MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 11322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011205	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011205	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	198244353
3	NC_011205	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	198244353
4	NC_011205	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	198244850
5	NC_011205	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	198242395
6	NC_011205	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	198242395
7	NC_011205	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	198242395
8	NC_011205	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	198242395
9	NC_011205	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	198242395
10	NC_011205	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	198245613
11	NC_011205	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	198245613
12	NC_011205	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	198245613
13	NC_011205	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	198241895
14	NC_011205	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	198241895
15	NC_011205	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011205	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	198245990
17	NC_011205	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	198243756
18	NC_011205	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	198244504
19	NC_011205	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	198244504
20	NC_011205	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011205	TGTT	2	8	11384	11391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011205	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	198242776
23	NC_011205	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	198242776
24	NC_011205	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	198242776
25	NC_011205	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	198242776
26	NC_011205	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	198242776
27	NC_011205	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	198242776
28	NC_011205	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	198243023
29	NC_011205	TCAG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	198245711
30	NC_011205	TTTG	2	8	15535	15542	0 %	75 %	25 %	0 %	198245711
31	NC_011205	CGAA	2	8	15750	15757	50 %	0 %	25 %	25 %	198245711
32	NC_011205	ATTG	2	8	15762	15769	25 %	50 %	25 %	0 %	198245711
33	NC_011205	ATTA	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	198244921
34	NC_011205	ATAA	2	8	16522	16529	75 %	25 %	0 %	0 %	198243700
35	NC_011205	AATA	2	8	17998	18005	75 %	25 %	0 %	0 %	198242422
36	NC_011205	GGGC	2	8	18584	18591	0 %	0 %	75 %	25 %	198242422
37	NC_011205	CGTG	2	8	19284	19291	0 %	25 %	50 %	25 %	198242422
38	NC_011205	CCAA	2	8	21285	21292	50 %	0 %	0 %	50 %	198242908
39	NC_011205	GACG	2	8	21631	21638	25 %	0 %	50 %	25 %	198242908
40	NC_011205	TGGC	2	8	22284	22291	0 %	25 %	50 %	25 %	198242908
41	NC_011205	TGGC	2	8	22390	22397	0 %	25 %	50 %	25 %	198242908
42	NC_011205	CGCC	2	8	22656	22663	0 %	0 %	25 %	75 %	198242908
43	NC_011205	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	198242908
44	NC_011205	TTAT	2	8	23267	23274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011205	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	198243657
46	NC_011205	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	198243657
47	NC_011205	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	198242187
48	NC_011205	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	198242187
49	NC_011205	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	198242340
50	NC_011205	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	198242340
51	NC_011205	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	198245430
52	NC_011205	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	198245430
53	NC_011205	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	198245430
54	NC_011205	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	198245430
55	NC_011205	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	198245430
56	NC_011205	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
57	NC_011205	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
58	NC_011205	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
59	NC_011205	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	198246163
60	NC_011205	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	198246163
61	NC_011205	ATGA	2	8	29973	29980	50 %	25 %	25 %	0 %	198245849
62	NC_011205	TGCT	2	8	30543	30550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011205	TATC	2	8	30599	30606	25 %	50 %	0 %	25 %	198243542
64	NC_011205	GTAA	2	8	30636	30643	50 %	25 %	25 %	0 %	198243542
65	NC_011205	TTCG	2	8	30898	30905	0 %	50 %	25 %	25 %	198243542
66	NC_011205	GTCA	2	8	31407	31414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011205	ACCG	2	8	32227	32234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011205	AGGC	2	8	32265	32272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011205	CCTG	2	8	32701	32708	0 %	25 %	25 %	50 %	198245062
70	NC_011205	AACA	2	8	32717	32724	75 %	0 %	0 %	25 %	198245062
71	NC_011205	CGCA	2	8	32891	32898	25 %	0 %	25 %	50 %	198245062
72	NC_011205	TAAA	2	8	32961	32968	75 %	25 %	0 %	0 %	198245062
73	NC_011205	CCAG	2	8	33347	33354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011205	TTAT	2	8	33530	33537	25 %	75 %	0 %	0 %	198244833
75	NC_011205	TTGG	2	8	33914	33921	0 %	50 %	50 %	0 %	198244833
76	NC_011205	CTTT	2	8	34294	34301	0 %	75 %	0 %	25 %	198244833
77	NC_011205	GAAG	2	8	34334	34341	50 %	0 %	50 %	0 %	198244833
78	NC_011205	ATAA	2	8	34665	34672	75 %	25 %	0 %	0 %	198244219
79	NC_011205	GTGC	2	8	34788	34795	0 %	25 %	50 %	25 %	198244219
80	NC_011205	TTAA	2	8	34798	34805	50 %	50 %	0 %	0 %	198244219
81	NC_011205	TGAT	2	8	35033	35040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011205	TGGA	2	8	35550	35557	25 %	25 %	50 %	0 %	198242535
83	NC_011205	GGGA	2	8	36494	36501	25 %	0 %	75 %	0 %	198242535
84	NC_011205	ATAC	2	8	37479	37486	50 %	25 %	0 %	25 %	198242289
85	NC_011205	GAAG	2	8	37551	37558	50 %	0 %	50 %	0 %	198242289
86	NC_011205	CACG	2	8	38114	38121	25 %	0 %	25 %	50 %	198242289
87	NC_011205	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	198242289
88	NC_011205	CCAT	2	8	38672	38679	25 %	25 %	0 %	50 %	198242289
89	NC_011205	ATTA	2	8	38766	38773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011205	AATT	2	8	40046	40053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011205	GCGG	2	8	40537	40544	0 %	0 %	75 %	25 %	198243820
92	NC_011205	CTGG	2	8	40755	40762	0 %	25 %	50 %	25 %	198243820
93	NC_011205	CCGA	2	8	41272	41279	25 %	0 %	25 %	50 %	198243820
94	NC_011205	ATCG	2	8	41428	41435	25 %	25 %	25 %	25 %	198243820
95	NC_011205	TCAA	2	8	41489	41496	50 %	25 %	0 %	25 %	198243820
96	NC_011205	AACC	2	8	41755	41762	50 %	0 %	0 %	50 %	198243215
97	NC_011205	GAAA	2	8	41807	41814	75 %	0 %	25 %	0 %	198243215
98	NC_011205	GGTC	2	8	42379	42386	0 %	25 %	50 %	25 %	198243215
99	NC_011205	TTTG	2	8	42903	42910	0 %	75 %	25 %	0 %	198243215
100	NC_011205	GTAT	2	8	43198	43205	25 %	50 %	25 %	0 %	198244819
101	NC_011205	TCCG	2	8	43592	43599	0 %	25 %	25 %	50 %	198244819
102	NC_011205	ATGA	2	8	45654	45661	50 %	25 %	25 %	0 %	198244177
103	NC_011205	AACG	2	8	45956	45963	50 %	0 %	25 %	25 %	198244177
104	NC_011205	TGAC	2	8	46040	46047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011205	GAAA	2	8	46904	46911	75 %	0 %	25 %	0 %	198245761
106	NC_011205	TCGC	2	8	46919	46926	0 %	25 %	25 %	50 %	198245761
107	NC_011205	GCTG	2	8	47110	47117	0 %	25 %	50 %	25 %	198245761
108	NC_011205	CACG	2	8	47808	47815	25 %	0 %	25 %	50 %	198242822
109	NC_011205	CAGC	2	8	47835	47842	25 %	0 %	25 %	50 %	198242822
110	NC_011205	CTGC	2	8	47972	47979	0 %	25 %	25 %	50 %	198242822
111	NC_011205	TACC	2	8	48319	48326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011205	CATG	2	8	48540	48547	25 %	25 %	25 %	25 %	198242197
113	NC_011205	AAGT	2	8	49334	49341	50 %	25 %	25 %	0 %	198242197
114	NC_011205	CCAG	2	8	49392	49399	25 %	0 %	25 %	50 %	198242197
115	NC_011205	TTGA	2	8	50173	50180	25 %	50 %	25 %	0 %	198242197
116	NC_011205	GAAA	2	8	50508	50515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011205	GCCA	2	8	50849	50856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011205	TAAA	2	8	51242	51249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011205	TCTT	2	8	51361	51368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011205	AGTA	2	8	51935	51942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011205	ATCA	2	8	51975	51982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011205	GAAA	2	8	52095	52102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011205	GAGG	2	8	52127	52134	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011205	CATA	2	8	52887	52894	50 %	25 %	0 %	25 %	198244244
125	NC_011205	TCAG	2	8	52898	52905	25 %	25 %	25 %	25 %	198244244
126	NC_011205	TGGC	2	8	53612	53619	0 %	25 %	50 %	25 %	198244244
127	NC_011205	GTTC	2	8	56029	56036	0 %	50 %	25 %	25 %	198245825
128	NC_011205	AGCC	2	8	57439	57446	25 %	0 %	25 %	50 %	198245423
129	NC_011205	AAAG	2	8	57518	57525	75 %	0 %	25 %	0 %	198245423
130	NC_011205	ATGG	2	8	57651	57658	25 %	25 %	50 %	0 %	198245423
131	NC_011205	TGAT	2	8	58323	58330	25 %	50 %	25 %	0 %	198242816
132	NC_011205	TGGA	2	8	58992	58999	25 %	25 %	50 %	0 %	198242213
133	NC_011205	GATT	2	8	59390	59397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011205	GATC	2	8	59759	59766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011205	CTGC	2	8	60777	60784	0 %	25 %	25 %	50 %	198242945
136	NC_011205	CTGG	2	8	60884	60891	0 %	25 %	50 %	25 %	198242945
137	NC_011205	GTGG	2	8	61049	61056	0 %	25 %	75 %	0 %	198242945
138	NC_011205	CTGC	2	8	61259	61266	0 %	25 %	25 %	50 %	198245736
139	NC_011205	ACCA	2	8	61895	61902	50 %	0 %	0 %	50 %	198243185
140	NC_011205	GTGG	2	8	61930	61937	0 %	25 %	75 %	0 %	198243185
141	NC_011205	CATT	2	8	62120	62127	25 %	50 %	0 %	25 %	198243185
142	NC_011205	TCAA	2	8	63161	63168	50 %	25 %	0 %	25 %	198243185
143	NC_011205	TACT	2	8	63480	63487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_011205	TTAA	2	8	68517	68524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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