MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011274	CT	3	6	22683	22688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_011274	GGT	2	6	22836	22841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011274	CTA	2	6	22843	22848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011274	CGG	2	6	22883	22888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011274	CTGG	2	8	22889	22896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_011274	TAT	2	6	22914	22919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011274	ATA	2	6	22940	22945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011274	TTA	2	6	23055	23060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011274	TCTTAA	2	12	23092	23103	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
510	NC_011274	TTAT	2	8	23154	23161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011274	A	7	7	23227	23233	100 %	0 %	0 %	0 %	205351363
512	NC_011274	TGA	2	6	23234	23239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351363
513	NC_011274	ACG	2	6	23240	23245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351363
514	NC_011274	ATA	2	6	23258	23263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351363
515	NC_011274	CTTTT	2	10	23282	23291	0 %	80 %	0 %	20 %	205351363
516	NC_011274	T	6	6	23288	23293	0 %	100 %	0 %	0 %	205351363
517	NC_011274	CAG	2	6	23296	23301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351363
518	NC_011274	TTG	2	6	23341	23346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351363
519	NC_011274	TTTA	2	8	23387	23394	25 %	75 %	0 %	0 %	205351363
520	NC_011274	ATG	2	6	23402	23407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351363
521	NC_011274	GTT	2	6	23437	23442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351363
522	NC_011274	ATG	2	6	23453	23458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351363
523	NC_011274	AT	3	6	23471	23476	50 %	50 %	0 %	0 %	205351363
524	NC_011274	CG	3	6	23541	23546	0 %	0 %	50 %	50 %	205351363
525	NC_011274	ACG	2	6	23642	23647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351363
526	NC_011274	TGA	2	6	23678	23683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351363
527	NC_011274	GC	4	8	23684	23691	0 %	0 %	50 %	50 %	205351363
528	NC_011274	GCT	2	6	23736	23741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351363
529	NC_011274	TCTG	2	8	23844	23851	0 %	50 %	25 %	25 %	205351363
530	NC_011274	A	7	7	23856	23862	100 %	0 %	0 %	0 %	205351363
531	NC_011274	GGC	2	6	23888	23893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351363
532	NC_011274	AT	3	6	23945	23950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011274	GTT	2	6	24005	24010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011274	ACA	2	6	24084	24089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011274	GAT	2	6	24121	24126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011274	TAA	2	6	24148	24153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011274	TAA	2	6	24155	24160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011274	ACG	2	6	24195	24200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011274	AAG	2	6	24242	24247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011274	T	7	7	24252	24258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011274	GAA	2	6	24288	24293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011274	CAG	2	6	24298	24303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011274	A	6	6	24314	24319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011274	TGAA	2	8	24355	24362	50 %	25 %	25 %	0 %	205351364
545	NC_011274	TGT	2	6	24410	24415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351364
546	NC_011274	TAC	2	6	24432	24437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351364
547	NC_011274	CGGTA	2	10	24450	24459	20 %	20 %	40 %	20 %	205351364
548	NC_011274	CTGTT	2	10	24489	24498	0 %	60 %	20 %	20 %	205351364
549	NC_011274	TGG	2	6	24569	24574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351364
550	NC_011274	AGA	2	6	24585	24590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351364
551	NC_011274	CCAG	2	8	24626	24633	25 %	0 %	25 %	50 %	205351364
552	NC_011274	GCG	2	6	24637	24642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351364
553	NC_011274	CGA	2	6	24713	24718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351364
554	NC_011274	T	7	7	24914	24920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011274	CG	3	6	24953	24958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_011274	A	8	8	25004	25011	100 %	0 %	0 %	0 %	205351365
557	NC_011274	ATT	2	6	25030	25035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351365
558	NC_011274	CTG	2	6	25040	25045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351365
559	NC_011274	CGG	2	6	25047	25052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351365
560	NC_011274	CCT	2	6	25134	25139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351365
561	NC_011274	ATT	2	6	25145	25150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351365
562	NC_011274	TTC	2	6	25153	25158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351365
563	NC_011274	T	7	7	25170	25176	0 %	100 %	0 %	0 %	205351365
564	NC_011274	CGC	2	6	25233	25238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351365
565	NC_011274	CT	3	6	25239	25244	0 %	50 %	0 %	50 %	205351365
566	NC_011274	A	6	6	25259	25264	100 %	0 %	0 %	0 %	205351365
567	NC_011274	AT	3	6	25269	25274	50 %	50 %	0 %	0 %	205351365
568	NC_011274	TAT	2	6	25279	25284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351365
569	NC_011274	ACCG	2	8	25303	25310	25 %	0 %	25 %	50 %	205351365
570	NC_011274	TATTT	2	10	25323	25332	20 %	80 %	0 %	0 %	205351365
571	NC_011274	AAAT	2	8	25363	25370	75 %	25 %	0 %	0 %	205351365
572	NC_011274	TAC	2	6	25520	25525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351365
573	NC_011274	A	6	6	25556	25561	100 %	0 %	0 %	0 %	205351365
574	NC_011274	CCG	2	6	25580	25585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351365
575	NC_011274	ACG	2	6	25655	25660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351365
576	NC_011274	ATG	2	6	25684	25689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351365
577	NC_011274	TCTG	2	8	25820	25827	0 %	50 %	25 %	25 %	205351366
578	NC_011274	GGC	2	6	25877	25882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
579	NC_011274	ACG	2	6	25959	25964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351366
580	NC_011274	GC	3	6	25972	25977	0 %	0 %	50 %	50 %	205351366
581	NC_011274	GCCT	2	8	26001	26008	0 %	25 %	25 %	50 %	205351366
582	NC_011274	GGC	3	9	26069	26077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
583	NC_011274	GCC	2	6	26112	26117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351366
584	NC_011274	GCA	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351366
585	NC_011274	GGC	2	6	26168	26173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
586	NC_011274	GGC	2	6	26286	26291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
587	NC_011274	ACT	2	6	26359	26364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351366
588	NC_011274	GCG	2	6	26383	26388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
589	NC_011274	AGCGAC	2	12	26397	26408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351366
590	NC_011274	GCA	2	6	26411	26416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351366
591	NC_011274	ATT	2	6	26495	26500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351366
592	NC_011274	CCTT	2	8	26507	26514	0 %	50 %	0 %	50 %	205351366
593	NC_011274	GAC	2	6	26538	26543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351366
594	NC_011274	CAT	2	6	26636	26641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351366
595	NC_011274	GCC	2	6	26657	26662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351366
596	NC_011274	CCG	2	6	26695	26700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351366
597	NC_011274	GCG	2	6	26704	26709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
598	NC_011274	CCG	2	6	26770	26775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351366
599	NC_011274	GGC	2	6	26797	26802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
600	NC_011274	GCG	2	6	26811	26816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
601	NC_011274	AGT	2	6	26841	26846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351366
602	NC_011274	TCAG	2	8	26866	26873	25 %	25 %	25 %	25 %	205351366
603	NC_011274	GCG	2	6	26962	26967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
604	NC_011274	ATA	2	6	27031	27036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351366
605	NC_011274	GAT	2	6	27150	27155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351366
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607	NC_011274	TTA	2	6	27245	27250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351366
608	NC_011274	AGG	2	6	27255	27260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351366
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610	NC_011274	TTA	2	6	27313	27318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351366
611	NC_011274	CAGC	2	8	27323	27330	25 %	0 %	25 %	50 %	205351366
612	NC_011274	TGA	2	6	27347	27352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351366
613	NC_011274	TTG	2	6	27363	27368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351366
614	NC_011274	ACA	2	6	27418	27423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351366
615	NC_011274	GAT	2	6	27507	27512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351366
616	NC_011274	CTG	2	6	27606	27611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351366
617	NC_011274	ACA	2	6	27631	27636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351366
618	NC_011274	GCG	2	6	27673	27678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
619	NC_011274	CAG	2	6	27753	27758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351366
620	NC_011274	GCG	2	6	27775	27780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
621	NC_011274	TGG	2	6	27784	27789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351366
622	NC_011274	AGCC	2	8	27813	27820	25 %	0 %	25 %	50 %	205351366
623	NC_011274	CG	3	6	27902	27907	0 %	0 %	50 %	50 %	205351366
624	NC_011274	GGT	2	6	27917	27922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351366
625	NC_011274	ACA	2	6	27933	27938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351366
626	NC_011274	TGA	2	6	27980	27985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351366
627	NC_011274	TGA	2	6	27995	28000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351366
628	NC_011274	CCGA	2	8	28020	28027	25 %	0 %	25 %	50 %	205351366
629	NC_011274	GC	3	6	28030	28035	0 %	0 %	50 %	50 %	205351366
630	NC_011274	GC	3	6	28066	28071	0 %	0 %	50 %	50 %	205351366
631	NC_011274	ACGGTG	2	12	28122	28133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	205351366
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