MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 101724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012125	GCC	2	6	117076	117081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581946
2502	NC_012125	TTCC	2	8	117126	117133	0 %	50 %	0 %	50 %	224581946
2503	NC_012125	GCT	3	9	117160	117168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581946
2504	NC_012125	TGC	2	6	117180	117185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581946
2505	NC_012125	GGCT	2	8	117197	117204	0 %	25 %	50 %	25 %	224581946
2506	NC_012125	GGC	2	6	117210	117215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581946
2507	NC_012125	TGG	2	6	117321	117326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581946
2508	NC_012125	TA	3	6	117354	117359	50 %	50 %	0 %	0 %	224581946
2509	NC_012125	GGC	2	6	117409	117414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_012125	TAG	2	6	117484	117489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581947
2511	NC_012125	TTGCC	2	10	117500	117509	0 %	40 %	20 %	40 %	224581947
2512	NC_012125	CGTC	2	8	117518	117525	0 %	25 %	25 %	50 %	224581947
2513	NC_012125	CGA	3	9	117528	117536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581947
2514	NC_012125	CGC	2	6	117556	117561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581947
2515	NC_012125	TCGC	2	8	117601	117608	0 %	25 %	25 %	50 %	224581947
2516	NC_012125	CAG	3	9	117679	117687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581947
2517	NC_012125	GC	3	6	117712	117717	0 %	0 %	50 %	50 %	224581947
2518	NC_012125	GCC	2	6	117739	117744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581947
2519	NC_012125	TCA	2	6	117768	117773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581947
2520	NC_012125	GCTG	2	8	117819	117826	0 %	25 %	50 %	25 %	224581947
2521	NC_012125	TGC	2	6	117869	117874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581947
2522	NC_012125	ATT	2	6	117895	117900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224581947
2523	NC_012125	GCG	2	6	117936	117941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581947
2524	NC_012125	CAA	2	6	118012	118017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224581947
2525	NC_012125	CGC	2	6	118032	118037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581947
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2528	NC_012125	ATCA	2	8	118120	118127	50 %	25 %	0 %	25 %	224581947
2529	NC_012125	AGCAG	2	10	118177	118186	40 %	0 %	40 %	20 %	224581948
2530	NC_012125	CAG	3	9	118184	118192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581948
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2539	NC_012125	CGCC	2	8	118705	118712	0 %	0 %	25 %	75 %	224581948
2540	NC_012125	ACC	2	6	118800	118805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224581948
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2544	NC_012125	CGTC	2	8	118858	118865	0 %	25 %	25 %	50 %	224581948
2545	NC_012125	GCGTCA	2	12	118906	118917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	224581948
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2549	NC_012125	GTG	2	6	119058	119063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581948
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2553	NC_012125	GCG	2	6	119211	119216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581948
2554	NC_012125	GCT	2	6	119224	119229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581948
2555	NC_012125	GCA	2	6	119254	119259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581948
2556	NC_012125	A	6	6	119285	119290	100 %	0 %	0 %	0 %	224581948
2557	NC_012125	GCCA	2	8	119367	119374	25 %	0 %	25 %	50 %	224581948
2558	NC_012125	GCA	2	6	119452	119457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581948
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2580	NC_012125	GCTT	2	8	120291	120298	0 %	50 %	25 %	25 %	224581949
2581	NC_012125	GCC	2	6	120358	120363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581949
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2591	NC_012125	CGG	2	6	120594	120599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581949
2592	NC_012125	T	7	7	120679	120685	0 %	100 %	0 %	0 %	224581949
2593	NC_012125	GC	4	8	120787	120794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2594	NC_012125	TAGTG	2	10	120825	120834	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_012125	TTG	2	6	120838	120843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_012125	GCA	2	6	120848	120853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2602	NC_012125	CG	3	6	121074	121079	0 %	0 %	50 %	50 %	224581950
2603	NC_012125	GC	3	6	121251	121256	0 %	0 %	50 %	50 %	224581950
2604	NC_012125	CGG	2	6	121326	121331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581950
2605	NC_012125	GCT	2	6	121398	121403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581950
2606	NC_012125	TGG	2	6	121434	121439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581950
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2617	NC_012125	TGC	2	6	122006	122011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581950
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2620	NC_012125	TCGAT	2	10	122255	122264	20 %	40 %	20 %	20 %	224581950
2621	NC_012125	CAG	2	6	122272	122277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581950
2622	NC_012125	CCGC	2	8	122283	122290	0 %	0 %	25 %	75 %	224581950
2623	NC_012125	CG	3	6	122376	122381	0 %	0 %	50 %	50 %	224581950
2624	NC_012125	AGC	2	6	122396	122401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581950
2625	NC_012125	CAG	2	6	122428	122433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224581950
2626	NC_012125	GTG	2	6	122453	122458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581950
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2628	NC_012125	TAT	2	6	122561	122566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_012125	AAT	2	6	122581	122586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_012125	AAGAGG	2	12	122602	122613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_012125	A	6	6	122656	122661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_012125	CTGG	2	8	122666	122673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2633	NC_012125	GC	3	6	122683	122688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2634	NC_012125	CAT	2	6	122755	122760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2637	NC_012125	CTG	2	6	122818	122823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2638	NC_012125	T	7	7	122826	122832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_012125	GAC	2	6	122852	122857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2645	NC_012125	CTC	2	6	123103	123108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224581952
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2857	NC_012125	CTTG	2	8	134198	134205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2871	NC_012125	CGAT	2	8	134901	134908	25 %	25 %	25 %	25 %	224581963
2872	NC_012125	CAT	2	6	134962	134967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224581963
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2874	NC_012125	TCT	2	6	135056	135061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224581963
2875	NC_012125	CG	3	6	135135	135140	0 %	0 %	50 %	50 %	224581963
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2883	NC_012125	GGCG	2	8	135440	135447	0 %	0 %	75 %	25 %	224581963
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2908	NC_012125	A	6	6	136516	136521	100 %	0 %	0 %	0 %	224581965
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2991	NC_012125	GGC	2	6	140160	140165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581967
2992	NC_012125	GCT	2	6	140167	140172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224581967
2993	NC_012125	GGC	2	6	140220	140225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581967
2994	NC_012125	CCG	2	6	140321	140326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224581967
2995	NC_012125	TGG	2	6	140366	140371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224581967
2996	NC_012125	AAGCG	2	10	140400	140409	40 %	0 %	40 %	20 %	224581967
2997	NC_012125	GCG	2	6	140440	140445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581967
2998	NC_012125	TCAG	2	8	140477	140484	25 %	25 %	25 %	25 %	224581967
2999	NC_012125	GCG	2	6	140501	140506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224581967
3000	NC_012125	ATG	2	6	140575	140580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224581967

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