MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011274	GAC	2	6	45277	45282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351382
1002	NC_011274	AGG	2	6	45350	45355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351382
1003	NC_011274	CGT	2	6	45402	45407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351382
1004	NC_011274	AAT	2	6	45418	45423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351382
1005	NC_011274	TGA	2	6	45477	45482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351382
1006	NC_011274	CCG	2	6	45499	45504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351382
1007	NC_011274	GTG	2	6	45532	45537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351382
1008	NC_011274	ATGA	2	8	45541	45548	50 %	25 %	25 %	0 %	205351382
1009	NC_011274	GC	3	6	45590	45595	0 %	0 %	50 %	50 %	205351382
1010	NC_011274	CAG	2	6	45631	45636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351382
1011	NC_011274	TGA	2	6	45675	45680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351382
1012	NC_011274	GCT	2	6	45756	45761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351382
1013	NC_011274	TAC	2	6	45826	45831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351382
1014	NC_011274	AACG	2	8	45843	45850	50 %	0 %	25 %	25 %	205351382
1015	NC_011274	ATC	2	6	45919	45924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011274	TGAC	2	8	45927	45934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011274	A	6	6	45941	45946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011274	A	6	6	45975	45980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011274	TCA	2	6	45989	45994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011274	TA	3	6	45995	46000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011274	TAG	2	6	46035	46040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011274	GAA	2	6	46045	46050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011274	GA	3	6	46062	46067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011274	T	6	6	46093	46098	0 %	100 %	0 %	0 %	205351383
1025	NC_011274	AGC	2	6	46099	46104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351383
1026	NC_011274	CAT	2	6	46119	46124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351383
1027	NC_011274	TCA	2	6	46127	46132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351383
1028	NC_011274	CGC	2	6	46134	46139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351383
1029	NC_011274	CAA	2	6	46239	46244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351383
1030	NC_011274	TGT	2	6	46253	46258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351383
1031	NC_011274	GCC	2	6	46372	46377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351383
1032	NC_011274	CGG	2	6	46380	46385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351383
1033	NC_011274	GAT	2	6	46386	46391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351383
1034	NC_011274	ACT	2	6	46421	46426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351383
1035	NC_011274	GGGCT	2	10	46446	46455	0 %	20 %	60 %	20 %	205351383
1036	NC_011274	ATC	2	6	46555	46560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351383
1037	NC_011274	GAT	2	6	46561	46566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351383
1038	NC_011274	TTA	2	6	46580	46585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351383
1039	NC_011274	GGC	2	6	46632	46637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351383
1040	NC_011274	GCT	2	6	46659	46664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351383
1041	NC_011274	GCG	2	6	46673	46678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351383
1042	NC_011274	TA	3	6	46694	46699	50 %	50 %	0 %	0 %	205351383
1043	NC_011274	CGG	2	6	46724	46729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351383
1044	NC_011274	GAAA	2	8	46791	46798	75 %	0 %	25 %	0 %	205351383
1045	NC_011274	TCGC	2	8	46806	46813	0 %	25 %	25 %	50 %	205351383
1046	NC_011274	TGC	2	6	46934	46939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351383
1047	NC_011274	ATT	2	6	46948	46953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351383
1048	NC_011274	CTG	2	6	46960	46965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351383
1049	NC_011274	GCTG	2	8	46997	47004	0 %	25 %	50 %	25 %	205351383
1050	NC_011274	TG	3	6	47075	47080	0 %	50 %	50 %	0 %	205351383
1051	NC_011274	TTA	2	6	47144	47149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351383
1052	NC_011274	GTG	2	6	47194	47199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351383
1053	NC_011274	GC	4	8	47214	47221	0 %	0 %	50 %	50 %	205351383
1054	NC_011274	GC	3	6	47228	47233	0 %	0 %	50 %	50 %	205351383
1055	NC_011274	GA	3	6	47296	47301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011274	TAT	2	6	47336	47341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351384
1057	NC_011274	AAG	2	6	47358	47363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351384
1058	NC_011274	CGC	2	6	47400	47405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351384
1059	NC_011274	TGT	2	6	47586	47591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351384
1060	NC_011274	CAG	2	6	47632	47637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351384
1061	NC_011274	GCG	2	6	47648	47653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351384
1062	NC_011274	GTG	3	9	47654	47662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351384
1063	NC_011274	CACG	2	8	47695	47702	25 %	0 %	25 %	50 %	205351384
1064	NC_011274	CAGC	2	8	47722	47729	25 %	0 %	25 %	50 %	205351384
1065	NC_011274	GCA	2	6	47773	47778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351384
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1067	NC_011274	GTT	2	6	47920	47925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351384
1068	NC_011274	TGA	2	6	47974	47979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351384
1069	NC_011274	GAA	2	6	48104	48109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351384
1070	NC_011274	GA	3	6	48128	48133	50 %	0 %	50 %	0 %	205351384
1071	NC_011274	CGG	2	6	48147	48152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351384
1072	NC_011274	ACT	2	6	48174	48179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351384
1073	NC_011274	TACC	2	8	48206	48213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_011274	CAG	2	6	48266	48271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351385
1075	NC_011274	GCGTA	2	10	48322	48331	20 %	20 %	40 %	20 %	205351385
1076	NC_011274	CCT	2	6	48345	48350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351385
1077	NC_011274	CATG	2	8	48427	48434	25 %	25 %	25 %	25 %	205351385
1078	NC_011274	CAG	2	6	48446	48451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351385
1079	NC_011274	TCC	2	6	48555	48560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351385
1080	NC_011274	CCG	2	6	48825	48830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351385
1081	NC_011274	CGT	2	6	48836	48841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351385
1082	NC_011274	CCA	2	6	48842	48847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351385
1083	NC_011274	CGG	2	6	48877	48882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351385
1084	NC_011274	GAG	2	6	48909	48914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351385
1085	NC_011274	GACCA	2	10	48927	48936	40 %	0 %	20 %	40 %	205351385
1086	NC_011274	A	6	6	49019	49024	100 %	0 %	0 %	0 %	205351385
1087	NC_011274	CCGGC	2	10	49069	49078	0 %	0 %	40 %	60 %	205351385
1088	NC_011274	GTCGTA	2	12	49094	49105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	205351385
1089	NC_011274	CG	4	8	49195	49202	0 %	0 %	50 %	50 %	205351385
1090	NC_011274	AAGT	2	8	49221	49228	50 %	25 %	25 %	0 %	205351385
1091	NC_011274	CCAG	2	8	49279	49286	25 %	0 %	25 %	50 %	205351385
1092	NC_011274	CG	3	6	49408	49413	0 %	0 %	50 %	50 %	205351385
1093	NC_011274	AAG	2	6	49449	49454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351385
1094	NC_011274	GCG	2	6	49484	49489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351385
1095	NC_011274	CAG	2	6	49511	49516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351385
1096	NC_011274	CAT	2	6	49574	49579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351385
1097	NC_011274	CGG	2	6	49580	49585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351385
1098	NC_011274	AGT	2	6	49648	49653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351385
1099	NC_011274	GTT	2	6	49724	49729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351385
1100	NC_011274	T	6	6	49858	49863	0 %	100 %	0 %	0 %	205351385
1101	NC_011274	GAT	2	6	49968	49973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351385
1102	NC_011274	TG	3	6	50026	50031	0 %	50 %	50 %	0 %	205351385
1103	NC_011274	TTGA	2	8	50060	50067	25 %	50 %	25 %	0 %	205351385
1104	NC_011274	TGG	2	6	50103	50108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351385
1105	NC_011274	TGC	2	6	50253	50258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351385
1106	NC_011274	CAGAC	2	10	50259	50268	40 %	0 %	20 %	40 %	205351385
1107	NC_011274	TTG	2	6	50279	50284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351385
1108	NC_011274	TGG	2	6	50296	50301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351385
1109	NC_011274	TCT	2	6	50368	50373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011274	GAAA	2	8	50395	50402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011274	AGT	2	6	50403	50408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011274	GCA	2	6	50478	50483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011274	GGC	2	6	50528	50533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011274	TGC	2	6	50575	50580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011274	GGC	2	6	50705	50710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011274	TGT	2	6	50725	50730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011274	GCCA	2	8	50736	50743	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_011274	CAT	2	6	50744	50749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_011274	CGC	2	6	50752	50757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_011274	CAG	2	6	50771	50776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011274	AAG	2	6	50817	50822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011274	GAT	2	6	50831	50836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011274	TCG	2	6	50851	50856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011274	ATA	2	6	50909	50914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011274	GCT	2	6	50932	50937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011274	AGA	2	6	50950	50955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_011274	T	6	6	51013	51018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1495	NC_011274	GCC	2	6	68026	68031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351400
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1497	NC_011274	ACC	2	6	68107	68112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351400
1498	NC_011274	AGTC	2	8	68118	68125	25 %	25 %	25 %	25 %	205351400
1499	NC_011274	TAA	2	6	68152	68157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351400
1500	NC_011274	TAAT	2	8	68160	68167	50 %	50 %	0 %	0 %	205351400

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