MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012470	A	7	7	286492	286498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_012470	GAC	2	6	286576	286581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_012470	AG	3	6	286669	286674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_012470	GGC	2	6	286701	286706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_012470	GAT	2	6	286736	286741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_012470	CGA	2	6	286951	286956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_012470	GCA	2	6	287025	287030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_012470	G	6	6	287050	287055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_012470	CGC	2	6	287072	287077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_012470	GTGA	2	8	287078	287085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_012470	TGT	2	6	287111	287116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_012470	AGA	2	6	287120	287125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012470	CAT	2	6	287148	287153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_012470	TAAC	2	8	287161	287168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_012470	CAG	2	6	287194	287199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_012470	AGCG	2	8	287249	287256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_012470	AT	3	6	287378	287383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_012470	GGA	2	6	287384	287389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_012470	CT	3	6	287409	287414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_012470	GAA	2	6	287648	287653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_012470	AAG	2	6	287694	287699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_012470	GGT	2	6	287722	287727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_012470	GTC	2	6	287736	287741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_012470	TCGTG	2	10	287745	287754	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6025	NC_012470	CAT	2	6	287804	287809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_012470	TAA	2	6	287839	287844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_012470	GGA	2	6	287848	287853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_012470	ATC	2	6	287872	287877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_012470	AC	3	6	287899	287904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_012470	TGGT	2	8	287914	287921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_012470	CGC	2	6	288038	288043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_012470	AC	3	6	288068	288073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_012470	CAC	2	6	288083	288088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_012470	AGCC	2	8	288131	288138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_012470	GAT	2	6	288154	288159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_012470	CCT	2	6	288210	288215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_012470	AGG	2	6	288311	288316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_012470	CGGTT	2	10	288365	288374	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6039	NC_012470	TG	3	6	288412	288417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_012470	CA	3	6	288423	288428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_012470	T	6	6	288441	288446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_012470	AAG	2	6	288450	288455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012470	ATC	3	9	288516	288524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_012470	AGA	2	6	288571	288576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012470	A	6	6	288629	288634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_012470	GTTAA	2	10	288639	288648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_012470	GAA	2	6	288685	288690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_012470	ACG	2	6	288702	288707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_012470	GTAA	2	8	288725	288732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_012470	GAAG	2	8	288807	288814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_012470	GCG	2	6	288878	288883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_012470	AGG	2	6	288895	288900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012470	GAC	2	6	288947	288952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_012470	AGA	2	6	288961	288966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_012470	AG	3	6	288989	288994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_012470	TCG	2	6	289064	289069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_012470	GGA	2	6	289077	289082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_012470	GGGAG	2	10	289158	289167	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_012470	AAG	2	6	289197	289202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_012470	TTACGT	2	12	289255	289266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6061	NC_012470	GGA	2	6	289393	289398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_012470	TC	3	6	289479	289484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_012470	ACC	2	6	289658	289663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_012470	AGC	2	6	289738	289743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_012470	ATTC	2	8	289745	289752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_012470	TG	3	6	289868	289873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012470	GA	3	6	290019	290024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_012470	ACA	2	6	290045	290050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_012470	TA	3	6	290073	290078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_012470	CTAA	2	8	290100	290107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_012470	GAC	2	6	290112	290117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_012470	GA	3	6	290314	290319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_012470	CTGA	2	8	290373	290380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_012470	CT	3	6	290430	290435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_012470	GAT	2	6	290448	290453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_012470	CGG	2	6	290539	290544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_012470	GA	3	6	290637	290642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_012470	TAGG	2	8	290755	290762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_012470	TAC	2	6	290809	290814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_012470	TTGG	2	8	290938	290945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_012470	AATC	2	8	290947	290954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_012470	GGT	2	6	291033	291038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_012470	TCG	2	6	291148	291153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_012470	CGT	2	6	291228	291233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_012470	AGGGA	2	10	291366	291375	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_012470	GA	3	6	291452	291457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_012470	GTG	2	6	291488	291493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_012470	ACTAAT	2	12	291507	291518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6090	NC_012470	TAAGT	2	10	291618	291627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_012470	AGT	2	6	291669	291674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_012470	AGT	2	6	291694	291699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_012470	GCTTA	2	10	291731	291740	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6094	NC_012470	GTA	2	6	291761	291766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_012470	ATG	2	6	291784	291789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6097	NC_012470	T	6	6	291886	291891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_012470	CTC	2	6	292059	292064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_012470	TGT	2	6	292101	292106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_012470	T	7	7	292106	292112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_012470	TAA	2	6	292126	292131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_012470	CTA	2	6	292134	292139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_012470	TGA	2	6	292167	292172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867854
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6105	NC_012470	TAT	3	9	292203	292211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867854
6106	NC_012470	ATT	2	6	292226	292231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867854
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6113	NC_012470	GAT	2	6	292480	292485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867854
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6115	NC_012470	GAG	2	6	292519	292524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867854
6116	NC_012470	AG	3	6	292533	292538	50 %	0 %	50 %	0 %	225867854
6117	NC_012470	GCTG	2	8	292732	292739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_012470	TTA	2	6	292808	292813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_012470	CTG	2	6	292825	292830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_012470	TATT	2	8	292834	292841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_012470	TTG	2	6	292912	292917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_012470	TTTTC	2	10	292944	292953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6123	NC_012470	ATC	2	6	293003	293008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_012470	A	6	6	293114	293119	100 %	0 %	0 %	0 %	225867855
6125	NC_012470	T	7	7	293145	293151	0 %	100 %	0 %	0 %	225867855
6126	NC_012470	TGA	2	6	293164	293169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867855
6127	NC_012470	ATG	2	6	293222	293227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867855
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6131	NC_012470	TCT	3	9	293367	293375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867855
6132	NC_012470	TTCTCT	2	12	293390	293401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867855
6133	NC_012470	TCA	2	6	293418	293423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867855
6134	NC_012470	ATC	2	6	293543	293548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867855
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6243	NC_012470	ATAA	2	8	298335	298342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_012470	A	6	6	298409	298414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6249	NC_012470	AGAA	2	8	298549	298556	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_012470	CTTGG	2	10	298626	298635	0 %	40 %	40 %	20 %	225867861
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