MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 93965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012587	GCC	2	6	21001	21006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820611
502	NC_012587	AGC	2	6	21032	21037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820611
503	NC_012587	TCG	2	6	21041	21046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820611
504	NC_012587	TTC	2	6	21049	21054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820611
505	NC_012587	GCC	2	6	21097	21102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820611
506	NC_012587	CGGG	2	8	21132	21139	0 %	0 %	75 %	25 %	227820611
507	NC_012587	CTTGAC	2	12	21193	21204	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227820611
508	NC_012587	CTC	2	6	21325	21330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820611
509	NC_012587	TCC	2	6	21352	21357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_012587	GCA	2	6	21366	21371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012587	GC	3	6	21395	21400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_012587	GC	3	6	21409	21414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_012587	GCAC	2	8	21485	21492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
514	NC_012587	CG	3	6	21502	21507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_012587	GGT	2	6	21567	21572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012587	CGG	2	6	21637	21642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
517	NC_012587	CGCGG	2	10	21651	21660	0 %	0 %	60 %	40 %	227820612
518	NC_012587	CATC	2	8	21690	21697	25 %	25 %	0 %	50 %	227820612
519	NC_012587	GCG	2	6	21706	21711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
520	NC_012587	CGG	2	6	21728	21733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
521	NC_012587	GCG	2	6	21753	21758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
522	NC_012587	CGC	2	6	21766	21771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820612
523	NC_012587	GCG	2	6	21820	21825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
524	NC_012587	GCCG	2	8	21830	21837	0 %	0 %	50 %	50 %	227820612
525	NC_012587	CCG	2	6	21871	21876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820612
526	NC_012587	ACC	2	6	21880	21885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820612
527	NC_012587	GCG	2	6	21895	21900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
528	NC_012587	CGA	2	6	22025	22030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820612
529	NC_012587	GGCGCT	2	12	22042	22053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	227820612
530	NC_012587	CCT	2	6	22123	22128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820612
531	NC_012587	AGC	2	6	22153	22158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820612
532	NC_012587	GGC	2	6	22190	22195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
533	NC_012587	CCGG	2	8	22198	22205	0 %	0 %	50 %	50 %	227820612
534	NC_012587	CGC	2	6	22256	22261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820612
535	NC_012587	GGCG	2	8	22265	22272	0 %	0 %	75 %	25 %	227820612
536	NC_012587	GAA	2	6	22298	22303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820612
537	NC_012587	CGA	2	6	22373	22378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820612
538	NC_012587	GAG	2	6	22401	22406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820612
539	NC_012587	CAT	2	6	22427	22432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820612
540	NC_012587	GACC	2	8	22436	22443	25 %	0 %	25 %	50 %	227820612
541	NC_012587	GGC	2	6	22499	22504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
542	NC_012587	GCGCGG	2	12	22619	22630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820612
543	NC_012587	TCA	2	6	22654	22659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820612
544	NC_012587	GGGC	2	8	22692	22699	0 %	0 %	75 %	25 %	227820612
545	NC_012587	CGC	2	6	22764	22769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820613
546	NC_012587	AGG	2	6	22785	22790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820613
547	NC_012587	CG	3	6	22826	22831	0 %	0 %	50 %	50 %	227820613
548	NC_012587	AGA	2	6	22839	22844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820613
549	NC_012587	CGA	2	6	22852	22857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820613
550	NC_012587	GGC	2	6	22945	22950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820613
551	NC_012587	GGGC	2	8	22999	23006	0 %	0 %	75 %	25 %	227820613
552	NC_012587	CGA	2	6	23037	23042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820613
553	NC_012587	CGC	2	6	23048	23053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820613
554	NC_012587	TGG	2	6	23067	23072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820613
555	NC_012587	AGC	2	6	23085	23090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820613
556	NC_012587	TCCG	2	8	23112	23119	0 %	25 %	25 %	50 %	227820613
557	NC_012587	CAT	2	6	23215	23220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820613
558	NC_012587	ACC	2	6	23234	23239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820613
559	NC_012587	CGA	2	6	23268	23273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820613
560	NC_012587	TCC	2	6	23322	23327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820613
561	NC_012587	CGT	2	6	23416	23421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820613
562	NC_012587	CTG	2	6	23423	23428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820613
563	NC_012587	GCCG	2	8	23452	23459	0 %	0 %	50 %	50 %	227820613
564	NC_012587	GC	3	6	23478	23483	0 %	0 %	50 %	50 %	227820613
565	NC_012587	GC	3	6	23486	23491	0 %	0 %	50 %	50 %	227820613
566	NC_012587	CAT	2	6	23542	23547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820613
567	NC_012587	GC	3	6	23558	23563	0 %	0 %	50 %	50 %	227820613
568	NC_012587	TGA	2	6	23591	23596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820613
569	NC_012587	TCG	2	6	23648	23653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820614
570	NC_012587	TGG	2	6	23684	23689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820614
571	NC_012587	AGG	2	6	23708	23713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820614
572	NC_012587	TCG	2	6	23804	23809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820614
573	NC_012587	CGT	2	6	23823	23828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820614
574	NC_012587	TCTGGC	2	12	23840	23851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820614
575	NC_012587	TTC	2	6	23872	23877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820614
576	NC_012587	GAT	2	6	23895	23900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820614
577	NC_012587	TCG	2	6	23924	23929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820614
578	NC_012587	GCT	2	6	23934	23939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820614
579	NC_012587	TCA	2	6	24017	24022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820614
580	NC_012587	ATC	2	6	24040	24045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820614
581	NC_012587	GCT	2	6	24054	24059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820614
582	NC_012587	TGCCA	2	10	24120	24129	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_012587	GAGC	2	8	24142	24149	25 %	0 %	50 %	25 %	227820615
584	NC_012587	CAG	2	6	24161	24166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
585	NC_012587	GCAA	2	8	24168	24175	50 %	0 %	25 %	25 %	227820615
586	NC_012587	CAG	2	6	24195	24200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
587	NC_012587	CG	3	6	24211	24216	0 %	0 %	50 %	50 %	227820615
588	NC_012587	CGGCGA	2	12	24219	24230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227820615
589	NC_012587	TCC	3	9	24241	24249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820615
590	NC_012587	GC	3	6	24254	24259	0 %	0 %	50 %	50 %	227820615
591	NC_012587	GCC	2	6	24320	24325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820615
592	NC_012587	TCG	2	6	24339	24344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820615
593	NC_012587	CTG	2	6	24368	24373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820615
594	NC_012587	CGGT	2	8	24387	24394	0 %	25 %	50 %	25 %	227820615
595	NC_012587	CTG	2	6	24413	24418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820615
596	NC_012587	GCT	2	6	24505	24510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820615
597	NC_012587	CGA	2	6	24513	24518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
598	NC_012587	ATG	2	6	24522	24527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820615
599	NC_012587	GCCG	2	8	24700	24707	0 %	0 %	50 %	50 %	227820615
600	NC_012587	GTC	2	6	24734	24739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820615
601	NC_012587	CGGC	2	8	24757	24764	0 %	0 %	50 %	50 %	227820615
602	NC_012587	GAG	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820615
603	NC_012587	GC	3	6	24838	24843	0 %	0 %	50 %	50 %	227820615
604	NC_012587	GCT	2	6	24871	24876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820615
605	NC_012587	CGC	2	6	24903	24908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820615
606	NC_012587	AGC	2	6	24963	24968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
607	NC_012587	GCA	2	6	24988	24993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
608	NC_012587	TCG	2	6	25017	25022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820615
609	NC_012587	GTG	2	6	25109	25114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820615
610	NC_012587	CGAT	2	8	25164	25171	25 %	25 %	25 %	25 %	227820615
611	NC_012587	GCG	2	6	25202	25207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820615
612	NC_012587	CAGG	2	8	25213	25220	25 %	0 %	50 %	25 %	227820615
613	NC_012587	CGG	2	6	25264	25269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820615
614	NC_012587	TGA	2	6	25318	25323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820615
615	NC_012587	CGA	2	6	25345	25350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
616	NC_012587	GAG	2	6	25367	25372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820615
617	NC_012587	CGC	2	6	25436	25441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820615
618	NC_012587	GGC	2	6	25457	25462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820615
619	NC_012587	CGA	2	6	25522	25527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
620	NC_012587	CGC	2	6	25550	25555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820615
621	NC_012587	GCTC	2	8	25585	25592	0 %	25 %	25 %	50 %	227820615
622	NC_012587	GGC	2	6	25640	25645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820615
623	NC_012587	CG	3	6	25655	25660	0 %	0 %	50 %	50 %	227820615
624	NC_012587	CGG	2	6	25671	25676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820615
625	NC_012587	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	227820615
626	NC_012587	ATC	2	6	25727	25732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820615
627	NC_012587	CCTG	2	8	25812	25819	0 %	25 %	25 %	50 %	227820615
628	NC_012587	GCA	2	6	25836	25841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820615
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748	NC_012587	TGT	2	6	30125	30130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820618
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753	NC_012587	CG	3	6	30382	30387	0 %	0 %	50 %	50 %	227820618
754	NC_012587	GCG	2	6	30443	30448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820618
755	NC_012587	GCC	2	6	30460	30465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820618
756	NC_012587	GAC	2	6	30466	30471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820618
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759	NC_012587	GCA	2	6	30554	30559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820618
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761	NC_012587	GCT	2	6	30621	30626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820618
762	NC_012587	CG	3	6	30785	30790	0 %	0 %	50 %	50 %	227820618
763	NC_012587	TCC	2	6	30797	30802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820618
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765	NC_012587	GACCG	2	10	31159	31168	20 %	0 %	40 %	40 %	227820618
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769	NC_012587	CGGAT	2	10	31226	31235	20 %	20 %	40 %	20 %	227820618
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771	NC_012587	TGC	2	6	31262	31267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820618
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773	NC_012587	GCGCC	2	10	31308	31317	0 %	0 %	40 %	60 %	227820618
774	NC_012587	CGG	2	6	31359	31364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820618
775	NC_012587	CG	3	6	31367	31372	0 %	0 %	50 %	50 %	227820618
776	NC_012587	GCG	3	9	31405	31413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820618
777	NC_012587	GCT	2	6	31422	31427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820618
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780	NC_012587	TCGAT	2	10	31508	31517	20 %	40 %	20 %	20 %	227820618
781	NC_012587	GGC	2	6	31552	31557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820618
782	NC_012587	GCG	2	6	31570	31575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820618
783	NC_012587	GCG	2	6	31577	31582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820618
784	NC_012587	CGA	2	6	31587	31592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820618
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787	NC_012587	CCG	2	6	31721	31726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820618
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807	NC_012587	CGG	2	6	32363	32368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820618
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809	NC_012587	CGA	2	6	32409	32414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820618
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814	NC_012587	GTC	2	6	32686	32691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820618
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823	NC_012587	CCGAC	2	10	33076	33085	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
824	NC_012587	TGC	2	6	33113	33118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
825	NC_012587	GTA	2	6	33158	33163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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849	NC_012587	GGA	2	6	34148	34153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820619
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852	NC_012587	TCG	2	6	34255	34260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820619
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879	NC_012587	CGG	2	6	35207	35212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820619
880	NC_012587	CGC	2	6	35249	35254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820619
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