MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 98603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011274	CG	3	6	209460	209465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_011274	TGC	2	6	209487	209492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_011274	AC	3	6	209503	209508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_011274	AGCGC	2	10	209509	209518	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4505	NC_011274	ATAA	2	8	209520	209527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_011274	GTTT	2	8	209587	209594	0 %	75 %	25 %	0 %	205351516
4507	NC_011274	TGA	2	6	209624	209629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351516
4508	NC_011274	GGC	3	9	209652	209660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351516
4509	NC_011274	ATA	2	6	209751	209756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351516
4510	NC_011274	TTC	2	6	209767	209772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351516
4511	NC_011274	GTGTT	2	10	209893	209902	0 %	60 %	40 %	0 %	205351516
4512	NC_011274	TGC	2	6	209915	209920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351516
4513	NC_011274	CCAG	2	8	209939	209946	25 %	0 %	25 %	50 %	205351516
4514	NC_011274	GCC	2	6	209976	209981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351516
4515	NC_011274	GTA	2	6	209996	210001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351516
4516	NC_011274	GCG	2	6	210032	210037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351516
4517	NC_011274	CAA	2	6	210229	210234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351516
4518	NC_011274	TGA	2	6	210264	210269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_011274	CCA	2	6	210302	210307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_011274	GCGG	2	8	210386	210393	0 %	0 %	75 %	25 %	205351517
4521	NC_011274	CTG	2	6	210424	210429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351517
4522	NC_011274	G	6	6	210432	210437	0 %	0 %	100 %	0 %	205351517
4523	NC_011274	CAT	2	6	210523	210528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351517
4524	NC_011274	GC	3	6	210578	210583	0 %	0 %	50 %	50 %	205351517
4525	NC_011274	CTG	2	6	210591	210596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351517
4526	NC_011274	AG	3	6	210672	210677	50 %	0 %	50 %	0 %	205351517
4527	NC_011274	TTC	2	6	210683	210688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351517
4528	NC_011274	GCG	2	6	210789	210794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351517
4529	NC_011274	GGC	2	6	210809	210814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351517
4530	NC_011274	AGTG	2	8	210824	210831	25 %	25 %	50 %	0 %	205351517
4531	NC_011274	GAT	2	6	210955	210960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_011274	GAA	2	6	210972	210977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_011274	AT	4	8	211011	211018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_011274	ATT	2	6	211026	211031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_011274	GTTT	2	8	211041	211048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_011274	GCT	2	6	211095	211100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_011274	AAT	2	6	211113	211118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_011274	T	7	7	211124	211130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011274	A	6	6	211135	211140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_011274	GT	3	6	211155	211160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_011274	A	7	7	211169	211175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011274	CAT	2	6	211184	211189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_011274	GGA	2	6	211208	211213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_011274	AAG	2	6	211283	211288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_011274	ATG	2	6	211358	211363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011274	TG	3	6	211362	211367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_011274	CGAC	2	8	211399	211406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_011274	CGGCG	2	10	211412	211421	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4549	NC_011274	TGA	2	6	211441	211446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_011274	GGA	2	6	211499	211504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_011274	GC	3	6	211567	211572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_011274	CAG	3	9	211596	211604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_011274	TGC	2	6	211624	211629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_011274	GAC	2	6	211661	211666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_011274	T	6	6	211688	211693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_011274	AT	3	6	211707	211712	50 %	50 %	0 %	0 %	205351518
4557	NC_011274	GTT	2	6	211723	211728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351518
4558	NC_011274	ACG	2	6	211792	211797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351518
4559	NC_011274	GCC	2	6	211804	211809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351518
4560	NC_011274	ATT	2	6	211895	211900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351518
4561	NC_011274	TGG	2	6	212090	212095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351518
4562	NC_011274	ATT	2	6	212113	212118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351518
4563	NC_011274	GGCT	2	8	212174	212181	0 %	25 %	50 %	25 %	205351518
4564	NC_011274	ATC	2	6	212234	212239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351518
4565	NC_011274	TGA	2	6	212250	212255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351518
4566	NC_011274	CCA	2	6	212282	212287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351518
4567	NC_011274	TTCGG	2	10	212292	212301	0 %	40 %	40 %	20 %	205351518
4568	NC_011274	GGA	2	6	212367	212372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351518
4569	NC_011274	CG	3	6	212386	212391	0 %	0 %	50 %	50 %	205351518
4570	NC_011274	GC	4	8	212401	212408	0 %	0 %	50 %	50 %	205351518
4571	NC_011274	GGT	2	6	212409	212414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351518
4572	NC_011274	TAT	2	6	212499	212504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351518
4573	NC_011274	T	6	6	212619	212624	0 %	100 %	0 %	0 %	205351518
4574	NC_011274	TCG	2	6	212643	212648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351518
4575	NC_011274	TA	3	6	212657	212662	50 %	50 %	0 %	0 %	205351518
4576	NC_011274	ATA	2	6	212675	212680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351518
4577	NC_011274	CGG	2	6	212704	212709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351518
4578	NC_011274	TCTT	2	8	212742	212749	0 %	75 %	0 %	25 %	205351518
4579	NC_011274	AGC	2	6	212784	212789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351518
4580	NC_011274	CAC	2	6	212817	212822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351518
4581	NC_011274	TGC	2	6	212858	212863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351518
4582	NC_011274	CTT	2	6	213036	213041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351519
4583	NC_011274	GCC	2	6	213101	213106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351519
4584	NC_011274	GAT	2	6	213121	213126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351519
4585	NC_011274	CTTGC	2	10	213301	213310	0 %	40 %	20 %	40 %	205351519
4586	NC_011274	CTT	2	6	213330	213335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_011274	GGC	3	9	213476	213484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351520
4588	NC_011274	GTC	2	6	213551	213556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351520
4589	NC_011274	TTCA	2	8	213572	213579	25 %	50 %	0 %	25 %	205351520
4590	NC_011274	GGCAAT	2	12	213590	213601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	205351520
4591	NC_011274	TCA	2	6	213652	213657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351520
4592	NC_011274	GCT	2	6	213685	213690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351520
4593	NC_011274	TGAGC	2	10	213713	213722	20 %	20 %	40 %	20 %	205351520
4594	NC_011274	AAT	2	6	213743	213748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351520
4595	NC_011274	CGA	2	6	213757	213762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351520
4596	NC_011274	CCA	2	6	213787	213792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351520
4597	NC_011274	CGC	2	6	213889	213894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351520
4598	NC_011274	TGG	2	6	213928	213933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351520
4599	NC_011274	ACGT	2	8	213951	213958	25 %	25 %	25 %	25 %	205351520
4600	NC_011274	CAC	2	6	214124	214129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351520
4601	NC_011274	CGT	2	6	214171	214176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351520
4602	NC_011274	TGG	2	6	214189	214194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351520
4603	NC_011274	GAC	2	6	214228	214233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351520
4604	NC_011274	GCA	2	6	214246	214251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351520
4605	NC_011274	CAA	2	6	214276	214281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351520
4606	NC_011274	TGA	2	6	214298	214303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_011274	GCGCT	2	10	214316	214325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4608	NC_011274	CGCGT	2	10	214368	214377	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4609	NC_011274	TTC	2	6	214417	214422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351521
4610	NC_011274	CTG	2	6	214459	214464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351521
4611	NC_011274	CGG	2	6	214467	214472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351521
4612	NC_011274	CCG	2	6	214526	214531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351521
4613	NC_011274	GCCGAT	2	12	214588	214599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	205351521
4614	NC_011274	GCAC	2	8	214647	214654	25 %	0 %	25 %	50 %	205351521
4615	NC_011274	CCAGCA	2	12	214656	214667	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	205351521
4616	NC_011274	CAG	2	6	214705	214710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351521
4617	NC_011274	GCC	2	6	214747	214752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351521
4618	NC_011274	CGGCA	2	10	214798	214807	20 %	0 %	40 %	40 %	205351521
4619	NC_011274	CCAG	2	8	214836	214843	25 %	0 %	25 %	50 %	205351521
4620	NC_011274	GCC	2	6	214846	214851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351521
4621	NC_011274	CGCA	2	8	214876	214883	25 %	0 %	25 %	50 %	205351521
4622	NC_011274	GC	3	6	214965	214970	0 %	0 %	50 %	50 %	205351521
4623	NC_011274	GCACG	2	10	214977	214986	20 %	0 %	40 %	40 %	205351521
4624	NC_011274	TCG	2	6	215087	215092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351521
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4626	NC_011274	CTTG	2	8	215151	215158	0 %	50 %	25 %	25 %	205351521
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4750	NC_011274	CGA	2	6	220784	220789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351528
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4752	NC_011274	TGA	2	6	220857	220862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351528
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4871	NC_011274	TCC	2	6	225470	225475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4872	NC_011274	ATAA	2	8	225476	225483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4873	NC_011274	TTA	2	6	225498	225503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4874	NC_011274	CCTT	2	8	225506	225513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4875	NC_011274	GTT	2	6	225522	225527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4876	NC_011274	GAT	2	6	225574	225579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4877	NC_011274	TAA	3	9	225604	225612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4878	NC_011274	TCA	2	6	225638	225643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4879	NC_011274	GTA	2	6	225709	225714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351530
4880	NC_011274	TGTC	2	8	225734	225741	0 %	50 %	25 %	25 %	205351530
4881	NC_011274	GGC	2	6	225750	225755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351530
4882	NC_011274	AGA	2	6	225768	225773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351530
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4886	NC_011274	GGT	2	6	225906	225911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351530
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4893	NC_011274	CGTC	2	8	226160	226167	0 %	25 %	25 %	50 %	205351530
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4896	NC_011274	TTCAA	2	10	226244	226253	40 %	40 %	0 %	20 %	205351530
4897	NC_011274	GGAC	2	8	226259	226266	25 %	0 %	50 %	25 %	205351530
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4901	NC_011274	CTA	2	6	226479	226484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351530
4902	NC_011274	GGCT	2	8	226486	226493	0 %	25 %	50 %	25 %	205351530
4903	NC_011274	TGG	2	6	226595	226600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351530
4904	NC_011274	A	6	6	226679	226684	100 %	0 %	0 %	0 %	205351530
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4989	NC_011274	GC	3	6	230595	230600	0 %	0 %	50 %	50 %	205351533
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4992	NC_011274	GC	3	6	230640	230645	0 %	0 %	50 %	50 %	205351533
4993	NC_011274	GC	3	6	230715	230720	0 %	0 %	50 %	50 %	205351533
4994	NC_011274	CTG	3	9	230723	230731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351533
4995	NC_011274	CT	3	6	230747	230752	0 %	50 %	0 %	50 %	205351533
4996	NC_011274	GCT	2	6	230794	230799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351533
4997	NC_011274	GAA	2	6	230801	230806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351533
4998	NC_011274	GGC	2	6	230836	230841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351533
4999	NC_011274	GGCG	2	8	230848	230855	0 %	0 %	75 %	25 %	205351533
5000	NC_011274	TGGCGG	2	12	230862	230873	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	205351533

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