MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011274	GTTC	2	8	115813	115820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2502	NC_011274	ATG	2	6	115904	115909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011274	TA	3	6	115914	115919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011274	CAG	2	6	115920	115925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_011274	TTTA	2	8	115962	115969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011274	A	6	6	116077	116082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_011274	T	6	6	116089	116094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011274	GTTT	2	8	116095	116102	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011274	ATA	2	6	116160	116165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_011274	TAAA	2	8	116186	116193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_011274	TCG	2	6	116213	116218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_011274	CT	3	6	116223	116228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2513	NC_011274	TAATT	2	10	116232	116241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011274	ATTTT	2	10	116258	116267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_011274	CGGGTG	2	12	116274	116285	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2516	NC_011274	T	6	6	116420	116425	0 %	100 %	0 %	0 %	205351439
2517	NC_011274	ACAGA	2	10	116441	116450	60 %	0 %	20 %	20 %	205351439
2518	NC_011274	ATT	2	6	116465	116470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351439
2519	NC_011274	T	7	7	116485	116491	0 %	100 %	0 %	0 %	205351439
2520	NC_011274	A	6	6	116512	116517	100 %	0 %	0 %	0 %	205351439
2521	NC_011274	ATT	2	6	116534	116539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351439
2522	NC_011274	CAA	2	6	116571	116576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351439
2523	NC_011274	TTC	2	6	116591	116596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351439
2524	NC_011274	GGAA	2	8	116605	116612	50 %	0 %	50 %	0 %	205351439
2525	NC_011274	ATA	2	6	116634	116639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351439
2526	NC_011274	AT	3	6	116692	116697	50 %	50 %	0 %	0 %	205351439
2527	NC_011274	TCA	2	6	116710	116715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351439
2528	NC_011274	C	6	6	116721	116726	0 %	0 %	0 %	100 %	205351439
2529	NC_011274	TGC	2	6	116810	116815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351440
2530	NC_011274	GCG	2	6	116829	116834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351440
2531	NC_011274	GGC	2	6	116841	116846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351440
2532	NC_011274	AGA	2	6	116847	116852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351440
2533	NC_011274	CTT	2	6	116868	116873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351440
2534	NC_011274	GCG	2	6	116963	116968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351440
2535	NC_011274	CTT	2	6	116976	116981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351440
2536	NC_011274	CAA	2	6	116994	116999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351440
2537	NC_011274	GGT	2	6	117094	117099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351440
2538	NC_011274	GT	3	6	117158	117163	0 %	50 %	50 %	0 %	205351440
2539	NC_011274	ACA	2	6	117195	117200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351440
2540	NC_011274	GAC	2	6	117221	117226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351440
2541	NC_011274	ACC	3	9	117269	117277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351440
2542	NC_011274	CGC	2	6	117333	117338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351440
2543	NC_011274	TCT	2	6	117434	117439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351440
2544	NC_011274	AAATG	2	10	117551	117560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_011274	CAGCG	2	10	117616	117625	20 %	0 %	40 %	40 %	205351441
2546	NC_011274	ATCA	2	8	117657	117664	50 %	25 %	0 %	25 %	205351441
2547	NC_011274	GC	3	6	117743	117748	0 %	0 %	50 %	50 %	205351441
2548	NC_011274	GCCA	2	8	117750	117757	25 %	0 %	25 %	50 %	205351441
2549	NC_011274	GCG	2	6	117839	117844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351441
2550	NC_011274	CAG	2	6	117870	117875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351441
2551	NC_011274	CGA	2	6	117908	117913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351441
2552	NC_011274	GCCGG	2	10	117916	117925	0 %	0 %	60 %	40 %	205351441
2553	NC_011274	GCC	2	6	117963	117968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351441
2554	NC_011274	AC	3	6	118023	118028	50 %	0 %	0 %	50 %	205351441
2555	NC_011274	CGAGC	2	10	118041	118050	20 %	0 %	40 %	40 %	205351441
2556	NC_011274	TCC	2	6	118087	118092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351441
2557	NC_011274	GCC	2	6	118104	118109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351441
2558	NC_011274	GCG	2	6	118150	118155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351441
2559	NC_011274	GTT	2	6	118226	118231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351441
2560	NC_011274	GTC	2	6	118255	118260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351441
2561	NC_011274	GC	3	6	118314	118319	0 %	0 %	50 %	50 %	205351441
2562	NC_011274	GGCG	2	8	118362	118369	0 %	0 %	75 %	25 %	205351441
2563	NC_011274	GCT	2	6	118380	118385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351441
2564	NC_011274	CAC	2	6	118434	118439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351441
2565	NC_011274	ATTTG	2	10	118484	118493	20 %	60 %	20 %	0 %	205351441
2566	NC_011274	GTCA	2	8	118512	118519	25 %	25 %	25 %	25 %	205351441
2567	NC_011274	GAC	2	6	118647	118652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351441
2568	NC_011274	TGC	2	6	118657	118662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351441
2569	NC_011274	CG	3	6	118672	118677	0 %	0 %	50 %	50 %	205351441
2570	NC_011274	GCC	2	6	118698	118703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351441
2571	NC_011274	GGTTCA	2	12	118715	118726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	205351441
2572	NC_011274	GCG	2	6	118759	118764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351441
2573	NC_011274	AGT	2	6	118786	118791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351441
2574	NC_011274	ACC	2	6	118855	118860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351441
2575	NC_011274	GCTG	2	8	119039	119046	0 %	25 %	50 %	25 %	205351441
2576	NC_011274	TGT	2	6	119162	119167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351442
2577	NC_011274	CTG	2	6	119185	119190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2578	NC_011274	GCG	2	6	119194	119199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2579	NC_011274	GGC	2	6	119278	119283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2580	NC_011274	CGG	2	6	119313	119318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2581	NC_011274	GCG	2	6	119327	119332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2582	NC_011274	CGA	2	6	119358	119363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2583	NC_011274	GCA	2	6	119389	119394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2584	NC_011274	GCC	2	6	119428	119433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351442
2585	NC_011274	GC	5	10	119489	119498	0 %	0 %	50 %	50 %	205351442
2586	NC_011274	GCG	2	6	119602	119607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2587	NC_011274	CAC	2	6	119626	119631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351442
2588	NC_011274	GCT	2	6	119688	119693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2589	NC_011274	CTGG	2	8	119695	119702	0 %	25 %	50 %	25 %	205351442
2590	NC_011274	TGC	2	6	119729	119734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2591	NC_011274	GTT	2	6	119742	119747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351442
2592	NC_011274	CAC	2	6	119833	119838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351442
2593	NC_011274	CGC	2	6	119994	119999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351442
2594	NC_011274	CGG	2	6	120072	120077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2595	NC_011274	TCA	2	6	120134	120139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351442
2596	NC_011274	AAG	2	6	120140	120145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351442
2597	NC_011274	GGC	2	6	120152	120157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2598	NC_011274	CGG	2	6	120212	120217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2599	NC_011274	GTG	2	6	120233	120238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351442
2600	NC_011274	AGC	2	6	120245	120250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2601	NC_011274	CA	3	6	120264	120269	50 %	0 %	0 %	50 %	205351442
2602	NC_011274	CGG	2	6	120285	120290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2603	NC_011274	GCC	2	6	120361	120366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351442
2604	NC_011274	AGT	2	6	120378	120383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351442
2605	NC_011274	TCG	2	6	120419	120424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2606	NC_011274	GCG	2	6	120584	120589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
2607	NC_011274	CG	3	6	120642	120647	0 %	0 %	50 %	50 %	205351442
2608	NC_011274	GAT	2	6	120648	120653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351442
2609	NC_011274	GTT	2	6	120664	120669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351442
2610	NC_011274	CTT	2	6	120690	120695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351442
2611	NC_011274	TGG	2	6	120720	120725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351442
2612	NC_011274	TCG	2	6	120731	120736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2613	NC_011274	GC	3	6	120761	120766	0 %	0 %	50 %	50 %	205351442
2614	NC_011274	CAATTG	2	12	120792	120803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	205351442
2615	NC_011274	TCCA	2	8	120816	120823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_011274	AG	3	6	120848	120853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_011274	CAGG	2	8	120870	120877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2618	NC_011274	AATGCT	2	12	120900	120911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2619	NC_011274	TCA	2	6	121052	121057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_011274	GTC	2	6	121088	121093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_011274	TCT	2	6	121117	121122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_011274	T	7	7	121245	121251	0 %	100 %	0 %	0 %	205351443
2623	NC_011274	ATCG	2	8	121252	121259	25 %	25 %	25 %	25 %	205351443
2624	NC_011274	AT	3	6	121278	121283	50 %	50 %	0 %	0 %	205351443
2625	NC_011274	TAA	3	9	121317	121325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351443
2626	NC_011274	TGTC	2	8	121338	121345	0 %	50 %	25 %	25 %	205351443
2627	NC_011274	AT	3	6	121355	121360	50 %	50 %	0 %	0 %	205351443
2628	NC_011274	CCG	2	6	121369	121374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351443
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2631	NC_011274	ATC	2	6	121555	121560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351443
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2748	NC_011274	T	7	7	126166	126172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2871	NC_011274	ATG	2	6	132152	132157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351452
2872	NC_011274	ACG	2	6	132162	132167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351452
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2986	NC_011274	AAAGC	2	10	138243	138252	60 %	0 %	20 %	20 %	205351457
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2993	NC_011274	GC	3	6	138730	138735	0 %	0 %	50 %	50 %	205351457
2994	NC_011274	CCGCA	2	10	138776	138785	20 %	0 %	20 %	60 %	205351457
2995	NC_011274	GCC	2	6	138843	138848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351457
2996	NC_011274	CAT	2	6	138907	138912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351457
2997	NC_011274	GCG	2	6	138947	138952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351457
2998	NC_011274	GCT	2	6	139004	139009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351457
2999	NC_011274	TGA	2	6	139097	139102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351457
3000	NC_011274	TCG	2	6	139151	139156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351457

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