CTG	2	6	42314	42319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820627
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1067	NC_012587	TGC	2	6	42372	42377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820627
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1070	NC_012587	GCT	2	6	42457	42462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820627
1071	NC_012587	GTC	2	6	42505	42510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820627
1072	NC_012587	TCG	2	6	42528	42533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820627
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1089	NC_012587	GCC	2	6	43104	43109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1097	NC_012587	GCG	2	6	43498	43503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820628
1098	NC_012587	GCG	2	6	43578	43583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820628
1099	NC_012587	GTC	2	6	43589	43594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820628
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1105	NC_012587	CGGGG	2	10	43852	43861	0 %	0 %	80 %	20 %	227820628
1106	NC_012587	CG	3	6	43924	43929	0 %	0 %	50 %	50 %	227820628
1107	NC_012587	ACC	2	6	43940	43945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820628
1108	NC_012587	CG	3	6	43953	43958	0 %	0 %	50 %	50 %	227820628
1109	NC_012587	ATCTGC	2	12	44013	44024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227820628
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1121	NC_012587	CG	3	6	44630	44635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_012587	GAG	2	6	44654	44659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012587	GAC	2	6	44714	44719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820629
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1125	NC_012587	GAG	2	6	44814	44819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820629
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1127	NC_012587	ACCA	2	8	44883	44890	50 %	0 %	0 %	50 %	227820629
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1129	NC_012587	CGC	2	6	44984	44989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820629
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1139	NC_012587	CGGCT	2	10	45255	45264	0 %	20 %	40 %	40 %	227820629
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1248	NC_012587	CGTTC	2	10	49456	49465	0 %	40 %	20 %	40 %	227820633
1249	NC_012587	CGG	2	6	49534	49539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820633
1250	NC_012587	CGG	2	6	49545	49550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820633
1251	NC_012587	GGC	2	6	49580	49585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820633
1252	NC_012587	CGA	2	6	49627	49632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820633
1253	NC_012587	GC	4	8	49644	49651	0 %	0 %	50 %	50 %	227820633
1254	NC_012587	GAT	2	6	49762	49767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820633
1255	NC_012587	CGC	2	6	49771	49776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820633
1256	NC_012587	TTG	2	6	49797	49802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820633
1257	NC_012587	GTG	2	6	49809	49814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820633
1258	NC_012587	GACG	2	8	49852	49859	25 %	0 %	50 %	25 %	227820633
1259	NC_012587	CCA	2	6	49881	49886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820633
1260	NC_012587	TGC	2	6	49899	49904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820633
1261	NC_012587	TCT	2	6	49914	49919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820633
1262	NC_012587	TTG	2	6	49940	49945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820633
1263	NC_012587	GCA	2	6	49949	49954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820633
1264	NC_012587	TCA	2	6	50024	50029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_012587	TGCC	2	8	50035	50042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1266	NC_012587	AAG	3	9	50149	50157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820634
1267	NC_012587	TTCGCC	2	12	50192	50203	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227820634
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1269	NC_012587	TCC	2	6	50323	50328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820634
1270	NC_012587	TGG	2	6	50417	50422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820634
1271	NC_012587	TGG	2	6	50501	50506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820634
1272	NC_012587	GGC	2	6	50523	50528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820634
1273	NC_012587	T	6	6	50587	50592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_012587	TTG	2	6	50628	50633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_012587	GCG	2	6	50666	50671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_012587	AT	3	6	50686	50691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_012587	CTT	2	6	50745	50750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1278	NC_012587	GC	3	6	50773	50778	0 %	0 %	50 %	50 %	227820635
1279	NC_012587	GT	3	6	50828	50833	0 %	50 %	50 %	0 %	227820635
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1282	NC_012587	CGA	2	6	50931	50936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820635
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1286	NC_012587	TCA	2	6	51012	51017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820635
1287	NC_012587	GCC	3	9	51035	51043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820635
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1289	NC_012587	CAT	2	6	51199	51204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820635
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1291	NC_012587	CCG	2	6	51228	51233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820635
1292	NC_012587	CTA	2	6	51253	51258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820635
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1310	NC_012587	GGC	2	6	52052	52057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1311	NC_012587	GT	5	10	52192	52201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1312	NC_012587	GAA	2	6	52237	52242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1313	NC_012587	CCGCG	2	10	52256	52265	0 %	0 %	40 %	60 %	227820636
1314	NC_012587	GCC	2	6	52290	52295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820636
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1329	NC_012587	GGC	2	6	53045	53050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1330	NC_012587	GTC	2	6	53099	53104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820637
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1337	NC_012587	CCG	2	6	53370	53375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1348	NC_012587	AGC	2	6	53861	53866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1349	NC_012587	CG	3	6	53925	53930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1350	NC_012587	GCT	2	6	53978	53983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1351	NC_012587	TCG	2	6	54008	54013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1352	NC_012587	AGG	2	6	54056	54061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1353	NC_012587	ATC	3	9	54086	54094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820639
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1361	NC_012587	AGC	2	6	54378	54383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820639
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1364	NC_012587	TGA	2	6	54522	54527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820639
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1366	NC_012587	CTT	2	6	54538	54543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820639
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1374	NC_012587	CGG	2	6	54784	54789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820639
1375	NC_012587	CCGG	2	8	54843	54850	0 %	0 %	50 %	50 %	227820639
1376	NC_012587	TCGAGA	2	12	54861	54872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227820639
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1453	NC_012587	CAA	2	6	57787	57792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_012587	GCGA	2	8	59653	59660	25 %	0 %	50 %	25 %	227820642
1488	NC_012587	TGT	2	6	59666	59671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820642
1489	NC_012587	GCC	2	6	59708	59713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820642
1490	NC_012587	GCTG	2	8	59786	59793	0 %	25 %	50 %	25 %	227820642
1491	NC_012587	GC	4	8	59817	59824	0 %	0 %	50 %	50 %	227820642
1492	NC_012587	GGC	2	6	59841	59846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820642
1493	NC_012587	AGC	2	6	59878	59883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820642
1494	NC_012587	GTT	2	6	59891	59896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820642
1495	NC_012587	GTC	2	6	59904	59909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820642
1496	NC_012587	CGC	2	6	59946	59951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820642
1497	NC_012587	GCT	2	6	60116	60121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_012587	GCA	2	6	60267	60272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820643
1499	NC_012587	CCA	2	6	60285	60290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820643
1500	NC_012587	CAGG	2	8	60313	60320	25 %	0 %	50 %	25 %	227820643

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