MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 99086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011294	TAA	2	6	162749	162754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855652
3502	NC_011294	ATG	2	6	162761	162766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855652
3503	NC_011294	GCG	2	6	162826	162831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855652
3504	NC_011294	GGA	2	6	162879	162884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855652
3505	NC_011294	TTG	2	6	162901	162906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855652
3506	NC_011294	ACC	2	6	162913	162918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855652
3507	NC_011294	TGA	2	6	162987	162992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855652
3508	NC_011294	CGG	2	6	163061	163066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855652
3509	NC_011294	AACG	2	8	163165	163172	50 %	0 %	25 %	25 %	207855652
3510	NC_011294	CGC	2	6	163292	163297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855652
3511	NC_011294	TCA	2	6	163313	163318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855652
3512	NC_011294	TC	3	6	163446	163451	0 %	50 %	0 %	50 %	207855652
3513	NC_011294	CGC	2	6	163452	163457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855652
3514	NC_011294	GAG	2	6	163540	163545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855652
3515	NC_011294	CTGC	2	8	163549	163556	0 %	25 %	25 %	50 %	207855652
3516	NC_011294	TAT	2	6	163576	163581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855652
3517	NC_011294	CG	3	6	163588	163593	0 %	0 %	50 %	50 %	207855652
3518	NC_011294	TATT	2	8	163616	163623	25 %	75 %	0 %	0 %	207855652
3519	NC_011294	ATT	2	6	163625	163630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855652
3520	NC_011294	GTC	2	6	163692	163697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855653
3521	NC_011294	CGC	2	6	163712	163717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855653
3522	NC_011294	CGG	2	6	163739	163744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855653
3523	NC_011294	C	6	6	163808	163813	0 %	0 %	0 %	100 %	207855653
3524	NC_011294	GAC	2	6	163815	163820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855653
3525	NC_011294	ACG	2	6	163846	163851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855653
3526	NC_011294	GCA	2	6	164015	164020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855654
3527	NC_011294	CGT	2	6	164027	164032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855654
3528	NC_011294	GATCA	2	10	164094	164103	40 %	20 %	20 %	20 %	207855654
3529	NC_011294	TGT	2	6	164179	164184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855654
3530	NC_011294	GCC	2	6	164229	164234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855654
3531	NC_011294	GCT	2	6	164285	164290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855654
3532	NC_011294	CTG	2	6	164337	164342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855654
3533	NC_011294	GCT	2	6	164405	164410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855654
3534	NC_011294	CAG	2	6	164427	164432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855654
3535	NC_011294	A	6	6	164488	164493	100 %	0 %	0 %	0 %	207855654
3536	NC_011294	TCT	2	6	164576	164581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855654
3537	NC_011294	TTA	2	6	164712	164717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855655
3538	NC_011294	GC	3	6	164744	164749	0 %	0 %	50 %	50 %	207855655
3539	NC_011294	CG	3	6	164791	164796	0 %	0 %	50 %	50 %	207855655
3540	NC_011294	CAT	2	6	164800	164805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855655
3541	NC_011294	CGTCA	2	10	164840	164849	20 %	20 %	20 %	40 %	207855655
3542	NC_011294	ACC	2	6	164850	164855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855655
3543	NC_011294	CAG	2	6	164894	164899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855655
3544	NC_011294	CTG	2	6	164957	164962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855655
3545	NC_011294	TTC	2	6	164999	165004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855655
3546	NC_011294	A	6	6	165013	165018	100 %	0 %	0 %	0 %	207855655
3547	NC_011294	CGG	2	6	165055	165060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855655
3548	NC_011294	GGGC	2	8	165100	165107	0 %	0 %	75 %	25 %	207855655
3549	NC_011294	GC	3	6	165128	165133	0 %	0 %	50 %	50 %	207855655
3550	NC_011294	AAT	2	6	165134	165139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855655
3551	NC_011294	CCG	2	6	165210	165215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855655
3552	NC_011294	CTA	2	6	165321	165326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_011294	A	7	7	165358	165364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_011294	GAA	2	6	165473	165478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855656
3555	NC_011294	ATT	2	6	165608	165613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855656
3556	NC_011294	CTG	2	6	165681	165686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855656
3557	NC_011294	A	6	6	165795	165800	100 %	0 %	0 %	0 %	207855656
3558	NC_011294	TCG	2	6	165885	165890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855656
3559	NC_011294	ACG	2	6	166022	166027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855656
3560	NC_011294	CGG	2	6	166062	166067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855656
3561	NC_011294	GGC	2	6	166100	166105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855656
3562	NC_011294	GGC	2	6	166121	166126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855656
3563	NC_011294	CGG	3	9	166159	166167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855656
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3569	NC_011294	CG	3	6	166319	166324	0 %	0 %	50 %	50 %	207855656
3570	NC_011294	CCGC	2	8	166374	166381	0 %	0 %	25 %	75 %	207855656
3571	NC_011294	CAC	2	6	166453	166458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855656
3572	NC_011294	CTGG	2	8	166512	166519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_011294	ATCCC	2	10	166540	166549	20 %	20 %	0 %	60 %	207855657
3574	NC_011294	CCA	3	9	166591	166599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855657
3575	NC_011294	TGA	2	6	166621	166626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855657
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3584	NC_011294	AGA	2	6	167136	167141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855657
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3586	NC_011294	GCA	2	6	167197	167202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855657
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3589	NC_011294	AGCGC	2	10	167248	167257	20 %	0 %	40 %	40 %	207855657
3590	NC_011294	AGC	2	6	167314	167319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855657
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3593	NC_011294	ATGA	2	8	167525	167532	50 %	25 %	25 %	0 %	207855657
3594	NC_011294	TGA	2	6	167544	167549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855657
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3597	NC_011294	TGA	2	6	167641	167646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855657
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3599	NC_011294	GC	3	6	167987	167992	0 %	0 %	50 %	50 %	207855658
3600	NC_011294	ACC	2	6	168079	168084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855658
3601	NC_011294	ATC	2	6	168103	168108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855658
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3603	NC_011294	TGG	2	6	168152	168157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855658
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3605	NC_011294	ATG	3	9	168250	168258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855658
3606	NC_011294	GCA	2	6	168284	168289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855658
3607	NC_011294	GGAT	2	8	168316	168323	25 %	25 %	50 %	0 %	207855658
3608	NC_011294	GC	3	6	168410	168415	0 %	0 %	50 %	50 %	207855658
3609	NC_011294	CAA	2	6	168561	168566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855658
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3617	NC_011294	TGA	2	6	169075	169080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855658
3618	NC_011294	TGAGC	2	10	169097	169106	20 %	20 %	40 %	20 %	207855658
3619	NC_011294	TGT	2	6	169162	169167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855659
3620	NC_011294	CCAG	2	8	169203	169210	25 %	0 %	25 %	50 %	207855659
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3989	NC_011294	CGA	2	6	185578	185583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3990	NC_011294	CTG	2	6	185584	185589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3991	NC_011294	ATT	2	6	185616	185621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855672
3992	NC_011294	CTG	2	6	185643	185648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3993	NC_011294	GCC	2	6	185653	185658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3994	NC_011294	AAG	2	6	185693	185698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855672
3995	NC_011294	GCC	2	6	185737	185742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3996	NC_011294	TGC	2	6	185773	185778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3997	NC_011294	CGC	2	6	185792	185797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3998	NC_011294	TGG	2	6	185804	185809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855672
3999	NC_011294	TAT	2	6	185831	185836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855672
4000	NC_011294	TGC	2	6	185872	185877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672

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