MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 39857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012004	A	7	7	185634	185640	100 %	0 %	0 %	0 %	222152377
4002	NC_012004	TTTG	2	8	185643	185650	0 %	75 %	25 %	0 %	222152377
4003	NC_012004	TGA	2	6	185657	185662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152377
4004	NC_012004	A	6	6	185670	185675	100 %	0 %	0 %	0 %	222152377
4005	NC_012004	A	6	6	185739	185744	100 %	0 %	0 %	0 %	222152377
4006	NC_012004	ATT	2	6	185787	185792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152377
4007	NC_012004	AAC	2	6	185835	185840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152377
4008	NC_012004	AGC	3	9	185861	185869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152377
4009	NC_012004	AGA	2	6	185873	185878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152377
4010	NC_012004	AAAT	2	8	185954	185961	75 %	25 %	0 %	0 %	222152377
4011	NC_012004	TTA	2	6	185966	185971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152377
4012	NC_012004	A	6	6	185971	185976	100 %	0 %	0 %	0 %	222152377
4013	NC_012004	ATG	2	6	185988	185993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152378
4014	NC_012004	TTG	2	6	186018	186023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152378
4015	NC_012004	GTC	2	6	186091	186096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152378
4016	NC_012004	TTG	2	6	186100	186105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152378
4017	NC_012004	GGT	2	6	186201	186206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152378
4018	NC_012004	TAT	2	6	186355	186360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152378
4019	NC_012004	TTGGC	2	10	186384	186393	0 %	40 %	40 %	20 %	222152378
4020	NC_012004	TTGG	2	8	186400	186407	0 %	50 %	50 %	0 %	222152378
4021	NC_012004	A	6	6	186432	186437	100 %	0 %	0 %	0 %	222152378
4022	NC_012004	T	6	6	186488	186493	0 %	100 %	0 %	0 %	222152378
4023	NC_012004	CAG	2	6	186526	186531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152378
4024	NC_012004	ATGG	2	8	186558	186565	25 %	25 %	50 %	0 %	222152378
4025	NC_012004	TTG	2	6	186627	186632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152378
4026	NC_012004	TAG	2	6	186640	186645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152378
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4028	NC_012004	GCT	2	6	186690	186695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152378
4029	NC_012004	TTTGC	2	10	186741	186750	0 %	60 %	20 %	20 %	222152378
4030	NC_012004	GAT	2	6	186819	186824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152378
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4033	NC_012004	TAT	2	6	186907	186912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152379
4034	NC_012004	TAT	2	6	186978	186983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152379
4035	NC_012004	A	7	7	187013	187019	100 %	0 %	0 %	0 %	222152379
4036	NC_012004	CTTT	2	8	187040	187047	0 %	75 %	0 %	25 %	222152379
4037	NC_012004	TTG	3	9	187073	187081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152379
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4039	NC_012004	TGA	3	9	187128	187136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152379
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4045	NC_012004	ACTG	2	8	187542	187549	25 %	25 %	25 %	25 %	222152379
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4050	NC_012004	TTC	2	6	187657	187662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152379
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4052	NC_012004	TAGG	2	8	187777	187784	25 %	25 %	50 %	0 %	222152380
4053	NC_012004	T	6	6	187835	187840	0 %	100 %	0 %	0 %	222152380
4054	NC_012004	TAT	2	6	187955	187960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152380
4055	NC_012004	A	6	6	187975	187980	100 %	0 %	0 %	0 %	222152380
4056	NC_012004	A	6	6	188049	188054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012004	CTT	2	6	188057	188062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_012004	T	6	6	188070	188075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012004	AAGTT	2	10	188096	188105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4061	NC_012004	AGT	2	6	188299	188304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152381
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4063	NC_012004	GTT	2	6	188440	188445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152381
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4065	NC_012004	CAG	2	6	188470	188475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152381
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4067	NC_012004	TGA	2	6	188597	188602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152381
4068	NC_012004	T	7	7	188695	188701	0 %	100 %	0 %	0 %	222152381
4069	NC_012004	ACC	2	6	188721	188726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_012004	TTA	2	6	188733	188738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012004	ATG	2	6	188825	188830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152382
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4082	NC_012004	CAT	2	6	189201	189206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152382
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4084	NC_012004	GCTT	2	8	189230	189237	0 %	50 %	25 %	25 %	222152382
4085	NC_012004	ATG	2	6	189263	189268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152382
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4089	NC_012004	TCA	2	6	189329	189334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152382
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4092	NC_012004	A	6	6	189495	189500	100 %	0 %	0 %	0 %	222152382
4093	NC_012004	CT	3	6	189506	189511	0 %	50 %	0 %	50 %	222152382
4094	NC_012004	T	7	7	189511	189517	0 %	100 %	0 %	0 %	222152382
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4102	NC_012004	ATTGC	2	10	189884	189893	20 %	40 %	20 %	20 %	222152382
4103	NC_012004	T	7	7	189897	189903	0 %	100 %	0 %	0 %	222152382
4104	NC_012004	ATAG	2	8	189943	189950	50 %	25 %	25 %	0 %	222152382
4105	NC_012004	AAT	2	6	190030	190035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152382
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4107	NC_012004	A	7	7	190106	190112	100 %	0 %	0 %	0 %	222152382
4108	NC_012004	ATA	2	6	190148	190153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152382
4109	NC_012004	ATTA	2	8	190162	190169	50 %	50 %	0 %	0 %	222152382
4110	NC_012004	ATG	2	6	190231	190236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152383
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4112	NC_012004	T	7	7	190260	190266	0 %	100 %	0 %	0 %	222152383
4113	NC_012004	TAA	2	6	190332	190337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152383
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4120	NC_012004	CAT	2	6	190704	190709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152383
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4122	NC_012004	GGTT	2	8	190732	190739	0 %	50 %	50 %	0 %	222152383
4123	NC_012004	CAT	2	6	190796	190801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152383
4124	NC_012004	TAA	2	6	190818	190823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152383
4125	NC_012004	TCA	2	6	190840	190845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152383
4126	NC_012004	TAAA	2	8	190851	190858	75 %	25 %	0 %	0 %	222152383
4127	NC_012004	AT	3	6	190870	190875	50 %	50 %	0 %	0 %	222152383
4128	NC_012004	CAA	2	6	190886	190891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_012004	ACA	2	6	190897	190902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_012004	T	7	7	190950	190956	0 %	100 %	0 %	0 %	222152384
4131	NC_012004	T	6	6	190991	190996	0 %	100 %	0 %	0 %	222152384
4132	NC_012004	AG	3	6	191037	191042	50 %	0 %	50 %	0 %	222152384
4133	NC_012004	TAA	2	6	191119	191124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_012004	AAGA	2	8	191164	191171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_012004	GAA	2	6	191180	191185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152385
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4138	NC_012004	ATC	2	6	191301	191306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152385
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4140	NC_012004	ATCG	2	8	191415	191422	25 %	25 %	25 %	25 %	222152385
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4144	NC_012004	A	8	8	191539	191546	100 %	0 %	0 %	0 %	222152385
4145	NC_012004	ATT	2	6	191609	191614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152385
4146	NC_012004	TAA	2	6	191626	191631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152385
4147	NC_012004	TGA	2	6	191668	191673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152385
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4150	NC_012004	CAT	2	6	191801	191806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152385
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4152	NC_012004	ATT	2	6	191931	191936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152385
4153	NC_012004	TAT	2	6	191998	192003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152385
4154	NC_012004	AAT	2	6	192077	192082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152385
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4156	NC_012004	A	6	6	192306	192311	100 %	0 %	0 %	0 %	222152385
4157	NC_012004	GAA	2	6	192328	192333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152385
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4159	NC_012004	AGT	2	6	192365	192370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152385
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4165	NC_012004	GAA	2	6	192590	192595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152385
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4171	NC_012004	T	7	7	192885	192891	0 %	100 %	0 %	0 %	222152385
4172	NC_012004	AGA	2	6	192925	192930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152385
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4177	NC_012004	AGA	2	6	193075	193080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4178	NC_012004	GTT	2	6	193094	193099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4179	NC_012004	T	7	7	193098	193104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4180	NC_012004	A	8	8	193132	193139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4192	NC_012004	TTA	2	6	193753	193758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152387
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4194	NC_012004	AAAT	2	8	193869	193876	75 %	25 %	0 %	0 %	222152388
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4217	NC_012004	AATCC	2	10	194917	194926	40 %	20 %	0 %	40 %	222152388
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4222	NC_012004	TTAT	2	8	195119	195126	25 %	75 %	0 %	0 %	222152388
4223	NC_012004	CAA	2	6	195166	195171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152388
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4225	NC_012004	TTTG	2	8	195309	195316	0 %	75 %	25 %	0 %	222152389
4226	NC_012004	GAT	2	6	195369	195374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152389
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4228	NC_012004	TTCT	2	8	195435	195442	0 %	75 %	0 %	25 %	222152389
4229	NC_012004	ATGCA	2	10	195475	195484	40 %	20 %	20 %	20 %	222152389
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4232	NC_012004	ATG	2	6	195580	195585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152389
4233	NC_012004	GTT	2	6	195603	195608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152389
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4236	NC_012004	GA	3	6	195642	195647	50 %	0 %	50 %	0 %	222152389
4237	NC_012004	A	6	6	195750	195755	100 %	0 %	0 %	0 %	222152389
4238	NC_012004	GTT	2	6	195798	195803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152389
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4240	NC_012004	ATC	2	6	195875	195880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152389
4241	NC_012004	GCT	2	6	195900	195905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152389
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4244	NC_012004	ATTT	2	8	196002	196009	25 %	75 %	0 %	0 %	222152389
4245	NC_012004	AAG	2	6	196021	196026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152389
4246	NC_012004	TA	3	6	196234	196239	50 %	50 %	0 %	0 %	222152389
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4372	NC_012004	GCT	2	6	202397	202402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152395
4373	NC_012004	TTTTCT	2	12	202403	202414	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222152395
4374	NC_012004	CTT	2	6	202419	202424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152395
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4378	NC_012004	CT	3	6	202619	202624	0 %	50 %	0 %	50 %	222152395
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4405	NC_012004	T	6	6	204153	204158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_012004	TGA	2	6	204163	204168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_012004	TCC	2	6	208552	208557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152401
4498	NC_012004	CAT	2	6	208588	208593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152401
4499	NC_012004	CCA	2	6	208620	208625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152401
4500	NC_012004	A	6	6	208670	208675	100 %	0 %	0 %	0 %	222152401

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