MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 43253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012469	CTT	2	6	48285	48290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860068
1003	NC_012469	CT	3	6	48359	48364	0 %	50 %	0 %	50 %	225860068
1004	NC_012469	TTG	2	6	48389	48394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860068
1005	NC_012469	TGA	2	6	48410	48415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860068
1006	NC_012469	ATG	2	6	48437	48442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012469	CTT	2	6	48464	48469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012469	TTGA	2	8	48476	48483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012469	AT	3	6	48546	48551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012469	GGA	2	6	48555	48560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012469	TCT	2	6	48598	48603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860069
1012	NC_012469	GA	3	6	48683	48688	50 %	0 %	50 %	0 %	225860069
1013	NC_012469	GAA	2	6	48703	48708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860069
1014	NC_012469	TGT	2	6	48828	48833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860069
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1018	NC_012469	CGT	2	6	49039	49044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860069
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1020	NC_012469	TAT	2	6	49140	49145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860069
1021	NC_012469	CAT	2	6	49194	49199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860069
1022	NC_012469	TTGA	2	8	49228	49235	25 %	50 %	25 %	0 %	225860069
1023	NC_012469	TGAT	2	8	49241	49248	25 %	50 %	25 %	0 %	225860069
1024	NC_012469	TTCT	2	8	49331	49338	0 %	75 %	0 %	25 %	225860069
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1029	NC_012469	CGTA	2	8	49473	49480	25 %	25 %	25 %	25 %	225860069
1030	NC_012469	A	7	7	49522	49528	100 %	0 %	0 %	0 %	225860069
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1032	NC_012469	T	6	6	49560	49565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012469	T	6	6	49570	49575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012469	AATA	2	8	49579	49586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012469	TAG	2	6	49589	49594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012469	ATA	2	6	49631	49636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012469	AAAAG	2	10	49637	49646	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1039	NC_012469	CAT	2	6	49682	49687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_012469	TAG	2	6	49735	49740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1043	NC_012469	GAT	2	6	49850	49855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012469	TG	3	6	49861	49866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012469	TGA	2	6	49876	49881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012469	TTCT	2	8	49953	49960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_012469	GTT	2	6	49966	49971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012469	T	11	11	50003	50013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012469	ATA	2	6	50030	50035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_012469	TTG	2	6	50503	50508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860071
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1063	NC_012469	TGAT	2	8	50710	50717	25 %	50 %	25 %	0 %	225860072
1064	NC_012469	A	6	6	50719	50724	100 %	0 %	0 %	0 %	225860072
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1102	NC_012469	TGA	3	9	52505	52513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860073
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1112	NC_012469	GTG	2	6	53499	53504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860073
1113	NC_012469	GCA	2	6	53640	53645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860073
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1116	NC_012469	AAAC	2	8	53787	53794	75 %	0 %	0 %	25 %	225860073
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1121	NC_012469	GTA	2	6	53898	53903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012469	TGA	2	6	53937	53942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_012469	TGG	2	6	54323	54328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860074
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1252	NC_012469	T	7	7	60109	60115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_012469	GAAG	2	8	60156	60163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_012469	GTT	2	6	60196	60201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_012469	TA	3	6	60262	60267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_012469	TGAC	2	8	60270	60277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1258	NC_012469	AGC	2	6	60316	60321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_012469	CTA	2	6	60465	60470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860083
1260	NC_012469	TTA	2	6	60477	60482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860083
1261	NC_012469	T	6	6	60483	60488	0 %	100 %	0 %	0 %	225860083
1262	NC_012469	GAC	2	6	60513	60518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860083
1263	NC_012469	ATGG	2	8	60520	60527	25 %	25 %	50 %	0 %	225860083
1264	NC_012469	GAC	2	6	60528	60533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860083
1265	NC_012469	TTG	2	6	60635	60640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860083
1266	NC_012469	AAGG	2	8	60652	60659	50 %	0 %	50 %	0 %	225860083
1267	NC_012469	ACT	2	6	60671	60676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860083
1268	NC_012469	AGGATA	2	12	60692	60703	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225860083
1269	NC_012469	GAA	2	6	60769	60774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860083
1270	NC_012469	A	7	7	60833	60839	100 %	0 %	0 %	0 %	225860083
1271	NC_012469	CT	3	6	60847	60852	0 %	50 %	0 %	50 %	225860083
1272	NC_012469	AGC	2	6	60872	60877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860083
1273	NC_012469	TTA	2	6	60942	60947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860083
1274	NC_012469	CAGAT	2	10	60977	60986	40 %	20 %	20 %	20 %	225860083
1275	NC_012469	ATT	2	6	61003	61008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860083
1276	NC_012469	TCC	2	6	61034	61039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860083
1277	NC_012469	CTTG	2	8	61071	61078	0 %	50 %	25 %	25 %	225860083
1278	NC_012469	CTT	2	6	61149	61154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860083
1279	NC_012469	ATC	2	6	61207	61212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860083
1280	NC_012469	ATT	2	6	61267	61272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860083
1281	NC_012469	TCT	3	9	61414	61422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860083
1282	NC_012469	A	6	6	61487	61492	100 %	0 %	0 %	0 %	225860083
1283	NC_012469	GAA	2	6	61518	61523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860083
1284	NC_012469	AG	3	6	61545	61550	50 %	0 %	50 %	0 %	225860083
1285	NC_012469	ATGG	2	8	61627	61634	25 %	25 %	50 %	0 %	225860083
1286	NC_012469	TTTAC	2	10	61679	61688	20 %	60 %	0 %	20 %	225860083
1287	NC_012469	ATC	2	6	61705	61710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860083
1288	NC_012469	TAG	2	6	61772	61777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860083
1289	NC_012469	GAAAA	2	10	61792	61801	80 %	0 %	20 %	0 %	225860083
1290	NC_012469	TGA	2	6	61820	61825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860083
1291	NC_012469	GAC	2	6	61953	61958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860083
1292	NC_012469	GAT	2	6	61968	61973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860083
1293	NC_012469	TCAATC	2	12	62021	62032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860083
1294	NC_012469	A	6	6	62041	62046	100 %	0 %	0 %	0 %	225860083
1295	NC_012469	TCT	2	6	62115	62120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860083
1296	NC_012469	AGG	2	6	62132	62137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860083
1297	NC_012469	GAC	2	6	62139	62144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860083
1298	NC_012469	CAGA	2	8	62218	62225	50 %	0 %	25 %	25 %	225860083
1299	NC_012469	GGT	2	6	62254	62259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860083
1300	NC_012469	CT	3	6	62288	62293	0 %	50 %	0 %	50 %	225860083
1301	NC_012469	GAA	2	6	62473	62478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860083
1302	NC_012469	TTGC	2	8	62494	62501	0 %	50 %	25 %	25 %	225860083
1303	NC_012469	AGAGG	2	10	62541	62550	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1304	NC_012469	TCG	2	6	62589	62594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860084
1305	NC_012469	AGT	2	6	62611	62616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860084
1306	NC_012469	CAA	2	6	62748	62753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860084
1307	NC_012469	GAA	2	6	62776	62781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860084
1308	NC_012469	AAG	2	6	62794	62799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860084
1309	NC_012469	AAG	2	6	62822	62827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860084
1310	NC_012469	CAGT	2	8	62859	62866	25 %	25 %	25 %	25 %	225860084
1311	NC_012469	A	7	7	62885	62891	100 %	0 %	0 %	0 %	225860084
1312	NC_012469	AGG	2	6	62922	62927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860084
1313	NC_012469	AGG	2	6	62945	62950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860084
1314	NC_012469	GCAG	2	8	62995	63002	25 %	0 %	50 %	25 %	225860084
1315	NC_012469	CAA	2	6	63022	63027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860084
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1320	NC_012469	CTA	2	6	63556	63561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860084
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1322	NC_012469	ATG	2	6	63677	63682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860084
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1324	NC_012469	CTA	2	6	63734	63739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860084
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1327	NC_012469	AAT	2	6	63921	63926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1328	NC_012469	TTC	2	6	63946	63951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1329	NC_012469	T	6	6	63958	63963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1330	NC_012469	T	6	6	64014	64019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1331	NC_012469	T	6	6	64022	64027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1332	NC_012469	TTA	2	6	64134	64139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860085
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1336	NC_012469	A	6	6	64310	64315	100 %	0 %	0 %	0 %	225860085
1337	NC_012469	ATT	2	6	64322	64327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860085
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1339	NC_012469	TAC	2	6	64427	64432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860085
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1347	NC_012469	AAT	2	6	64773	64778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860085
1348	NC_012469	TC	3	6	64802	64807	0 %	50 %	0 %	50 %	225860086
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1352	NC_012469	AG	3	6	65042	65047	50 %	0 %	50 %	0 %	225860087
1353	NC_012469	ATG	2	6	65103	65108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860087
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1358	NC_012469	CAG	2	6	65505	65510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860087
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1362	NC_012469	GAT	2	6	65846	65851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860087
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1371	NC_012469	GTGAT	2	10	66300	66309	20 %	40 %	40 %	0 %	225860087
1372	NC_012469	GGT	2	6	66347	66352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860087
1373	NC_012469	CTG	2	6	66396	66401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860087
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1377	NC_012469	CAA	2	6	66562	66567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860087
1378	NC_012469	TGT	2	6	66703	66708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860087
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1380	NC_012469	AGA	2	6	66853	66858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860087
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1382	NC_012469	TGG	2	6	66991	66996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860087
1383	NC_012469	TGC	2	6	67126	67131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860087
1384	NC_012469	TGG	2	6	67161	67166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860087
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