MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012471	GCT	2	6	118229	118234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869580
2502	NC_012471	TGA	2	6	118382	118387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869581
2503	NC_012471	TTTC	2	8	118425	118432	0 %	75 %	0 %	25 %	225869581
2504	NC_012471	A	6	6	118437	118442	100 %	0 %	0 %	0 %	225869581
2505	NC_012471	T	6	6	118467	118472	0 %	100 %	0 %	0 %	225869581
2506	NC_012471	A	6	6	118562	118567	100 %	0 %	0 %	0 %	225869581
2507	NC_012471	AGG	2	6	118574	118579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869581
2508	NC_012471	TGG	2	6	118662	118667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869581
2509	NC_012471	TCC	2	6	118710	118715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869581
2510	NC_012471	TGA	2	6	118728	118733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869581
2511	NC_012471	ATC	2	6	118816	118821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869581
2512	NC_012471	AGC	2	6	118882	118887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869581
2513	NC_012471	TAAA	2	8	118900	118907	75 %	25 %	0 %	0 %	225869581
2514	NC_012471	TCA	2	6	118943	118948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_012471	A	6	6	119018	119023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_012471	T	8	8	119044	119051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_012471	GAG	2	6	119072	119077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_012471	CAGG	2	8	119113	119120	25 %	0 %	50 %	25 %	225869582
2519	NC_012471	GAA	2	6	119123	119128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869582
2520	NC_012471	TA	3	6	119147	119152	50 %	50 %	0 %	0 %	225869582
2521	NC_012471	TGA	2	6	119181	119186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869582
2522	NC_012471	TGA	2	6	119194	119199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869582
2523	NC_012471	AGG	2	6	119201	119206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869582
2524	NC_012471	TTA	2	6	119244	119249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869582
2525	NC_012471	GAAT	2	8	119271	119278	50 %	25 %	25 %	0 %	225869582
2526	NC_012471	A	6	6	119286	119291	100 %	0 %	0 %	0 %	225869582
2527	NC_012471	TGA	2	6	119326	119331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869582
2528	NC_012471	ATC	3	9	119406	119414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869582
2529	NC_012471	A	6	6	119593	119598	100 %	0 %	0 %	0 %	225869582
2530	NC_012471	TTA	2	6	119733	119738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869582
2531	NC_012471	ATA	2	6	119844	119849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869582
2532	NC_012471	TTA	2	6	119877	119882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869582
2533	NC_012471	ATTG	2	8	119897	119904	25 %	50 %	25 %	0 %	225869582
2534	NC_012471	CAT	2	6	119924	119929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869582
2535	NC_012471	CAG	2	6	119948	119953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869582
2536	NC_012471	CTT	2	6	119963	119968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869582
2537	NC_012471	CAGG	2	8	119989	119996	25 %	0 %	50 %	25 %	225869582
2538	NC_012471	A	6	6	120006	120011	100 %	0 %	0 %	0 %	225869582
2539	NC_012471	AGC	2	6	120022	120027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869582
2540	NC_012471	T	6	6	120095	120100	0 %	100 %	0 %	0 %	225869583
2541	NC_012471	GCT	2	6	120113	120118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869583
2542	NC_012471	AAGC	2	8	120145	120152	50 %	0 %	25 %	25 %	225869583
2543	NC_012471	AGC	2	6	120185	120190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869583
2544	NC_012471	A	6	6	120265	120270	100 %	0 %	0 %	0 %	225869583
2545	NC_012471	AG	3	6	120401	120406	50 %	0 %	50 %	0 %	225869583
2546	NC_012471	TGAC	2	8	120418	120425	25 %	25 %	25 %	25 %	225869583
2547	NC_012471	TTG	2	6	120426	120431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869583
2548	NC_012471	ATT	2	6	120445	120450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869583
2549	NC_012471	TTTG	2	8	120460	120467	0 %	75 %	25 %	0 %	225869583
2550	NC_012471	TAT	2	6	120546	120551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869583
2551	NC_012471	CTA	2	6	120590	120595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869583
2552	NC_012471	GAT	2	6	120653	120658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869583
2553	NC_012471	CTA	2	6	120714	120719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869583
2554	NC_012471	TCA	2	6	120734	120739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869583
2555	NC_012471	T	6	6	120759	120764	0 %	100 %	0 %	0 %	225869583
2556	NC_012471	ATCAA	2	10	120801	120810	60 %	20 %	0 %	20 %	225869583
2557	NC_012471	T	6	6	120858	120863	0 %	100 %	0 %	0 %	225869583
2558	NC_012471	ATT	2	6	120900	120905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869583
2559	NC_012471	T	7	7	120904	120910	0 %	100 %	0 %	0 %	225869583
2560	NC_012471	TGA	2	6	120931	120936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869583
2561	NC_012471	TGC	2	6	120941	120946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869583
2562	NC_012471	TTA	2	6	120951	120956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869583
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2564	NC_012471	AAATGA	2	12	120988	120999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225869583
2565	NC_012471	GACA	2	8	121127	121134	50 %	0 %	25 %	25 %	225869584
2566	NC_012471	TGC	2	6	121142	121147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869584
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2569	NC_012471	AGC	2	6	121249	121254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869584
2570	NC_012471	ATT	2	6	121270	121275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869584
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2573	NC_012471	GAG	2	6	121411	121416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869585
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2575	NC_012471	GGC	2	6	121597	121602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869585
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2577	NC_012471	A	6	6	121685	121690	100 %	0 %	0 %	0 %	225869585
2578	NC_012471	ACAAA	2	10	121850	121859	80 %	0 %	0 %	20 %	225869586
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2581	NC_012471	ATT	2	6	121940	121945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869586
2582	NC_012471	CTTG	2	8	122000	122007	0 %	50 %	25 %	25 %	225869587
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2588	NC_012471	AAG	2	6	122187	122192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869587
2589	NC_012471	AGC	2	6	122234	122239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869587
2590	NC_012471	CAG	2	6	122296	122301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869587
2591	NC_012471	CAG	2	6	122307	122312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869587
2592	NC_012471	TTTA	2	8	122355	122362	25 %	75 %	0 %	0 %	225869587
2593	NC_012471	TTA	2	6	122428	122433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869588
2594	NC_012471	AGC	2	6	122537	122542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869588
2595	NC_012471	AGC	2	6	122600	122605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869588
2596	NC_012471	CAG	2	6	122635	122640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869588
2597	NC_012471	CAG	2	6	122668	122673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869588
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2599	NC_012471	G	6	6	122776	122781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_012471	TTA	2	6	122957	122962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869589
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2602	NC_012471	TGAT	2	8	123001	123008	25 %	50 %	25 %	0 %	225869589
2603	NC_012471	AGA	2	6	123117	123122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869589
2604	NC_012471	CCA	2	6	123129	123134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869589
2605	NC_012471	AGA	2	6	123154	123159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869589
2606	NC_012471	A	6	6	123233	123238	100 %	0 %	0 %	0 %	225869589
2607	NC_012471	GA	3	6	123242	123247	50 %	0 %	50 %	0 %	225869589
2608	NC_012471	ATC	2	6	123290	123295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869589
2609	NC_012471	TAT	3	9	123362	123370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_012471	AAG	2	6	123390	123395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_012471	ATG	2	6	123435	123440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_012471	CAT	2	6	123443	123448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_012471	TCG	2	6	123463	123468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_012471	A	6	6	123512	123517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_012471	TGA	2	6	123528	123533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_012471	CGT	2	6	123560	123565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_012471	TTC	2	6	123577	123582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_012471	TACCT	2	10	123682	123691	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2619	NC_012471	CTAT	2	8	123703	123710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_012471	ATT	2	6	123740	123745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_012471	ATC	2	6	123876	123881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_012471	TCCA	2	8	123907	123914	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_012471	GAT	2	6	123946	123951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_012471	CTT	2	6	123958	123963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_012471	TAC	2	6	124055	124060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_012471	AAC	2	6	124061	124066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2628	NC_012471	TTTCA	2	10	124183	124192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2751	NC_012471	TATC	2	8	129626	129633	25 %	50 %	0 %	25 %	225869595
2752	NC_012471	TGA	2	6	129800	129805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869595
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2869	NC_012471	A	6	6	135360	135365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2998	NC_012471	GCA	2	6	141306	141311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869603
2999	NC_012471	TTC	2	6	141314	141319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869603
3000	NC_012471	GCT	2	6	141412	141417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869603

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