MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 1582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012466	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225853612
2	NC_012466	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225853612
3	NC_012466	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225853612
4	NC_012466	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225853613
5	NC_012466	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225853614
6	NC_012466	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012466	AAACA	2	10	4432	4441	80 %	0 %	0 %	20 %	225853616
8	NC_012466	TCAAT	2	10	6059	6068	40 %	40 %	0 %	20 %	225853617
9	NC_012466	TTTTC	2	10	6099	6108	0 %	80 %	0 %	20 %	225853617
10	NC_012466	TAAAT	2	10	6617	6626	60 %	40 %	0 %	0 %	225853617
11	NC_012466	ACTCT	2	10	6698	6707	20 %	40 %	0 %	40 %	225853617
12	NC_012466	AAACG	2	10	7941	7950	60 %	0 %	20 %	20 %	225853617
13	NC_012466	TTGGT	2	10	8170	8179	0 %	60 %	40 %	0 %	225853617
14	NC_012466	CAATT	2	10	8239	8248	40 %	40 %	0 %	20 %	225853617
15	NC_012466	AGGAA	2	10	9255	9264	60 %	0 %	40 %	0 %	225853620
16	NC_012466	ATTGA	2	10	10673	10682	40 %	40 %	20 %	0 %	225853622
17	NC_012466	ATTCT	2	10	12806	12815	20 %	60 %	0 %	20 %	225853624
18	NC_012466	ATGCT	2	10	14034	14043	20 %	40 %	20 %	20 %	225853624
19	NC_012466	TCGTG	2	10	16422	16431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012466	GTTAA	2	10	17143	17152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012466	GGGAG	2	10	17661	17670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012466	AGGGA	2	10	19872	19881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012466	ATGGT	2	10	23041	23050	20 %	40 %	40 %	0 %	225853632
24	NC_012466	CTTTT	2	10	24209	24218	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012466	CATTT	2	10	25668	25677	20 %	60 %	0 %	20 %	225853634
26	NC_012466	ATATC	2	10	27126	27135	40 %	40 %	0 %	20 %	225853636
27	NC_012466	AGGAT	2	10	27854	27863	40 %	20 %	40 %	0 %	225853638
28	NC_012466	TTATA	2	10	29063	29072	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012466	TTTTG	2	10	30808	30817	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012466	ATTAT	2	10	30949	30958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012466	TATCG	2	10	31125	31134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012466	TATTT	2	10	34171	34180	20 %	80 %	0 %	0 %	225853653
33	NC_012466	TTTTA	2	10	34183	34192	20 %	80 %	0 %	0 %	225853653
34	NC_012466	AATCA	2	10	37461	37470	60 %	20 %	0 %	20 %	225853659
35	NC_012466	AGCAG	2	10	38132	38141	40 %	0 %	40 %	20 %	225853660
36	NC_012466	TAAAG	2	10	41615	41624	60 %	20 %	20 %	0 %	225853662
37	NC_012466	TCATA	2	10	46865	46874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012466	AATTA	2	10	50561	50570	60 %	40 %	0 %	0 %	225853674
39	NC_012466	CAGAT	2	10	52610	52619	40 %	20 %	20 %	20 %	225853677
40	NC_012466	TTTAC	2	10	53312	53321	20 %	60 %	0 %	20 %	225853677
41	NC_012466	AGAGG	2	10	54174	54183	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012466	GTGAC	2	10	56943	56952	20 %	20 %	40 %	20 %	225853681
43	NC_012466	GTGAT	2	10	57933	57942	20 %	40 %	40 %	0 %	225853681
44	NC_012466	CCTAC	2	10	59884	59893	20 %	20 %	0 %	60 %	225853681
45	NC_012466	GTTTG	2	10	60750	60759	0 %	60 %	40 %	0 %	225853682
46	NC_012466	AAATG	2	10	61359	61368	60 %	20 %	20 %	0 %	225853682
47	NC_012466	AGCTA	2	10	62253	62262	40 %	20 %	20 %	20 %	225853683
48	NC_012466	CCTTG	2	10	65143	65152	0 %	40 %	20 %	40 %	225853686
49	NC_012466	TCAAA	2	10	65337	65346	60 %	20 %	0 %	20 %	225853686
50	NC_012466	AGTGG	2	10	67704	67713	20 %	20 %	60 %	0 %	225853688
51	NC_012466	GGGTG	2	10	67742	67751	0 %	20 %	80 %	0 %	225853688
52	NC_012466	CTATT	2	10	68709	68718	20 %	60 %	0 %	20 %	225853689
53	NC_012466	GAAGC	2	10	68899	68908	40 %	0 %	40 %	20 %	225853689
54	NC_012466	AACTA	2	10	69943	69952	60 %	20 %	0 %	20 %	225853690
55	NC_012466	ATATA	2	10	70141	70150	60 %	40 %	0 %	0 %	225853690
56	NC_012466	ATTTT	2	10	71467	71476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012466	GCTTG	2	10	71619	71628	0 %	40 %	40 %	20 %	225853691
58	NC_012466	GCTTT	2	10	73048	73057	0 %	60 %	20 %	20 %	225853692
59	NC_012466	TCTGG	2	10	73654	73663	0 %	40 %	40 %	20 %	225853692
60	NC_012466	AGCAT	2	10	74608	74617	40 %	20 %	20 %	20 %	225853692
61	NC_012466	TACCA	2	10	75306	75315	40 %	20 %	0 %	40 %	225853692
62	NC_012466	TTCCT	2	10	76323	76332	0 %	60 %	0 %	40 %	225853692
63	NC_012466	TTTAT	2	10	76903	76912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012466	TTGGT	2	10	80278	80287	0 %	60 %	40 %	0 %	225853695
65	NC_012466	CTTCA	2	10	81333	81342	20 %	40 %	0 %	40 %	225853696
66	NC_012466	AATCA	2	10	81445	81454	60 %	20 %	0 %	20 %	225853697
67	NC_012466	ATTCA	2	10	82778	82787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012466	AGCTC	2	10	83622	83631	20 %	20 %	20 %	40 %	225853699
69	NC_012466	GCTCC	2	10	87859	87868	0 %	20 %	20 %	60 %	225853705
70	NC_012466	GCTGT	2	10	88177	88186	0 %	40 %	40 %	20 %	225853705
71	NC_012466	TATCA	2	10	88501	88510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012466	TCTAT	2	10	89470	89479	20 %	60 %	0 %	20 %	225853707
73	NC_012466	AGAAA	2	10	90395	90404	80 %	0 %	20 %	0 %	225853707
74	NC_012466	GAAAG	2	10	90447	90456	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012466	GCGGT	2	10	91733	91742	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012466	TGACT	2	10	93487	93496	20 %	40 %	20 %	20 %	225853710
77	NC_012466	ATAAA	2	10	99273	99282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012466	TAACC	2	10	99371	99380	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012466	ATTCT	2	10	99546	99555	20 %	60 %	0 %	20 %	225853717
80	NC_012466	TTACT	2	10	103363	103372	20 %	60 %	0 %	20 %	225853720
81	NC_012466	CAACC	2	10	104073	104082	40 %	0 %	0 %	60 %	225853720
82	NC_012466	TGCTT	2	10	104737	104746	0 %	60 %	20 %	20 %	225853721
83	NC_012466	TGGCT	2	10	104920	104929	0 %	40 %	40 %	20 %	225853721
84	NC_012466	AGATA	2	10	108887	108896	60 %	20 %	20 %	0 %	225853726
85	NC_012466	GTTTG	2	10	109054	109063	0 %	60 %	40 %	0 %	225853726
86	NC_012466	TATTT	2	10	111003	111012	20 %	80 %	0 %	0 %	225853728
87	NC_012466	AAAGC	2	10	113869	113878	60 %	0 %	20 %	20 %	225853730
88	NC_012466	GGCTT	2	10	115293	115302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012466	CACAA	2	10	115632	115641	60 %	0 %	0 %	40 %	225853732
90	NC_012466	AAATG	2	10	116761	116770	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012466	GGAAT	2	10	117117	117126	40 %	20 %	40 %	0 %	225853734
92	NC_012466	AGGAT	2	10	117682	117691	40 %	20 %	40 %	0 %	225853735
93	NC_012466	CTTTG	2	10	118991	119000	0 %	60 %	20 %	20 %	225853735
94	NC_012466	TCCTC	2	10	119117	119126	0 %	40 %	0 %	60 %	225853735
95	NC_012466	ACAGT	2	10	127663	127672	40 %	20 %	20 %	20 %	225853741
96	NC_012466	AATAA	2	10	128407	128416	80 %	20 %	0 %	0 %	225853742
97	NC_012466	TAAAA	2	10	132157	132166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012466	ACTAA	2	10	134067	134076	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012466	ATTAA	2	10	135801	135810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012466	CGTGG	2	10	136626	136635	0 %	20 %	60 %	20 %	225853749
101	NC_012466	GTGAA	2	10	137628	137637	40 %	20 %	40 %	0 %	225853750
102	NC_012466	GTTTG	2	10	142564	142573	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012466	ATGAC	2	10	142711	142720	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012466	GAAAA	2	10	143301	143310	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012466	TTGGA	2	10	143586	143595	20 %	40 %	40 %	0 %	225853757
106	NC_012466	ATGTT	2	10	154060	154069	20 %	60 %	20 %	0 %	225853766
107	NC_012466	ACAAA	2	10	154575	154584	80 %	0 %	0 %	20 %	225853766
108	NC_012466	GATCT	2	10	155573	155582	20 %	40 %	20 %	20 %	225853767
109	NC_012466	GAAAT	2	10	156795	156804	60 %	20 %	20 %	0 %	225853769
110	NC_012466	TATTT	2	10	156973	156982	20 %	80 %	0 %	0 %	225853769
111	NC_012466	TTAGT	2	10	157667	157676	20 %	60 %	20 %	0 %	225853770
112	NC_012466	CTTGC	2	10	158023	158032	0 %	40 %	20 %	40 %	225853770
113	NC_012466	GGCCT	2	10	158931	158940	0 %	20 %	40 %	40 %	225853771
114	NC_012466	CTGTT	2	10	159499	159508	0 %	60 %	20 %	20 %	225853771
115	NC_012466	TCAAA	2	10	159744	159753	60 %	20 %	0 %	20 %	225853772
116	NC_012466	AGAAA	2	10	161035	161044	80 %	0 %	20 %	0 %	225853774
117	NC_012466	TATAC	2	10	162996	163005	40 %	40 %	0 %	20 %	225853775
118	NC_012466	AGATC	2	10	163301	163310	40 %	20 %	20 %	20 %	225853776
119	NC_012466	TGGTC	2	10	164389	164398	0 %	40 %	40 %	20 %	225853777
120	NC_012466	TTTGT	2	10	165309	165318	0 %	80 %	20 %	0 %	225853778
121	NC_012466	ACTAT	2	10	169315	169324	40 %	40 %	0 %	20 %	225853781
122	NC_012466	TGAAA	2	10	170716	170725	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012466	TTGAG	2	10	171895	171904	20 %	40 %	40 %	0 %	225853784
124	NC_012466	ATTTC	2	10	172242	172251	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012466	GCCTT	2	10	173869	173878	0 %	40 %	20 %	40 %	225853787
126	NC_012466	AAGTA	2	10	176651	176660	60 %	20 %	20 %	0 %	225853789
127	NC_012466	TTGAT	2	10	177810	177819	20 %	60 %	20 %	0 %	225853790
128	NC_012466	TCACT	2	10	178185	178194	20 %	40 %	0 %	40 %	225853791
129	NC_012466	ATTTT	2	10	178508	178517	20 %	80 %	0 %	0 %	225853791
130	NC_012466	TTAAG	2	10	178860	178869	40 %	40 %	20 %	0 %	225853791
131	NC_012466	CCCTG	2	10	179493	179502	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_012466	TCAGG	2	10	179776	179785	20 %	20 %	40 %	20 %	225853792
133	NC_012466	GCCTT	2	10	181390	181399	0 %	40 %	20 %	40 %	225853794
134	NC_012466	TTCCC	2	10	181950	181959	0 %	40 %	0 %	60 %	225853795
135	NC_012466	TCTCT	2	10	185497	185506	0 %	60 %	0 %	40 %	225853798
136	NC_012466	GGCTA	2	10	187155	187164	20 %	20 %	40 %	20 %	225853798
137	NC_012466	GAAAG	2	10	187513	187522	60 %	0 %	40 %	0 %	225853798
138	NC_012466	AGTTA	2	10	188793	188802	40 %	40 %	20 %	0 %	225853800
139	NC_012466	TGGAG	2	10	189483	189492	20 %	20 %	60 %	0 %	225853801
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141	NC_012466	GCAGA	2	10	191642	191651	40 %	0 %	40 %	20 %	225853805
142	NC_012466	ATGAT	2	10	194678	194687	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_012466	ATTCT	2	10	222504	222513	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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