MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011274	ATT	2	6	230879	230884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351533
5002	NC_011274	GTG	2	6	230954	230959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351533
5003	NC_011274	CTGC	2	8	231002	231009	0 %	25 %	25 %	50 %	205351533
5004	NC_011274	GCG	3	9	231023	231031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351533
5005	NC_011274	CTG	2	6	231035	231040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351533
5006	NC_011274	ATT	2	6	231041	231046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351533
5007	NC_011274	GCC	2	6	231053	231058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351533
5008	NC_011274	GCG	2	6	231063	231068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351533
5009	NC_011274	CGC	2	6	231075	231080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351533
5010	NC_011274	TGC	2	6	231126	231131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351533
5011	NC_011274	ATG	2	6	231134	231139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351533
5012	NC_011274	GCG	2	6	231150	231155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351533
5013	NC_011274	CGC	2	6	231275	231280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351533
5014	NC_011274	GCG	2	6	231303	231308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351533
5015	NC_011274	CG	5	10	231313	231322	0 %	0 %	50 %	50 %	205351533
5016	NC_011274	GCT	2	6	231355	231360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351533
5017	NC_011274	GGC	2	6	231367	231372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351533
5018	NC_011274	CGA	2	6	231390	231395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351533
5019	NC_011274	CGG	2	6	231564	231569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351533
5020	NC_011274	GC	3	6	231591	231596	0 %	0 %	50 %	50 %	205351533
5021	NC_011274	A	8	8	231633	231640	100 %	0 %	0 %	0 %	205351533
5022	NC_011274	CAATAT	2	12	231697	231708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5023	NC_011274	CTGTC	2	10	231764	231773	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5024	NC_011274	AAG	2	6	231810	231815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011274	GC	3	6	231859	231864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_011274	TGA	2	6	231917	231922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011274	AAT	2	6	231945	231950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011274	TAA	3	9	232039	232047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011274	ATA	2	6	232068	232073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011274	ATT	2	6	232078	232083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011274	T	7	7	232082	232088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011274	TAA	2	6	232096	232101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011274	A	6	6	232100	232105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011274	AAAT	2	8	232117	232124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011274	A	8	8	232143	232150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011274	T	6	6	232163	232168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011274	T	8	8	232170	232177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011274	AAAT	2	8	232195	232202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011274	TA	3	6	232218	232223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011274	T	7	7	232245	232251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011274	T	7	7	232274	232280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011274	CTTG	2	8	232292	232299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_011274	TTTG	2	8	232301	232308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011274	T	6	6	232309	232314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011274	TAT	2	6	232331	232336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011274	TGA	2	6	232344	232349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011274	TAAA	2	8	232355	232362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_011274	A	6	6	232360	232365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011274	CG	3	6	232402	232407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_011274	TTAT	2	8	232417	232424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011274	GTT	2	6	232431	232436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011274	CTT	2	6	232439	232444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_011274	ATATA	2	10	232478	232487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011274	CTA	2	6	232491	232496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_011274	TAA	2	6	232559	232564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011274	CAG	2	6	232581	232586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351534
5057	NC_011274	TGC	2	6	232600	232605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351534
5058	NC_011274	TGC	2	6	232639	232644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351534
5059	NC_011274	CGA	2	6	232714	232719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351534
5060	NC_011274	CAC	2	6	232822	232827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351534
5061	NC_011274	AAG	2	6	232833	232838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351534
5062	NC_011274	CGG	3	9	232909	232917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351534
5063	NC_011274	ACC	2	6	232950	232955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351534
5064	NC_011274	GCG	3	9	233018	233026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351534
5065	NC_011274	CAG	2	6	233098	233103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351534
5066	NC_011274	ATC	2	6	233142	233147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_011274	A	7	7	233182	233188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011274	TA	3	6	233194	233199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011274	A	6	6	233232	233237	100 %	0 %	0 %	0 %	205351535
5070	NC_011274	GTG	2	6	233262	233267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351535
5071	NC_011274	GAT	2	6	233349	233354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351535
5072	NC_011274	TC	3	6	233366	233371	0 %	50 %	0 %	50 %	205351535
5073	NC_011274	ATC	2	6	233410	233415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351535
5074	NC_011274	TTA	2	6	233458	233463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351535
5075	NC_011274	ATA	2	6	233476	233481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351535
5076	NC_011274	GCT	2	6	233528	233533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351535
5077	NC_011274	ATT	2	6	233655	233660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351535
5078	NC_011274	TAT	2	6	233734	233739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351535
5079	NC_011274	ATG	2	6	233779	233784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351535
5080	NC_011274	GGTG	2	8	233819	233826	0 %	25 %	75 %	0 %	205351535
5081	NC_011274	GC	3	6	233849	233854	0 %	0 %	50 %	50 %	205351535
5082	NC_011274	GGCG	2	8	233956	233963	0 %	0 %	75 %	25 %	205351535
5083	NC_011274	GGC	2	6	234042	234047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5084	NC_011274	CGA	2	6	234059	234064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351535
5085	NC_011274	AT	3	6	234103	234108	50 %	50 %	0 %	0 %	205351535
5086	NC_011274	GC	3	6	234117	234122	0 %	0 %	50 %	50 %	205351535
5087	NC_011274	GCGG	2	8	234151	234158	0 %	0 %	75 %	25 %	205351535
5088	NC_011274	GAA	2	6	234246	234251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351535
5089	NC_011274	GGC	2	6	234375	234380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5090	NC_011274	CCT	2	6	234400	234405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351535
5091	NC_011274	CGG	2	6	234434	234439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5092	NC_011274	GCT	2	6	234497	234502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351535
5093	NC_011274	TGA	2	6	234617	234622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351535
5094	NC_011274	GAA	2	6	234663	234668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351535
5095	NC_011274	TGA	2	6	234944	234949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351535
5096	NC_011274	CAA	2	6	234983	234988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351535
5097	NC_011274	ACA	3	9	235024	235032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351535
5098	NC_011274	CG	3	6	235095	235100	0 %	0 %	50 %	50 %	205351535
5099	NC_011274	TCA	2	6	235133	235138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351535
5100	NC_011274	CGG	2	6	235196	235201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5101	NC_011274	GCACC	2	10	235250	235259	20 %	0 %	20 %	60 %	205351535
5102	NC_011274	CGG	2	6	235268	235273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5103	NC_011274	TGG	2	6	235285	235290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351535
5104	NC_011274	TA	3	6	235339	235344	50 %	50 %	0 %	0 %	205351535
5105	NC_011274	ACT	2	6	235384	235389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351535
5106	NC_011274	CGC	2	6	235491	235496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351535
5107	NC_011274	A	6	6	235515	235520	100 %	0 %	0 %	0 %	205351535
5108	NC_011274	GGC	2	6	235548	235553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5109	NC_011274	CGC	2	6	235555	235560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351535
5110	NC_011274	ACA	2	6	235579	235584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351535
5111	NC_011274	GCG	2	6	235695	235700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5112	NC_011274	TGC	2	6	235741	235746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351535
5113	NC_011274	TCA	2	6	235764	235769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351535
5114	NC_011274	GCG	2	6	235820	235825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351535
5115	NC_011274	CT	3	6	235851	235856	0 %	50 %	0 %	50 %	205351535
5116	NC_011274	ATG	2	6	235895	235900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351536
5117	NC_011274	TGC	2	6	235932	235937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351536
5118	NC_011274	GGC	2	6	235946	235951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351536
5119	NC_011274	GCC	2	6	235967	235972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351536
5120	NC_011274	TCACC	2	10	236103	236112	20 %	20 %	0 %	60 %	205351536
5121	NC_011274	TCG	2	6	236118	236123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351536
5122	NC_011274	T	6	6	236220	236225	0 %	100 %	0 %	0 %	205351536
5123	NC_011274	CCG	2	6	236246	236251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351536
5124	NC_011274	T	6	6	236304	236309	0 %	100 %	0 %	0 %	205351536
5125	NC_011274	GCA	2	6	236341	236346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351536
5126	NC_011274	TAC	2	6	236414	236419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351536
5127	NC_011274	GTG	2	6	236420	236425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351536
5128	NC_011274	GC	3	6	236571	236576	0 %	0 %	50 %	50 %	205351536
5129	NC_011274	ACA	2	6	236604	236609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351536
5130	NC_011274	GCA	2	6	236738	236743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351537
5131	NC_011274	GCCGC	2	10	236786	236795	0 %	0 %	40 %	60 %	205351537
5132	NC_011274	CGG	2	6	236809	236814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351537
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5135	NC_011274	GCG	2	6	237069	237074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351537
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5140	NC_011274	GCA	2	6	237206	237211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_011274	CCG	2	6	237265	237270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5142	NC_011274	CTG	2	6	237319	237324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5143	NC_011274	TAA	2	6	237327	237332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_011274	GTGA	2	8	237436	237443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_011274	CGG	3	9	237452	237460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5146	NC_011274	CCA	2	6	237527	237532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5147	NC_011274	GGC	2	6	237607	237612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5155	NC_011274	TGC	2	6	238206	238211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5157	NC_011274	TGG	2	6	238335	238340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_011274	AGTAT	2	10	238354	238363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_011274	AGG	2	6	238378	238383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5161	NC_011274	CTGG	2	8	238570	238577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5162	NC_011274	CTG	3	9	238593	238601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_011274	CCG	2	6	238628	238633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5171	NC_011274	A	8	8	239070	239077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5238	NC_011274	TGCTGG	2	12	241809	241820	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	205351540
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5240	NC_011274	GGC	2	6	241960	241965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351540
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5242	NC_011274	GCA	2	6	242123	242128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351541
5243	NC_011274	TA	3	6	242187	242192	50 %	50 %	0 %	0 %	205351541
5244	NC_011274	CGG	2	6	242197	242202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351541
5245	NC_011274	TGG	2	6	242289	242294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351541
5246	NC_011274	TGG	2	6	242319	242324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351541
5247	NC_011274	AACC	2	8	242374	242381	50 %	0 %	0 %	50 %	205351541
5248	NC_011274	CTTC	2	8	242412	242419	0 %	50 %	0 %	50 %	205351541
5249	NC_011274	GCC	2	6	242584	242589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351542
5250	NC_011274	GAC	2	6	242607	242612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351542
5251	NC_011274	CAT	2	6	242619	242624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351542
5252	NC_011274	ATA	2	6	242686	242691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351542
5253	NC_011274	AAT	2	6	242754	242759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351542
5254	NC_011274	CGC	2	6	242762	242767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351542
5255	NC_011274	ACAG	2	8	242790	242797	50 %	0 %	25 %	25 %	205351542
5256	NC_011274	TTGG	2	8	242906	242913	0 %	50 %	50 %	0 %	205351542
5257	NC_011274	CAG	2	6	242919	242924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351542
5258	NC_011274	CGA	2	6	242951	242956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351542
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5263	NC_011274	ATA	2	6	243235	243240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351543
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5269	NC_011274	GGC	2	6	243618	243623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351543
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5271	NC_011274	CCG	2	6	243727	243732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351543
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5275	NC_011274	CGGG	2	8	243824	243831	0 %	0 %	75 %	25 %	205351543
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5280	NC_011274	CG	3	6	243914	243919	0 %	0 %	50 %	50 %	205351543
5281	NC_011274	AGC	2	6	243949	243954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351543
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5298	NC_011274	TCG	2	6	244803	244808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351545
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5322	NC_011274	GTC	2	6	246136	246141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351545
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5357	NC_011274	CAG	2	6	247726	247731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351546
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5359	NC_011274	TATT	2	8	247818	247825	25 %	75 %	0 %	0 %	205351546
5360	NC_011274	C	6	6	247891	247896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5361	NC_011274	TGCTC	2	10	247969	247978	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5362	NC_011274	AGG	2	6	247981	247986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_011274	TGGC	3	12	247993	248004	0 %	25 %	50 %	25 %	205351547
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5365	NC_011274	CAT	2	6	248051	248056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351547
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5367	NC_011274	GCG	2	6	248104	248109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351547
5368	NC_011274	GC	3	6	248140	248145	0 %	0 %	50 %	50 %	205351547
5369	NC_011274	GT	3	6	248313	248318	0 %	50 %	50 %	0 %	205351547
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5371	NC_011274	TGA	2	6	248398	248403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351547
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5494	NC_011274	GCA	2	6	253460	253465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351551
5495	NC_011274	GC	3	6	253482	253487	0 %	0 %	50 %	50 %	205351551
5496	NC_011274	GGC	2	6	253520	253525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351551
5497	NC_011274	CGT	2	6	253548	253553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351551
5498	NC_011274	CAT	2	6	253587	253592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351551
5499	NC_011274	GTC	2	6	253638	253643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351551
5500	NC_011274	GCAG	2	8	253708	253715	25 %	0 %	50 %	25 %	205351551

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