MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 39857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012004	A	6	6	258598	258603	100 %	0 %	0 %	0 %	222152451
5502	NC_012004	TCA	2	6	258646	258651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152451
5503	NC_012004	TTTG	2	8	258656	258663	0 %	75 %	25 %	0 %	222152451
5504	NC_012004	T	6	6	258683	258688	0 %	100 %	0 %	0 %	222152451
5505	NC_012004	TTC	2	6	258690	258695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152451
5506	NC_012004	ATA	2	6	258748	258753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152451
5507	NC_012004	CAT	2	6	258792	258797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152451
5508	NC_012004	TTG	2	6	258816	258821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152451
5509	NC_012004	T	6	6	258858	258863	0 %	100 %	0 %	0 %	222152451
5510	NC_012004	CATTAA	2	12	258864	258875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222152451
5511	NC_012004	AATTTT	2	12	258940	258951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152451
5512	NC_012004	CGTT	2	8	258994	259001	0 %	50 %	25 %	25 %	222152451
5513	NC_012004	AT	3	6	259033	259038	50 %	50 %	0 %	0 %	222152451
5514	NC_012004	CCT	2	6	259056	259061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_012004	CT	3	6	259060	259065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_012004	TCT	2	6	259087	259092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152452
5517	NC_012004	ATAG	2	8	259108	259115	50 %	25 %	25 %	0 %	222152452
5518	NC_012004	TAA	2	6	259178	259183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152452
5519	NC_012004	CCA	2	6	259240	259245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152452
5520	NC_012004	T	7	7	259249	259255	0 %	100 %	0 %	0 %	222152452
5521	NC_012004	T	6	6	259271	259276	0 %	100 %	0 %	0 %	222152452
5522	NC_012004	T	7	7	259332	259338	0 %	100 %	0 %	0 %	222152452
5523	NC_012004	GCC	2	6	259367	259372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222152452
5524	NC_012004	T	6	6	259427	259432	0 %	100 %	0 %	0 %	222152452
5525	NC_012004	CAC	2	6	259576	259581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152452
5526	NC_012004	CTT	2	6	259618	259623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152452
5527	NC_012004	CTT	2	6	259648	259653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152452
5528	NC_012004	TAA	2	6	259664	259669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152452
5529	NC_012004	CTT	2	6	259699	259704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152452
5530	NC_012004	AAG	2	6	259738	259743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152452
5531	NC_012004	ATGG	2	8	259757	259764	25 %	25 %	50 %	0 %	222152452
5532	NC_012004	CAA	2	6	259774	259779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152452
5533	NC_012004	GAA	2	6	259800	259805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152452
5534	NC_012004	T	6	6	259883	259888	0 %	100 %	0 %	0 %	222152452
5535	NC_012004	ATA	2	6	259894	259899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152452
5536	NC_012004	T	6	6	259910	259915	0 %	100 %	0 %	0 %	222152452
5537	NC_012004	CAA	2	6	259960	259965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152452
5538	NC_012004	TAT	2	6	259998	260003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_012004	AAAT	2	8	260010	260017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_012004	ATT	2	6	260120	260125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152453
5541	NC_012004	CTT	2	6	260126	260131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152453
5542	NC_012004	AAT	2	6	260196	260201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152453
5543	NC_012004	GTT	2	6	260216	260221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152453
5544	NC_012004	GTT	2	6	260298	260303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152453
5545	NC_012004	TTG	2	6	260376	260381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152453
5546	NC_012004	T	8	8	260443	260450	0 %	100 %	0 %	0 %	222152453
5547	NC_012004	AAGT	2	8	260473	260480	50 %	25 %	25 %	0 %	222152453
5548	NC_012004	T	7	7	260674	260680	0 %	100 %	0 %	0 %	222152453
5549	NC_012004	AGC	2	6	260686	260691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152453
5550	NC_012004	A	7	7	260721	260727	100 %	0 %	0 %	0 %	222152453
5551	NC_012004	TAG	2	6	260748	260753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152453
5552	NC_012004	TTTA	2	8	260754	260761	25 %	75 %	0 %	0 %	222152453
5553	NC_012004	T	6	6	260793	260798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_012004	TAAA	2	8	260851	260858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_012004	A	6	6	260899	260904	100 %	0 %	0 %	0 %	222152454
5556	NC_012004	CTA	2	6	260910	260915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
5557	NC_012004	CT	3	6	260919	260924	0 %	50 %	0 %	50 %	222152454
5558	NC_012004	ATG	2	6	260928	260933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152454
5559	NC_012004	ATG	2	6	260970	260975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152454
5560	NC_012004	TCC	2	6	261033	261038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152454
5561	NC_012004	ATC	2	6	261072	261077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
5562	NC_012004	CCTA	2	8	261082	261089	25 %	25 %	0 %	50 %	222152454
5563	NC_012004	ATC	2	6	261102	261107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
5564	NC_012004	AGG	2	6	261134	261139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152454
5565	NC_012004	TCA	2	6	261214	261219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
5566	NC_012004	CAT	2	6	261236	261241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
5567	NC_012004	CTC	2	6	261290	261295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152454
5568	NC_012004	TTC	2	6	261311	261316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152454
5569	NC_012004	TTGG	2	8	261352	261359	0 %	50 %	50 %	0 %	222152454
5570	NC_012004	CTTTG	2	10	261383	261392	0 %	60 %	20 %	20 %	222152454
5571	NC_012004	CT	3	6	261403	261408	0 %	50 %	0 %	50 %	222152454
5572	NC_012004	CA	3	6	261458	261463	50 %	0 %	0 %	50 %	222152454
5573	NC_012004	TCA	2	6	261541	261546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
5574	NC_012004	A	6	6	261583	261588	100 %	0 %	0 %	0 %	222152454
5575	NC_012004	AAG	2	6	261607	261612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152454
5576	NC_012004	TGA	2	6	261631	261636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152454
5577	NC_012004	T	6	6	261695	261700	0 %	100 %	0 %	0 %	222152454
5578	NC_012004	GCT	2	6	261750	261755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152454
5579	NC_012004	A	6	6	261844	261849	100 %	0 %	0 %	0 %	222152454
5580	NC_012004	ACC	2	6	261851	261856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152454
5581	NC_012004	CAA	2	6	261874	261879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152454
5582	NC_012004	GGC	2	6	261912	261917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222152454
5583	NC_012004	T	6	6	261937	261942	0 %	100 %	0 %	0 %	222152454
5584	NC_012004	TCA	2	6	261950	261955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
5585	NC_012004	CTG	2	6	261987	261992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152454
5586	NC_012004	AC	3	6	262119	262124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_012004	A	7	7	262174	262180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_012004	A	8	8	262210	262217	100 %	0 %	0 %	0 %	222152455
5589	NC_012004	ATC	2	6	262222	262227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152455
5590	NC_012004	TACT	2	8	262283	262290	25 %	50 %	0 %	25 %	222152455
5591	NC_012004	A	6	6	262330	262335	100 %	0 %	0 %	0 %	222152455
5592	NC_012004	TGA	2	6	262358	262363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152455
5593	NC_012004	A	7	7	262363	262369	100 %	0 %	0 %	0 %	222152455
5594	NC_012004	CGT	2	6	262378	262383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152455
5595	NC_012004	CGT	2	6	262402	262407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152455
5596	NC_012004	CGT	2	6	262453	262458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152455
5597	NC_012004	CGT	2	6	262486	262491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_012004	TGC	2	6	262529	262534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_012004	TA	4	8	262577	262584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_012004	TTC	2	6	262586	262591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_012004	T	6	6	262738	262743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_012004	TA	3	6	262767	262772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_012004	TTC	2	6	262774	262779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_012004	T	7	7	262904	262910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_012004	T	7	7	262922	262928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_012004	T	7	7	262964	262970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_012004	TCT	2	6	262974	262979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_012004	ACG	2	6	263066	263071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_012004	GAAAG	2	10	263159	263168	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_012004	TTC	2	6	263186	263191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_012004	AAAC	2	8	263213	263220	75 %	0 %	0 %	25 %	222152456
5612	NC_012004	GTT	2	6	263252	263257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152456
5613	NC_012004	GCT	2	6	263330	263335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152456
5614	NC_012004	A	7	7	263345	263351	100 %	0 %	0 %	0 %	222152456
5615	NC_012004	GAA	2	6	263390	263395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152456
5616	NC_012004	A	6	6	263394	263399	100 %	0 %	0 %	0 %	222152456
5617	NC_012004	GGT	2	6	263423	263428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152456
5618	NC_012004	TTCT	2	8	263550	263557	0 %	75 %	0 %	25 %	222152456
5619	NC_012004	ATG	2	6	263559	263564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152456
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5621	NC_012004	ATC	2	6	263684	263689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152456
5622	NC_012004	AAG	2	6	263748	263753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152456
5623	NC_012004	AGA	2	6	263791	263796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152456
5624	NC_012004	CAT	2	6	263797	263802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152456
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5626	NC_012004	GAA	2	6	263858	263863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152456
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