MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 39857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012004	TG	3	6	21123	21128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012004	AAG	2	6	21129	21134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012004	GAG	2	6	21144	21149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012004	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012004	GTAT	2	8	21325	21332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012004	CTAA	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_012004	ATAC	2	8	21509	21516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_012004	GA	3	6	21570	21575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012004	CT	3	6	21687	21692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_012004	GAT	2	6	21705	21710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012004	CGG	2	6	21796	21801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_012004	GA	3	6	21894	21899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012004	TAGG	2	8	22012	22019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012004	GTT	2	6	22056	22061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012004	TAC	2	6	22066	22071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_012004	CCT	2	6	22154	22159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_012004	CAA	2	6	22250	22255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012004	GGT	2	6	22290	22295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012004	TCG	2	6	22405	22410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_012004	CGT	2	6	22485	22490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_012004	AGGGA	2	10	22623	22632	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012004	C	6	6	22661	22666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_012004	GA	3	6	22709	22714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012004	GAAGTG	2	12	22734	22745	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012004	ACTAAT	2	12	22764	22775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_012004	CTT	2	6	22828	22833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_012004	AGATAT	2	12	22838	22849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012004	AGT	2	6	23044	23049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012004	AGT	2	6	23069	23074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012004	GCTTA	2	10	23106	23115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
531	NC_012004	A	8	8	23315	23322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012004	A	6	6	23526	23531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012004	ACC	2	6	23645	23650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_012004	CGT	2	6	23682	23687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_012004	TAA	2	6	23787	23792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012004	CTC	2	6	23863	23868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_012004	CAT	2	6	23876	23881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_012004	CGC	2	6	24029	24034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_012004	TATT	2	8	24035	24042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012004	GGA	2	6	24141	24146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012004	GCGT	2	8	24200	24207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_012004	TCC	2	6	24224	24229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_012004	AGC	2	6	24251	24256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012004	TCG	2	6	24265	24270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_012004	CGG	2	6	24383	24388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012004	TGT	2	6	24459	24464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012004	TAT	2	6	24508	24513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012004	GGT	2	6	24537	24542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012004	GGT	2	6	24572	24577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012004	ATA	2	6	24704	24709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012004	TGA	2	6	24714	24719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012004	T	14	14	24727	24740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012004	TAA	3	9	24766	24774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152218
554	NC_012004	T	8	8	24785	24792	0 %	100 %	0 %	0 %	222152218
555	NC_012004	T	6	6	24813	24818	0 %	100 %	0 %	0 %	222152218
556	NC_012004	TTTC	2	8	24828	24835	0 %	75 %	0 %	25 %	222152218
557	NC_012004	T	7	7	24880	24886	0 %	100 %	0 %	0 %	222152218
558	NC_012004	ATTAT	2	10	24900	24909	40 %	60 %	0 %	0 %	222152218
559	NC_012004	GTT	2	6	24926	24931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152218
560	NC_012004	ATT	2	6	25103	25108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152218
561	NC_012004	AAT	2	6	25150	25155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152218
562	NC_012004	TCA	2	6	25172	25177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152218
563	NC_012004	TTA	2	6	25179	25184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152218
564	NC_012004	ACTA	2	8	25267	25274	50 %	25 %	0 %	25 %	222152218
565	NC_012004	AT	3	6	25325	25330	50 %	50 %	0 %	0 %	222152218
566	NC_012004	ATCAT	2	10	25342	25351	40 %	40 %	0 %	20 %	222152218
567	NC_012004	TCT	2	6	25373	25378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152218
568	NC_012004	GAAAA	2	10	25504	25513	80 %	0 %	20 %	0 %	222152218
569	NC_012004	TGA	2	6	25540	25545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152218
570	NC_012004	TTA	2	6	25628	25633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152219
571	NC_012004	T	7	7	25716	25722	0 %	100 %	0 %	0 %	222152219
572	NC_012004	TAT	2	6	25765	25770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152219
573	NC_012004	ATT	4	12	25788	25799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152219
574	NC_012004	T	6	6	25804	25809	0 %	100 %	0 %	0 %	222152219
575	NC_012004	A	7	7	25862	25868	100 %	0 %	0 %	0 %	222152219
576	NC_012004	TTTA	3	12	25921	25932	25 %	75 %	0 %	0 %	222152219
577	NC_012004	TCT	3	9	25948	25956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152219
578	NC_012004	ATC	2	6	25962	25967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152219
579	NC_012004	CTTT	2	8	25985	25992	0 %	75 %	0 %	25 %	222152219
580	NC_012004	T	6	6	26008	26013	0 %	100 %	0 %	0 %	222152219
581	NC_012004	CTT	2	6	26016	26021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152219
582	NC_012004	T	6	6	26024	26029	0 %	100 %	0 %	0 %	222152219
583	NC_012004	T	7	7	26072	26078	0 %	100 %	0 %	0 %	222152219
584	NC_012004	ATT	2	6	26083	26088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152219
585	NC_012004	T	7	7	26169	26175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012004	GTG	2	6	26213	26218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152220
587	NC_012004	CAA	2	6	26234	26239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152220
588	NC_012004	ATC	2	6	26287	26292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152220
589	NC_012004	GCT	2	6	26314	26319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152220
590	NC_012004	TTG	2	6	26459	26464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152220
591	NC_012004	ACAT	2	8	26524	26531	50 %	25 %	0 %	25 %	222152220
592	NC_012004	TGT	2	6	26565	26570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152220
593	NC_012004	TGCTAA	2	12	26604	26615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222152220
594	NC_012004	CAA	2	6	26626	26631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152220
595	NC_012004	GAA	2	6	26653	26658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152220
596	NC_012004	AGC	2	6	26664	26669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
597	NC_012004	AAG	2	6	26675	26680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152220
598	NC_012004	ACA	2	6	26742	26747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152220
599	NC_012004	GCA	2	6	26779	26784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
600	NC_012004	CTG	2	6	26795	26800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152220
601	NC_012004	TCT	2	6	26817	26822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152220
602	NC_012004	AGA	2	6	26832	26837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152220
603	NC_012004	AGAAGC	2	12	26847	26858	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222152220
604	NC_012004	GCA	2	6	26860	26865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
605	NC_012004	CAAGCA	2	12	26872	26883	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222152220
606	NC_012004	GCA	2	6	26890	26895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
607	NC_012004	GCA	2	6	26902	26907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
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610	NC_012004	CTG	2	6	26969	26974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152220
611	NC_012004	GCT	2	6	26986	26991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152220
612	NC_012004	CTG	2	6	26993	26998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152220
613	NC_012004	GCA	2	6	27049	27054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
614	NC_012004	CAG	2	6	27068	27073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
615	NC_012004	GCA	2	6	27085	27090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
616	NC_012004	ATAC	2	8	27131	27138	50 %	25 %	0 %	25 %	222152220
617	NC_012004	TGG	2	6	27204	27209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152220
618	NC_012004	GCA	4	12	27226	27237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
619	NC_012004	TGG	3	9	27288	27296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152220
620	NC_012004	ATC	2	6	27330	27335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152220
621	NC_012004	TGGT	2	8	27396	27403	0 %	50 %	50 %	0 %	222152220
622	NC_012004	CAACAT	2	12	27410	27421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222152220
623	NC_012004	GCA	2	6	27430	27435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152220
624	NC_012004	TA	3	6	27437	27442	50 %	50 %	0 %	0 %	222152220
625	NC_012004	T	7	7	27481	27487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012004	A	6	6	27510	27515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012004	GGA	2	6	27555	27560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012004	A	6	6	27560	27565	100 %	0 %	0 %	0 %	222152221
629	NC_012004	GTT	2	6	27585	27590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152221
630	NC_012004	GTC	2	6	27597	27602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152221
631	NC_012004	CAT	2	6	27629	27634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152221
632	NC_012004	TCA	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152221
633	NC_012004	TGG	2	6	27788	27793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152221
634	NC_012004	CAGT	2	8	27821	27828	25 %	25 %	25 %	25 %	222152221
635	NC_012004	TGC	2	6	27960	27965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152221
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645	NC_012004	CTG	2	6	28250	28255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152221
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653	NC_012004	T	7	7	28545	28551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_012004	TAA	2	6	28585	28590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_012004	TAT	2	6	28594	28599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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657	NC_012004	TAA	2	6	28635	28640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152222
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661	NC_012004	CTTA	2	8	28870	28877	25 %	50 %	0 %	25 %	222152222
662	NC_012004	CT	3	6	28922	28927	0 %	50 %	0 %	50 %	222152222
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