MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011274	TAA	2	6	162901	162906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351478
3502	NC_011274	ATG	2	6	162913	162918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351478
3503	NC_011274	GCG	2	6	162978	162983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351478
3504	NC_011274	GGA	2	6	163031	163036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351478
3505	NC_011274	TTG	2	6	163053	163058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351478
3506	NC_011274	ACC	2	6	163065	163070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351478
3507	NC_011274	TGA	2	6	163139	163144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351478
3508	NC_011274	CGG	2	6	163213	163218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351478
3509	NC_011274	AACG	2	8	163317	163324	50 %	0 %	25 %	25 %	205351478
3510	NC_011274	CGC	2	6	163444	163449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351478
3511	NC_011274	TCA	2	6	163465	163470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351478
3512	NC_011274	TC	3	6	163598	163603	0 %	50 %	0 %	50 %	205351478
3513	NC_011274	CGC	2	6	163604	163609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351478
3514	NC_011274	GAG	2	6	163692	163697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351478
3515	NC_011274	CTGC	2	8	163701	163708	0 %	25 %	25 %	50 %	205351478
3516	NC_011274	TAT	2	6	163728	163733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351478
3517	NC_011274	CG	3	6	163740	163745	0 %	0 %	50 %	50 %	205351478
3518	NC_011274	TATT	2	8	163768	163775	25 %	75 %	0 %	0 %	205351478
3519	NC_011274	ATT	2	6	163777	163782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351478
3520	NC_011274	GTC	2	6	163844	163849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351479
3521	NC_011274	CGC	2	6	163864	163869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351479
3522	NC_011274	CGG	2	6	163891	163896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351479
3523	NC_011274	C	6	6	163960	163965	0 %	0 %	0 %	100 %	205351479
3524	NC_011274	GAC	2	6	163967	163972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351479
3525	NC_011274	ACG	2	6	163998	164003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351479
3526	NC_011274	GCA	2	6	164167	164172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351480
3527	NC_011274	CGT	2	6	164179	164184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351480
3528	NC_011274	GATCA	2	10	164246	164255	40 %	20 %	20 %	20 %	205351480
3529	NC_011274	TGT	2	6	164331	164336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351480
3530	NC_011274	GCC	2	6	164381	164386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351480
3531	NC_011274	GCT	2	6	164437	164442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351480
3532	NC_011274	CTG	2	6	164489	164494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351480
3533	NC_011274	GCT	2	6	164557	164562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351480
3534	NC_011274	CAG	2	6	164579	164584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351480
3535	NC_011274	A	6	6	164640	164645	100 %	0 %	0 %	0 %	205351480
3536	NC_011274	TCT	2	6	164728	164733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351480
3537	NC_011274	TTA	2	6	164864	164869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351481
3538	NC_011274	GC	3	6	164896	164901	0 %	0 %	50 %	50 %	205351481
3539	NC_011274	CG	3	6	164943	164948	0 %	0 %	50 %	50 %	205351481
3540	NC_011274	CAT	2	6	164952	164957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351481
3541	NC_011274	CGTCA	2	10	164992	165001	20 %	20 %	20 %	40 %	205351481
3542	NC_011274	ACC	2	6	165002	165007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351481
3543	NC_011274	CAG	2	6	165046	165051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351481
3544	NC_011274	CTG	2	6	165109	165114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351481
3545	NC_011274	TTC	2	6	165151	165156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351481
3546	NC_011274	A	6	6	165165	165170	100 %	0 %	0 %	0 %	205351481
3547	NC_011274	CGG	2	6	165207	165212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351481
3548	NC_011274	GGGC	2	8	165252	165259	0 %	0 %	75 %	25 %	205351481
3549	NC_011274	GC	3	6	165280	165285	0 %	0 %	50 %	50 %	205351481
3550	NC_011274	AAT	2	6	165286	165291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351481
3551	NC_011274	CCG	2	6	165362	165367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351481
3552	NC_011274	CTA	2	6	165473	165478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_011274	A	7	7	165510	165516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_011274	GAA	2	6	165625	165630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351482
3555	NC_011274	ATT	2	6	165760	165765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351482
3556	NC_011274	CTG	2	6	165833	165838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351482
3557	NC_011274	A	6	6	165947	165952	100 %	0 %	0 %	0 %	205351482
3558	NC_011274	TCG	2	6	166037	166042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351482
3559	NC_011274	ACG	2	6	166174	166179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351482
3560	NC_011274	CGG	2	6	166214	166219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351482
3561	NC_011274	GGC	2	6	166252	166257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351482
3562	NC_011274	GGC	2	6	166273	166278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351482
3563	NC_011274	CGG	3	9	166311	166319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351482
3564	NC_011274	GGC	2	6	166339	166344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351482
3565	NC_011274	AG	3	6	166362	166367	50 %	0 %	50 %	0 %	205351482
3566	NC_011274	CGG	2	6	166368	166373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351482
3567	NC_011274	AGA	2	6	166383	166388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351482
3568	NC_011274	CGG	2	6	166452	166457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351482
3569	NC_011274	CG	3	6	166471	166476	0 %	0 %	50 %	50 %	205351482
3570	NC_011274	CCGC	2	8	166526	166533	0 %	0 %	25 %	75 %	205351482
3571	NC_011274	CAC	2	6	166605	166610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351482
3572	NC_011274	CTGG	2	8	166664	166671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_011274	ATCCC	2	10	166692	166701	20 %	20 %	0 %	60 %	205351483
3574	NC_011274	CCA	3	9	166743	166751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351483
3575	NC_011274	TGA	2	6	166773	166778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351483
3576	NC_011274	GCCAGC	2	12	166817	166828	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351483
3577	NC_011274	GCA	2	6	166860	166865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351483
3578	NC_011274	T	6	6	166937	166942	0 %	100 %	0 %	0 %	205351483
3579	NC_011274	GAA	2	6	167049	167054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351483
3580	NC_011274	AGA	2	6	167150	167155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351483
3581	NC_011274	CGCTGC	2	12	167156	167167	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	205351483
3582	NC_011274	AAT	2	6	167272	167277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351483
3583	NC_011274	CG	3	6	167280	167285	0 %	0 %	50 %	50 %	205351483
3584	NC_011274	AGA	2	6	167288	167293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351483
3585	NC_011274	GGC	2	6	167323	167328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483
3586	NC_011274	GGC	2	6	167371	167376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483
3587	NC_011274	AAT	2	6	167386	167391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351483
3588	NC_011274	AGCGC	2	10	167400	167409	20 %	0 %	40 %	40 %	205351483
3589	NC_011274	AGC	2	6	167466	167471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351483
3590	NC_011274	ATC	2	6	167507	167512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351483
3591	NC_011274	GCG	2	6	167523	167528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483
3592	NC_011274	ATGA	2	8	167677	167684	50 %	25 %	25 %	0 %	205351483
3593	NC_011274	TGA	2	6	167696	167701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351483
3594	NC_011274	CTT	2	6	167721	167726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351483
3595	NC_011274	GCG	2	6	167735	167740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483
3596	NC_011274	TGA	2	6	167793	167798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351483
3597	NC_011274	TGCC	2	8	168122	168129	0 %	25 %	25 %	50 %	205351484
3598	NC_011274	GC	3	6	168139	168144	0 %	0 %	50 %	50 %	205351484
3599	NC_011274	ACC	2	6	168231	168236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351484
3600	NC_011274	ATC	2	6	168255	168260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351484
3601	NC_011274	TGC	2	6	168279	168284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351484
3602	NC_011274	TGG	2	6	168304	168309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351484
3603	NC_011274	GCC	2	6	168351	168356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351484
3604	NC_011274	ATG	3	9	168402	168410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351484
3605	NC_011274	GCA	2	6	168436	168441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351484
3606	NC_011274	GGAT	2	8	168468	168475	25 %	25 %	50 %	0 %	205351484
3607	NC_011274	GC	3	6	168562	168567	0 %	0 %	50 %	50 %	205351484
3608	NC_011274	CAA	2	6	168713	168718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351484
3609	NC_011274	GAC	2	6	168725	168730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351484
3610	NC_011274	CTT	2	6	168739	168744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351484
3611	NC_011274	CGCC	2	8	168781	168788	0 %	0 %	25 %	75 %	205351484
3612	NC_011274	GAA	2	6	168910	168915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351484
3613	NC_011274	GAT	2	6	169081	169086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351484
3614	NC_011274	CA	3	6	169110	169115	50 %	0 %	0 %	50 %	205351484
3615	NC_011274	ACC	2	6	169179	169184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351484
3616	NC_011274	TGA	2	6	169227	169232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351484
3617	NC_011274	TGAGC	2	10	169249	169258	20 %	20 %	40 %	20 %	205351484
3618	NC_011274	TGT	2	6	169314	169319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351485
3619	NC_011274	CCAG	2	8	169355	169362	25 %	0 %	25 %	50 %	205351485
3620	NC_011274	GGCG	2	8	169385	169392	0 %	0 %	75 %	25 %	205351485
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3622	NC_011274	TGA	2	6	169438	169443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351485
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3867	NC_011274	GCA	2	6	181036	181041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351494
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3873	NC_011274	CT	3	6	181290	181295	0 %	50 %	0 %	50 %	205351494
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3988	NC_011274	CTG	2	6	185736	185741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351498
3989	NC_011274	ATT	2	6	185768	185773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351498
3990	NC_011274	CTG	2	6	185795	185800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351498
3991	NC_011274	CTGT	2	8	185816	185823	0 %	50 %	25 %	25 %	205351498
3992	NC_011274	GCC	2	6	185889	185894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351498
3993	NC_011274	TGC	2	6	185925	185930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351498
3994	NC_011274	CGC	2	6	185944	185949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351498
3995	NC_011274	TGG	2	6	185956	185961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351498
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3997	NC_011274	TGC	2	6	186024	186029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351498
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3999	NC_011274	ACC	2	6	186125	186130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351498
4000	NC_011274	ATG	2	6	186131	186136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351498

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