MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 43253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012469	TCAT	2	8	191350	191357	25 %	50 %	0 %	25 %	225860209
4002	NC_012469	TGA	2	6	191377	191382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860209
4003	NC_012469	ATT	2	6	191527	191532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860209
4004	NC_012469	TCACT	2	10	191551	191560	20 %	40 %	0 %	40 %	225860210
4005	NC_012469	AT	4	8	191688	191695	50 %	50 %	0 %	0 %	225860210
4006	NC_012469	TCA	2	6	191703	191708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860210
4007	NC_012469	TGT	2	6	191715	191720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860210
4008	NC_012469	T	6	6	191825	191830	0 %	100 %	0 %	0 %	225860210
4009	NC_012469	ATTTT	2	10	191874	191883	20 %	80 %	0 %	0 %	225860210
4010	NC_012469	TCC	2	6	192000	192005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860210
4011	NC_012469	CCA	2	6	192052	192057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860210
4012	NC_012469	CTT	2	6	192106	192111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860210
4013	NC_012469	GATT	2	8	192126	192133	25 %	50 %	25 %	0 %	225860210
4014	NC_012469	TTAAG	2	10	192226	192235	40 %	40 %	20 %	0 %	225860210
4015	NC_012469	ATT	2	6	192272	192277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860210
4016	NC_012469	ACT	2	6	192339	192344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860210
4017	NC_012469	AGG	2	6	192380	192385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860210
4018	NC_012469	ACA	2	6	192401	192406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860210
4019	NC_012469	TC	3	6	192470	192475	0 %	50 %	0 %	50 %	225860210
4020	NC_012469	CCA	2	6	192486	192491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860210
4021	NC_012469	A	6	6	192491	192496	100 %	0 %	0 %	0 %	225860210
4022	NC_012469	GAT	2	6	192515	192520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860210
4023	NC_012469	GGATTG	2	12	192555	192566	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225860210
4024	NC_012469	AT	3	6	192609	192614	50 %	50 %	0 %	0 %	225860210
4025	NC_012469	A	7	7	192641	192647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012469	ACT	2	6	192665	192670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_012469	TCT	2	6	192767	192772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_012469	ACC	2	6	192838	192843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_012469	CCCTG	2	10	192858	192867	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4030	NC_012469	GAT	2	6	192888	192893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012469	CTC	2	6	192974	192979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_012469	AG	3	6	193017	193022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012469	TCAGG	2	10	193141	193150	20 %	20 %	40 %	20 %	225860211
4034	NC_012469	AGG	2	6	193157	193162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860211
4035	NC_012469	TAT	2	6	193293	193298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860211
4036	NC_012469	GCT	2	6	193300	193305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860211
4037	NC_012469	CAG	2	6	193393	193398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860211
4038	NC_012469	GTA	2	6	193423	193428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860211
4039	NC_012469	GCAA	2	8	193464	193471	50 %	0 %	25 %	25 %	225860211
4040	NC_012469	GAA	2	6	193492	193497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860211
4041	NC_012469	GTT	2	6	193646	193651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860212
4042	NC_012469	ATG	2	6	193691	193696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860212
4043	NC_012469	ATG	2	6	193718	193723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860212
4044	NC_012469	GTT	2	6	193731	193736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860212
4045	NC_012469	GTT	2	6	193740	193745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860212
4046	NC_012469	CAGG	2	8	193762	193769	25 %	0 %	50 %	25 %	225860212
4047	NC_012469	CAA	2	6	193791	193796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860212
4048	NC_012469	TGAC	2	8	193853	193860	25 %	25 %	25 %	25 %	225860212
4049	NC_012469	TTG	2	6	193997	194002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860212
4050	NC_012469	A	6	6	194089	194094	100 %	0 %	0 %	0 %	225860212
4051	NC_012469	TGA	2	6	194157	194162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860212
4052	NC_012469	ATG	2	6	194196	194201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860212
4053	NC_012469	CTT	2	6	194281	194286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860213
4054	NC_012469	CTT	2	6	194345	194350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860213
4055	NC_012469	CAA	2	6	194370	194375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860213
4056	NC_012469	TTC	2	6	194406	194411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860213
4057	NC_012469	TGA	2	6	194446	194451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860213
4058	NC_012469	TGT	2	6	194453	194458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860213
4059	NC_012469	AAC	2	6	194548	194553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860213
4060	NC_012469	ACT	2	6	194555	194560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860213
4061	NC_012469	AGA	2	6	194597	194602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860213
4062	NC_012469	ATT	2	6	194603	194608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860213
4063	NC_012469	ATT	2	6	194664	194669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860213
4064	NC_012469	GCCTT	2	10	194755	194764	0 %	40 %	20 %	40 %	225860213
4065	NC_012469	TAT	2	6	194768	194773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860213
4066	NC_012469	GAAA	2	8	194780	194787	75 %	0 %	25 %	0 %	225860213
4067	NC_012469	CTA	2	6	194798	194803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860213
4068	NC_012469	AAATG	2	10	194868	194877	60 %	20 %	20 %	0 %	225860213
4069	NC_012469	TGA	2	6	194955	194960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_012469	A	6	6	194983	194988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012469	GTC	2	6	195166	195171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860214
4072	NC_012469	TGA	2	6	195213	195218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860214
4073	NC_012469	TCT	2	6	195266	195271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860214
4074	NC_012469	TTC	2	6	195283	195288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860214
4075	NC_012469	TTCCC	2	10	195311	195320	0 %	40 %	0 %	60 %	225860214
4076	NC_012469	ACC	2	6	195418	195423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860214
4077	NC_012469	CAA	2	6	195457	195462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860214
4078	NC_012469	TGAC	2	8	195482	195489	25 %	25 %	25 %	25 %	225860214
4079	NC_012469	GTTC	2	8	195524	195531	0 %	50 %	25 %	25 %	225860214
4080	NC_012469	TTC	2	6	195567	195572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860214
4081	NC_012469	TCAA	2	8	195578	195585	50 %	25 %	0 %	25 %	225860214
4082	NC_012469	AGT	2	6	195594	195599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860214
4083	NC_012469	GGT	2	6	195696	195701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860214
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4085	NC_012469	ATC	2	6	195835	195840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860214
4086	NC_012469	TAG	2	6	196029	196034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860214
4087	NC_012469	TCC	2	6	196048	196053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_012469	AGA	2	6	196112	196117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012469	AGCT	2	8	196200	196207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_012469	A	6	6	196245	196250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_012469	TGCACT	2	12	196320	196331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225860215
4092	NC_012469	AGG	2	6	196372	196377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860215
4093	NC_012469	GCT	2	6	196378	196383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860215
4094	NC_012469	AAT	2	6	196386	196391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860215
4095	NC_012469	TTG	2	6	196442	196447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860215
4096	NC_012469	AGA	2	6	196451	196456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860215
4097	NC_012469	AGT	2	6	196559	196564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860215
4098	NC_012469	CCA	2	6	196585	196590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860215
4099	NC_012469	AGA	2	6	196606	196611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860215
4100	NC_012469	AATC	2	8	196614	196621	50 %	25 %	0 %	25 %	225860215
4101	NC_012469	AAG	2	6	196648	196653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860215
4102	NC_012469	TGA	2	6	196688	196693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860215
4103	NC_012469	ATC	2	6	196711	196716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860215
4104	NC_012469	ATC	2	6	196725	196730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860215
4105	NC_012469	CTC	2	6	196836	196841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860215
4106	NC_012469	TGA	2	6	196904	196909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860215
4107	NC_012469	TTG	2	6	196911	196916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860215
4108	NC_012469	CTC	2	6	196985	196990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_012469	T	6	6	197000	197005	0 %	100 %	0 %	0 %	225860216
4110	NC_012469	AG	3	6	197017	197022	50 %	0 %	50 %	0 %	225860216
4111	NC_012469	ATG	2	6	197181	197186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860216
4112	NC_012469	GTT	2	6	197195	197200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860216
4113	NC_012469	GAGG	2	8	197381	197388	25 %	0 %	75 %	0 %	225860216
4114	NC_012469	T	6	6	197407	197412	0 %	100 %	0 %	0 %	225860216
4115	NC_012469	TCAA	2	8	197427	197434	50 %	25 %	0 %	25 %	225860216
4116	NC_012469	TTC	2	6	197435	197440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860216
4117	NC_012469	TTGA	2	8	197449	197456	25 %	50 %	25 %	0 %	225860216
4118	NC_012469	TGA	2	6	197653	197658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860216
4119	NC_012469	GTA	2	6	197681	197686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860216
4120	NC_012469	TTTC	2	8	197697	197704	0 %	75 %	0 %	25 %	225860216
4121	NC_012469	TTC	2	6	197768	197773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860216
4122	NC_012469	CAATAT	2	12	197800	197811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225860216
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4124	NC_012469	AG	3	6	197915	197920	50 %	0 %	50 %	0 %	225860216
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4253	NC_012469	GGA	2	6	203984	203989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860224
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4256	NC_012469	AG	3	6	204291	204296	50 %	0 %	50 %	0 %	225860225
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4262	NC_012469	GAA	2	6	204716	204721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_012469	TAG	2	6	204839	204844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860227
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4272	NC_012469	AGA	2	6	205624	205629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_012469	CCT	2	6	205679	205684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860228
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4278	NC_012469	TGA	2	6	206197	206202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860228
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4283	NC_012469	TGG	2	6	206608	206613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860228
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4294	NC_012469	ATA	2	6	207165	207170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4296	NC_012469	TG	3	6	207198	207203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4323	NC_012469	TAC	2	6	208882	208887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4328	NC_012469	A	6	6	208978	208983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4329	NC_012469	A	6	6	209002	209007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4331	NC_012469	T	6	6	209115	209120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4343	NC_012469	TTGC	2	8	209862	209869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4370	NC_012469	TCAT	2	8	210967	210974	25 %	50 %	0 %	25 %	225860233
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4373	NC_012469	CT	3	6	211084	211089	0 %	50 %	0 %	50 %	225860233
4374	NC_012469	AG	3	6	211115	211120	50 %	0 %	50 %	0 %	225860233
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4499	NC_012469	TAAAAA	2	12	217232	217243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_012469	G	6	6	217258	217263	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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