MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012471	CTT	2	6	141510	141515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869604
3002	NC_012471	AGC	2	6	141562	141567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869604
3003	NC_012471	ATCA	2	8	141577	141584	50 %	25 %	0 %	25 %	225869604
3004	NC_012471	GCT	2	6	141586	141591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869604
3005	NC_012471	CAT	2	6	141625	141630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869604
3006	NC_012471	AAT	2	6	141652	141657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869604
3007	NC_012471	ACA	2	6	141758	141763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869604
3008	NC_012471	ATC	2	6	141769	141774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869604
3009	NC_012471	GT	3	6	141796	141801	0 %	50 %	50 %	0 %	225869604
3010	NC_012471	CAAA	2	8	141884	141891	75 %	0 %	0 %	25 %	225869604
3011	NC_012471	CTG	2	6	141900	141905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869604
3012	NC_012471	AAC	2	6	141916	141921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869604
3013	NC_012471	TTTCC	2	10	142002	142011	0 %	60 %	0 %	40 %	225869604
3014	NC_012471	CATGT	2	10	142021	142030	20 %	40 %	20 %	20 %	225869604
3015	NC_012471	CCT	2	6	142031	142036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_012471	T	6	6	142036	142041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012471	TAT	2	6	142056	142061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012471	ATA	2	6	142176	142181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012471	ATA	2	6	142192	142197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012471	AAT	2	6	142226	142231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_012471	ATT	2	6	142238	142243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_012471	A	6	6	142270	142275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_012471	A	6	6	142288	142293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_012471	AGC	2	6	142296	142301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_012471	A	6	6	142307	142312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_012471	GCT	2	6	142315	142320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_012471	TCG	2	6	142415	142420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_012471	TA	3	6	142444	142449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012471	GTT	2	6	142481	142486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012471	T	6	6	142502	142507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_012471	A	7	7	142518	142524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012471	A	7	7	142528	142534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012471	TTCTT	2	10	142594	142603	0 %	80 %	0 %	20 %	225869605
3034	NC_012471	A	6	6	142705	142710	100 %	0 %	0 %	0 %	225869605
3035	NC_012471	AG	3	6	142729	142734	50 %	0 %	50 %	0 %	225869605
3036	NC_012471	GAC	2	6	142748	142753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869605
3037	NC_012471	CAA	2	6	142754	142759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869605
3038	NC_012471	T	7	7	142760	142766	0 %	100 %	0 %	0 %	225869605
3039	NC_012471	TAA	2	6	142831	142836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869605
3040	NC_012471	T	6	6	142906	142911	0 %	100 %	0 %	0 %	225869605
3041	NC_012471	ATG	2	6	143038	143043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869605
3042	NC_012471	TCT	2	6	143110	143115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869605
3043	NC_012471	CTT	2	6	143144	143149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869605
3044	NC_012471	TTTGA	2	10	143226	143235	20 %	60 %	20 %	0 %	225869605
3045	NC_012471	CATT	2	8	143282	143289	25 %	50 %	0 %	25 %	225869605
3046	NC_012471	TTA	2	6	143317	143322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869605
3047	NC_012471	T	6	6	143343	143348	0 %	100 %	0 %	0 %	225869605
3048	NC_012471	ACA	2	6	143392	143397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869605
3049	NC_012471	AT	3	6	143447	143452	50 %	50 %	0 %	0 %	225869605
3050	NC_012471	TTTA	2	8	143463	143470	25 %	75 %	0 %	0 %	225869605
3051	NC_012471	GTA	2	6	143565	143570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869605
3052	NC_012471	CGC	2	6	143591	143596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869605
3053	NC_012471	T	6	6	143677	143682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_012471	T	6	6	143734	143739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012471	AATAA	2	10	143740	143749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_012471	TAT	2	6	143857	143862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_012471	T	7	7	143867	143873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012471	A	6	6	143876	143881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012471	ATT	2	6	143901	143906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869606
3060	NC_012471	AAT	2	6	143907	143912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869606
3061	NC_012471	ATC	2	6	143937	143942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869606
3062	NC_012471	TATT	2	8	143975	143982	25 %	75 %	0 %	0 %	225869606
3063	NC_012471	ATA	2	6	143986	143991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869606
3064	NC_012471	TTG	2	6	144040	144045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869606
3065	NC_012471	CTT	2	6	144068	144073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869606
3066	NC_012471	T	6	6	144159	144164	0 %	100 %	0 %	0 %	225869606
3067	NC_012471	TTA	2	6	144274	144279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869606
3068	NC_012471	T	6	6	144330	144335	0 %	100 %	0 %	0 %	225869606
3069	NC_012471	ATG	2	6	144354	144359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869606
3070	NC_012471	CAA	2	6	144395	144400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869606
3071	NC_012471	CAC	2	6	144410	144415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869606
3072	NC_012471	AAATTT	2	12	144531	144542	50 %	50 %	0 %	0 %	225869606
3073	NC_012471	CT	3	6	144586	144591	0 %	50 %	0 %	50 %	225869607
3074	NC_012471	AAAT	2	8	144641	144648	75 %	25 %	0 %	0 %	225869607
3075	NC_012471	TTC	2	6	144649	144654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869607
3076	NC_012471	TTG	2	6	144662	144667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869607
3077	NC_012471	T	7	7	144709	144715	0 %	100 %	0 %	0 %	225869607
3078	NC_012471	TCAT	2	8	144752	144759	25 %	50 %	0 %	25 %	225869607
3079	NC_012471	TGA	2	6	144780	144785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869607
3080	NC_012471	CAT	2	6	144864	144869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869607
3081	NC_012471	TCT	2	6	144902	144907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869607
3082	NC_012471	TCT	2	6	144962	144967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869607
3083	NC_012471	T	6	6	144979	144984	0 %	100 %	0 %	0 %	225869607
3084	NC_012471	AAC	2	6	144997	145002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869607
3085	NC_012471	TTC	2	6	145012	145017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869607
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3088	NC_012471	T	6	6	145176	145181	0 %	100 %	0 %	0 %	225869607
3089	NC_012471	TGG	2	6	145233	145238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869607
3090	NC_012471	T	6	6	145255	145260	0 %	100 %	0 %	0 %	225869607
3091	NC_012471	ATC	2	6	145339	145344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012471	CAA	2	6	145382	145387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_012471	A	7	7	145406	145412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_012471	TTG	2	6	145521	145526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869608
3095	NC_012471	ACT	2	6	145535	145540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869608
3096	NC_012471	CAA	2	6	145541	145546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869608
3097	NC_012471	GCG	2	6	145602	145607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869608
3098	NC_012471	AGA	2	6	145663	145668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869608
3099	NC_012471	T	8	8	145680	145687	0 %	100 %	0 %	0 %	225869608
3100	NC_012471	AAC	2	6	145759	145764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869609
3101	NC_012471	ATT	2	6	145812	145817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869609
3102	NC_012471	CTA	2	6	145878	145883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869609
3103	NC_012471	GT	3	6	145905	145910	0 %	50 %	50 %	0 %	225869610
3104	NC_012471	CAA	2	6	145948	145953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869610
3105	NC_012471	ATT	2	6	146006	146011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869610
3106	NC_012471	CAAC	2	8	146040	146047	50 %	0 %	0 %	50 %	225869610
3107	NC_012471	TCC	2	6	146093	146098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_012471	GAT	2	6	146106	146111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012471	TAT	2	6	146117	146122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_012471	A	7	7	146141	146147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_012471	AAT	2	6	146171	146176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012471	TAG	2	6	146202	146207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869611
3113	NC_012471	ATT	2	6	146208	146213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869611
3114	NC_012471	TGA	2	6	146223	146228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869611
3115	NC_012471	TAA	2	6	146277	146282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869611
3116	NC_012471	A	6	6	146484	146489	100 %	0 %	0 %	0 %	225869612
3117	NC_012471	AGA	2	6	146519	146524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869612
3118	NC_012471	CAA	2	6	146541	146546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869612
3119	NC_012471	ATG	2	6	146621	146626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869612
3120	NC_012471	TTG	2	6	146655	146660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869613
3121	NC_012471	GA	3	6	146667	146672	50 %	0 %	50 %	0 %	225869613
3122	NC_012471	ACA	2	6	146676	146681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869613
3123	NC_012471	GGT	2	6	146722	146727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869613
3124	NC_012471	A	6	6	146801	146806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012471	TTG	3	9	146828	146836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869614
3126	NC_012471	GGA	2	6	146875	146880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869614
3127	NC_012471	GGCG	2	8	146978	146985	0 %	0 %	75 %	25 %	225869614
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3246	NC_012471	ATG	2	6	151626	151631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869625
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3250	NC_012471	GAT	2	6	151796	151801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869625
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3357	NC_012471	ATA	2	6	156465	156470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3361	NC_012471	AAT	2	6	156618	156623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_012471	T	7	7	156642	156648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_012471	A	7	7	156740	156746	100 %	0 %	0 %	0 %	225869635
3364	NC_012471	AGG	2	6	156771	156776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869635
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3370	NC_012471	CAAAA	2	10	157169	157178	80 %	0 %	0 %	20 %	225869636
3371	NC_012471	CAT	2	6	157182	157187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869636
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3373	NC_012471	AGA	2	6	157290	157295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869636
3374	NC_012471	ATC	2	6	157301	157306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869636
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