MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 99086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011294	CGG	2	6	208475	208480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855691
4502	NC_011294	TCG	2	6	208547	208552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
4503	NC_011294	GCTG	2	8	208565	208572	0 %	25 %	50 %	25 %	207855691
4504	NC_011294	CGG	2	6	208658	208663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855691
4505	NC_011294	TCG	2	6	208825	208830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
4506	NC_011294	CCT	2	6	208898	208903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	207855691
4507	NC_011294	CGG	2	6	208914	208919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855691
4508	NC_011294	GTT	2	6	208935	208940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855691
4509	NC_011294	GCTG	2	8	208997	209004	0 %	25 %	50 %	25 %	207855691
4510	NC_011294	TATTGA	2	12	209183	209194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	207855691
4511	NC_011294	CG	3	6	209309	209314	0 %	0 %	50 %	50 %	207855691
4512	NC_011294	GT	3	6	209325	209330	0 %	50 %	50 %	0 %	207855691
4513	NC_011294	TGC	2	6	209336	209341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
4514	NC_011294	AC	3	6	209352	209357	50 %	0 %	0 %	50 %	207855691
4515	NC_011294	AGCGC	2	10	209358	209367	20 %	0 %	40 %	40 %	207855691
4516	NC_011294	ATAA	2	8	209369	209376	75 %	25 %	0 %	0 %	207855691
4517	NC_011294	GTTT	2	8	209436	209443	0 %	75 %	25 %	0 %	207855692
4518	NC_011294	TGA	2	6	209473	209478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855692
4519	NC_011294	GGC	3	9	209501	209509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855692
4520	NC_011294	ATA	2	6	209600	209605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855692
4521	NC_011294	TTC	2	6	209616	209621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855692
4522	NC_011294	ATCG	2	8	209656	209663	25 %	25 %	25 %	25 %	207855692
4523	NC_011294	GT	3	6	209740	209745	0 %	50 %	50 %	0 %	207855692
4524	NC_011294	TGC	2	6	209764	209769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855692
4525	NC_011294	CCAG	2	8	209788	209795	25 %	0 %	25 %	50 %	207855692
4526	NC_011294	CCG	2	6	209826	209831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855692
4527	NC_011294	T	7	7	209853	209859	0 %	100 %	0 %	0 %	207855692
4528	NC_011294	GCG	2	6	209881	209886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855692
4529	NC_011294	CAA	2	6	210078	210083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855692
4530	NC_011294	TGA	2	6	210113	210118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_011294	CCA	2	6	210151	210156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_011294	GCGG	2	8	210235	210242	0 %	0 %	75 %	25 %	207855693
4533	NC_011294	CTG	2	6	210273	210278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855693
4534	NC_011294	CAT	2	6	210372	210377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855693
4535	NC_011294	GC	3	6	210427	210432	0 %	0 %	50 %	50 %	207855693
4536	NC_011294	CTG	2	6	210440	210445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855693
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4540	NC_011294	GGC	2	6	210658	210663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855693
4541	NC_011294	AGTG	2	8	210673	210680	25 %	25 %	50 %	0 %	207855693
4542	NC_011294	GAT	2	6	210804	210809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_011294	GAA	2	6	210821	210826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_011294	AT	4	8	210860	210867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_011294	ATT	2	6	210875	210880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011294	GTTT	2	8	210890	210897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_011294	GCT	2	6	210944	210949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_011294	AAT	2	6	210962	210967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_011294	T	7	7	210973	210979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_011294	A	6	6	210984	210989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_011294	GT	3	6	211004	211009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_011294	A	7	7	211018	211024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011294	CAT	2	6	211033	211038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_011294	GGA	2	6	211057	211062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_011294	AAG	2	6	211132	211137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855694
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4557	NC_011294	TG	3	6	211211	211216	0 %	50 %	50 %	0 %	207855694
4558	NC_011294	CGGCG	2	10	211272	211281	0 %	0 %	60 %	40 %	207855694
4559	NC_011294	TGA	2	6	211301	211306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855694
4560	NC_011294	GGA	2	6	211359	211364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855694
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4562	NC_011294	CAG	3	9	211456	211464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855694
4563	NC_011294	TGC	2	6	211484	211489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855694
4564	NC_011294	GAC	2	6	211521	211526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_011294	T	6	6	211548	211553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_011294	AT	3	6	211567	211572	50 %	50 %	0 %	0 %	207855695
4567	NC_011294	GTT	2	6	211583	211588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855695
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4571	NC_011294	TGG	2	6	211950	211955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855695
4572	NC_011294	ATT	2	6	211973	211978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855695
4573	NC_011294	GGCT	2	8	212034	212041	0 %	25 %	50 %	25 %	207855695
4574	NC_011294	ATC	2	6	212094	212099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855695
4575	NC_011294	TGA	2	6	212110	212115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855695
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4577	NC_011294	TTCGG	2	10	212152	212161	0 %	40 %	40 %	20 %	207855695
4578	NC_011294	GGA	2	6	212227	212232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855695
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4580	NC_011294	TGA	2	6	212284	212289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855695
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4582	NC_011294	T	6	6	212479	212484	0 %	100 %	0 %	0 %	207855695
4583	NC_011294	CGC	2	6	212504	212509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855695
4584	NC_011294	TA	3	6	212517	212522	50 %	50 %	0 %	0 %	207855695
4585	NC_011294	ATA	2	6	212535	212540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855695
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4587	NC_011294	TCTT	2	8	212602	212609	0 %	75 %	0 %	25 %	207855695
4588	NC_011294	GGC	2	6	212618	212623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855695
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4591	NC_011294	TGC	2	6	212718	212723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855695
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4594	NC_011294	GAT	2	6	212981	212986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855696
4595	NC_011294	CTTGC	2	10	213161	213170	0 %	40 %	20 %	40 %	207855696
4596	NC_011294	CTT	2	6	213190	213195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_011294	GGC	3	9	213336	213344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855697
4598	NC_011294	GTC	2	6	213411	213416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4599	NC_011294	TTCA	2	8	213432	213439	25 %	50 %	0 %	25 %	207855697
4600	NC_011294	GGCAAT	2	12	213450	213461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	207855697
4601	NC_011294	TCA	2	6	213512	213517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855697
4602	NC_011294	GCT	2	6	213545	213550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4603	NC_011294	TGAGC	2	10	213573	213582	20 %	20 %	40 %	20 %	207855697
4604	NC_011294	AAT	2	6	213603	213608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855697
4605	NC_011294	CGA	2	6	213617	213622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855697
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4608	NC_011294	AG	3	6	213792	213797	50 %	0 %	50 %	0 %	207855697
4609	NC_011294	ACGT	2	8	213811	213818	25 %	25 %	25 %	25 %	207855697
4610	NC_011294	CCGG	2	8	213941	213948	0 %	0 %	50 %	50 %	207855697
4611	NC_011294	CAC	2	6	213984	213989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855697
4612	NC_011294	CGT	2	6	214031	214036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855697
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4618	NC_011294	GCGCT	2	10	214176	214185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4619	NC_011294	CGCGT	2	10	214228	214237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4620	NC_011294	TTC	2	6	214277	214282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855698
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4622	NC_011294	CGG	2	6	214327	214332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855698
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4748	NC_011294	CGC	2	6	220188	220193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855705
4749	NC_011294	TGT	2	6	220200	220205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855705
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4751	NC_011294	CGT	2	6	220298	220303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855705
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4778	NC_011294	GGC	2	6	221362	221367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855705
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4802	NC_011294	CAGCG	2	10	222399	222408	20 %	0 %	40 %	40 %	207855705
4803	NC_011294	CG	3	6	222423	222428	0 %	0 %	50 %	50 %	207855705
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4990	NC_011294	CTG	2	6	230301	230306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855710
4991	NC_011294	GCT	2	6	230351	230356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855710
4992	NC_011294	CTG	2	6	230382	230387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855710
4993	NC_011294	GC	3	6	230388	230393	0 %	0 %	50 %	50 %	207855710
4994	NC_011294	ATGG	2	8	230468	230475	25 %	25 %	50 %	0 %	207855710
4995	NC_011294	GC	3	6	230509	230514	0 %	0 %	50 %	50 %	207855710
4996	NC_011294	GCT	2	6	230516	230521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855710
4997	NC_011294	GCT	2	6	230528	230533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855710
4998	NC_011294	GC	3	6	230554	230559	0 %	0 %	50 %	50 %	207855710
4999	NC_011294	GGC	2	6	230585	230590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855710
5000	NC_011294	GC	3	6	230629	230634	0 %	0 %	50 %	50 %	207855710

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