MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 39857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_012004	AGA	2	6	1164112	1164117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222153320
25003	NC_012004	AGG	2	6	1164228	1164233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222153320
25004	NC_012004	ATG	2	6	1164305	1164310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222153320
25005	NC_012004	TTC	2	6	1164391	1164396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153320
25006	NC_012004	TTC	2	6	1164426	1164431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153320
25007	NC_012004	TGA	2	6	1164439	1164444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222153320
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25009	NC_012004	TTA	2	6	1164525	1164530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222153320
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25011	NC_012004	TGA	2	6	1164835	1164840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222153320
25012	NC_012004	A	6	6	1164971	1164976	100 %	0 %	0 %	0 %	222153320
25013	NC_012004	ATT	2	6	1164980	1164985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222153320
25014	NC_012004	GA	3	6	1165013	1165018	50 %	0 %	50 %	0 %	222153320
25015	NC_012004	TAT	2	6	1165050	1165055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222153320
25016	NC_012004	AG	3	6	1165068	1165073	50 %	0 %	50 %	0 %	222153320
25017	NC_012004	ACTA	2	8	1165117	1165124	50 %	25 %	0 %	25 %	222153320
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25024	NC_012004	AT	3	6	1165423	1165428	50 %	50 %	0 %	0 %	222153320
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25028	NC_012004	ACA	2	6	1165601	1165606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222153320
25029	NC_012004	GAG	2	6	1165640	1165645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222153320
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25031	NC_012004	GA	3	6	1165675	1165680	50 %	0 %	50 %	0 %	222153320
25032	NC_012004	TGAT	2	8	1165730	1165737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25033	NC_012004	TTTAT	2	10	1165788	1165797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25034	NC_012004	CCAC	2	8	1165832	1165839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25035	NC_012004	TAA	2	6	1165842	1165847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25037	NC_012004	ATT	2	6	1165870	1165875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25038	NC_012004	ATC	2	6	1165882	1165887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25039	NC_012004	T	6	6	1166202	1166207	0 %	100 %	0 %	0 %	222153321
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25043	NC_012004	CAT	2	6	1166490	1166495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222153321
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25098	NC_012004	TAT	3	9	1168997	1169005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25100	NC_012004	ATT	2	6	1169051	1169056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25101	NC_012004	A	6	6	1169078	1169083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25102	NC_012004	TGA	2	6	1169098	1169103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25105	NC_012004	TAA	2	6	1169157	1169162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222153323
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25238	NC_012004	TCT	2	6	1175488	1175493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153329
25239	NC_012004	TTG	2	6	1175500	1175505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222153329
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25263	NC_012004	TG	3	6	1176520	1176525	0 %	50 %	50 %	0 %	222153330
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25354	NC_012004	TA	3	6	1180551	1180556	50 %	50 %	0 %	0 %	222153332
25355	NC_012004	GCA	2	6	1180580	1180585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222153332
25356	NC_012004	TTC	2	6	1180615	1180620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153332
25357	NC_012004	TTTG	2	8	1180632	1180639	0 %	75 %	25 %	0 %	222153332
25358	NC_012004	CCA	2	6	1180664	1180669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222153332
25359	NC_012004	TC	3	6	1180718	1180723	0 %	50 %	0 %	50 %	222153332
25360	NC_012004	CTTT	2	8	1180775	1180782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25361	NC_012004	ACC	2	6	1180789	1180794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25362	NC_012004	AAC	2	6	1180796	1180801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25363	NC_012004	TGC	2	6	1180861	1180866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222153333
25364	NC_012004	CCA	2	6	1180871	1180876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222153333
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25366	NC_012004	TCA	2	6	1180919	1180924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222153333
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25384	NC_012004	GCA	2	6	1181522	1181527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222153333
25385	NC_012004	TGC	2	6	1181548	1181553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222153333
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25388	NC_012004	TTA	2	6	1181687	1181692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25389	NC_012004	T	6	6	1181719	1181724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25390	NC_012004	ACT	2	6	1181731	1181736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25391	NC_012004	TAT	2	6	1181749	1181754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25392	NC_012004	ATC	2	6	1181795	1181800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25393	NC_012004	ATT	2	6	1181814	1181819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222153334
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25418	NC_012004	TC	3	6	1182868	1182873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25419	NC_012004	AAT	2	6	1182895	1182900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222153335
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25459	NC_012004	TCC	2	6	1184920	1184925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25460	NC_012004	T	6	6	1184926	1184931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25461	NC_012004	TTAT	2	8	1184944	1184951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25462	NC_012004	TAT	3	9	1184949	1184957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25463	NC_012004	TGA	2	6	1184968	1184973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25464	NC_012004	TTTA	2	8	1184986	1184993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25465	NC_012004	A	9	9	1184999	1185007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25466	NC_012004	CAT	2	6	1185133	1185138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222153337
25467	NC_012004	GTTT	2	8	1185209	1185216	0 %	75 %	25 %	0 %	222153337
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25469	NC_012004	GATT	2	8	1185257	1185264	25 %	50 %	25 %	0 %	222153337
25470	NC_012004	AGC	2	6	1185382	1185387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222153337
25471	NC_012004	AAC	2	6	1185388	1185393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222153337
25472	NC_012004	TTC	2	6	1185394	1185399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153337
25473	NC_012004	TGT	2	6	1185487	1185492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222153337
25474	NC_012004	TCT	2	6	1185533	1185538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153337
25475	NC_012004	AT	3	6	1185591	1185596	50 %	50 %	0 %	0 %	222153337
25476	NC_012004	AGC	2	6	1185601	1185606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222153337
25477	NC_012004	CT	3	6	1185622	1185627	0 %	50 %	0 %	50 %	222153337
25478	NC_012004	TAA	2	6	1185721	1185726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222153337
25479	NC_012004	T	6	6	1185738	1185743	0 %	100 %	0 %	0 %	222153337
25480	NC_012004	TAC	2	6	1185767	1185772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25481	NC_012004	CAT	2	6	1185779	1185784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25482	NC_012004	ATT	2	6	1185789	1185794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25483	NC_012004	T	6	6	1185809	1185814	0 %	100 %	0 %	0 %	222153338
25484	NC_012004	T	6	6	1185848	1185853	0 %	100 %	0 %	0 %	222153338
25485	NC_012004	AAC	2	6	1185863	1185868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222153338
25486	NC_012004	CAA	2	6	1185973	1185978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222153338
25487	NC_012004	TCA	2	6	1185990	1185995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222153338
25488	NC_012004	TCATA	2	10	1186009	1186018	40 %	40 %	0 %	20 %	222153338
25489	NC_012004	TCC	2	6	1186035	1186040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222153338
25490	NC_012004	CCAT	2	8	1186196	1186203	25 %	25 %	0 %	50 %	222153338
25491	NC_012004	CAT	2	6	1186265	1186270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222153338
25492	NC_012004	TGGC	2	8	1186362	1186369	0 %	25 %	50 %	25 %	222153338
25493	NC_012004	ACC	2	6	1186383	1186388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222153338
25494	NC_012004	AAC	2	6	1186394	1186399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222153338
25495	NC_012004	CTT	2	6	1186453	1186458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153338
25496	NC_012004	TCA	2	6	1186548	1186553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222153338
25497	NC_012004	CAT	2	6	1186586	1186591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222153338
25498	NC_012004	TTC	2	6	1186592	1186597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222153338
25499	NC_012004	GGAA	2	8	1186621	1186628	50 %	0 %	50 %	0 %	222153338
25500	NC_012004	AAG	2	6	1186646	1186651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222153338

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