MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011668	TCGCT	2	10	89	98	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011668	TTCGC	2	10	335	344	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011668	CAAAA	2	10	540	549	80 %	0 %	0 %	20 %	217980265
4	NC_011668	CAATA	2	10	3671	3680	60 %	20 %	0 %	20 %	217980267
5	NC_011668	TTTAT	2	10	3941	3950	20 %	80 %	0 %	0 %	217980268
6	NC_011668	CTGTT	2	10	6152	6161	0 %	60 %	20 %	20 %	217980268
7	NC_011668	GCTGT	2	10	7375	7384	0 %	40 %	40 %	20 %	217980268
8	NC_011668	TTCTT	2	10	9719	9728	0 %	80 %	0 %	20 %	217980268
9	NC_011668	GCCGC	2	10	9746	9755	0 %	0 %	40 %	60 %	217980268
10	NC_011668	TCGTG	2	10	10404	10413	0 %	40 %	40 %	20 %	217980270
11	NC_011668	TGCTT	2	10	10590	10599	0 %	60 %	20 %	20 %	217980271
12	NC_011668	TGCGC	2	10	10936	10945	0 %	20 %	40 %	40 %	217980272
13	NC_011668	TGGTT	2	10	11944	11953	0 %	60 %	40 %	0 %	217980272
14	NC_011668	CACAC	2	10	12094	12103	40 %	0 %	0 %	60 %	217980272
15	NC_011668	ATAGC	2	10	12704	12713	40 %	20 %	20 %	20 %	217980272
16	NC_011668	TTTTG	2	10	15319	15328	0 %	80 %	20 %	0 %	217980274
17	NC_011668	GCCTT	2	10	17303	17312	0 %	40 %	20 %	40 %	217980275
18	NC_011668	TGGTT	2	10	19915	19924	0 %	60 %	40 %	0 %	217980279
19	NC_011668	CTTTG	2	10	22193	22202	0 %	60 %	20 %	20 %	217980281
20	NC_011668	AAATG	2	10	23287	23296	60 %	20 %	20 %	0 %	217980282
21	NC_011668	TGCCA	2	10	25401	25410	20 %	20 %	20 %	40 %	217980285
22	NC_011668	CTTCT	2	10	26081	26090	0 %	60 %	0 %	40 %	217980285
23	NC_011668	ATGGC	2	10	29705	29714	20 %	20 %	40 %	20 %	217980288
24	NC_011668	GACGA	2	10	30110	30119	40 %	0 %	40 %	20 %	217980289
25	NC_011668	TGTTT	2	10	30166	30175	0 %	80 %	20 %	0 %	217980289
26	NC_011668	GAAAA	2	10	34183	34192	80 %	0 %	20 %	0 %	217980295
27	NC_011668	GAGTT	2	10	37821	37830	20 %	40 %	40 %	0 %	217980298
28	NC_011668	TGTTC	2	10	37985	37994	0 %	60 %	20 %	20 %	217980298
29	NC_011668	GATCT	2	10	40409	40418	20 %	40 %	20 %	20 %	217980300
30	NC_011668	CTGGA	2	10	40860	40869	20 %	20 %	40 %	20 %	217980300
31	NC_011668	GCTTT	2	10	42100	42109	0 %	60 %	20 %	20 %	217980301
32	NC_011668	AAAGC	2	10	49573	49582	60 %	0 %	20 %	20 %	217980311
33	NC_011668	AAGCA	2	10	49757	49766	60 %	0 %	20 %	20 %	217980311
34	NC_011668	TGATT	2	10	53185	53194	20 %	60 %	20 %	0 %	217980315
35	NC_011668	AGGAT	2	10	53597	53606	40 %	20 %	40 %	0 %	217980315
36	NC_011668	TTCTT	2	10	55360	55369	0 %	80 %	0 %	20 %	217980316
37	NC_011668	TTAGA	2	10	55706	55715	40 %	40 %	20 %	0 %	217980316
38	NC_011668	CAACA	2	10	57005	57014	60 %	0 %	0 %	40 %	217980317
39	NC_011668	AACCC	2	10	57314	57323	40 %	0 %	0 %	60 %	217980318
40	NC_011668	ACGAT	2	10	58334	58343	40 %	20 %	20 %	20 %	217980318
41	NC_011668	AAAGC	2	10	61374	61383	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011668	CAGTT	2	10	61777	61786	20 %	40 %	20 %	20 %	217980321
43	NC_011668	AGCCA	2	10	62495	62504	40 %	0 %	20 %	40 %	217980322
44	NC_011668	CTTGT	2	10	64043	64052	0 %	60 %	20 %	20 %	217980322

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.