MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus carnosus subsp. carnosus TM300 chromosome

Total Repeats: 2142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012121	AGAAT	2	10	6983	6992	60 %	20 %	20 %	0 %	224475502
2	NC_012121	AAGAT	2	10	7063	7072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012121	AAGTG	2	10	8940	8949	40 %	20 %	40 %	0 %	224475504
4	NC_012121	AAAAG	2	10	10749	10758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012121	TTGAG	2	10	10800	10809	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012121	AGTTA	2	10	14014	14023	40 %	40 %	20 %	0 %	224475507
7	NC_012121	ACCGC	2	10	15207	15216	20 %	0 %	20 %	60 %	224475508
8	NC_012121	AGGAG	2	10	16815	16824	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012121	ATTTA	2	10	20294	20303	40 %	60 %	0 %	0 %	224475513
10	NC_012121	AAATT	2	10	21061	21070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012121	TAAAA	2	10	21111	21120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012121	CATTA	2	10	21985	21994	40 %	40 %	0 %	20 %	224475514
13	NC_012121	TTGCA	2	10	22377	22386	20 %	40 %	20 %	20 %	224475514
14	NC_012121	AATTT	2	10	23475	23484	40 %	60 %	0 %	0 %	224475514
15	NC_012121	CAAAT	2	10	23931	23940	60 %	20 %	0 %	20 %	224475514
16	NC_012121	ATACA	2	10	25032	25041	60 %	20 %	0 %	20 %	224475514
17	NC_012121	AAAAG	2	10	25186	25195	80 %	0 %	20 %	0 %	224475514
18	NC_012121	TAGAA	2	10	25448	25457	60 %	20 %	20 %	0 %	224475514
19	NC_012121	TGAAA	2	10	27847	27856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012121	AAACA	2	10	29115	29124	80 %	0 %	0 %	20 %	224475519
21	NC_012121	ATTGA	2	10	33021	33030	40 %	40 %	20 %	0 %	224475525
22	NC_012121	AGTAA	2	10	33312	33321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012121	AAAGG	2	10	33952	33961	60 %	0 %	40 %	0 %	224475526
24	NC_012121	GCTTG	2	10	34098	34107	0 %	40 %	40 %	20 %	224475527
25	NC_012121	GAATT	2	10	34429	34438	40 %	40 %	20 %	0 %	224475527
26	NC_012121	CATTA	2	10	35723	35732	40 %	40 %	0 %	20 %	224475528
27	NC_012121	TTATT	2	10	35927	35936	20 %	80 %	0 %	0 %	224475529
28	NC_012121	ATTAT	2	10	36601	36610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012121	AATAC	2	10	36741	36750	60 %	20 %	0 %	20 %	224475530
30	NC_012121	TTTGA	2	10	39027	39036	20 %	60 %	20 %	0 %	224475532
31	NC_012121	TAAAG	2	10	40681	40690	60 %	20 %	20 %	0 %	224475534
32	NC_012121	TGAAT	2	10	42188	42197	40 %	40 %	20 %	0 %	224475536
33	NC_012121	TAATG	2	10	42425	42434	40 %	40 %	20 %	0 %	224475536
34	NC_012121	GTGAA	2	10	42628	42637	40 %	20 %	40 %	0 %	224475536
35	NC_012121	AGGTA	2	10	43055	43064	40 %	20 %	40 %	0 %	224475536
36	NC_012121	ATCTG	2	10	44815	44824	20 %	40 %	20 %	20 %	224475537
37	NC_012121	GGTTT	2	10	48263	48272	0 %	60 %	40 %	0 %	224475542
38	NC_012121	GAATT	2	10	52027	52036	40 %	40 %	20 %	0 %	224475545
39	NC_012121	TAATA	2	10	52691	52700	60 %	40 %	0 %	0 %	224475545
40	NC_012121	TACAC	2	10	52725	52734	40 %	20 %	0 %	40 %	224475545
41	NC_012121	TGAAG	2	10	52836	52845	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012121	TAAAT	2	10	54277	54286	60 %	40 %	0 %	0 %	224475548
43	NC_012121	AATGG	2	10	54799	54808	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012121	CTTCA	2	10	57728	57737	20 %	40 %	0 %	40 %	224475550
45	NC_012121	CATAA	2	10	58682	58691	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012121	TTAAG	2	10	59495	59504	40 %	40 %	20 %	0 %	224475551
47	NC_012121	ACGTA	2	10	61973	61982	40 %	20 %	20 %	20 %	224475553
48	NC_012121	ATAAA	2	10	64143	64152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012121	ATTAC	2	10	65388	65397	40 %	40 %	0 %	20 %	224475556
50	NC_012121	TATAA	2	10	67010	67019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012121	GGTAT	2	10	67825	67834	20 %	40 %	40 %	0 %	224475558
52	NC_012121	TATTT	2	10	68673	68682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012121	TGAAA	2	10	72371	72380	60 %	20 %	20 %	0 %	224475565
54	NC_012121	AACCA	2	10	72629	72638	60 %	0 %	0 %	40 %	224475565
55	NC_012121	ATGAA	2	10	73305	73314	60 %	20 %	20 %	0 %	224475567
56	NC_012121	TAAAT	2	10	73612	73621	60 %	40 %	0 %	0 %	224475567
57	NC_012121	AATTG	2	10	73801	73810	40 %	40 %	20 %	0 %	224475567
58	NC_012121	TATGA	2	10	75316	75325	40 %	40 %	20 %	0 %	224475569
59	NC_012121	ATCTT	2	10	76848	76857	20 %	60 %	0 %	20 %	224475570
60	NC_012121	GTTTT	2	10	77493	77502	0 %	80 %	20 %	0 %	224475571
61	NC_012121	GTTTC	2	10	78448	78457	0 %	60 %	20 %	20 %	224475572
62	NC_012121	TTCTT	2	10	79181	79190	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012121	TAAAC	2	10	82338	82347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012121	AATTG	2	10	82413	82422	40 %	40 %	20 %	0 %	224475577
65	NC_012121	TTTTA	2	10	83050	83059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012121	TTTTA	2	10	83901	83910	20 %	80 %	0 %	0 %	224475578
67	NC_012121	CTTAT	2	10	84225	84234	20 %	60 %	0 %	20 %	224475578
68	NC_012121	TTGAA	2	10	84272	84281	40 %	40 %	20 %	0 %	224475578
69	NC_012121	TAAAT	2	10	86908	86917	60 %	40 %	0 %	0 %	224475580
70	NC_012121	ATTAT	2	10	87896	87905	40 %	60 %	0 %	0 %	224475582
71	NC_012121	ATGGA	2	10	88840	88849	40 %	20 %	40 %	0 %	224475583
72	NC_012121	ATCCA	2	10	90325	90334	40 %	20 %	0 %	40 %	224475585
73	NC_012121	TTTTA	2	10	90822	90831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012121	ATTTA	2	10	90879	90888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012121	ATGAA	2	10	91170	91179	60 %	20 %	20 %	0 %	224475586
76	NC_012121	TGAGA	2	10	91970	91979	40 %	20 %	40 %	0 %	224475587
77	NC_012121	TCATA	2	10	92703	92712	40 %	40 %	0 %	20 %	224475587
78	NC_012121	ATCGC	2	10	92996	93005	20 %	20 %	20 %	40 %	224475587
79	NC_012121	ATTTT	2	10	94589	94598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012121	ATATT	2	10	96399	96408	40 %	60 %	0 %	0 %	224475589
81	NC_012121	ATTTT	2	10	97330	97339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012121	TTGAT	2	10	97565	97574	20 %	60 %	20 %	0 %	224475592
83	NC_012121	GATTT	2	10	98035	98044	20 %	60 %	20 %	0 %	224475592
84	NC_012121	CAATA	2	10	100906	100915	60 %	20 %	0 %	20 %	224475596
85	NC_012121	GGATT	2	10	105440	105449	20 %	40 %	40 %	0 %	224475598
86	NC_012121	GGAAT	2	10	107305	107314	40 %	20 %	40 %	0 %	224475599
87	NC_012121	AAAAT	2	10	108387	108396	80 %	20 %	0 %	0 %	224475599
88	NC_012121	TAAAT	2	10	109675	109684	60 %	40 %	0 %	0 %	224475601
89	NC_012121	AATCC	2	10	109844	109853	40 %	20 %	0 %	40 %	224475601
90	NC_012121	TTGGT	2	10	110106	110115	0 %	60 %	40 %	0 %	224475601
91	NC_012121	AAGTA	2	10	110797	110806	60 %	20 %	20 %	0 %	224475602
92	NC_012121	GATAT	2	10	111291	111300	40 %	40 %	20 %	0 %	224475603
93	NC_012121	ATGAA	2	10	111801	111810	60 %	20 %	20 %	0 %	224475603
94	NC_012121	ATTTA	2	10	113795	113804	40 %	60 %	0 %	0 %	224475605
95	NC_012121	AAAAG	2	10	114125	114134	80 %	0 %	20 %	0 %	224475606
96	NC_012121	TCAGT	2	10	118261	118270	20 %	40 %	20 %	20 %	224475610
97	NC_012121	CAGAA	2	10	121277	121286	60 %	0 %	20 %	20 %	224475613
98	NC_012121	AACAA	2	10	121568	121577	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012121	GGTAA	2	10	122053	122062	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012121	TCGTG	2	10	122872	122881	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012121	TGAAA	2	10	128874	128883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012121	TGTGG	2	10	129106	129115	0 %	40 %	60 %	0 %	224475616
103	NC_012121	GACAA	2	10	135438	135447	60 %	0 %	20 %	20 %	224475624
104	NC_012121	AGATG	2	10	138069	138078	40 %	20 %	40 %	0 %	224475626
105	NC_012121	TGGGT	2	10	138152	138161	0 %	40 %	60 %	0 %	224475626
106	NC_012121	ATGAA	2	10	138334	138343	60 %	20 %	20 %	0 %	224475627
107	NC_012121	ATTAA	2	10	138788	138797	60 %	40 %	0 %	0 %	224475628
108	NC_012121	ATATT	2	10	138890	138899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012121	CTTCA	2	10	139207	139216	20 %	40 %	0 %	40 %	224475629
110	NC_012121	TAAGT	2	10	140097	140106	40 %	40 %	20 %	0 %	224475630
111	NC_012121	ATTTT	2	10	144391	144400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012121	TTTAA	2	10	144730	144739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012121	ATTAC	2	10	146080	146089	40 %	40 %	0 %	20 %	224475635
114	NC_012121	AAATG	2	10	147788	147797	60 %	20 %	20 %	0 %	224475637
115	NC_012121	AATGT	2	10	151459	151468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012121	AATAT	2	10	153560	153569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012121	ATTAT	2	10	155118	155127	40 %	60 %	0 %	0 %	224475645
118	NC_012121	TTTTG	2	10	158799	158808	0 %	80 %	20 %	0 %	224475646
119	NC_012121	AGAAA	2	10	160660	160669	80 %	0 %	20 %	0 %	224475647
120	NC_012121	AGAAA	2	10	160928	160937	80 %	0 %	20 %	0 %	224475648
121	NC_012121	GAGAT	2	10	161081	161090	40 %	20 %	40 %	0 %	224475649
122	NC_012121	ATGAG	2	10	161299	161308	40 %	20 %	40 %	0 %	224475650
123	NC_012121	GAAAT	2	10	161628	161637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012121	TTAAA	2	10	161697	161706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012121	TATTT	2	10	162192	162201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012121	GTTTT	2	10	163490	163499	0 %	80 %	20 %	0 %	224475652
127	NC_012121	TTTTC	2	10	167547	167556	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012121	GAAGT	2	10	169106	169115	40 %	20 %	40 %	0 %	224475657
129	NC_012121	TTGAA	2	10	169574	169583	40 %	40 %	20 %	0 %	224475657
130	NC_012121	TACCG	2	10	173971	173980	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_012121	GGTAA	2	10	174681	174690	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012121	TCGTG	2	10	175498	175507	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012121	TGTTT	2	10	179451	179460	0 %	80 %	20 %	0 %	224475662
134	NC_012121	ATTAC	2	10	179836	179845	40 %	40 %	0 %	20 %	224475662
135	NC_012121	CTTTT	2	10	180000	180009	0 %	80 %	0 %	20 %	224475662
136	NC_012121	TTTCT	2	10	180047	180056	0 %	80 %	0 %	20 %	224475662
137	NC_012121	CATAA	2	10	181970	181979	60 %	20 %	0 %	20 %	224475664
138	NC_012121	ATTGA	2	10	183739	183748	40 %	40 %	20 %	0 %	224475666
139	NC_012121	TGATT	2	10	185533	185542	20 %	60 %	20 %	0 %	224475669
140	NC_012121	ATATA	2	10	186768	186777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012121	GAATC	2	10	188360	188369	40 %	20 %	20 %	20 %	224475672
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269	NC_012121	AGACA	2	10	351624	351633	60 %	0 %	20 %	20 %	224475836
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