MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 44608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012468	ACAA	2	8	241559	241566	75 %	0 %	0 %	25 %	225858077
5002	NC_012468	A	6	6	241660	241665	100 %	0 %	0 %	0 %	225858077
5003	NC_012468	AAG	2	6	241742	241747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858077
5004	NC_012468	TGG	2	6	241764	241769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858077
5005	NC_012468	GTTT	2	8	241847	241854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012468	ACAA	2	8	241855	241862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_012468	GTTCA	2	10	241898	241907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5008	NC_012468	TAA	2	6	242000	242005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858078
5009	NC_012468	CTG	2	6	242020	242025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858078
5010	NC_012468	ACT	2	6	242184	242189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858078
5011	NC_012468	AAC	2	6	242202	242207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225858078
5012	NC_012468	GTT	2	6	242211	242216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858078
5013	NC_012468	AAGA	2	8	242235	242242	75 %	0 %	25 %	0 %	225858078
5014	NC_012468	GGTT	2	8	242258	242265	0 %	50 %	50 %	0 %	225858078
5015	NC_012468	CAA	3	9	242368	242376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225858078
5016	NC_012468	GTT	2	6	242379	242384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858078
5017	NC_012468	AGT	2	6	242402	242407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858078
5018	NC_012468	GCT	2	6	242418	242423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858078
5019	NC_012468	TACG	2	8	242424	242431	25 %	25 %	25 %	25 %	225858078
5020	NC_012468	TAAAGG	2	12	242456	242467	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225858078
5021	NC_012468	TTCG	2	8	242487	242494	0 %	50 %	25 %	25 %	225858078
5022	NC_012468	AAG	2	6	242500	242505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858078
5023	NC_012468	AAT	2	6	242518	242523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858078
5024	NC_012468	ATC	2	6	242536	242541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_012468	ACC	2	6	242543	242548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_012468	AAAC	2	8	242626	242633	75 %	0 %	0 %	25 %	225858079
5027	NC_012468	CT	3	6	242669	242674	0 %	50 %	0 %	50 %	225858079
5028	NC_012468	CTG	2	6	242679	242684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858079
5029	NC_012468	TGAT	2	8	242736	242743	25 %	50 %	25 %	0 %	225858079
5030	NC_012468	AAG	2	6	242787	242792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858079
5031	NC_012468	GTG	2	6	242876	242881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858079
5032	NC_012468	AGG	2	6	242964	242969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_012468	AGA	2	6	243009	243014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858080
5034	NC_012468	GTT	2	6	243046	243051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858080
5035	NC_012468	CGT	2	6	243061	243066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858080
5036	NC_012468	TTG	4	12	243083	243094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858080
5037	NC_012468	AAG	2	6	243137	243142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858080
5038	NC_012468	GAT	2	6	243169	243174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858080
5039	NC_012468	AAC	2	6	243210	243215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225858080
5040	NC_012468	TTG	2	6	243259	243264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858080
5041	NC_012468	CTG	2	6	243269	243274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858080
5042	NC_012468	TGG	2	6	243297	243302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858080
5043	NC_012468	GAA	2	6	243427	243432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858080
5044	NC_012468	TGC	2	6	243435	243440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858080
5045	NC_012468	AAATTA	2	12	243495	243506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858081
5046	NC_012468	TGT	2	6	243553	243558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858081
5047	NC_012468	ACTTGG	2	12	243562	243573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225858081
5048	NC_012468	TTA	2	6	243591	243596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858081
5049	NC_012468	AAG	2	6	243597	243602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858081
5050	NC_012468	GCT	2	6	243608	243613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858081
5051	NC_012468	CAG	2	6	243630	243635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858081
5052	NC_012468	GAA	2	6	243656	243661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858081
5053	NC_012468	ATG	2	6	243726	243731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_012468	TCA	2	6	243884	243889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858082
5055	NC_012468	CGT	2	6	243989	243994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858082
5056	NC_012468	GTT	2	6	244094	244099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858082
5057	NC_012468	AGC	2	6	244186	244191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858082
5058	NC_012468	GAA	2	6	244211	244216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858082
5059	NC_012468	GGT	2	6	244232	244237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858082
5060	NC_012468	AG	3	6	244255	244260	50 %	0 %	50 %	0 %	225858082
5061	NC_012468	T	6	6	244271	244276	0 %	100 %	0 %	0 %	225858083
5062	NC_012468	ATT	2	6	244279	244284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858083
5063	NC_012468	TTTA	2	8	244324	244331	25 %	75 %	0 %	0 %	225858083
5064	NC_012468	CTT	2	6	244423	244428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858083
5065	NC_012468	A	6	6	244462	244467	100 %	0 %	0 %	0 %	225858083
5066	NC_012468	TTG	2	6	244515	244520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858083
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5068	NC_012468	ATC	2	6	244733	244738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858083
5069	NC_012468	GTA	2	6	244749	244754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858083
5070	NC_012468	TTGG	2	8	244765	244772	0 %	50 %	50 %	0 %	225858083
5071	NC_012468	GAT	2	6	244852	244857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858083
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5074	NC_012468	TTG	2	6	244949	244954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858083
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5080	NC_012468	ACT	2	6	245192	245197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858083
5081	NC_012468	ATT	2	6	245231	245236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858083
5082	NC_012468	TTC	2	6	245246	245251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858083
5083	NC_012468	AGC	2	6	245281	245286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858083
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5087	NC_012468	AT	3	6	245350	245355	50 %	50 %	0 %	0 %	225858083
5088	NC_012468	CTT	2	6	245363	245368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858083
5089	NC_012468	CGT	2	6	245369	245374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858083
5090	NC_012468	TGT	2	6	245455	245460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858083
5091	NC_012468	TGG	2	6	245467	245472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858083
5092	NC_012468	ACAGA	2	10	245565	245574	60 %	0 %	20 %	20 %	225858083
5093	NC_012468	AAAAT	2	10	245705	245714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_012468	AGC	2	6	245776	245781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858084
5095	NC_012468	AT	3	6	245881	245886	50 %	50 %	0 %	0 %	225858084
5096	NC_012468	GAT	2	6	245951	245956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858084
5097	NC_012468	ATC	2	6	246113	246118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858084
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5099	NC_012468	AGA	3	9	246175	246183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858084
5100	NC_012468	TAC	2	6	246185	246190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858084
5101	NC_012468	GAT	2	6	246200	246205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858084
5102	NC_012468	CGT	2	6	246224	246229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858084
5103	NC_012468	ATG	2	6	246321	246326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858084
5104	NC_012468	TCT	2	6	246327	246332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858084
5105	NC_012468	TTG	2	6	246430	246435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012468	ATCGA	2	10	246453	246462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5107	NC_012468	TTGAAG	2	12	246503	246514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858085
5108	NC_012468	AGT	2	6	246519	246524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858085
5109	NC_012468	AAT	2	6	246698	246703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858085
5110	NC_012468	TCG	2	6	246777	246782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858086
5111	NC_012468	ACAA	2	8	246824	246831	75 %	0 %	0 %	25 %	225858086
5112	NC_012468	GTA	2	6	246903	246908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858087
5113	NC_012468	GCT	3	9	246963	246971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858087
5114	NC_012468	AGA	2	6	246980	246985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858087
5115	NC_012468	AAG	2	6	247015	247020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858087
5116	NC_012468	CGT	2	6	247029	247034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858087
5117	NC_012468	TCG	2	6	247067	247072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858087
5118	NC_012468	CGT	2	6	247134	247139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858087
5119	NC_012468	AAC	2	6	247170	247175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225858087
5120	NC_012468	GTAAAG	2	12	247186	247197	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225858087
5121	NC_012468	A	6	6	247218	247223	100 %	0 %	0 %	0 %	225858087
5122	NC_012468	AGG	2	6	247230	247235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_012468	CGT	2	6	247265	247270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858088
5124	NC_012468	TAA	2	6	247318	247323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858088
5125	NC_012468	TCA	2	6	247370	247375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858088
5126	NC_012468	GCT	2	6	247421	247426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858088
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5131	NC_012468	ATC	2	6	247627	247632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858088
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5134	NC_012468	TCG	2	6	247783	247788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858089
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5152	NC_012468	AGG	2	6	248606	248611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_012468	AATC	2	8	248699	248706	50 %	25 %	0 %	25 %	225858090
5154	NC_012468	A	6	6	248750	248755	100 %	0 %	0 %	0 %	225858090
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5165	NC_012468	TTG	2	6	249015	249020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_012468	ATG	3	9	249027	249035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5171	NC_012468	AAG	2	6	249247	249252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5211	NC_012468	TTTA	2	8	251012	251019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5212	NC_012468	ATA	2	6	251040	251045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5213	NC_012468	TTTTA	2	10	251077	251086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5214	NC_012468	TCAT	2	8	251087	251094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5215	NC_012468	ATA	2	6	251098	251103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5228	NC_012468	A	6	6	251873	251878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5229	NC_012468	AGG	2	6	252083	252088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_012468	AG	3	6	252097	252102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_012468	AAGAT	2	10	252123	252132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_012468	CAT	2	6	252157	252162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5234	NC_012468	CAG	2	6	252213	252218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5235	NC_012468	CTT	2	6	252219	252224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5236	NC_012468	TGT	2	6	252242	252247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_012468	TCT	2	6	252283	252288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5238	NC_012468	TAGG	2	8	252459	252466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_012468	AAC	2	6	252486	252491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_012468	ATACC	2	10	252593	252602	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5241	NC_012468	AGATAA	2	12	252653	252664	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_012468	T	7	7	252710	252716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_012468	TGGA	2	8	252726	252733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_012468	TCC	2	6	252831	252836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5245	NC_012468	TAA	2	6	252845	252850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5247	NC_012468	GCT	2	6	252948	252953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5249	NC_012468	GCT	2	6	253026	253031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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