MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_012466	GCA	2	6	2105851	2105856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855721
43002	NC_012466	AACACC	2	12	2105880	2105891	50 %	0 %	0 %	50 %	225855721
43003	NC_012466	AGT	2	6	2105904	2105909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855721
43004	NC_012466	AAC	2	6	2105940	2105945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855721
43005	NC_012466	CAG	2	6	2105981	2105986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855721
43006	NC_012466	AGA	2	6	2106169	2106174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855721
43007	NC_012466	CTT	2	6	2106257	2106262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855721
43008	NC_012466	GAA	2	6	2106299	2106304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855721
43009	NC_012466	ACCA	2	8	2106426	2106433	50 %	0 %	0 %	50 %	225855721
43010	NC_012466	CAA	2	6	2106455	2106460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855721
43011	NC_012466	AAG	2	6	2106529	2106534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855721
43012	NC_012466	AAT	2	6	2106543	2106548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855721
43013	NC_012466	TTG	2	6	2106591	2106596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855721
43014	NC_012466	AGCAAT	2	12	2106642	2106653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225855721
43015	NC_012466	CT	3	6	2106664	2106669	0 %	50 %	0 %	50 %	225855721
43016	NC_012466	TAA	2	6	2106692	2106697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855721
43017	NC_012466	GTT	2	6	2106733	2106738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855721
43018	NC_012466	CAT	2	6	2106788	2106793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855721
43019	NC_012466	T	6	6	2106807	2106812	0 %	100 %	0 %	0 %	225855721
43020	NC_012466	TCTT	2	8	2106856	2106863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43021	NC_012466	TATC	2	8	2106889	2106896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43022	NC_012466	TAAA	2	8	2106934	2106941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43023	NC_012466	A	6	6	2106939	2106944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43024	NC_012466	TTC	2	6	2106952	2106957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43025	NC_012466	ACC	2	6	2107195	2107200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855722
43026	NC_012466	TCT	2	6	2107241	2107246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855722
43027	NC_012466	GAC	2	6	2107248	2107253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855722
43028	NC_012466	GATCTG	2	12	2107320	2107331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855722
43029	NC_012466	T	6	6	2107348	2107353	0 %	100 %	0 %	0 %	225855722
43030	NC_012466	CAT	2	6	2107368	2107373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855722
43031	NC_012466	TAAA	2	8	2107378	2107385	75 %	25 %	0 %	0 %	225855722
43032	NC_012466	ATT	2	6	2107390	2107395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855722
43033	NC_012466	CT	3	6	2107446	2107451	0 %	50 %	0 %	50 %	225855722
43034	NC_012466	GAAC	2	8	2107514	2107521	50 %	0 %	25 %	25 %	225855722
43035	NC_012466	GCT	2	6	2107601	2107606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855722
43036	NC_012466	ATA	2	6	2107723	2107728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855722
43037	NC_012466	ATCCA	2	10	2107789	2107798	40 %	20 %	0 %	40 %	225855722
43038	NC_012466	TTG	2	6	2107876	2107881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855722
43039	NC_012466	TAA	2	6	2107924	2107929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855722
43040	NC_012466	AAT	2	6	2107999	2108004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855722
43041	NC_012466	T	7	7	2108054	2108060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43042	NC_012466	AAAT	2	8	2108084	2108091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43043	NC_012466	AAAAAT	2	12	2108152	2108163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43044	NC_012466	TAG	2	6	2108184	2108189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43045	NC_012466	AATA	2	8	2108190	2108197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43046	NC_012466	TGA	2	6	2108272	2108277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855723
43047	NC_012466	CTA	2	6	2108379	2108384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855723
43048	NC_012466	TC	3	6	2108394	2108399	0 %	50 %	0 %	50 %	225855723
43049	NC_012466	TC	3	6	2108416	2108421	0 %	50 %	0 %	50 %	225855723
43050	NC_012466	TTC	2	6	2108424	2108429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855723
43051	NC_012466	CAT	2	6	2108503	2108508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855723
43052	NC_012466	GAAAGA	2	12	2108509	2108520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855723
43053	NC_012466	GAAG	2	8	2108533	2108540	50 %	0 %	50 %	0 %	225855723
43054	NC_012466	TGC	2	6	2108566	2108571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855723
43055	NC_012466	AG	3	6	2108614	2108619	50 %	0 %	50 %	0 %	225855723
43056	NC_012466	ACT	2	6	2108632	2108637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855723
43057	NC_012466	AGA	2	6	2108656	2108661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855723
43058	NC_012466	TTC	2	6	2108748	2108753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855723
43059	NC_012466	CTA	2	6	2108766	2108771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855723
43060	NC_012466	AGA	2	6	2108803	2108808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855723
43061	NC_012466	CTT	2	6	2108809	2108814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855723
43062	NC_012466	GTA	2	6	2108840	2108845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855723
43063	NC_012466	CTT	2	6	2108860	2108865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855723
43064	NC_012466	GGAA	2	8	2108940	2108947	50 %	0 %	50 %	0 %	225855723
43065	NC_012466	TCT	2	6	2108948	2108953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855723
43066	NC_012466	TGC	2	6	2108959	2108964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855723
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43068	NC_012466	A	6	6	2109000	2109005	100 %	0 %	0 %	0 %	225855723
43069	NC_012466	AGGC	2	8	2109059	2109066	25 %	0 %	50 %	25 %	225855723
43070	NC_012466	AGA	2	6	2109103	2109108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855723
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43073	NC_012466	TACC	2	8	2109374	2109381	25 %	25 %	0 %	50 %	225855723
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43078	NC_012466	CAA	2	6	2109615	2109620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855723
43079	NC_012466	ACTTGG	2	12	2109624	2109635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855723
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43083	NC_012466	GCCA	2	8	2109692	2109699	25 %	0 %	25 %	50 %	225855723
43084	NC_012466	TAAA	2	8	2109842	2109849	75 %	25 %	0 %	0 %	225855723
43085	NC_012466	TATTT	2	10	2109936	2109945	20 %	80 %	0 %	0 %	225855724
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43087	NC_012466	TATC	2	8	2109981	2109988	25 %	50 %	0 %	25 %	225855724
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43089	NC_012466	TCA	2	6	2110040	2110045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855724
43090	NC_012466	TAG	2	6	2110091	2110096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855724
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43093	NC_012466	CT	3	6	2110231	2110236	0 %	50 %	0 %	50 %	225855724
43094	NC_012466	GATT	2	8	2110246	2110253	25 %	50 %	25 %	0 %	225855724
43095	NC_012466	T	6	6	2110266	2110271	0 %	100 %	0 %	0 %	225855724
43096	NC_012466	TGA	2	6	2110339	2110344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855724
43097	NC_012466	GTCA	2	8	2110353	2110360	25 %	25 %	25 %	25 %	225855724
43098	NC_012466	TTAT	2	8	2110476	2110483	25 %	75 %	0 %	0 %	225855724
43099	NC_012466	ATT	3	9	2110489	2110497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855724
43100	NC_012466	AT	3	6	2110502	2110507	50 %	50 %	0 %	0 %	225855724
43101	NC_012466	ATC	2	6	2110571	2110576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855724
43102	NC_012466	ACA	2	6	2110755	2110760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855724
43103	NC_012466	TTG	2	6	2110786	2110791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855724
43104	NC_012466	ATTTT	2	10	2110815	2110824	20 %	80 %	0 %	0 %	225855724
43105	NC_012466	T	6	6	2110821	2110826	0 %	100 %	0 %	0 %	225855724
43106	NC_012466	AT	3	6	2110860	2110865	50 %	50 %	0 %	0 %	225855724
43107	NC_012466	GCAT	2	8	2110930	2110937	25 %	25 %	25 %	25 %	225855724
43108	NC_012466	CAG	3	9	2110996	2111004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855724
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43110	NC_012466	GTA	2	6	2111064	2111069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855724
43111	NC_012466	ATCT	2	8	2111088	2111095	25 %	50 %	0 %	25 %	225855724
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43113	NC_012466	T	6	6	2111111	2111116	0 %	100 %	0 %	0 %	225855724
43114	NC_012466	TTTA	2	8	2111228	2111235	25 %	75 %	0 %	0 %	225855724
43115	NC_012466	AT	3	6	2111354	2111359	50 %	50 %	0 %	0 %	225855724
43116	NC_012466	TC	3	6	2111437	2111442	0 %	50 %	0 %	50 %	225855724
43117	NC_012466	TCA	2	6	2111466	2111471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855724
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43119	NC_012466	ATA	2	6	2111536	2111541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855724
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43232	NC_012466	T	6	6	2116650	2116655	0 %	100 %	0 %	0 %	225855730
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.