MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 99024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011566	TTA	2	6	107903	107908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633004
2003	NC_011566	GAT	2	6	107984	107989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633004
2004	NC_011566	GTT	2	6	107998	108003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633004
2005	NC_011566	TGA	2	6	108058	108063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633004
2006	NC_011566	GATG	2	8	108136	108143	25 %	25 %	50 %	0 %	212633004
2007	NC_011566	TA	4	8	108219	108226	50 %	50 %	0 %	0 %	212633004
2008	NC_011566	GAT	2	6	108254	108259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633004
2009	NC_011566	TGAG	2	8	108315	108322	25 %	25 %	50 %	0 %	212633004
2010	NC_011566	GAT	2	6	108386	108391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633004
2011	NC_011566	A	6	6	108423	108428	100 %	0 %	0 %	0 %	212633004
2012	NC_011566	AGC	2	6	108486	108491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633004
2013	NC_011566	TGC	2	6	108502	108507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633004
2014	NC_011566	AAT	2	6	108518	108523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633004
2015	NC_011566	GCA	2	6	108535	108540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633004
2016	NC_011566	CAA	2	6	108657	108662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633004
2017	NC_011566	TGTA	2	8	108686	108693	25 %	50 %	25 %	0 %	212633004
2018	NC_011566	ACC	2	6	108777	108782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633004
2019	NC_011566	TGA	2	6	108841	108846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633004
2020	NC_011566	CAA	2	6	108850	108855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633004
2021	NC_011566	AAC	2	6	108913	108918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633004
2022	NC_011566	GAT	2	6	108934	108939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633004
2023	NC_011566	TGG	2	6	108960	108965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633004
2024	NC_011566	TGC	2	6	109063	109068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633004
2025	NC_011566	GCAA	2	8	109110	109117	50 %	0 %	25 %	25 %	212633004
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2030	NC_011566	TCACCG	2	12	109402	109413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212633005
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2035	NC_011566	ATG	2	6	110008	110013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633005
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2039	NC_011566	GTA	2	6	110297	110302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633005
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2044	NC_011566	TCGGT	2	10	110482	110491	0 %	40 %	40 %	20 %	212633005
2045	NC_011566	AC	3	6	110522	110527	50 %	0 %	0 %	50 %	212633005
2046	NC_011566	GTTG	2	8	110554	110561	0 %	50 %	50 %	0 %	212633005
2047	NC_011566	TCA	3	9	110584	110592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633005
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2049	NC_011566	TAGT	2	8	110708	110715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_011566	TGC	2	6	110721	110726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_011566	CATC	2	8	110745	110752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_011566	ACA	2	6	110762	110767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_011566	GTTGA	2	10	110770	110779	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_011566	TAA	2	6	110818	110823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_011566	TGC	2	6	110866	110871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_011566	AATC	2	8	110879	110886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2057	NC_011566	ACT	2	6	110979	110984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2059	NC_011566	TTA	2	6	111088	111093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_011566	AAGC	2	8	111134	111141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2061	NC_011566	TTG	2	6	111334	111339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_011566	AT	4	8	111387	111394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_011566	AGCGT	2	10	111415	111424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2064	NC_011566	ATA	2	6	111442	111447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_011566	TGG	2	6	111454	111459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2072	NC_011566	CT	3	6	111727	111732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2073	NC_011566	TA	4	8	111734	111741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_011566	AAT	2	6	111747	111752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_011566	TAAT	2	8	111774	111781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2084	NC_011566	TGA	2	6	112277	112282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633007
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2087	NC_011566	T	7	7	112539	112545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_011566	GCG	2	6	112563	112568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2096	NC_011566	TGA	2	6	113098	113103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633008
2097	NC_011566	CAAAG	2	10	113128	113137	60 %	0 %	20 %	20 %	212633008
2098	NC_011566	GCTC	2	8	113150	113157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2099	NC_011566	T	6	6	113193	113198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_011566	ATGG	2	8	113277	113284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_011566	ATGG	2	8	113327	113334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_011566	ATGG	2	8	113377	113384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_011566	AGC	2	6	113397	113402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2122	NC_011566	TGC	2	6	114754	114759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633010
2123	NC_011566	GAT	2	6	114779	114784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_011566	GCTT	2	8	114794	114801	0 %	50 %	25 %	25 %	212633011
2125	NC_011566	GTC	2	6	114839	114844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633011
2126	NC_011566	ATC	2	6	114872	114877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633011
2127	NC_011566	ACC	2	6	114971	114976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633011
2128	NC_011566	GCAA	2	8	114983	114990	50 %	0 %	25 %	25 %	212633011
2129	NC_011566	AT	3	6	114999	115004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_011566	ATTG	2	8	115063	115070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_011566	GTT	2	6	115160	115165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_011566	T	6	6	115374	115379	0 %	100 %	0 %	0 %	212633012
2133	NC_011566	ACA	2	6	115460	115465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633012
2134	NC_011566	GCTG	2	8	115555	115562	0 %	25 %	50 %	25 %	212633012
2135	NC_011566	CAT	2	6	115573	115578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633012
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2138	NC_011566	CAT	3	9	115693	115701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633012
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2140	NC_011566	AAAT	2	8	115938	115945	75 %	25 %	0 %	0 %	212633012
2141	NC_011566	TCG	2	6	115965	115970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633012
2142	NC_011566	ATC	2	6	116212	116217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633012
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2145	NC_011566	CA	3	6	116379	116384	50 %	0 %	0 %	50 %	212633012
2146	NC_011566	CAG	2	6	116386	116391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633012
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2149	NC_011566	TTG	2	6	116506	116511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2150	NC_011566	TGTGC	2	10	116516	116525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2151	NC_011566	TAT	2	6	116541	116546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2152	NC_011566	CAT	2	6	116553	116558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633013
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2154	NC_011566	TTG	2	6	116624	116629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633013
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2158	NC_011566	TGG	2	6	116841	116846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633013
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2165	NC_011566	TTG	2	6	117315	117320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633014
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2232	NC_011566	TGG	2	6	121479	121484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633017
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2238	NC_011566	GTT	2	6	121858	121863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2239	NC_011566	TTGA	2	8	121956	121963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2240	NC_011566	TTG	2	6	121997	122002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633019
2241	NC_011566	TGT	3	9	122009	122017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633019
2242	NC_011566	T	6	6	122045	122050	0 %	100 %	0 %	0 %	212633019
2243	NC_011566	T	8	8	122084	122091	0 %	100 %	0 %	0 %	212633019
2244	NC_011566	CAA	2	6	122236	122241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_011566	GCGAT	2	10	122255	122264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2246	NC_011566	TTA	2	6	122437	122442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633020
2247	NC_011566	GTT	2	6	122455	122460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633020
2248	NC_011566	CTAT	2	8	122465	122472	25 %	50 %	0 %	25 %	212633020
2249	NC_011566	GCT	2	6	122494	122499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633020
2250	NC_011566	GCT	2	6	122664	122669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633020
2251	NC_011566	A	6	6	122708	122713	100 %	0 %	0 %	0 %	212633020
2252	NC_011566	TGA	2	6	122733	122738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633020
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2269	NC_011566	AAC	2	6	124017	124022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2270	NC_011566	T	8	8	124044	124051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2276	NC_011566	TA	3	6	124383	124388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2346	NC_011566	TGC	2	6	128379	128384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633029
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2351	NC_011566	CGA	2	6	128866	128871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2353	NC_011566	A	7	7	128958	128964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2354	NC_011566	TCA	2	6	129033	129038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2358	NC_011566	ATC	2	6	129129	129134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633030
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2367	NC_011566	TTC	2	6	129607	129612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633030
2368	NC_011566	TGAG	2	8	129629	129636	25 %	25 %	50 %	0 %	212633030
2369	NC_011566	CGTCAT	2	12	129674	129685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212633030
2370	NC_011566	TGT	2	6	129694	129699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633030
2371	NC_011566	T	6	6	129761	129766	0 %	100 %	0 %	0 %	212633030
2372	NC_011566	GGTTG	2	10	129774	129783	0 %	40 %	60 %	0 %	212633030
2373	NC_011566	TGT	2	6	129792	129797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633030
2374	NC_011566	AGC	2	6	129888	129893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633030
2375	NC_011566	CAT	2	6	129899	129904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633030
2376	NC_011566	TATC	2	8	129920	129927	25 %	50 %	0 %	25 %	212633030
2377	NC_011566	CGA	2	6	129948	129953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633030
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2379	NC_011566	AGGC	2	8	129997	130004	25 %	0 %	50 %	25 %	212633030
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2384	NC_011566	CTG	2	6	130215	130220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2385	NC_011566	A	6	6	130260	130265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2386	NC_011566	GTT	2	6	130291	130296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2387	NC_011566	TGG	2	6	130333	130338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2388	NC_011566	ATT	2	6	130342	130347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2389	NC_011566	TGA	2	6	130488	130493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2390	NC_011566	ACT	2	6	130522	130527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2391	NC_011566	TGA	2	6	130567	130572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2392	NC_011566	ACC	2	6	130585	130590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2393	NC_011566	TAC	2	6	130639	130644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2394	NC_011566	AACGG	2	10	130661	130670	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2395	NC_011566	AT	3	6	130675	130680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_011566	ATT	2	6	130697	130702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_011566	ATG	2	6	130721	130726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2398	NC_011566	AAGTG	2	10	130765	130774	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2399	NC_011566	AAT	2	6	130785	130790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2400	NC_011566	CTG	2	6	130867	130872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633031
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2404	NC_011566	A	6	6	131215	131220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2412	NC_011566	T	6	6	131675	131680	0 %	100 %	0 %	0 %	212633032
2413	NC_011566	AGT	2	6	131807	131812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2414	NC_011566	ACA	2	6	131868	131873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2415	NC_011566	CTC	2	6	131882	131887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2486	NC_011566	TGGT	2	8	135223	135230	0 %	50 %	50 %	0 %	212633035
2487	NC_011566	TGT	2	6	135262	135267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633035
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2490	NC_011566	T	6	6	135302	135307	0 %	100 %	0 %	0 %	212633035
2491	NC_011566	TTA	2	6	135383	135388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633035
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2494	NC_011566	CAT	2	6	135599	135604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633035
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2496	NC_011566	TAT	2	6	135829	135834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633035
2497	NC_011566	CTC	2	6	135872	135877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633035
2498	NC_011566	CTT	2	6	135940	135945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633035
2499	NC_011566	T	6	6	135965	135970	0 %	100 %	0 %	0 %	212633035
2500	NC_011566	AATT	2	8	136073	136080	50 %	50 %	0 %	0 %	212633035

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