MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

Total Repeats: 45632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011900	AAG	2	6	23498	23503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011900	T	7	7	23518	23524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011900	ATA	2	6	23544	23549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011900	TA	3	6	23552	23557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011900	T	6	6	23621	23626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011900	TTG	2	6	23680	23685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011900	T	6	6	23732	23737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011900	A	6	6	23754	23759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011900	A	6	6	23785	23790	100 %	0 %	0 %	0 %	221230964
510	NC_011900	GAA	2	6	23826	23831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230964
511	NC_011900	TAT	2	6	23895	23900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230964
512	NC_011900	TTG	2	6	24008	24013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230964
513	NC_011900	GAT	2	6	24060	24065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011900	T	6	6	24095	24100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011900	TCT	2	6	24133	24138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011900	T	6	6	24153	24158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011900	TAA	2	6	24163	24168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011900	ATGT	2	8	24203	24210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011900	GTT	3	9	24254	24262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230965
520	NC_011900	TGA	2	6	24280	24285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230965
521	NC_011900	GGT	2	6	24347	24352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221230965
522	NC_011900	TTC	2	6	24422	24427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221230965
523	NC_011900	A	6	6	24432	24437	100 %	0 %	0 %	0 %	221230965
524	NC_011900	ATGGT	2	10	24453	24462	20 %	40 %	40 %	0 %	221230965
525	NC_011900	AAC	2	6	24517	24522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221230965
526	NC_011900	AAG	3	9	24591	24599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230965
527	NC_011900	GCT	2	6	24662	24667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230965
528	NC_011900	GAT	2	6	24791	24796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230965
529	NC_011900	GAA	2	6	24803	24808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230965
530	NC_011900	CAA	2	6	24824	24829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221230965
531	NC_011900	GATA	2	8	24844	24851	50 %	25 %	25 %	0 %	221230965
532	NC_011900	ATG	2	6	24867	24872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230965
533	NC_011900	TCA	2	6	24959	24964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230965
534	NC_011900	TGG	2	6	24976	24981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221230965
535	NC_011900	CAAG	2	8	25008	25015	50 %	0 %	25 %	25 %	221230965
536	NC_011900	GTT	2	6	25084	25089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230965
537	NC_011900	TGA	2	6	25090	25095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230965
538	NC_011900	ACA	2	6	25136	25141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221230965
539	NC_011900	GTC	2	6	25146	25151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230965
540	NC_011900	CGT	2	6	25154	25159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230965
541	NC_011900	GGTT	2	8	25163	25170	0 %	50 %	50 %	0 %	221230965
542	NC_011900	CGT	2	6	25196	25201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230965
543	NC_011900	CTTT	2	8	25220	25227	0 %	75 %	0 %	25 %	221230965
544	NC_011900	TG	3	6	25271	25276	0 %	50 %	50 %	0 %	221230965
545	NC_011900	ACT	2	6	25305	25310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230965
546	NC_011900	CTAT	2	8	25347	25354	25 %	50 %	0 %	25 %	221230965
547	NC_011900	AGA	2	6	25375	25380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230965
548	NC_011900	TCG	2	6	25435	25440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230965
549	NC_011900	TTGG	2	8	25451	25458	0 %	50 %	50 %	0 %	221230965
550	NC_011900	AACA	2	8	25497	25504	75 %	0 %	0 %	25 %	221230965
551	NC_011900	AAG	2	6	25583	25588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011900	CCT	2	6	25590	25595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_011900	TTG	2	6	25599	25604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011900	CTTTT	2	10	25621	25630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
555	NC_011900	ATA	2	6	25633	25638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011900	CTT	2	6	25669	25674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011900	ATA	3	9	25694	25702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011900	TAT	2	6	25735	25740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230966
559	NC_011900	GAA	2	6	25747	25752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230966
560	NC_011900	AAG	2	6	25754	25759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230966
561	NC_011900	GAGG	2	8	25767	25774	25 %	0 %	75 %	0 %	221230966
562	NC_011900	GA	3	6	25779	25784	50 %	0 %	50 %	0 %	221230966
563	NC_011900	TG	3	6	25825	25830	0 %	50 %	50 %	0 %	221230966
564	NC_011900	AGCG	2	8	25886	25893	25 %	0 %	50 %	25 %	221230966
565	NC_011900	ATGC	2	8	25897	25904	25 %	25 %	25 %	25 %	221230966
566	NC_011900	TGAG	2	8	25934	25941	25 %	25 %	50 %	0 %	221230966
567	NC_011900	GCT	2	6	26068	26073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230966
568	NC_011900	ATC	2	6	26111	26116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230966
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570	NC_011900	A	6	6	26191	26196	100 %	0 %	0 %	0 %	221230966
571	NC_011900	ATA	2	6	26230	26235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011900	GGA	2	6	26273	26278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011900	CAG	2	6	26282	26287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011900	TG	3	6	26305	26310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011900	T	6	6	26314	26319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011900	TTTG	2	8	26363	26370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011900	T	6	6	26452	26457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011900	ATG	2	6	26517	26522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011900	ATGT	2	8	26575	26582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011900	T	7	7	26592	26598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011900	T	6	6	26608	26613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011900	TGA	2	6	26674	26679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011900	TAT	2	6	26717	26722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011900	ATA	2	6	26733	26738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_011900	TTTC	2	8	27026	27033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_011900	TCG	2	6	27039	27044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011900	CAA	2	6	27070	27075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011900	CATTT	2	10	27080	27089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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592	NC_011900	TAA	2	6	27206	27211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_011900	T	7	7	27469	27475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011900	TC	3	6	27502	27507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_011900	A	6	6	27508	27513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_011900	T	7	7	27596	27602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011900	T	8	8	27708	27715	0 %	100 %	0 %	0 %	221230967
606	NC_011900	T	6	6	27742	27747	0 %	100 %	0 %	0 %	221230967
607	NC_011900	AGCA	2	8	27826	27833	50 %	0 %	25 %	25 %	221230967
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615	NC_011900	TTG	2	6	28148	28153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230967
616	NC_011900	TGA	2	6	28174	28179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230967
617	NC_011900	TATCAA	2	12	28188	28199	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	221230967
618	NC_011900	TGA	2	6	28218	28223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230967
619	NC_011900	TAG	2	6	28359	28364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230967
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621	NC_011900	ATATC	2	10	28538	28547	40 %	40 %	0 %	20 %	221230967
622	NC_011900	GAA	2	6	28558	28563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230967
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625	NC_011900	T	7	7	28686	28692	0 %	100 %	0 %	0 %	221230968
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631	NC_011900	TGT	2	6	28935	28940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230968
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634	NC_011900	GAC	2	6	29126	29131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230969
635	NC_011900	GAT	2	6	29156	29161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230969
636	NC_011900	AGGAT	2	10	29266	29275	40 %	20 %	40 %	0 %	221230969
637	NC_011900	T	6	6	29300	29305	0 %	100 %	0 %	0 %	221230969
638	NC_011900	T	6	6	29321	29326	0 %	100 %	0 %	0 %	221230969
639	NC_011900	GCT	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230970
640	NC_011900	GTC	2	6	29485	29490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230970
641	NC_011900	GTTT	2	8	29520	29527	0 %	75 %	25 %	0 %	221230970
642	NC_011900	T	7	7	29549	29555	0 %	100 %	0 %	0 %	221230970
643	NC_011900	TGATAG	2	12	29565	29576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230970
644	NC_011900	ATC	2	6	29637	29642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230971
645	NC_011900	GCT	3	9	29680	29688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230971
646	NC_011900	TCA	2	6	29728	29733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230971
647	NC_011900	AAT	2	6	29792	29797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221230971
648	NC_011900	T	6	6	29836	29841	0 %	100 %	0 %	0 %	221230971
649	NC_011900	TCT	3	9	29875	29883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221230971
650	NC_011900	T	6	6	29908	29913	0 %	100 %	0 %	0 %	221230971
651	NC_011900	T	6	6	29927	29932	0 %	100 %	0 %	0 %	221230971
652	NC_011900	A	8	8	29977	29984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_011900	T	6	6	30039	30044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_011900	A	7	7	30062	30068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_011900	AAAT	2	8	30077	30084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
656	NC_011900	TAT	2	6	30132	30137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
657	NC_011900	GTT	2	6	30203	30208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
658	NC_011900	AGG	2	6	30231	30236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
659	NC_011900	ACC	2	6	30283	30288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221230972
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662	NC_011900	CAT	2	6	30401	30406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_011900	TGCT	2	8	30422	30429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
664	NC_011900	TTATA	2	10	30475	30484	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_011900	AGA	2	6	30493	30498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
666	NC_011900	AAGAAA	2	12	30499	30510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
667	NC_011900	A	6	6	30580	30585	100 %	0 %	0 %	0 %	221230973
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670	NC_011900	AGTT	2	8	30798	30805	25 %	50 %	25 %	0 %	221230974
671	NC_011900	A	7	7	30846	30852	100 %	0 %	0 %	0 %	221230974
672	NC_011900	AGA	2	6	30877	30882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230974
673	NC_011900	AGG	2	6	30936	30941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221230974
674	NC_011900	TA	3	6	30964	30969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_011900	T	6	6	31023	31028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_011900	T	6	6	31098	31103	0 %	100 %	0 %	0 %	221230975
677	NC_011900	GGAG	2	8	31129	31136	25 %	0 %	75 %	0 %	221230975
678	NC_011900	TCC	2	6	31266	31271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
679	NC_011900	TAT	2	6	31306	31311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
680	NC_011900	GAA	2	6	31347	31352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
681	NC_011900	CA	3	6	31354	31359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
682	NC_011900	TAC	2	6	31372	31377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
683	NC_011900	GAA	2	6	31410	31415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
684	NC_011900	TAC	2	6	31492	31497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
685	NC_011900	AAG	2	6	31508	31513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
686	NC_011900	CGGA	2	8	31547	31554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
687	NC_011900	TAC	2	6	31564	31569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
688	NC_011900	TAAA	2	8	31638	31645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
689	NC_011900	CAGGCT	2	12	31680	31691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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691	NC_011900	TTC	2	6	31714	31719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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694	NC_011900	GAG	2	6	31746	31751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
695	NC_011900	TAT	2	6	31763	31768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
696	NC_011900	TAA	2	6	31789	31794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
697	NC_011900	T	6	6	31808	31813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
698	NC_011900	ATT	2	6	31815	31820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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703	NC_011900	AT	3	6	32073	32078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
704	NC_011900	TTTTG	2	10	32220	32229	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
705	NC_011900	TATC	2	8	32289	32296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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708	NC_011900	ATTAT	2	10	32361	32370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
709	NC_011900	TGA	2	6	32401	32406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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712	NC_011900	A	6	6	32473	32478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
713	NC_011900	TATCG	2	10	32537	32546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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717	NC_011900	AATA	2	8	32587	32594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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719	NC_011900	ATA	2	6	32619	32624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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739	NC_011900	TCT	2	6	33703	33708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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768	NC_011900	GAA	2	6	35571	35576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
769	NC_011900	TATTT	2	10	35583	35592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_011900	TTTTA	2	10	35595	35604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_011900	ACGG	2	8	35644	35651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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