MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 1457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	TTAGT	2	10	974	983	20 %	60 %	20 %	0 %	222152202
2	NC_012004	TTTTC	2	10	2180	2189	0 %	80 %	0 %	20 %	222152203
3	NC_012004	GTAAA	2	10	2435	2444	60 %	20 %	20 %	0 %	222152203
4	NC_012004	CAAAA	2	10	6975	6984	80 %	0 %	0 %	20 %	222152208
5	NC_012004	GTTTT	2	10	9436	9445	0 %	80 %	20 %	0 %	222152209
6	NC_012004	CTTCT	2	10	12950	12959	0 %	60 %	0 %	40 %	222152214
7	NC_012004	AAAAG	2	10	13390	13399	80 %	0 %	20 %	0 %	222152214
8	NC_012004	GTTCC	2	10	13752	13761	0 %	40 %	20 %	40 %	222152215
9	NC_012004	TTTAT	2	10	16464	16473	20 %	80 %	0 %	0 %	222152217
10	NC_012004	AATTA	2	10	17636	17645	60 %	40 %	0 %	0 %	222152217
11	NC_012004	GGTAA	2	10	18264	18273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012004	TCGTG	2	10	19081	19090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012004	GAAGT	2	10	19727	19736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012004	GTTAA	2	10	19895	19904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012004	GGGAG	2	10	20414	20423	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012004	AGGGA	2	10	22623	22632	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012004	GCTTA	2	10	23106	23115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012004	ATTAT	2	10	24900	24909	40 %	60 %	0 %	0 %	222152218
19	NC_012004	ATCAT	2	10	25342	25351	40 %	40 %	0 %	20 %	222152218
20	NC_012004	GAAAA	2	10	25504	25513	80 %	0 %	20 %	0 %	222152218
21	NC_012004	AGTGA	2	10	28180	28189	40 %	20 %	40 %	0 %	222152221
22	NC_012004	GAATT	2	10	29242	29251	40 %	40 %	20 %	0 %	222152222
23	NC_012004	CTTAT	2	10	29712	29721	20 %	60 %	0 %	20 %	222152222
24	NC_012004	AGAAA	2	10	32158	32167	80 %	0 %	20 %	0 %	222152226
25	NC_012004	CAGCT	2	10	33153	33162	20 %	20 %	20 %	40 %	222152227
26	NC_012004	ACCAT	2	10	34939	34948	40 %	20 %	0 %	40 %	222152227
27	NC_012004	AAATG	2	10	37495	37504	60 %	20 %	20 %	0 %	222152228
28	NC_012004	AGAAA	2	10	38475	38484	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012004	AAAAG	2	10	38535	38544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012004	AAGGC	2	10	39192	39201	40 %	0 %	40 %	20 %	222152229
31	NC_012004	GTCAA	2	10	41443	41452	40 %	20 %	20 %	20 %	222152231
32	NC_012004	TTTTA	2	10	41845	41854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012004	TAGAA	2	10	42000	42009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012004	ATATT	2	10	42699	42708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012004	TTATG	2	10	42724	42733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012004	TTTAG	2	10	43089	43098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012004	TAATA	2	10	43384	43393	60 %	40 %	0 %	0 %	222152233
38	NC_012004	TCATT	2	10	43581	43590	20 %	60 %	0 %	20 %	222152233
39	NC_012004	ATCAA	2	10	43699	43708	60 %	20 %	0 %	20 %	222152233
40	NC_012004	AAACC	2	10	43826	43835	60 %	0 %	0 %	40 %	222152233
41	NC_012004	AATGA	2	10	43979	43988	60 %	20 %	20 %	0 %	222152233
42	NC_012004	TTTAT	2	10	44694	44703	20 %	80 %	0 %	0 %	222152233
43	NC_012004	CATTA	2	10	44713	44722	40 %	40 %	0 %	20 %	222152233
44	NC_012004	AATAT	2	10	46698	46707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012004	TTACT	2	10	49058	49067	20 %	60 %	0 %	20 %	222152239
46	NC_012004	GTTCC	2	10	49527	49536	0 %	40 %	20 %	40 %	222152239
47	NC_012004	ATTTT	2	10	52859	52868	20 %	80 %	0 %	0 %	222152243
48	NC_012004	TGCTA	2	10	53494	53503	20 %	40 %	20 %	20 %	222152243
49	NC_012004	AACAA	2	10	53732	53741	80 %	0 %	0 %	20 %	222152244
50	NC_012004	AGGAC	2	10	55260	55269	40 %	0 %	40 %	20 %	222152246
51	NC_012004	AGTAA	2	10	56347	56356	60 %	20 %	20 %	0 %	222152247
52	NC_012004	TGTCT	2	10	56538	56547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012004	TAAGG	2	10	56612	56621	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012004	TTTTA	2	10	57108	57117	20 %	80 %	0 %	0 %	222152249
55	NC_012004	TGGCT	2	10	57891	57900	0 %	40 %	40 %	20 %	222152250
56	NC_012004	TTTTC	2	10	63082	63091	0 %	80 %	0 %	20 %	222152255
57	NC_012004	CTTAT	2	10	64077	64086	20 %	60 %	0 %	20 %	222152256
58	NC_012004	ATATA	2	10	64342	64351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012004	TTTGT	2	10	64444	64453	0 %	80 %	20 %	0 %	222152257
60	NC_012004	CAAAT	2	10	65026	65035	60 %	20 %	0 %	20 %	222152258
61	NC_012004	GTTTT	2	10	66073	66082	0 %	80 %	20 %	0 %	222152259
62	NC_012004	TTTAG	2	10	66654	66663	20 %	60 %	20 %	0 %	222152259
63	NC_012004	TAAAT	2	10	67309	67318	60 %	40 %	0 %	0 %	222152260
64	NC_012004	ATGGT	2	10	67962	67971	20 %	40 %	40 %	0 %	222152260
65	NC_012004	AATTC	2	10	68645	68654	40 %	40 %	0 %	20 %	222152260
66	NC_012004	AACTT	2	10	71121	71130	40 %	40 %	0 %	20 %	222152262
67	NC_012004	GCAAT	2	10	72502	72511	40 %	20 %	20 %	20 %	222152263
68	NC_012004	TTACT	2	10	72710	72719	20 %	60 %	0 %	20 %	222152263
69	NC_012004	TGAAA	2	10	75647	75656	60 %	20 %	20 %	0 %	222152268
70	NC_012004	GAAAA	2	10	76221	76230	80 %	0 %	20 %	0 %	222152269
71	NC_012004	TTTGG	2	10	76635	76644	0 %	60 %	40 %	0 %	222152270
72	NC_012004	AAATC	2	10	77107	77116	60 %	20 %	0 %	20 %	222152271
73	NC_012004	TGAAA	2	10	78071	78080	60 %	20 %	20 %	0 %	222152273
74	NC_012004	AAGGA	2	10	79159	79168	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012004	AAAAC	2	10	81294	81303	80 %	0 %	0 %	20 %	222152281
76	NC_012004	TAAAA	2	10	82334	82343	80 %	20 %	0 %	0 %	222152283
77	NC_012004	CCAAT	2	10	83650	83659	40 %	20 %	0 %	40 %	222152285
78	NC_012004	GAAAA	2	10	84186	84195	80 %	0 %	20 %	0 %	222152285
79	NC_012004	CATTT	2	10	84324	84333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012004	CGTGA	2	10	86209	86218	20 %	20 %	40 %	20 %	222152290
81	NC_012004	GTTTC	2	10	86291	86300	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012004	GGTAA	2	10	88502	88511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012004	TCGTG	2	10	89319	89328	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012004	GAAGT	2	10	89965	89974	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012004	GTTAA	2	10	90133	90142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012004	GGGAG	2	10	90652	90661	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012004	AGGGA	2	10	92861	92870	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012004	GCTTA	2	10	93344	93353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012004	TTAGC	2	10	95488	95497	20 %	40 %	20 %	20 %	222152293
90	NC_012004	ATTTA	2	10	95638	95647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012004	AATAT	2	10	96971	96980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012004	TTGAC	2	10	97202	97211	20 %	40 %	20 %	20 %	222152295
93	NC_012004	TATAA	2	10	98759	98768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012004	CAAAC	2	10	99582	99591	60 %	0 %	0 %	40 %	222152297
95	NC_012004	TTGAT	2	10	100368	100377	20 %	60 %	20 %	0 %	222152298
96	NC_012004	TAAAA	2	10	100828	100837	80 %	20 %	0 %	0 %	222152298
97	NC_012004	TTGGT	2	10	103067	103076	0 %	60 %	40 %	0 %	222152300
98	NC_012004	TTTTG	2	10	103389	103398	0 %	80 %	20 %	0 %	222152300
99	NC_012004	GGATT	2	10	103533	103542	20 %	40 %	40 %	0 %	222152301
100	NC_012004	TTCTT	2	10	103642	103651	0 %	80 %	0 %	20 %	222152301
101	NC_012004	AGAGA	2	10	107771	107780	60 %	0 %	40 %	0 %	222152303
102	NC_012004	AAGAT	2	10	108847	108856	60 %	20 %	20 %	0 %	222152304
103	NC_012004	ATTTC	2	10	110854	110863	20 %	60 %	0 %	20 %	222152307
104	NC_012004	CAGCT	2	10	111983	111992	20 %	20 %	20 %	40 %	222152308
105	NC_012004	GGATT	2	10	114314	114323	20 %	40 %	40 %	0 %	222152309
106	NC_012004	ATCAA	2	10	114549	114558	60 %	20 %	0 %	20 %	222152309
107	NC_012004	TAAAT	2	10	116764	116773	60 %	40 %	0 %	0 %	222152310
108	NC_012004	TAAAT	2	10	122783	122792	60 %	40 %	0 %	0 %	222152312
109	NC_012004	CAATC	2	10	124078	124087	40 %	20 %	0 %	40 %	222152314
110	NC_012004	AAAAG	2	10	124905	124914	80 %	0 %	20 %	0 %	222152315
111	NC_012004	TGAAT	2	10	124974	124983	40 %	40 %	20 %	0 %	222152315
112	NC_012004	TGATT	2	10	127780	127789	20 %	60 %	20 %	0 %	222152321
113	NC_012004	TACTA	2	10	128837	128846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012004	CTGGA	2	10	130499	130508	20 %	20 %	40 %	20 %	222152325
115	NC_012004	TTGTT	2	10	132570	132579	0 %	80 %	20 %	0 %	222152328
116	NC_012004	AAGAA	2	10	133672	133681	80 %	0 %	20 %	0 %	222152330
117	NC_012004	TGATT	2	10	135149	135158	20 %	60 %	20 %	0 %	222152330
118	NC_012004	GAATT	2	10	135789	135798	40 %	40 %	20 %	0 %	222152330
119	NC_012004	ACGTT	2	10	138341	138350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012004	TAGGA	2	10	141379	141388	40 %	20 %	40 %	0 %	222152334
121	NC_012004	AGTTA	2	10	147728	147737	40 %	40 %	20 %	0 %	222152340
122	NC_012004	CAATG	2	10	148608	148617	40 %	20 %	20 %	20 %	222152341
123	NC_012004	CCACA	2	10	148671	148680	40 %	0 %	0 %	60 %	222152341
124	NC_012004	TAGCA	2	10	151076	151085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012004	GACAG	2	10	151271	151280	40 %	0 %	40 %	20 %	222152342
126	NC_012004	TTGTT	2	10	151853	151862	0 %	80 %	20 %	0 %	222152344
127	NC_012004	TGCTT	2	10	152517	152526	0 %	60 %	20 %	20 %	222152344
128	NC_012004	CCATA	2	10	154476	154485	40 %	20 %	0 %	40 %	222152346
129	NC_012004	CCAAA	2	10	158707	158716	60 %	0 %	0 %	40 %	222152351
130	NC_012004	CTTTG	2	10	159334	159343	0 %	60 %	20 %	20 %	222152352
131	NC_012004	TTTTG	2	10	160275	160284	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012004	CTTTT	2	10	160407	160416	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012004	GAAAA	2	10	160417	160426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012004	CCTAT	2	10	163091	163100	20 %	40 %	0 %	40 %	222152354
135	NC_012004	AGAAC	2	10	164637	164646	60 %	0 %	20 %	20 %	222152354
136	NC_012004	CTTTA	2	10	166128	166137	20 %	60 %	0 %	20 %	222152357
137	NC_012004	AGGAA	2	10	168431	168440	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012004	AAAAT	2	10	169345	169354	80 %	20 %	0 %	0 %	222152359
139	NC_012004	TGGGT	2	10	170337	170346	0 %	40 %	60 %	0 %	222152361
140	NC_012004	GTCCT	2	10	170403	170412	0 %	40 %	20 %	40 %	222152361
141	NC_012004	TAGAA	2	10	171109	171118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012004	AGTCC	2	10	171483	171492	20 %	20 %	20 %	40 %	222152362
143	NC_012004	GCAGA	2	10	171523	171532	40 %	0 %	40 %	20 %	222152362
144	NC_012004	ATTGA	2	10	175241	175250	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012004	GATTT	2	10	178370	178379	20 %	60 %	20 %	0 %	222152369
146	NC_012004	TTATG	2	10	178393	178402	20 %	60 %	20 %	0 %	222152369
147	NC_012004	TTGGC	2	10	178840	178849	0 %	40 %	40 %	20 %	222152369
148	NC_012004	AAGGC	2	10	180283	180292	40 %	0 %	40 %	20 %	222152371
149	NC_012004	TAAGG	2	10	180595	180604	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012004	GTTCA	2	10	181601	181610	20 %	40 %	20 %	20 %	222152373
151	NC_012004	TTGAA	2	10	182259	182268	40 %	40 %	20 %	0 %	222152373
152	NC_012004	ATATT	2	10	182634	182643	40 %	60 %	0 %	0 %	222152373
153	NC_012004	TACCA	2	10	182869	182878	40 %	20 %	0 %	40 %	222152373
154	NC_012004	ACCCT	2	10	184401	184410	20 %	20 %	0 %	60 %	222152375
155	NC_012004	AAATC	2	10	185167	185176	60 %	20 %	0 %	20 %	222152376
156	NC_012004	TTGGC	2	10	186384	186393	0 %	40 %	40 %	20 %	222152378
157	NC_012004	TTTGC	2	10	186741	186750	0 %	60 %	20 %	20 %	222152378
158	NC_012004	AAGTT	2	10	188096	188105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012004	TTTAC	2	10	188861	188870	20 %	60 %	0 %	20 %	222152382
160	NC_012004	ATTGC	2	10	189884	189893	20 %	40 %	20 %	20 %	222152382
161	NC_012004	CAGCA	2	10	192211	192220	40 %	0 %	20 %	40 %	222152385
162	NC_012004	AATCC	2	10	194917	194926	40 %	20 %	0 %	40 %	222152388
163	NC_012004	ATGCA	2	10	195475	195484	40 %	20 %	20 %	20 %	222152389
164	NC_012004	GTATG	2	10	197243	197252	20 %	40 %	40 %	0 %	222152390
165	NC_012004	TGAAA	2	10	198916	198925	60 %	20 %	20 %	0 %	222152391
166	NC_012004	CTGGT	2	10	199594	199603	0 %	40 %	40 %	20 %	222152392
167	NC_012004	CCTTT	2	10	200129	200138	0 %	60 %	0 %	40 %	222152392
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172	NC_012004	CTTTT	2	10	205960	205969	0 %	80 %	0 %	20 %	222152398
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174	NC_012004	ATATC	2	10	211852	211861	40 %	40 %	0 %	20 %	222152406
175	NC_012004	TACTA	2	10	213677	213686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_012004	AACCT	2	10	215356	215365	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
177	NC_012004	CCTAA	2	10	215366	215375	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_012004	CAAGC	2	10	216406	216415	40 %	0 %	20 %	40 %	222152411
179	NC_012004	ATTAG	2	10	219726	219735	40 %	40 %	20 %	0 %	222152419
180	NC_012004	CTTAC	2	10	220867	220876	20 %	40 %	0 %	40 %	222152421
181	NC_012004	AGATA	2	10	220894	220903	60 %	20 %	20 %	0 %	222152421
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183	NC_012004	CTATT	2	10	224045	224054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_012004	AATGA	2	10	224157	224166	60 %	20 %	20 %	0 %	222152425
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195	NC_012004	GTTTA	2	10	230554	230563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012004	GTAAA	2	10	234410	234419	60 %	20 %	20 %	0 %	222152432
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198	NC_012004	TTACA	2	10	235215	235224	40 %	40 %	0 %	20 %	222152432
199	NC_012004	GACAT	2	10	236044	236053	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_012004	TGAGG	2	10	236146	236155	20 %	20 %	60 %	0 %	222152434
201	NC_012004	TTTGG	2	10	236558	236567	0 %	60 %	40 %	0 %	222152434
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203	NC_012004	CAATG	2	10	239509	239518	40 %	20 %	20 %	20 %	222152436
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212	NC_012004	TTTTC	2	10	258297	258306	0 %	80 %	0 %	20 %	222152451
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218	NC_012004	CAGGT	2	10	268890	268899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
219	NC_012004	TGACA	2	10	268957	268966	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
220	NC_012004	GATGA	2	10	269793	269802	40 %	20 %	40 %	0 %	222152461
221	NC_012004	CTATC	2	10	270845	270854	20 %	40 %	0 %	40 %	222152463
222	NC_012004	ACCGC	2	10	271036	271045	20 %	0 %	20 %	60 %	222152463
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228	NC_012004	ACAGT	2	10	276455	276464	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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231	NC_012004	AAAGT	2	10	276810	276819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
232	NC_012004	AAAAT	2	10	277920	277929	80 %	20 %	0 %	0 %	222152468
233	NC_012004	CATTC	2	10	280767	280776	20 %	40 %	0 %	40 %	222152470
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240	NC_012004	TATTT	2	10	291588	291597	20 %	80 %	0 %	0 %	222152481
241	NC_012004	GAATT	2	10	291955	291964	40 %	40 %	20 %	0 %	222152482
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244	NC_012004	GTATT	2	10	295422	295431	20 %	60 %	20 %	0 %	222152487
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251	NC_012004	GTAAT	2	10	304766	304775	40 %	40 %	20 %	0 %	222152496
252	NC_012004	TTTTC	2	10	305541	305550	0 %	80 %	0 %	20 %	222152496
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254	NC_012004	GGTAA	2	10	309366	309375	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
255	NC_012004	TCGTG	2	10	310183	310192	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
256	NC_012004	GAAGT	2	10	310829	310838	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012004	GTTAA	2	10	310997	311006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012004	GGGAG	2	10	311516	311525	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012004	AGGGA	2	10	313725	313734	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
260	NC_012004	GATAT	2	10	318716	318725	40 %	40 %	20 %	0 %	222152505
261	NC_012004	ATATT	2	10	321698	321707	40 %	60 %	0 %	0 %	222152507
262	NC_012004	CATTA	2	10	322120	322129	40 %	40 %	0 %	20 %	222152508
263	NC_012004	TGAAA	2	10	323232	323241	60 %	20 %	20 %	0 %	222152509
264	NC_012004	TCAAA	2	10	327140	327149	60 %	20 %	0 %	20 %	222152511
265	NC_012004	ATTTA	2	10	328206	328215	40 %	60 %	0 %	0 %	222152513
266	NC_012004	GTAAA	2	10	331265	331274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_012004	TTTTA	2	10	331359	331368	20 %	80 %	0 %	0 %	222152517
268	NC_012004	ATCAA	2	10	332896	332905	60 %	20 %	0 %	20 %	222152518
269	NC_012004	TGCCT	2	10	334703	334712	0 %	40 %	20 %	40 %	222152519
270	NC_012004	TTAGT	2	10	338104	338113	20 %	60 %	20 %	0 %	222152522
271	NC_012004	ATTAA	2	10	338948	338957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012004	AACCC	2	10	340637	340646	40 %	0 %	0 %	60 %	222152525
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402	NC_012004	TTTTA	2	10	483347	483356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_012004	ATTTT	2	10	483474	483483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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