MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 1880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	TGAAA	2	10	2747	2756	60 %	20 %	20 %	0 %	225869490
2	NC_012471	AAAGG	2	10	3023	3032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012471	TGGTA	2	10	3613	3622	20 %	40 %	40 %	0 %	225869492
4	NC_012471	TTAGC	2	10	5692	5701	20 %	40 %	20 %	20 %	225869494
5	NC_012471	AGCAA	2	10	7025	7034	60 %	0 %	20 %	20 %	225869494
6	NC_012471	GCTTC	2	10	8631	8640	0 %	40 %	20 %	40 %	225869494
7	NC_012471	TTTTA	2	10	9757	9766	20 %	80 %	0 %	0 %	225869495
8	NC_012471	TGCTG	2	10	10065	10074	0 %	40 %	40 %	20 %	225869495
9	NC_012471	TTATC	2	10	12318	12327	20 %	60 %	0 %	20 %	225869499
10	NC_012471	GATTA	2	10	14154	14163	40 %	40 %	20 %	0 %	225869501
11	NC_012471	GTATG	2	10	15862	15871	20 %	40 %	40 %	0 %	225869502
12	NC_012471	GATTT	2	10	16447	16456	20 %	60 %	20 %	0 %	225869503
13	NC_012471	TATTG	2	10	16869	16878	20 %	60 %	20 %	0 %	225869503
14	NC_012471	GTATT	2	10	17144	17153	20 %	60 %	20 %	0 %	225869503
15	NC_012471	TCGTG	2	10	19115	19124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012471	GTTAA	2	10	20190	20199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012471	GGGAG	2	10	20709	20718	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012471	AGGGA	2	10	22917	22926	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012471	TAAGT	2	10	23169	23178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012471	GCTTA	2	10	23282	23291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012471	GCATA	2	10	23878	23887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012471	CTTTT	2	10	25692	25701	0 %	80 %	0 %	20 %	225869505
23	NC_012471	CTTGC	2	10	25901	25910	0 %	40 %	20 %	40 %	225869505
24	NC_012471	TTTTG	2	10	26118	26127	0 %	80 %	20 %	0 %	225869505
25	NC_012471	TTTAT	2	10	31054	31063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012471	GCTTG	2	10	34350	34359	0 %	40 %	40 %	20 %	225869512
27	NC_012471	CAGCT	2	10	34712	34721	20 %	20 %	20 %	40 %	225869512
28	NC_012471	ATCTG	2	10	36097	36106	20 %	40 %	20 %	20 %	225869513
29	NC_012471	AAATG	2	10	36823	36832	60 %	20 %	20 %	0 %	225869513
30	NC_012471	ACAAG	2	10	39701	39710	60 %	0 %	20 %	20 %	225869516
31	NC_012471	AAGCA	2	10	39755	39764	60 %	0 %	20 %	20 %	225869516
32	NC_012471	GTGGA	2	10	41230	41239	20 %	20 %	60 %	0 %	225869517
33	NC_012471	AGCAG	2	10	45272	45281	40 %	0 %	40 %	20 %	225869520
34	NC_012471	TGCTA	2	10	48879	48888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012471	TGACA	2	10	49785	49794	40 %	20 %	20 %	20 %	225869523
36	NC_012471	TGAGG	2	10	50293	50302	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012471	CTTGT	2	10	51530	51539	0 %	60 %	20 %	20 %	225869526
38	NC_012471	TTGGT	2	10	51749	51758	0 %	60 %	40 %	0 %	225869526
39	NC_012471	CTTTC	2	10	51913	51922	0 %	60 %	0 %	40 %	225869526
40	NC_012471	TTTTC	2	10	52299	52308	0 %	80 %	0 %	20 %	225869526
41	NC_012471	ATCCA	2	10	52715	52724	40 %	20 %	0 %	40 %	225869526
42	NC_012471	TGGTA	2	10	52970	52979	20 %	40 %	40 %	0 %	225869526
43	NC_012471	ATGGT	2	10	54254	54263	20 %	40 %	40 %	0 %	225869527
44	NC_012471	ATTCA	2	10	54938	54947	40 %	40 %	0 %	20 %	225869527
45	NC_012471	TACAA	2	10	57833	57842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012471	AACCA	2	10	57916	57925	60 %	0 %	0 %	40 %	225869529
47	NC_012471	TGACT	2	10	59274	59283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012471	AAATG	2	10	59320	59329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012471	ACATA	2	10	59454	59463	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012471	GATAC	2	10	59578	59587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012471	AGGAT	2	10	61413	61422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012471	TTTTG	2	10	62155	62164	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012471	GATTT	2	10	62383	62392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012471	ATTTA	2	10	62784	62793	40 %	60 %	0 %	0 %	225869531
55	NC_012471	TGAAG	2	10	63501	63510	40 %	20 %	40 %	0 %	225869531
56	NC_012471	TCATA	2	10	63654	63663	40 %	40 %	0 %	20 %	225869531
57	NC_012471	GAATT	2	10	63967	63976	40 %	40 %	20 %	0 %	225869532
58	NC_012471	AATTT	2	10	64183	64192	40 %	60 %	0 %	0 %	225869532
59	NC_012471	AGTCA	2	10	64716	64725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012471	TTTAG	2	10	64781	64790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012471	AAGCT	2	10	67781	67790	40 %	20 %	20 %	20 %	225869534
62	NC_012471	GAAAA	2	10	71577	71586	80 %	0 %	20 %	0 %	225869540
63	NC_012471	TTTGG	2	10	71991	72000	0 %	60 %	40 %	0 %	225869541
64	NC_012471	TTCAC	2	10	72347	72356	20 %	40 %	0 %	40 %	225869542
65	NC_012471	TGAAA	2	10	73427	73436	60 %	20 %	20 %	0 %	225869544
66	NC_012471	AAGGA	2	10	74515	74524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012471	AAATA	2	10	78740	78749	80 %	20 %	0 %	0 %	225869556
68	NC_012471	CTTCC	2	10	78843	78852	0 %	40 %	0 %	60 %	225869556
69	NC_012471	TCCAA	2	10	79421	79430	40 %	20 %	0 %	40 %	225869556
70	NC_012471	AGAAT	2	10	79991	80000	60 %	20 %	20 %	0 %	225869556
71	NC_012471	ACTAG	2	10	80832	80841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012471	GTTTC	2	10	82076	82085	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012471	TAGAT	2	10	83900	83909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012471	CGATT	2	10	85852	85861	20 %	40 %	20 %	20 %	225869564
75	NC_012471	TCGTG	2	10	88701	88710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012471	GTTAA	2	10	89776	89785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012471	GGGAG	2	10	90295	90304	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012471	AGGGA	2	10	92503	92512	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012471	TAAGT	2	10	92755	92764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012471	GCTTA	2	10	92868	92877	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012471	AGTTT	2	10	93846	93855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012471	CAACC	2	10	95070	95079	40 %	0 %	0 %	60 %	225869566
83	NC_012471	AAGGA	2	10	96922	96931	60 %	0 %	40 %	0 %	225869567
84	NC_012471	TTCCT	2	10	107148	107157	0 %	60 %	0 %	40 %	225869575
85	NC_012471	GACTA	2	10	108854	108863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012471	AATTT	2	10	112936	112945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012471	ATTGA	2	10	114232	114241	40 %	40 %	20 %	0 %	225869578
88	NC_012471	TAAGG	2	10	116232	116241	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012471	TTTGG	2	10	116297	116306	0 %	60 %	40 %	0 %	225869580
90	NC_012471	AACAC	2	10	117681	117690	60 %	0 %	0 %	40 %	225869580
91	NC_012471	ATCAA	2	10	120801	120810	60 %	20 %	0 %	20 %	225869583
92	NC_012471	ACAAA	2	10	121850	121859	80 %	0 %	0 %	20 %	225869586
93	NC_012471	TACCT	2	10	123682	123691	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_012471	AAAGC	2	10	124076	124085	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012471	TTTCA	2	10	124183	124192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012471	TGATA	2	10	124202	124211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012471	AATCG	2	10	125055	125064	40 %	20 %	20 %	20 %	225869590
98	NC_012471	TGATT	2	10	125436	125445	20 %	60 %	20 %	0 %	225869591
99	NC_012471	TTTAA	2	10	126616	126625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012471	AAAGC	2	10	127991	128000	60 %	0 %	20 %	20 %	225869593
101	NC_012471	TCACT	2	10	128732	128741	20 %	40 %	0 %	40 %	225869594
102	NC_012471	ATTAT	2	10	128937	128946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012471	TTTAT	2	10	130011	130020	20 %	80 %	0 %	0 %	225869595
104	NC_012471	ACGAT	2	10	130704	130713	40 %	20 %	20 %	20 %	225869595
105	NC_012471	GCTTT	2	10	130888	130897	0 %	60 %	20 %	20 %	225869595
106	NC_012471	TCATT	2	10	133553	133562	20 %	60 %	0 %	20 %	225869598
107	NC_012471	TTTAA	2	10	135352	135361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012471	ACATC	2	10	138966	138975	40 %	20 %	0 %	40 %	225869602
109	NC_012471	TTTCC	2	10	142002	142011	0 %	60 %	0 %	40 %	225869604
110	NC_012471	CATGT	2	10	142021	142030	20 %	40 %	20 %	20 %	225869604
111	NC_012471	TTCTT	2	10	142594	142603	0 %	80 %	0 %	20 %	225869605
112	NC_012471	TTTGA	2	10	143226	143235	20 %	60 %	20 %	0 %	225869605
113	NC_012471	AATAA	2	10	143740	143749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012471	GAAAT	2	10	148353	148362	60 %	20 %	20 %	0 %	225869619
115	NC_012471	TCCAA	2	10	148555	148564	40 %	20 %	0 %	40 %	225869620
116	NC_012471	GGCAT	2	10	151378	151387	20 %	20 %	40 %	20 %	225869624
117	NC_012471	ATATT	2	10	153730	153739	40 %	60 %	0 %	0 %	225869630
118	NC_012471	AGAGG	2	10	154276	154285	40 %	0 %	60 %	0 %	225869631
119	NC_012471	TAATA	2	10	155030	155039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012471	CAAAA	2	10	157169	157178	80 %	0 %	0 %	20 %	225869636
121	NC_012471	CAAAA	2	10	163266	163275	80 %	0 %	0 %	20 %	225869643
122	NC_012471	GGGAT	2	10	164388	164397	20 %	20 %	60 %	0 %	225869646
123	NC_012471	GACTT	2	10	164445	164454	20 %	40 %	20 %	20 %	225869647
124	NC_012471	AGTCG	2	10	165765	165774	20 %	20 %	40 %	20 %	225869650
125	NC_012471	GAAAA	2	10	168156	168165	80 %	0 %	20 %	0 %	225869651
126	NC_012471	GACAG	2	10	174517	174526	40 %	0 %	40 %	20 %	225869656
127	NC_012471	AAATC	2	10	174684	174693	60 %	20 %	0 %	20 %	225869656
128	NC_012471	GCCTA	2	10	175449	175458	20 %	20 %	20 %	40 %	225869656
129	NC_012471	ACAAA	2	10	175634	175643	80 %	0 %	0 %	20 %	225869657
130	NC_012471	TAAAT	2	10	178366	178375	60 %	40 %	0 %	0 %	225869661
131	NC_012471	CAATT	2	10	178814	178823	40 %	40 %	0 %	20 %	225869662
132	NC_012471	ATTAT	2	10	179529	179538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012471	TTAAT	2	10	179657	179666	40 %	60 %	0 %	0 %	225869664
134	NC_012471	ATTTT	2	10	180413	180422	20 %	80 %	0 %	0 %	225869666
135	NC_012471	GGGTA	2	10	180762	180771	20 %	20 %	60 %	0 %	225869666
136	NC_012471	CATTT	2	10	180937	180946	20 %	60 %	0 %	20 %	225869666
137	NC_012471	CATCC	2	10	181776	181785	20 %	20 %	0 %	60 %	225869667
138	NC_012471	GATTC	2	10	183138	183147	20 %	40 %	20 %	20 %	225869670
139	NC_012471	GCTTG	2	10	184447	184456	0 %	40 %	40 %	20 %	225869671
140	NC_012471	AAGTT	2	10	187331	187340	40 %	40 %	20 %	0 %	225869673
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268	NC_012471	TTTAT	2	10	341943	341952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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