MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 4669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	AAAC	2	8	61	68	75 %	0 %	0 %	25 %	222152202
2	NC_012004	ACAA	2	8	297	304	75 %	0 %	0 %	25 %	222152202
3	NC_012004	CTCG	2	8	1168	1175	0 %	25 %	25 %	50 %	222152202
4	NC_012004	TTTC	2	8	2222	2229	0 %	75 %	0 %	25 %	222152203
5	NC_012004	AGAT	2	8	2265	2272	50 %	25 %	25 %	0 %	222152203
6	NC_012004	AATT	2	8	2618	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	222152203
7	NC_012004	AGTT	2	8	3203	3210	25 %	50 %	25 %	0 %	222152205
8	NC_012004	ACTT	2	8	3280	3287	25 %	50 %	0 %	25 %	222152205
9	NC_012004	ATTT	2	8	3433	3440	25 %	75 %	0 %	0 %	222152205
10	NC_012004	ATAG	2	8	3451	3458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012004	TTTG	2	8	3470	3477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012004	ATTA	2	8	4193	4200	50 %	50 %	0 %	0 %	222152206
13	NC_012004	CAGA	2	8	4226	4233	50 %	0 %	25 %	25 %	222152206
14	NC_012004	ATCA	2	8	4868	4875	50 %	25 %	0 %	25 %	222152207
15	NC_012004	ATTT	2	8	5551	5558	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
16	NC_012004	TTAT	2	8	5695	5702	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
17	NC_012004	TGAA	2	8	5934	5941	50 %	25 %	25 %	0 %	222152208
18	NC_012004	ATTT	2	8	6109	6116	25 %	75 %	0 %	0 %	222152208
19	NC_012004	GACG	2	8	6956	6963	25 %	0 %	50 %	25 %	222152208
20	NC_012004	AAAG	2	8	7325	7332	75 %	0 %	25 %	0 %	222152208
21	NC_012004	TTGA	2	8	7877	7884	25 %	50 %	25 %	0 %	222152208
22	NC_012004	CTTA	2	8	8052	8059	25 %	50 %	0 %	25 %	222152208
23	NC_012004	ATAG	2	8	8444	8451	50 %	25 %	25 %	0 %	222152208
24	NC_012004	ATTT	2	8	9143	9150	25 %	75 %	0 %	0 %	222152209
25	NC_012004	TGTT	2	8	9254	9261	0 %	75 %	25 %	0 %	222152209
26	NC_012004	TCTT	2	8	9687	9694	0 %	75 %	0 %	25 %	222152209
27	NC_012004	TGTA	2	8	10040	10047	25 %	50 %	25 %	0 %	222152209
28	NC_012004	TACC	2	8	10233	10240	25 %	25 %	0 %	50 %	222152209
29	NC_012004	AAGA	2	8	10489	10496	75 %	0 %	25 %	0 %	222152210
30	NC_012004	CAAT	2	8	10576	10583	50 %	25 %	0 %	25 %	222152211
31	NC_012004	TATT	2	8	10680	10687	25 %	75 %	0 %	0 %	222152211
32	NC_012004	TTAT	2	8	10884	10891	25 %	75 %	0 %	0 %	222152211
33	NC_012004	ATTT	2	8	11356	11363	25 %	75 %	0 %	0 %	222152213
34	NC_012004	GTTG	2	8	11421	11428	0 %	50 %	50 %	0 %	222152213
35	NC_012004	CATT	2	8	12252	12259	25 %	50 %	0 %	25 %	222152213
36	NC_012004	TATT	2	8	12316	12323	25 %	75 %	0 %	0 %	222152213
37	NC_012004	TATT	2	8	13448	13455	25 %	75 %	0 %	0 %	222152214
38	NC_012004	TGGT	2	8	13734	13741	0 %	50 %	50 %	0 %	222152215
39	NC_012004	CCTT	2	8	14119	14126	0 %	50 %	0 %	50 %	222152215
40	NC_012004	ATTA	2	8	14306	14313	50 %	50 %	0 %	0 %	222152216
41	NC_012004	CAAA	2	8	14326	14333	75 %	0 %	0 %	25 %	222152216
42	NC_012004	GTTC	2	8	14984	14991	0 %	50 %	25 %	25 %	222152216
43	NC_012004	GGTA	2	8	15241	15248	25 %	25 %	50 %	0 %	222152216
44	NC_012004	TGAT	2	8	15906	15913	25 %	50 %	25 %	0 %	222152216
45	NC_012004	AATT	2	8	15990	15997	50 %	50 %	0 %	0 %	222152216
46	NC_012004	ACGA	2	8	17985	17992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012004	ACCT	2	8	18133	18140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012004	GTGA	2	8	18414	18421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012004	TAAC	2	8	18497	18504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012004	AGCG	2	8	18585	18592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012004	TGGT	2	8	19250	19257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012004	AGCC	2	8	19467	19474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012004	GTAA	2	8	19981	19988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012004	GAAG	2	8	20063	20070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012004	GCGA	2	8	20137	20144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012004	ATTC	2	8	21003	21010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012004	GTAT	2	8	21325	21332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012004	CTAA	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012004	ATAC	2	8	21509	21516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012004	TAGG	2	8	22012	22019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012004	TATT	2	8	24035	24042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012004	GCGT	2	8	24200	24207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012004	TTTC	2	8	24828	24835	0 %	75 %	0 %	25 %	222152218
64	NC_012004	ACTA	2	8	25267	25274	50 %	25 %	0 %	25 %	222152218
65	NC_012004	TTTA	3	12	25921	25932	25 %	75 %	0 %	0 %	222152219
66	NC_012004	CTTT	2	8	25985	25992	0 %	75 %	0 %	25 %	222152219
67	NC_012004	ACAT	2	8	26524	26531	50 %	25 %	0 %	25 %	222152220
68	NC_012004	ATAC	2	8	27131	27138	50 %	25 %	0 %	25 %	222152220
69	NC_012004	TGGT	2	8	27396	27403	0 %	50 %	50 %	0 %	222152220
70	NC_012004	CAGT	2	8	27821	27828	25 %	25 %	25 %	25 %	222152221
71	NC_012004	TGAT	2	8	28241	28248	25 %	50 %	25 %	0 %	222152221
72	NC_012004	TGAT	2	8	28421	28428	25 %	50 %	25 %	0 %	222152221
73	NC_012004	TTGA	2	8	28819	28826	25 %	50 %	25 %	0 %	222152222
74	NC_012004	CTTA	2	8	28870	28877	25 %	50 %	0 %	25 %	222152222
75	NC_012004	GTGA	2	8	29221	29228	25 %	25 %	50 %	0 %	222152222
76	NC_012004	TGAA	2	8	29964	29971	50 %	25 %	25 %	0 %	222152223
77	NC_012004	ATTT	2	8	30033	30040	25 %	75 %	0 %	0 %	222152223
78	NC_012004	AATG	2	8	30230	30237	50 %	25 %	25 %	0 %	222152223
79	NC_012004	TTAT	3	12	30351	30362	25 %	75 %	0 %	0 %	222152223
80	NC_012004	GTTT	2	8	30978	30985	0 %	75 %	25 %	0 %	222152224
81	NC_012004	CATT	2	8	31472	31479	25 %	50 %	0 %	25 %	222152224
82	NC_012004	GTAC	2	8	31586	31593	25 %	25 %	25 %	25 %	222152224
83	NC_012004	ATGT	2	8	32001	32008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012004	CCAA	2	8	32051	32058	50 %	0 %	0 %	50 %	222152226
85	NC_012004	TAAA	2	8	32282	32289	75 %	25 %	0 %	0 %	222152226
86	NC_012004	ATTG	2	8	32559	32566	25 %	50 %	25 %	0 %	222152226
87	NC_012004	TTCT	2	8	33024	33031	0 %	75 %	0 %	25 %	222152227
88	NC_012004	TTAT	2	8	33214	33221	25 %	75 %	0 %	0 %	222152227
89	NC_012004	GTTT	2	8	34275	34282	0 %	75 %	25 %	0 %	222152227
90	NC_012004	GATT	2	8	34378	34385	25 %	50 %	25 %	0 %	222152227
91	NC_012004	ACAA	2	8	35222	35229	75 %	0 %	0 %	25 %	222152227
92	NC_012004	AATC	2	8	35449	35456	50 %	25 %	0 %	25 %	222152227
93	NC_012004	TGAA	2	8	35838	35845	50 %	25 %	25 %	0 %	222152227
94	NC_012004	CCAA	2	8	36138	36145	50 %	0 %	0 %	50 %	222152227
95	NC_012004	CATC	2	8	36837	36844	25 %	25 %	0 %	50 %	222152228
96	NC_012004	ATTG	2	8	37099	37106	25 %	50 %	25 %	0 %	222152228
97	NC_012004	CCAA	2	8	37543	37550	50 %	0 %	0 %	50 %	222152228
98	NC_012004	AATT	2	8	37779	37786	50 %	50 %	0 %	0 %	222152228
99	NC_012004	ACCT	2	8	37841	37848	25 %	25 %	0 %	50 %	222152228
100	NC_012004	TGAT	2	8	37863	37870	25 %	50 %	25 %	0 %	222152228
101	NC_012004	GCTA	2	8	38767	38774	25 %	25 %	25 %	25 %	222152229
102	NC_012004	CATT	2	8	39115	39122	25 %	50 %	0 %	25 %	222152229
103	NC_012004	TTGT	2	8	39803	39810	0 %	75 %	25 %	0 %	222152230
104	NC_012004	CATT	2	8	39963	39970	25 %	50 %	0 %	25 %	222152230
105	NC_012004	ACTT	2	8	40806	40813	25 %	50 %	0 %	25 %	222152231
106	NC_012004	GCTA	2	8	41211	41218	25 %	25 %	25 %	25 %	222152231
107	NC_012004	CAAA	2	8	41503	41510	75 %	0 %	0 %	25 %	222152231
108	NC_012004	TGTT	2	8	41792	41799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012004	AAAT	2	8	42534	42541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012004	AAAT	2	8	42566	42573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012004	TGTT	2	8	44366	44373	0 %	75 %	25 %	0 %	222152233
112	NC_012004	TATT	2	8	44733	44740	25 %	75 %	0 %	0 %	222152233
113	NC_012004	CAAA	2	8	44784	44791	75 %	0 %	0 %	25 %	222152234
114	NC_012004	TTTG	2	8	44843	44850	0 %	75 %	25 %	0 %	222152234
115	NC_012004	TATT	2	8	45110	45117	25 %	75 %	0 %	0 %	222152234
116	NC_012004	TATT	2	8	45557	45564	25 %	75 %	0 %	0 %	222152235
117	NC_012004	TATT	2	8	45596	45603	25 %	75 %	0 %	0 %	222152235
118	NC_012004	ATTT	2	8	45663	45670	25 %	75 %	0 %	0 %	222152235
119	NC_012004	AGAA	2	8	45742	45749	75 %	0 %	25 %	0 %	222152235
120	NC_012004	CTTT	2	8	46177	46184	0 %	75 %	0 %	25 %	222152236
121	NC_012004	ATAG	2	8	46206	46213	50 %	25 %	25 %	0 %	222152236
122	NC_012004	TAGA	2	8	46629	46636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012004	CTTA	2	8	46649	46656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012004	TAAT	2	8	46690	46697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012004	GTTG	2	8	46773	46780	0 %	50 %	50 %	0 %	222152237
126	NC_012004	TTAT	2	8	47073	47080	25 %	75 %	0 %	0 %	222152237
127	NC_012004	AGAA	2	8	47163	47170	75 %	0 %	25 %	0 %	222152237
128	NC_012004	CAAC	2	8	47452	47459	50 %	0 %	0 %	50 %	222152237
129	NC_012004	ATAA	2	8	47461	47468	75 %	25 %	0 %	0 %	222152237
130	NC_012004	TTTC	2	8	47596	47603	0 %	75 %	0 %	25 %	222152238
131	NC_012004	AAAG	2	8	47608	47615	75 %	0 %	25 %	0 %	222152238
132	NC_012004	AGGA	2	8	47939	47946	50 %	0 %	50 %	0 %	222152238
133	NC_012004	TTTA	2	8	48200	48207	25 %	75 %	0 %	0 %	222152238
134	NC_012004	CATT	2	8	48648	48655	25 %	50 %	0 %	25 %	222152238
135	NC_012004	ACTT	2	8	50281	50288	25 %	50 %	0 %	25 %	222152240
136	NC_012004	GGTT	2	8	51269	51276	0 %	50 %	50 %	0 %	222152241
137	NC_012004	TTGA	2	8	51878	51885	25 %	50 %	25 %	0 %	222152241
138	NC_012004	ACTG	2	8	51916	51923	25 %	25 %	25 %	25 %	222152241
139	NC_012004	TTTG	2	8	52079	52086	0 %	75 %	25 %	0 %	222152241
140	NC_012004	TCAA	2	8	52725	52732	50 %	25 %	0 %	25 %	222152242
141	NC_012004	TTAC	2	8	53440	53447	25 %	50 %	0 %	25 %	222152243
142	NC_012004	AAAT	2	8	53752	53759	75 %	25 %	0 %	0 %	222152244
143	NC_012004	TGGT	2	8	54286	54293	0 %	50 %	50 %	0 %	222152244
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